单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19061 - 19080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19061 | 2024-08-05 |
Identification of the Hub Genes Involved in Stem Cell Treatment for Intervertebral Disc Degeneration: A Conjoint Analysis of Single-Cell and Machine Learning
2023, Stem cells international
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/2023/7055264
PMID:36733465
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研究论文 | 本研究旨在识别与椎间盘退变(IDD)相关的新生物标志物 | 这是首次结合机器学习和单细胞测序数据的研究，发现了椎间盘退变的中心基因LAPTM5 | 本研究未提及样本量和样本来源的具体限制 | 研究的目的是寻找椎间盘退变的诊断生物标志物 | 研究对象为接受干细胞治疗的椎间盘退变样本 | 机器学习 | 脊柱退行性疾病 | 单细胞测序和机器学习 | 支持向量机和LASSO | 基因表达数据 | NA |
| 19062 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptional Changes in Hypothalamic Corticotropin-Releasing Factor-Expressing Neurons After Early-Life Adversity Inform Enduring Alterations in Vulnerabilities to Stress
2023-Jan, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2021.12.006
PMID:36712559
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研究论文 | 这篇文章研究了早期生活逆境对下丘脑促肾上腺皮质激素释放因子(CRF)表达神经元的转录变化及其对压力脆弱性的长期影响 | 文章揭示了不同CRF细胞类型如何受到早期生活逆境的不同影响，导致压力脆弱性增加 | 暂未提到研究的具体局限性 | 探讨早期生活逆境如何影响神经内分泌和行为反应以改善心理健康 | 研究对象为发育中的雄性小鼠的CRF表达神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 发育中的雄性小鼠中CRF表达神经元的单细胞样本 |
| 19063 | 2024-08-08 |
Sex differences in interindividual gene expression variability across human tissues
2022-Nov, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac243
PMID:36712323
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研究论文 | 本文分析了GTEx项目中43种组织的RNA-seq数据，研究了基因表达变异性的性别差异及其生物学意义 | 首次系统地探讨了基因表达变异性的性别差异，并发现这些差异与性激素反应、免疫反应等多种生物学功能相关 | NA | 探究性别差异在个体间基因表达变异性中的作用及其生物学和医学意义 | 人类不同组织中的基因表达变异性 | 基因组学 | 甲状腺疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 43种组织 |
| 19064 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals intratumoral heterogeneity and potential mechanisms of malignant progression in prostate cancer with perineural invasion
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.1073232
PMID:36712886
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了三名伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织，揭示了肿瘤内异质性及其在恶性进展中的潜在机制 | 首次在单细胞水平上详细分析了伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和相关基因表达模式 | 研究样本仅限于三名患者，可能影响结果的普遍性 | 深入理解伴有神经周围侵犯的前列腺癌的细胞异质性和恶性进展机制 | 伴有神经周围侵犯的前列腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 基因表达数据 | 约17,000个单细胞转录组，来自三名患者 |
| 19065 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals distinct subsets of CD14+ monocytes drive blood immune signatures of active tuberculosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087010
PMID:36713384
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了活动性结核病（ATB）患者血液中CD14+单核细胞的不同亚群对免疫特征的贡献 | 首次证明中间型和经典型单核细胞分别对ATB的血液免疫特征有贡献，并识别出可能与疾病相关的新亚群和基因特征 | NA | 研究活动性结核病患者血液中单核细胞的免疫特征及其在疾病中的作用 | 活动性结核病患者和健康对照者的血液样本中的单核细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞分析 | NA | 基因表达数据 | 活动性结核病患者和健康对照者的配对血液样本 |
| 19066 | 2024-08-08 |
Secondary myeloid neoplasms after CD19 CAR T therapy in patients with refractory/relapsed B-cell lymphoma: Case series and review of literature
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1063986
PMID:36713414
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病例系列和文献综述 | 本文介绍了四例在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现继发性骨髓肿瘤的难治/复发性B细胞淋巴瘤患者的病例，并进行了文献综述。 | 使用单细胞RNA测序技术比较了MDS患者和健康捐赠者的骨髓样本，并描述了CD34+细胞的转录改变。 | 样本量较小，仅包括四例患者，且均为来自东部中国的两家医院的病例。 | 研究CD19 CAR T细胞治疗后难治/复发性B细胞淋巴瘤患者中继发性骨髓肿瘤的发生和发展。 | 难治/复发性B细胞淋巴瘤患者在接受CD19 CAR T细胞治疗后出现的继发性骨髓肿瘤。 | NA | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 骨髓样本 | 4例患者 |
| 19067 | 2024-08-08 |
Activated autophagy of innate immune cells during the early stages of major trauma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1090358
PMID:36713435
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，探讨了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的关键作用 | 研究样本量有限，且仅限于重大创伤患者早期阶段 | 探究重大创伤早期固有免疫细胞中自噬的调控作用及其对免疫功能的影响 | 重大创伤患者的固有免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 167名重大创伤患者和3名对照参与者的外周血单个核细胞 |
| 19068 | 2024-08-08 |
Associative analysis of multi-omics data indicates that acetylation modification is widely involved in cigarette smoke-induced chronic obstructive pulmonary disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1030644
PMID:36714109
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据关联分析，探讨了蛋白乙酰化修饰在香烟烟雾诱导的慢性阻塞性肺疾病（COPD）中的作用 | 首次系统性地研究了蛋白乙酰化修饰在COPD中的作用，并通过多组学数据关联分析揭示了其在疾病发展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证结果 | 全面系统地研究香烟烟雾引起的慢性阻塞性肺疾病的分子机制，并探索蛋白乙酰化修饰在其中的作用 | 慢性阻塞性肺疾病（COPD）及其分子机制 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA测序（RNA-seq）、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组学、蛋白质组学、乙酰组学数据 | C57BL/6J小鼠模型，COPD患者肺组织样本 |
| 19069 | 2024-08-08 |
Mass cytometry and single-cell RNA sequencing reveal immune cell characteristics of active and inactive phases of Crohn's disease
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.1064106
PMID:36714133
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，揭示了克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 首次综合运用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了克罗恩病不同阶段患者的免疫细胞特征，并通过KEGG通路富集分析和CellChat分析揭示了细胞间的相互作用网络 | NA | 旨在了解克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞特征 | 克罗恩病活动期和非活动期患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 包括活动期克罗恩病（CDa）、非活动期克罗恩病（CDin）和健康对照（HC）的数据 |
| 19070 | 2024-08-08 |
Identification and validation of a muscle failure index to predict prognosis and immunotherapy in lung adenocarcinoma through integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1057088
PMID:36733390
|
研究论文 | 本研究通过综合分析大量和单细胞RNA测序数据，识别并验证了一个肌肉衰竭指数（MFI），用于预测肺腺癌的预后和免疫治疗效果 | 提出了一种基于肌肉衰竭相关基因的新评分系统MFI，并验证了其在预测肺腺癌预后和免疫治疗敏感性中的作用 | NA | 研究肌肉衰竭相关基因在肺腺癌发生中的作用，并构建一个可靠的MFI模型以指导临床决策 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | RNA测序数据 | 包括早期、晚期和脑转移的肺腺癌组织及正常肺组织 |
| 19071 | 2024-08-08 |
High-fiber-diet-related metabolites improve neurodegenerative symptoms in patients with obesity with diabetes mellitus by modulating the hippocampal-hypothalamic endocrine axis
2022, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2022.1026904
PMID:36733447
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研究论文 | 本研究通过转录组和代谢组分析，探讨了高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 本研究首次通过分子对接分析，发现与高纤维饮食相关的代谢标志物醋酰氨基苯甲酸与SPEG蛋白具有最强的结合亲和力，可能通过靶向SPEG蛋白改善肥胖患者的糖尿病和神经退行性疾病 | NA | 探讨高纤维饮食在糖尿病合并肥胖及神经退行性症状中的作用 | 高纤维饮食相关的代谢物、糖尿病前期痴呆的血液甲基化谱、阿尔茨海默病患者海马样本的单细胞测序数据 | NA | 糖尿病、神经退行性疾病 | 转录组分析、代谢组分析、单细胞测序、分子对接 | PCA、AutoDock | 基因表达矩阵、甲基化谱、单细胞测序数据 | 24个与高纤维饮食、T2DM和AD相关的标记基因 |
| 19072 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals cellular heterogeneity from deep fascia in patients with acute compartment syndrome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1062479
PMID:36741388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了急性腔隙综合征患者深层筋膜中的特定高应力腔隙亚群和免疫细胞及成纤维细胞亚群的变化 | 样本量较小，仅包括6名患者 | 探究急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞异质性 | 急性腔隙综合征患者深层筋膜的细胞 | 数字病理学 | 急性腔隙综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6名患者（高应力组3名，正常应力组3名） |
| 19073 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of myeloid cells in HPV+ tonsillar cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1087843
PMID:36741389
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞组成 | 揭示了HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的四种树突状细胞系和两种巨噬细胞极化过程，以及它们的成熟序列特征 | NA | 探究HPV阳性扁桃体癌中髓系细胞的起源和动态变化，并识别可用于评估患者预后的髓系生物标志物 | HPV阳性扁桃体癌中的髓系细胞 | 数字病理学 | 扁桃体癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用26重流式细胞术验证了大部分单细胞RNA-seq集群 |
| 19074 | 2024-08-08 |
Multimodal human thymic profiling reveals trajectories and cellular milieu for T agonist selection
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1092028
PMID:36741401
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研究论文 | 本文通过多模态人类胸腺分析，揭示了T细胞受体(TCRs)阳性选择过程中的细胞命运和细胞微环境 | 首次使用CITE-seq和空间转录组学技术对小儿人类胸腺进行分析，揭示了胸腺细胞在TCR信号传导标记物表达后的发育轨迹和时间诱导模式 | NA | 研究胸腺细胞发育、选择和谱系选择过程中的空间背景和细胞间相互作用 | 胸腺细胞和其发育过程中的细胞微环境 | 免疫学 | NA | CITE-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小儿人类胸腺样本 |
| 19075 | 2024-08-05 |
MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13402
PMID:36710661
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研究论文 | 本研究介绍了一个关于男性生殖系统的单细胞测序数据的互动网站MHA | MHA是第一个专注于男性生殖学和男性生殖的单细胞数据库网站，提供了独特的单细胞测序资源和可访问的工具 | 该研究依赖于已发表的研究数据，可能存在数据质量和完整性的问题 | 旨在为男性生殖系统的单细胞测序数据提供一个共享平台 | 男性特定组织和器官的单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 57个样本（人类和小鼠） |
| 19076 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics for profiling the tropism of viral vectors in tissues
2023-09, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01648-w
PMID:36702899
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研究论文 | 该研究开发了一种超灵敏的空间转录组测序方法，用于在完整组织中分析病毒载体的细胞亚型嗜性 | 文章提出了一种结合水凝胶组织清洁、信号增强和多重标记的新方法USeqFISH，能够高通量、高清晰度地分析内源性和病毒RNA | 尚未提及具体的局限性 | 研究工程化腺相关病毒载体在哺乳动物组织中传导特性 | 研究六种系统腺相关病毒（AAV）在小鼠大脑不同区域的转导和细胞亚型嗜性 | 数字病理 | NA | USeqFISH | NA | RNA | 六种系统AAV在小鼠脑部的多个区域 |
| 19077 | 2024-08-08 |
Comparing the adult and pre-pubertal testis: Metabolic transitions and the change in the spermatogonial stem cell metabolic microenvironment
2023-09, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13397
PMID:36690000
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综述 | 本文综述了生精干细胞在维持和分化过程中的代谢需求，并强调了Sertoli细胞和干细胞微环境成熟对生精干细胞代谢需求在发育过程中的潜在影响 | 提出了生精干细胞成熟的新定义，并根据代谢变化对其进行了修正 | NA | 深入理解生精干细胞的代谢需求及其调控机制，以改善其在实验室中的培养 | 生精干细胞的代谢需求及其在发育过程中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19078 | 2024-08-08 |
Growth Hormone Promotes Oocyte Maturation In Vitro by Protecting Mitochondrial Function and Reducing Apoptosis
2023-07, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-022-01147-y
PMID:36694082
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）中对卵母细胞成熟的影响及其机制 | 首次详细阐述了GH通过保护线粒体功能和减少细胞凋亡来促进卵母细胞体外成熟的具体机制 | NA | 研究GH对卵母细胞体外成熟的影响及其机制 | 卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | GH组和对照组的卵母细胞 |
| 19079 | 2024-08-05 |
Metabolic heterogeneity in early-stage lung adenocarcinoma revealed by RNA-seq and scRNA-seq
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03082-z
PMID:36692643
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研究论文 | 本研究揭示了早期肺腺癌中的代谢异质性 | 通过RNA-seq和单细胞RNA-seq识别了代谢相关的亚型，为肺腺癌的预后和治疗提供了潜在生物标志物 | 研究主要依赖于TCGA和GEO的数据，可能存在数据源的局限性 | 探讨肺腺癌的代谢重编程及其对预后的影响 | 研究对象为肺腺癌样本，尤其关注其代谢相关的亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集中肺腺癌样本的数量未具体说明 |
| 19080 | 2024-08-08 |
Bioinformatic analysis of single-cell RNA sequencing dataset dissects cellular heterogeneity of triple-negative breast cancer in transcriptional profile, splicing event and crosstalk network
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03083-y
PMID:36692641
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，全面探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）不同亚型上皮细胞的转录组特征、可变剪接事件及上皮与非上皮细胞间的相互作用 | 发现管腔前体亚型表现出最复杂的基因调控网络和剪接事件，并揭示了hnRNPs在管腔前体亚型中对可变剪接事件的负调控作用，以及NOTCH4在TNBC中的关键作用和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌的细胞异质性及其调控网络 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的细胞异质性及其调控网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |