单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19041 - 19060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19041 | 2024-08-05 |
Estimation of cell lineages in tumors from spatial transcriptomics data
2023-02-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36062-6
PMID:36732531
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法SpaCET，用于从空间转录组学数据中估计肿瘤细胞谱系 | 开发了SpaCET，能够整合基因模式字典并校准局部细胞密度，以更准确地推断肿瘤细胞类型 | 现有方法难以处理含有多种细胞类型的肿瘤ST数据 | 研究如何从空间转录组学数据中推断肿瘤内的细胞身份 | 针对肿瘤组织中的免疫细胞和恶性细胞进行探讨 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 (ST) | 约束回归模型 | 肿瘤组织的基因表达数据 | 通过模拟和真实ST数据进行的验证 |
| 19042 | 2024-08-08 |
Multimodal single-cell analyses of peripheral blood mononuclear cells of COVID-19 patients in Japan
2023-02-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-28696-9
PMID:36732528
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研究论文 | 本研究对来自日本的COVID-19患者的外周血单个核细胞进行了多模态单细胞分析 | 首次对COVID-19患者的外周血单个核细胞进行了单细胞转录组和T细胞受体谱分析，揭示了轻度和重度病例之间的细胞比例和基因表达谱的显著差异 | 研究样本主要来自日本的COVID-19患者，可能限制了结果的普遍性 | 深入理解COVID-19患者的免疫景观和反应多样性，为个性化临床治疗策略提供依据 | COVID-19患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析，T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞数据 | 多个COVID-19患者的外周血单个核细胞样本 |
| 19043 | 2024-08-08 |
Correction: Construction of transcriptome atlas of white yak hair follicle during anagen and catagen using single-cell RNA sequencing
2023-Feb-02, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09127-5
PMID:36732700
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19044 | 2024-08-05 |
Intestinal fibrosis in aganglionic segment of Hirschsprung's disease revealed by single-cell RNA sequencing
2023-02, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1193
PMID:36738110
|
研究论文 | 这项研究揭示了无神经节段Hirschsprung病中的肠道纤维化及相关调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序识别Hirschsprung病无神经节段中的肠道纤维化及其调节因子 | 本研究的样本数量相对较小，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨Hirschsprung病无神经节段的肠道纤维化及其细胞调节机制 | 8个Hirschsprung病的无神经节段和5个正常节段，以及7个健康供体的26个健康节段 | 数字病理学 | Hirschsprung病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共研究了7个Hirschsprung病患者和7个健康供体的样本 |
| 19045 | 2024-08-05 |
Combining single-cell transcriptomics and CellTagging to identify differentiation trajectories of human adipose-derived mesenchymal stem cells
2023-02-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03237-3
PMID:36721241
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学和CellTagging技术，识别了人脂肪来源间充质干细胞的分化轨迹 | 创新性地运用单细胞转录组与CellTagging方法，追踪细胞的分化过程和克隆历史 | 研究中未确定所有与成骨分化相关的基因 | 探索人脂肪来源间充质干细胞的细胞异质性及其分化潜力 | 人脂肪来源间充质干细胞（hADSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序，CellTagging | NA | RNA测序数据 | NA |
| 19046 | 2024-08-05 |
Central lung gene expression associates with myofibroblast features in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-02, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2022-001391
PMID:36725082
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研究论文 | 本文探讨了特发性肺纤维化中，中心肺组织的基因表达与肌成纤维细胞特征之间的关系 | 通过RNA测序揭示了中心IPF肺组织中的独特基因表达特征，并与疾病进展相关联 | 本研究未阐明所观察到的基因表达变化的具体机制 | 旨在确定特发性肺纤维化中心和外周肺组织中细胞类型间的关系 | 特发性肺纤维化中心和外周的肺组织样本 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了成对的特发性肺纤维化中心和外周肺组织样本以及非特发性肺组织 |
| 19047 | 2024-08-05 |
Tumor stemness score to estimate epithelial-to-mesenchymal transition (EMT) and cancer stem cells (CSCs) characterization and to predict the prognosis and immunotherapy response in bladder urothelial carcinoma
2023-02-01, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03239-1
PMID:36721217
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研究论文 | 该研究通过肿瘤干性评分来评估膀胱尿路癌中的上皮-间充质转化和癌症干细胞特征，并预测预后和免疫治疗反应 | 建立了一个肿瘤干性评分系统，通过分析不同的EMT过程和CSC特征，提供了肿瘤侵袭和转移机制的更好理解 | NA | 研究膀胱尿路癌中肿瘤干性、EMT及其与免疫治疗反应的关系 | 膀胱尿路癌患者的肿瘤样本及细胞系 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，实时定量PCR，RNA-seq | NA | 细胞样本和基因表达数据 | 3846 BLCA细胞，6个细胞系，1627 BLCA样本，以及来自32种其他类型肿瘤的9858个样本 |
| 19048 | 2024-08-08 |
Additive efficacy of a bispecific anti-TNF/IL-6 nanobody compound in translational models of rheumatoid arthritis
2023-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abq4419
PMID:36724239
|
研究论文 | 研究双特异性抗TNF/IL-6纳米抗体化合物在类风湿性关节炎转化模型中的加性疗效 | 开发了一种双特异性抗TNF/IL-6纳米抗体化合物，显示出比单特异性治疗更好的疗效 | NA | 探讨同时抑制TNF和IL-6是否能提高治疗类风湿性关节炎的疗效 | 类风湿性关节炎患者和胶原诱导性关节炎小鼠模型 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自类风湿性关节炎患者的成纤维样滑膜细胞和T细胞 |
| 19049 | 2024-08-08 |
VSELs and OSCs together sustain oogenesis in adult ovaries and their dysfunction results in age-related senescence, PCOS, POI and cancer
2023-Feb-01, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-022-01093-y
PMID:36726163
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研究论文 | 本文通过重新分析单细胞RNA测序数据，成功检测到卵巢干细胞（OSCs）和减数分裂标记，支持成年人类卵巢中的新卵子发生。同时，详细研究了卵巢表面上皮细胞（OSE）涂片，揭示了VSELs/OSCs在生理条件下的新功能。 | 本文首次通过先进的软件重新分析单细胞RNA测序数据，成功检测到卵巢干细胞（OSCs）和减数分裂标记，支持成年人类卵巢中的新卵子发生。此外，详细研究了VSELs/OSCs在生理条件下的功能，揭示了其在卵巢功能维持中的重要作用。 | 本文对VSELs的生物学相关性及其与OSCs的关系仍持批评态度，需要进一步的研究来证实这些发现。 | 研究卵巢干细胞（VSELs和OSCs）在成年卵巢中的功能及其在卵巢疾病中的作用。 | 卵巢干细胞（VSELs和OSCs）及其在成年卵巢中的功能。 | 数字病理学 | 卵巢疾病 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 小鼠和人类卵巢样本 |
| 19050 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling of degraded and challenging fresh frozen samples
2023-01-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36071-5
PMID:36720873
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研究论文 | 本文介绍了RNA-Rescue空间转录组学（RRST），旨在改善低至中等RNA质量的新鲜冷冻样本中的mRNA回收。 | 提出了一种新的工作流程RRST，提高了从新鲜冷冻标本中回收mRNA的能力，适用于RNA质量较低的样本。 | 研究仅对五种特定组织类型进行了测试，可能限制了其广泛应用。 | 研究旨在提高新鲜冷冻样本中mRNA的回收率并提供有效的空间转录组学分析。 | 本研究对象包括来自不同组织类型的52个组织切片，涉及人类及小鼠样本。 | 数字病理学 | 肺癌、肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | 共分析52个组织切片 |
| 19051 | 2024-08-05 |
Multi-omics analyses of CD276 in pan-cancer reveals its clinical prognostic value in glioblastoma and other major cancer types
2023-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-10575-1
PMID:36717836
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研究论文 | 本研究分析了CD276在不同癌症中的表达模式和临床意义，尤其是在脑胶质瘤中的预后价值 | 本研究通过单细胞测序和生物信息学方法系统性分析了CD276的临床预后价值和其在多种癌症中的作用 | 目前针对CD276在癌症中的作用的系统研究较少，需更多的验证和深入探讨 | 评估CD276在脑胶质瘤及其他主要癌症类型中的临床预后价值 | 研究对象为CD276在不同类型癌症（包括脑胶质瘤）中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | 生物信息学数据 | 利用LinkedOmics数据库和RT-qPCR分析不同类型癌症中的CD276表达模式 |
| 19052 | 2024-08-05 |
Dynamic single-cell RNA-seq analysis reveals distinct tumor program associated with microenvironmental remodeling and drug sensitivity in multiple myeloma
2023-Jan-30, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00971-2
PMID:36717896
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了多发性骨髓瘤中肿瘤程序与微环境重塑及药物敏感性的关系 | 本研究揭示了肿瘤细胞免疫反应程序与免疫抑制表型之间的联系，提供了关于多发性骨髓瘤药物敏感性的新的见解 | 样本量较小，仅包含10名多发性骨髓瘤患者和3名健康对照者 | 研究多发性骨髓瘤中药物敏感性及临床结果的分子机制 | 针对10名多发性骨髓瘤患者及3名健康志愿者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10名多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者 |
| 19053 | 2024-08-08 |
Inhibition of 2-arachidonoylglycerol degradation enhances glial immunity by single-cell transcriptomic analysis
2023-Jan-30, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02701-4
PMID:36717883
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析，研究了抑制2-花生四烯酰甘油（2-AG）降解对胶质细胞免疫的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了细胞类型特异性MAGL敲除小鼠大脑中免疫相关基因和其他基本细胞途径的差异表达 | 文章未明确提及研究的局限性 | 探究抑制2-AG代谢在神经退行性疾病中的抗炎和神经保护作用的分子机制 | 海马和皮质细胞，MAGL敲除小鼠 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 细胞类型特异性MAGL敲除小鼠的海马和皮质细胞 |
| 19054 | 2024-08-08 |
Determinants of renin cell differentiation: a single cell epi-transcriptomics approach
2023-Jan-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524595
PMID:36711565
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研究论文 | 本文通过单细胞表观转录组学方法，研究了FoxD1+前体细胞向肾素细胞分化的分子机制 | 首次提供了肾素细胞分化为肾小球旁细胞（JG细胞）的发育轨迹，并强调了对其阶段特异性分化重要的新因子 | NA | 全面评估驱动FoxD1+前体细胞向肾脏血管细胞分化的染色质状态和转录因子 | FoxD1+前体细胞及其后代细胞，特别是肾素细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 胚胎第12天（1234个细胞），胚胎第18天（3696个细胞），出生后第5天（1986个细胞），出生后第30天（1196个细胞） |
| 19055 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals unique gene expression changes in different brain regions after sleep deprivation
2023-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524406
PMID:36712009
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研究论文 | 这篇文章探讨了睡眠剥夺对不同脑区基因表达变化的影响 | 文章创新性地应用空间转录组学技术，揭示了不同脑区在睡眠剥夺后的基因表达差异 | 研究可能未考虑其他可能影响基因表达的因素，如环境因素或个体差异 | 研究睡眠剥夺对大脑不同区域基因表达的影响 | 研究对象包括小鼠大脑的不同区域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同脑区的组织切片样本 |
| 19056 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-Jan-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523481
PMID:36712023
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研究论文 | 这篇文章探讨了在先进的肝细胞癌患者中，新辅助cabozantinib和nivolumab的空间转录组学分析 | 该研究揭示了肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞和癌相关成纤维细胞的丰富程度，以及独特的分子和细胞特征，提供了增强系统治疗反应的新靶点 | 研究只涉及了15名患者，样本量较小，且只有5名患者表现出病理反应 | 研究现代系统治疗在肝细胞癌中的反应机制 | 在临床试验中接受新辅助cabozantinib和nivolumab治疗的肝细胞癌患者的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 肿瘤样本 | 15名肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 |
| 19057 | 2024-08-05 |
Deconfounded Dimension Reduction via Partial Embeddings
2023-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.10.523448
PMID:36711940
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研究论文 | 本文介绍了一种名为部分嵌入（PARE）的框架，可以从基于距离的降维方法中去除混杂因素 | 提出的PARE框架允许对任何降维方法进行混杂因素的去除，扩展了现有降维工具的应用范围 | 具体的限制在摘要中没有明显提及 | 研究旨在提高降维技术在生物模式识别中的效果，减少混杂因素的影响 | 研究对象包括基因组和神经影像数据 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 高维数据 | 单细胞测序数据和神经影像测量数据 |
| 19058 | 2024-08-08 |
Persistence of foetal testicular features in patients with defective androgen signalling
2023-Jan-10, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvad007
PMID:36721956
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研究论文 | 研究探讨了46,XY个体中由于雄激素信号缺陷导致的性腺组织发育异常，特别是在完全雄激素不敏感综合征（CAIS）患者中的表现 | 发现CAIS患者的性腺组织中HSD17B3在Sertoli细胞中表达，而在Leydig细胞中不表达，这一模式与典型成人睾丸不同，更类似于胎儿期小鼠睾丸 | 研究样本量较小，仅包括五名46,XY个体，可能影响结果的普遍性 | 探究雄激素信号缺陷对46,XY个体性腺发育的影响 | 46,XY个体中由于雄激素合成或作用缺陷导致的性腺组织发育异常 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织切片 | 包括四名CAIS患者、一名CYP17A1缺乏症患者和一名对照 |
| 19059 | 2024-08-05 |
Gene Expression Changes in Cultured Reactive Rat Astrocyte Models and Comparison to Device-Associated Effects in the Brain
2023-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.06.522870
PMID:36712012
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研究论文 | 研究了对植入微电极阵列反应的反应性星形胶质细胞亚型及其基因表达变化 | 揭示了反应性星形胶质细胞与植入电极之间的基因表达重叠，提供了新型生物标志物的潜在信息 | 未明确指出研究的局限性 | 深入了解反应性星形胶质细胞对植入电极的反应亚型 | 两种反应性星形胶质细胞培养模型及其与大鼠运动皮层设备相关基因表达的比较 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种时间点的24小时、1周和6周大鼠组织样本 |
| 19060 | 2024-08-05 |
Computational workflow and interactive analysis of single-cell expression profiling of islets generated by the Human Pancreas Analysis Program
2023-Jan-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522578
PMID:36711819
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研究论文 | 本文介绍了人类胰腺分析计划生成的胰岛单细胞表达谱的计算工作流程和交互式分析 | 提出了一种新的计算工作流程，用于分析由HPAP生成的人类胰腺高质量单细胞RNA-seq数据集 | 研究依赖于来自已故捐赠者的胰腺组织样本，可能无法全面反映活体胰腺的状况 | 了解糖尿病发生过程中的初始分子扰动，特别是胰岛功能障碍的分子病理机制 | 研究对象为67名人类捐赠者的胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 67名人类捐赠者的258,379个高质量细胞 |