单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 19001 - 19020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 19001 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing: Inhibited Notch2 signalling underlying the increased lens fibre cells differentiation in high myopia
2023-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13412
PMID:36717696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞的转录组图谱，揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系。 | 首次揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系，并验证了NOTCH2在高度近视晶状体上皮细胞中的下调作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 探究高度近视中晶状体纤维细胞分化增加的细胞过程及其涉及的信号通路。 | 高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞。 | 数字病理学 | 高度近视 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 50,375个单细胞 |
| 19002 | 2024-08-08 |
Colony-stimulating factor 1 positive (CSF1+ ) secretory epithelial cells induce excessive trophoblast invasion in tubal pregnancy rupture
2023-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13408
PMID:36721079
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析输卵管-滋养层界面，探讨了输卵管异位妊娠破裂的机制 | 首次揭示了CSF1+分泌上皮细胞在输卵管异位妊娠破裂中的作用，以及CSF1与CSF1R配对刺激EVT侵袭和巨噬细胞积累的机制 | 研究仅限于单细胞转录组测序分析，未涉及其他可能的细胞间通讯机制 | 探讨输卵管异位妊娠破裂的机制，为早期妊娠中REP的治疗提供新的研究方向和治疗策略 | 输卵管异位妊娠破裂中的细胞谱和细胞间通讯 | NA | 输卵管异位妊娠 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 包括输卵管异位妊娠破裂、流产性输卵管异位妊娠和宫内妊娠患者 |
| 19003 | 2024-08-05 |
Inhibition of phosphoglycerate kinase 1 attenuates autoimmune myocarditis by reprogramming CD4+ T cell metabolism
2023-06-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad029
PMID:36726197
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研究论文 | 该研究揭示了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在CD4+ T细胞代谢中的调节作用以及其对实验性自身免疫性心肌炎的影响 | 研究首次表明PGK1通过调节糖酵解和PDHK1-ROS轴来影响CD4+ T细胞和Th17细胞的分化 | 本研究主要集中在小鼠模型中，临床数据的验证尚不足 | 阐明PGK1在CD4+ T细胞激活和实验性自身免疫性心肌炎中的作用机制 | 该研究对象为BALB/c小鼠及心肌炎患者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 研究涉及BALB/c小鼠和心肌炎患者的CD4+ T细胞 |
| 19004 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic survey of cell diversity and functional changes in yak hearts at different altitude
2023-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202200345
PMID:36739517
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术研究了不同海拔高度下牦牛心脏的细胞多样性和功能变化 | 揭示了牦牛心脏中特定细胞群体在不同海拔的基因表达差异及其适应高原低氧环境的机制 | 研究主要集中在牦牛心脏，缺乏与其他物种的比较分析 | 探索牦牛在不同海拔下心脏细胞的功能变化及其适应机制 | 牦牛心脏中的平滑肌细胞和血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同海拔的牦牛心脏细胞群体，具体样本数量未说明 |
| 19005 | 2024-08-08 |
Single-cell Expression Atlas Reveals Cell Heterogeneity in the Creeping Fat of Crohn's Disease
2023-06-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izac266
PMID:36715181
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在爬行脂肪中发现了一种高表达脂蛋白脂肪酶的特定血管内皮细胞亚群，并鉴定了一种新的与炎症相关且与肠道纤维化相关的成纤维细胞亚群FC3 | NA | 揭示克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病发展中的作用 | 爬行脂肪组织中的细胞组成及其在克罗恩病进展中的潜在机制 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 67,064个细胞来自3对手术切除的爬行脂肪组织及其未受累的肠系膜脂肪组织样本，以及6对肠系膜脂肪组织样本通过免疫荧光验证 |
| 19006 | 2024-08-08 |
Clonal Kinetics and Single-Cell Transcriptional Profiles of T Cells Mobilized to Blood by Acute Exercise
2023-06-01, Medicine and science in sports and exercise
DOI:10.1249/MSS.0000000000003130
PMID:36719647
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研究论文 | 研究急性运动如何影响血液中T细胞的克隆动力学和单细胞转录组特征 | 首次揭示急性运动通过优先动员最主要的克隆群，促进寡克隆T细胞受体谱，并发现这些克隆对已知病毒抗原具有特异性，并显示出细胞毒性、激活和凋亡相关基因的不同表达 | NA | 探究急性运动对T细胞受体谱和转录组变化的影响 | 健康志愿者的外周血单个核细胞 | NA | NA | 深度TCR-β链测序和串联单细胞RNA测序 | NA | DNA和RNA | 健康志愿者完成分级自行车运动实验，采集静息、运动中和运动后1小时的外周血单个核细胞样本 |
| 19007 | 2024-08-05 |
Review of single-cell RNA-seq data clustering for cell-type identification and characterization
2023-05, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078965.121
PMID:36737104
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA-seq数据聚类方法，用于细胞类型的识别和特征化。 | 提供了对现有单细胞RNA-seq数据聚类方法的深入见解和比较，以及聚类方法的优势和局限性。 | 聚类方法的性能可能会受到模拟数据和多种单细胞转录组数据集的限制。 | 探讨和评估单细胞RNA-seq数据聚类方法，以促进细胞类型的识别。 | 现有单细胞RNA-seq数据聚类方法及其相关的处理技术。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个单细胞转录组数据集 |
| 19008 | 2024-08-05 |
Deciphering Adult Neural Stem Cells with Single-Cell Sequencing
2023-05, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2022.0234
PMID:36721381
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综述 | 本文综述了关于成体神经干细胞的最新研究进展，特别是在单细胞分析方面 | 介绍了常规和非常规神经干细胞的单细胞分析的异质性和转录改变 | 未提供具体的实验数据和样本分析 | 全面理解成体神经干细胞在生理和病理状态下的作用 | 成体神经干细胞及其在衰老和脑肿瘤中的转录改变 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 19009 | 2024-08-08 |
Endothelial hyperactivation of mutant MAP3K3 induces cerebral cavernous malformation enhanced by PIK3CA GOF mutation
2023-05, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09866-9
PMID:36719480
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序和液滴数字聚合酶链反应分析了散发性脑洞畸形患者的病变和匹配血液，发现MAP3K3和PIK3CA突变在病变中的共存及其对血管异常的影响。 | 首次揭示了MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制，并通过动物模型验证了这些突变对病变形成和维持的影响。 | 研究主要集中在动物模型和体外实验，需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨MAP3K3和PIK3CA突变在脑洞畸形中的分子机制及其对病变的影响。 | 散发性脑洞畸形患者的病变组织和匹配血液，以及小鼠模型。 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 全外显子测序，液滴数字聚合酶链反应，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列，RNA | 94例散发性脑洞畸形患者，小鼠模型 |
| 19010 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of solid pseudopapillary neoplasms of the pancreas in children
2023-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15744
PMID:36721980
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究儿童胰腺实性假乳头状瘤（SPN）的细胞类型和起源 | 首次描述了SPN内部的异质性，并提出了Wnt/β-catenin途径和上皮间质转化在肿瘤发生和复发中的作用 | NA | 全面揭示儿童胰腺实性假乳头状瘤的特征和发病机制 | 儿童胰腺实性假乳头状瘤的细胞类型和起源 | 数字病理学 | 胰腺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用手术标本进行研究 |
| 19011 | 2024-08-08 |
scRNA-seq data analysis method to improve analysis performance
2023-May, IET nanobiotechnology
IF:3.8Q3
DOI:10.1049/nbt2.12115
PMID:36727937
|
综述 | 本文综述了当前常用的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析方法及其上游处理流程 | NA | NA | 探讨和评估单细胞RNA测序数据分析工具及其性能 | 单细胞RNA测序数据分析方法和工具 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 19012 | 2024-08-08 |
Cardiovascular utility of single cell RNA-Seq
2023-05-01, Current opinion in cardiology
IF:2.0Q3
DOI:10.1097/HCO.0000000000001014
PMID:36728943
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在心血管疾病诊断、风险分层和提供新型治疗靶点方面的应用潜力 | 单细胞RNA测序技术在心血管领域的应用有助于改善患者预后，并可能扩展到其他高影响临床领域 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在心血管疾病中的应用及未来发展方向 | 心血管疾病 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 19013 | 2024-08-08 |
Shear Stress Markedly Alters the Proteomic Response to Hypoxia in Human Pulmonary Endothelial Cells
2023-05, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0340OC
PMID:36730645
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研究论文 | 研究剪切应力对人类肺微血管内皮细胞在低氧条件下蛋白质组响应的影响 | 首次探讨了低氧与剪切应力对肺微血管内皮细胞表型的交互作用，并发现了60种蛋白质在生理剪切应力条件下对低氧的响应，其中55种蛋白质之前未被认为与低氧肺疾病的发展有关 | 研究仅限于人类肺微血管内皮细胞，未涉及其他类型的细胞或组织 | 探讨低氧和剪切应力对肺微血管内皮细胞蛋白质组响应的交互作用及其在低氧性肺血管疾病发展中的重要性 | 人类肺微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 无偏蛋白质组学 | NA | 蛋白质组数据 | 60种蛋白质 |
| 19014 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Immune Reconstitution in Patients with R/R T-ALL/LBL Treated with Donor-Derived CD7 CAR-T Therapy
2023-04-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-2924
PMID:36735547
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研究论文 | 本研究探讨了CD7 CAR-T治疗后复发/refractory T-ALL/LBL患者的免疫重建情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示CD7 CAR-T治疗后免疫动态和CD7- T细胞的功能特征 | 研究样本量较小，仅涉及7名患者，且随访时间较短 | 评估CD7 CAR-T细胞在复发/refractory T-ALL/LBL患者中的安全性和疗效 | 7名复发/refractory T-ALL/LBL患者 | 数字病理学 | T细胞急性淋巴细胞白血病/淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本, 流式细胞术数据 | 7名复发/refractory T-ALL/LBL患者 |
| 19015 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq analysis of early larval cell-types of the starfish, Patiria pectinifera: Insights into evolution of the chordate body plan
2023-04, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2023.01.009
PMID:36717049
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研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序分析了海星Patiria pectinifera早期幼虫细胞类型，探讨了脊椎动物身体结构的演化。 | 针对海星胚胎发育的基因表达特征进行了分类，并将其与脊椎动物胚胎的同源基因表达进行比较，提出了脊椎动物体型从后口动物祖先演化的理论。 | 该研究主要集中在一种海星物种，可能无法代表所有海星或其他相关类群的情况。 | 研究海星胚胎发育的细胞类型及其与脊椎动物身体计划演化的关系。 | 针对海星Patiria pectinifera的原肠胚和双鳍幼虫进行的研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了来自原肠胚和双鳍幼虫的多个细胞，构成22个细胞簇 |
| 19016 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics-based multidisease analysis revealing the molecular dynamics of retinal neurovascular units under inflammatory and hypoxic conditions
2023-04, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2023.114345
PMID:36736650
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据构建了炎症和缺氧条件下视网膜神经血管单位的图谱 | 首次在单细胞水平上对视网膜神经血管单位的疾病广泛病因进行了联合分析 | 缺乏对其他类型的视网膜疾病的详细探讨 | 探索视网膜神经血管单位在各种疾病中的分子动态 | 以AireKO和NdpKO小鼠的视网膜为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变、青光眼、早产儿视网膜病 | 单细胞转录组 | NA | NA | 野生型、AireKO和NdpKO小鼠的视网膜样本 |
| 19017 | 2024-08-08 |
CCR4+ CD8+ T cells clonally expand to differentiated effectors in murine psoriasis and in human psoriatic arthritis
2023-04, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149702
PMID:36722608
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研究论文 | 研究通过建立小鼠和人类的银屑病及银屑病关节炎模型，探讨了CCR4+ CD8+ T细胞的克隆扩增及其在疾病中的作用 | 首次在银屑病和银屑病关节炎模型中观察到CCR4+ CD8+ T细胞的克隆扩增，并发现这些细胞在循环和滑液中的扩增与自身反应性T细胞的生成和扩散有关 | NA | 探究银屑病和银屑病关节炎中自身反应性T细胞的机制 | CCR4+ CD8+ T细胞在银屑病和银屑病关节炎中的克隆扩增及其作用 | NA | 银屑病，银屑病关节炎 | scRNA-seq，TCR sequencing | NA | 细胞数据 | 使用K5-mOVA.tg C57BL/6小鼠模型和银屑病关节炎患者的样本 |
| 19018 | 2024-08-05 |
SMURF: embedding single-cell RNA-seq data with matrix factorization preserving self-consistency
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad026
PMID:36715274
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研究论文 | 该文章提出了一种名为SMURF的工具，用于从单细胞RNA测序数据中提取低维嵌入。 | SMURF利用矩阵分解和混合的Poisson-Gamma发散作为目标，保持自我一致性，而不是传统的插补方法。 | 该文章没有明确指出局限性 | 研究单细胞RNA测序数据的细胞特异性转录组学，旨在改善细胞嵌入的发现效果。 | 该研究对象为细胞和基因的低维嵌入。 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq | NA | 细胞数据 | 涉及多个模拟和八个网络实验室的scRNA数据集，无具体样本数量 |
| 19019 | 2024-08-05 |
Denoising adaptive deep clustering with self-attention mechanism on single-cell sequencing data
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad021
PMID:36715275
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研究论文 | 本文提出了一种新的自适应模糊聚类模型，旨在利用去噪自编码器和自注意力机制分析单细胞RNA测序数据 | 文章创新性地引入了联合学习和自适应反馈机制，提高了聚类精度和稳定性 | 实验只在16个真实的scRNA-seq数据集上进行了验证，可能缺乏对其他类型数据的普适性 | 研究旨在提高单细胞RNA测序样本的聚类分析能力 | 研究对象为单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 去噪自编码器 | 自适应模糊聚类模型 | RNA测序数据 | 16个真实scRNA-seq数据集 |
| 19020 | 2024-08-05 |
scGGAN: single-cell RNA-seq imputation by graph-based generative adversarial network
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad040
PMID:36733262
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研究论文 | 本文提出了一种新的模型scGGAN，通过图卷积网络和生成对抗网络对单细胞RNA测序数据进行插补 | 创新之处在于考虑了基因之间的内在关系，并结合图卷积网络和生成对抗网络来处理scRNA-seq数据插补 | 未提到具体的实验限制 | 研究目标是提高单细胞RNA测序数据的插补质量 | 研究对象为单细胞RNA测序数据及其相关的基因序列数据 | 机器学习 | NA | 生成对抗网络（GAN） | 图卷积网络（GCN） | 单细胞RNA测序数据 | 模拟和真实的scRNA-seq数据集 |