单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27703 篇文献，本页显示第 18981 - 19000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18981 | 2024-08-08 |
The Hidradenitis Suppurativa 'Omics Database (HS-OmicsDB)
2023-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.26.524600
PMID:36747861
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研究论文 | 本文介绍了Hidradenitis Suppurativa（HS）的'Omics数据库（HS-OmicsDB），旨在聚合公开可用的'Omics数据以增强HS研究 | 首次为Hidradenitis Suppurativa（HS）建立了一个纵向的'Omics数据库，包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 | NA | 增强Hidradenitis Suppurativa（HS）的研究 | Hidradenitis Suppurativa（HS）患者的'Omics数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括未治疗HS患者的批量和单细胞RNA测序数据 |
| 18982 | 2024-08-08 |
Investigating the Complexity of Gene Co-expression Estimation for Single-cell Data
2023-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.24.525447
PMID:36747724
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研究论文 | 本研究测试了现有的基因共表达估计方法在具有已知真实共表达网络的模拟数据集上的表现 | 通过使用从实验数据中学习的参数生成新的模拟数据集，这些模拟更好地捕捉了真实世界单细胞数据集的潜在属性 | 所有方法在模拟和实验数据集上的估计结果显示出高假发现率，可能是由于数据中的高稀疏性水平 | 深入测试现有基因共表达估计方法在单细胞数据上的表现 | 基因共表达估计方法在单细胞RNA测序数据上的性能 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因共表达网络 | 数十个模拟数据集和八个实验数据集 |
| 18983 | 2024-08-05 |
Systemically Identifying Triple-Negative Breast Cancer Subtype-Specific Prognosis Signatures, Based on Single-Cell RNA-Seq Data
2023-01-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12030367
PMID:36766710
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研究论文 | 本研究提出了一种单细胞RNA测序基础的生物信息学方法来识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物。 | 通过单细胞RNA-seq数据识别三阴性乳腺癌亚型相关的生物标志物，以克服传统RNA-seq的局限性。 | 研究主要依赖于生物信息学分析，可能缺乏临床验证。 | 识别三阴性乳腺癌亚型特异性预后标志物，以改善治疗效果。 | 关注三阴性乳腺癌的不同分子亚型及其相关预后标志物。 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 在四个独立验证数据集中进行确认，具体样本数量未提及 |
| 18984 | 2024-08-05 |
Actin-like Protein 6A Expression Correlates with Cancer Stem Cell-like Features and Poor Prognosis in Ovarian Cancer
2023-Jan-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24032016
PMID:36768349
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研究论文 | 本研究探讨了Actin-like Protein 6A在卵巢癌中的表达与癌症干细胞特征的关系及其对预后的影响 | 发现ACTL6A的高表达与卵巢癌患者的不良预后相关，并且可以作为预测耐药、转移和预后的生物标志物 | 未提及具体的临床试验数据以支持结果 | 探索与卵巢癌发展相关的遗传标记的机制和临床价值 | 分析来自多个数据库的与卵巢癌相关的差异表达基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用GSE185833和GSE176246数据集 |
| 18985 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Analysis Reveals a Cell Atlas and Cell Communication in Yak Ovary
2023-Jan-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24031839
PMID:36768166
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研究论文 | 本文揭示了牦牛卵巢的细胞图谱和细胞间通信 | 首次利用单细胞RNA测序构建了牦牛卵巢的细胞图谱，识别出不同细胞类型及其特定分子标记 | 研究中未提及样本规模及其对结果的可能影响 | 阐明牦牛在高海拔环境中的生殖适应机制 | 牦牛卵巢中的不同细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 18986 | 2024-08-08 |
Spatial Transcriptome Profiling of Mouse Hippocampal Single Cell Microzone in Parkinson's Disease
2023-Jan-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24031810
PMID:36768134
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研究论文 | 本研究分析了帕金森病中不同空间位置的小鼠海马体单细胞的基因表达特征，并探讨了基因表达调控对学习和记忆机制的影响 | 首次揭示了帕金森病中海马体空间定位细胞的转录组图谱和异质性，并证明了PD受损的学习和记忆能力受到CA1和CA3亚区神经元基因协同效应的影响 | NA | 分析小鼠海马体不同空间位置的单细胞基因表达特征，并探讨基因表达调控对学习和记忆机制的影响 | 小鼠海马体不同空间位置的单细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序和空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 74个单细胞样本 |
| 18987 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomics: advances and applications
2023-Jan, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000141
PMID:36742187
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review | 这篇文章总结并比较了空间转录组学的主要方法 | 文章强调了空间转录组学的技术进步及其在生物研究和临床中的潜在应用 | NA | 本研究旨在提高对生物过程和疾病的理解 | 主要涉及神经科学、癌症生物学、发育生物学和血液学的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18988 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics reveals age-associated immune landscape of glioblastoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1028775
PMID:36761752
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研究论文 | 本研究揭示了与年龄相关的胶质母细胞瘤的免疫景观。 | 开发了一种基于机器学习的方法，整合公共单细胞RNA测序数据集，建立了胶质母细胞瘤中免疫细胞的综合图谱。 | 年龄相关的免疫异质性和预后在胶质母细胞瘤中仍然没有得到充分研究。 | 探讨胶质母细胞瘤与年龄相关的免疫微环境之间的关系。 | 包括不同年龄段的胶质母细胞瘤患者的免疫细胞及其对预后的影响。 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 18989 | 2024-08-05 |
Comprehensive Bioinformatics Analysis Reveals PTPN1 (PTP1B) Is a Promising Immunotherapy Target Associated with T Cell Function for Liver Cancer
2023, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2023/1533794
PMID:36741874
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研究论文 | 本研究探讨了PTPN1（PTP1B）在肝癌中的免疫学相关性和功能 | 识别PTPN1作为一种新的免疫检查点，并揭示其在肝癌中的免疫调节作用 | 对PTPN1在肝癌中作为免疫调节因子的影响的研究有限 | 研究PTPN1在肝癌中的免疫相关功能与临床预后 | 使用TCGA和ICGC数据库的肝癌患者表达谱和临床信息 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq | Cox回归分析 | 基于基因表达的数据 | 使用TCGA和ICGC数据库以及GEO数据库中的多个样本数据 |
| 18990 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals melanocytes may promote inflammation in chronic wounds through cathepsin G
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1072995
PMID:36755572
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素细胞可能通过猫啉G促进慢性创伤中的炎症 | 首次发现黑色素细胞能够合成并分泌猫啉G，并且这一过程可能促进慢性创伤中的炎症 | 尚未明确黑色素细胞与慢性创伤中其他细胞相互作用的具体机制 | 提供慢性创伤愈合过程中的新见解 | 研究慢性创伤愈合中的表皮细胞间相互作用变化 | 数字病理学 | 慢性创伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 18991 | 2024-08-08 |
Combination of single-cell and bulk RNA seq reveals the immune infiltration landscape and targeted therapeutic drugs in spinal cord injury
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1068359
PMID:36742334
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后免疫浸润景观及靶向治疗药物 | 首次通过结合单细胞和批量RNA测序技术，识别了脊髓损伤亚急性期的免疫枢纽基因和靶向治疗药物 | NA | 旨在识别脊髓损伤亚急性期的免疫枢纽基因和靶向治疗药物，以促进神经再生 | 脊髓损伤后的免疫微环境，特别是巨噬细胞/小胶质细胞的作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的批量RNA测序数据集（GSE5296和GSE47681）和单细胞RNA测序数据集（GSE189070），以及T9脊髓损伤小鼠模型进行体内实验 |
| 18992 | 2024-08-08 |
Oxidative Stress Response Biomarkers of Ovarian Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/1261039
PMID:36743693
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量RNA测序数据，探索卵巢癌中氧化应激反应相关的生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术结合批量RNA测序数据，构建了一个与氧化应激反应相关的风险评分模型，用于预测卵巢癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究仅使用了公开数据库中的数据，未涉及临床样本的验证 | 探索卵巢癌中氧化应激反应相关的生物标志物，以预测患者的预后和免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的氧化应激反应相关生物标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据来自GSE146026，批量RNA测序数据来自TCGA和GTEx数据库 |
| 18993 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the COL11A1+ fibroblasts are cancer-specific fibroblasts that promote tumor progression
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1121586
PMID:36744260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，发现并命名了一种肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs），这些细胞在肿瘤组织中特异性存在，并可能通过调节细胞外基质重塑和抗肿瘤免疫反应促进肿瘤进展。 | 首次发现并命名了COL11A1+成纤维细胞为肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs），并揭示了其功能和特异性膜标记物。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和免疫组化染色，未来需更多临床试验验证CSFs作为治疗靶点的有效性。 | 旨在识别促进肿瘤进展的成纤维细胞群，阐明其功能并确定其特异性膜标记物，以实现精准靶向治疗。 | 肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs）及其在肿瘤进展中的作用。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤和邻近正常组织的单细胞RNA测序数据集 |
| 18994 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis Reveals Distinct Immunological and Prognostic Characteristics of CD276/B7-H3 in Pan-Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S395553
PMID:36756390
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研究论文 | 本文通过公共数据库和临床组织标本探讨并验证了CD276在多种肿瘤中的mRNA和蛋白表达水平，评估了其在肿瘤免疫学和预后中的作用。 | 首次进行了关于CD276在肿瘤免疫学和预后方面的系统性全面泛癌分析。 | NA | 探讨CD276在肿瘤免疫学和预后中的作用及其生物学功能和相关通路。 | CD276在多种肿瘤中的表达及其与临床特征、免疫特征的关系。 | 数字病理学 | NA | 单变量Cox回归分析、Kaplan-Meier分析、GSEA、CCK-8实验 | NA | mRNA、蛋白、scRNA-seq数据 | 多个肿瘤队列来自TCGA数据库及临床组织标本 |
| 18995 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1108743
PMID:36760364
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18996 | 2024-08-08 |
Hallmarks of crustacean immune hemocytes at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1121528
PMID:36761772
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对虾和龙虾这两种代表性甲壳类动物的免疫血细胞异质性进行了表征，并首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 由于形态学分类的限制，无脊椎动物免疫血细胞的类型尚未分类 | 确定甲壳类动物的免疫血细胞类型 | 虾和龙虾的免疫血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 虾和龙虾分别包含11和12种类型的血细胞 |
| 18997 | 2024-08-08 |
Phenotypic plasticity of malignant T cells in blood and skin of a Sézary syndrome patient revealed by single cell transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1090592
PMID:36761972
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，研究了塞扎里综合征患者血液和皮肤中恶性T细胞的表型可塑性。 | 首次在单细胞水平上比较了塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中恶性T细胞的转录组，揭示了这些细胞在不同微环境中的功能异质性。 | 研究仅基于单一患者的样本，可能限制了结果的普遍性。 | 比较塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中单细胞的转录组，以揭示恶性T细胞的表型可塑性。 | 塞扎里综合征患者的血液和皮肤样本中的恶性T细胞。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一患者 |
| 18998 | 2024-08-08 |
Mapping the tumor microenvironment in bladder cancer and exploring the prognostic genes by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1105026
PMID:36741702
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研究论文 | 本研究使用10X单细胞RNA测序技术分析了七份膀胱肿瘤组织及其对应的正常组织，构建了膀胱癌肿瘤微环境图谱，并探索了与预后相关的关键基因 | 首次构建了膀胱癌的完整肿瘤微环境图谱，并细分了膀胱癌上皮细胞的14个亚群，揭示了高度的肿瘤内异质性 | NA | 探索膀胱癌肿瘤微环境并识别与预后相关的关键基因 | 膀胱癌肿瘤组织及其对应的正常组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 10X单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七份膀胱肿瘤组织（三份非肌肉侵袭性膀胱癌和四份肌肉侵袭性膀胱癌）及七份对应的正常组织 |
| 18999 | 2024-08-08 |
Deconvolution of Focal Segmental Glomerulosclerosis Pathophysiology Using Transcriptomics Techniques
2021-Oct, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000518404
PMID:36751384
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研究论文 | 本文利用转录组学技术对局灶节段性肾小球硬化症的病理生理进行了解卷积分析 | 文章介绍了新的转录组学技术，如下一代测序技术，包括RNA测序和单细胞转录组学，这些技术有助于发现新的临床应用生物标志物 | NA | 旨在通过转录组学技术识别可应用于临床实践的基因表达生物标志物 | 局灶节段性肾小球硬化症患者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型患者队列 |
| 19000 | 2024-08-05 |
Defining the cellular complexity of the zebrafish bipotential gonad
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524593
PMID:36712047
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研究论文 | 研究揭示了斑马鱼双潜性生殖腺发育过程中的细胞复杂性和相互作用 | 首次通过转基因报告和单细胞测序分析明确不同关键细胞类型到达斑马鱼生殖腺的时间 | 研究仅限于斑马鱼，可能不适用于其他物种的生殖腺发育研究 | 阐明早期双潜性生殖腺发育中的基本步骤和细胞类型 | 斑马鱼的双潜性生殖腺及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 215个唯一表达的基因 |