单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1881 - 1900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2025-09-06 |
Applications and prospects of spatial transcriptomics in prostate cancer research: A narrative review
2025-Sep, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000288
PMID:40894285
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在前列腺癌研究中的应用与前景，重点探讨其在肿瘤微环境、异质性和临床意义方面的价值 | 系统总结了空间转录组学在前列腺癌这一相对研究较少领域的应用潜力，并提出了未来研究方向 | 现有研究仍较为有限，需要更多实证数据支持 | 概述空间转录组学技术原理及其在前列腺癌研究中的应用现状和发展前景 | 前列腺癌肿瘤组织 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1882 | 2025-09-06 |
PDPN+ cancer-associated fibroblasts correlate with the neoadjuvant immunotherapy response in gastric cancer
2025-Sep, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250475
PMID:40895767
|
研究论文 | 本研究探讨PDPN+癌症相关成纤维细胞（CAFs）与胃癌新辅助免疫治疗反应的相关性 | 首次鉴定PDPN作为CAFs亚群的标志物，并验证其与免疫治疗疗效的负相关性 | 样本来源限于特定临床试验和公共数据库，需进一步扩大验证 | 预测胃癌患者对新辅助免疫治疗的反应 | 胃癌患者组织样本和类器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, Western blot, 多重免疫组化/免疫荧光 | GC-PDOs（胃癌患者来源类器官） | 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 | 多个公共数据库（TCGA-STAD等）及临床试验NCT04208347的胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1883 | 2025-09-06 |
The Pdgfd-Pdgfrb axis orchestrates tumor-nerve crosstalk in pancreatic cancer
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672505
PMID:40909696
|
研究论文 | 本研究揭示了Pdgfd-Pdgfrb信号轴在胰腺癌中介导肿瘤-神经交互作用并促进神经周围侵袭的机制 | 首次发现Pdgfd信号通过协调癌细胞、神经元和胶质细胞的多方面相互作用促进神经侵袭，并证明该轴可作为治疗靶点 | NA | 探究胰腺导管腺癌中肿瘤-神经相互作用的分子机制及其对神经周围侵袭的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的肿瘤细胞、神经及胶质细胞 | 肿瘤微环境研究 | 胰腺癌 | 全转录组测序、单细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1884 | 2025-09-06 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-Aug-30, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢异常 | 首次结合转录组、蛋白质组和空间代谢组学动态追踪AD模型星形胶质细胞代谢变化，并验证人类早期AD样本的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证需进一步扩展 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞的分子动态变化 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞，以及人类脑组织样本 | 多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物空间分布数据 | 5个时间点（2/4/6/9/12月龄）的小鼠模型，人类早期AD与对照脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1885 | 2025-09-06 |
Cross-species analysis identifies genotype-driven vulnerabilities in lung adenocarcinoma
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.24.671070
PMID:40909610
|
研究论文 | 通过跨物种单细胞分析揭示肺腺癌基因型驱动的肿瘤微环境特征和代谢依赖性 | 首次通过人鼠跨物种保守性分析揭示致癌基因突变对肿瘤微环境的特异性免疫印记 | 样本量有限（57例人类和18例小鼠样本），需进一步验证 | 解析肺腺癌主要基因突变亚型对肿瘤细胞和微环境的特异性影响 | 人类和小鼠肺腺癌样本 | 计算生物学 | 肺腺癌 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | 跨物种比较分析 | 单细胞转录组数据 | 57例人类样本和18例小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1886 | 2025-09-06 |
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2025-Aug-27, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据，识别儿童急性淋巴细胞白血病中关键的B细胞亚群和相关分子作为生物标志物 | 首次应用单细胞RNA测序技术结合多组学分析构建儿童急性白血病的预后风险模型并探索其免疫调控机制 | 样本量较小（仅2例患者和3例健康对照），需要更大规模验证 | 探究儿童急性淋巴细胞白血病的预后生物标志物和免疫特征 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者和健康儿童骨髓样本 | 生物信息学 | 儿童急性白血病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 功能富集分析, 伪时间轨迹分析, 细胞通讯分析 | Cox回归, LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 2例预B细胞高倍体ALL患者, 3例健康儿童骨髓样本, 511例cALL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1887 | 2025-09-06 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
|
研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测细胞在不同环境变化下的转录组响应 | 首次将扩散模型应用于跨细胞类型的转录组变化预测，支持连续去噪和语义特征整合以捕捉瞬态细胞状态 | 未明确说明模型在处理极端罕见细胞类型或超高维数据时的局限性 | 预测细胞在环境刺激（如放疗、药物处理）下的转录组动态变化，加速疾病机制研究和药物发现 | 多种细胞类型（包括血管类器官）对环境刺激的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序，扩散模型 | 扩散模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及细胞分化、基因扰动和药物响应等多场景数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1888 | 2025-09-06 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Reveals Fibroblast and Neuroimmune Microenvironments in Endometriosis Lesions
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671344
PMID:40909522
|
研究论文 | 本研究通过高分辨率空间转录组学揭示了子宫内膜异位症病灶中的成纤维细胞和神经免疫微环境 | 首次建立人类卵巢和腹膜病灶的精确空间转录组图谱，发现跨病灶类型的共享空间特征并验证上皮-神经元相互作用组 | NA | 探究子宫内膜异位症疼痛症状和疾病进展的机制 | 人类卵巢和腹膜子宫内膜异位症病灶 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学，3D共培养模型 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1889 | 2025-09-06 |
Single-Cell Network Analysis Identifies CLEC4E as a Key Mediator of Proinflammatory mDC Responses in Influenza Infection
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.21.671587
PMID:40909530
|
研究论文 | 本研究通过单细胞网络分析发现CLEC4E是流感感染中促炎性mDC反应的关键介质 | 采用整合单细胞共表达网络方法，首次识别出CLEC4E作为调节病理性炎症反应的上游驱动因子 | NA | 揭示流感感染中特定免疫细胞内的关键分子驱动机制 | 髓样树突状细胞(mDCs)和流感感染模型 | 生物信息学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序，网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 流感感染患者的独立单细胞数据集和小鼠流感模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1890 | 2025-09-06 |
The spleen tyrosine kinase inhibitor entospletinib resolves inflammation to promote repair following acute kidney injury
2025-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189601
PMID:40857403
|
研究论文 | 研究脾酪氨酸激酶抑制剂entospletinib在急性肾损伤后通过缓解炎症促进修复的作用机制 | 首次证明选择性SYK抑制剂entospletinib可靶向白细胞表达的SYK，阻断促炎巨噬细胞活化，从而解决肾炎症并促进修复 | 研究基于小鼠模型，人类临床应用效果尚需进一步验证 | 探索entospletinib在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的治疗潜力及机制 | 小鼠肾脏（单侧肾缺血再灌注损伤模型） | 肾脏病学 | 急性肾损伤与慢性肾病 | 单细胞RNA测序、数字空间分析、活体显微镜、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、影像数据 | 小鼠肾脏样本（14天内动态分析） | NA | NA | NA | NA |
| 1891 | 2025-09-06 |
SCAN-ACT: adoptive T cell therapy target discovery through single-cell transcriptomics
2025-Aug-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01514-9
PMID:40814001
|
研究论文 | 开发SCAN-ACT计算流程，利用单细胞转录组学数据发现和优先排序用于过继性T细胞疗法的靶点 | 提出首个整合单细胞RNA测序和多组学数据的综合性计算流程，支持单特异性CAR-T靶点、双特异性布尔逻辑门控CAR-T靶点对及肽-MHC TCR-T靶点的系统发现 | NA | 加速实体瘤过继性T细胞疗法（ACT）的靶点发现与开发 | 软组织肉瘤（STS）和胶质母细胞瘤的肿瘤相关靶点 | 计算生物学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学数据分析 | 计算流程（pipeline） | 单细胞转录组数据，多组学数据 | 986,749个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1892 | 2025-10-06 |
Paracrine Orchestration of Tumor Microenvironment Remodeling Induced by GLO1 Potentiates Lymph Node Metastasis in Breast Cancer
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500722
PMID:40492378
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境的重塑机制，并发现GLO1在促进淋巴管生成和转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘乳腺癌淋巴结转移的完整生态系统，发现GLO1通过维持GSH和ROS平衡促进转移的新机制 | 样本量相对有限（23名患者的28个淋巴结样本），需要更大规模研究验证 | 探究乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境重塑的分子机制 | 乳腺癌患者的淋巴结样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 23名患者的28个淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1893 | 2025-10-06 |
β-Mangostin Attenuates TET2-Mediated DNA Demethylation of Prkcg in the Prevention of Intervertebral Disc Degeneration
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505077
PMID:40558107
|
研究论文 | 研究β-芒果苷通过调控TET2介导的Prkcg DNA去甲基化来预防椎间盘退变 | 首次揭示β-芒果苷通过TET2-Prkcg轴调控DNA甲基化状态，同时靶向炎症失调和基质稳态的双重作用机制 | 未提及具体样本量和实验模型细节 | 探索β-芒果苷在椎间盘退变治疗中的潜在作用机制 | 椎间盘髓核细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1894 | 2025-10-06 |
Advances in Single-Cell Sequencing for Infectious Diseases: Progress and Perspectives
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415678
PMID:40613694
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在传染病研究中的进展与应用 | 系统总结了真核、原核（如MATQ-seq和BacDrop）及双端（如PatH-Cap）单细胞测序技术的最新进展，揭示了宿主-病原体相互作用的共同机制 | NA | 促进强大诊断或治疗策略的开发，推动精准医学发展 | 传染病中的宿主细胞和病原体 | 生物医学 | 传染病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1895 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies MMP11+ Cancer-Associated Fibroblasts as Drivers of Angiogenesis and Bladder Cancer Progression
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502774
PMID:40552583
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定MMP11+癌症相关成纤维细胞作为膀胱癌血管生成和进展的驱动因素 | 发现新型MMP11 mCAF亚群，揭示其通过WNT5A-MCAM信号轴调控血管生成的新机制 | NA | 探索癌症相关成纤维细胞异质性及其在肿瘤进展中的作用机制 | 膀胱癌组织中的癌症相关成纤维细胞和内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1896 | 2025-10-06 |
Identification of Schwann Cells in Human Intracranial Arteries: Potential Regulatory Role in Atherosclerotic Plaque Progression
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503033
PMID:40574459
|
研究论文 | 本研究通过多模态分析发现人类颅内动脉中存在雪旺细胞，并揭示其在动脉粥样硬化斑块进展中的潜在调控作用 | 首次在人类颅内动脉中鉴定出雪旺细胞，发现斑块血管中雪旺细胞来源的髓鞘显著增加，并揭示SPP1-ITGB1信号通路介导的雪旺细胞-血管平滑肌细胞相互作用 | 样本量有限（16例捐赠者），仅使用尸检样本可能无法完全反映活体状态 | 探究雪旺细胞在颅内动脉粥样硬化病理生物学中的作用 | 人类颅内动脉样本（含斑块和无斑块区域） | 神经血管生物学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，超微结构评估，细胞间通讯分析，配体-受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，超微结构图像数据 | 16例尸检捐赠者的颅内动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1897 | 2025-09-06 |
Progress in the Application of Single-Cell Sequencing in Neoadjuvant Therapy for Esophageal Cancer
2025-Jul, Cureus
DOI:10.7759/cureus.89163
PMID:40895953
|
综述 | 本文探讨单细胞测序技术在食管癌新辅助治疗中的应用进展及其对肿瘤微环境和治疗策略的启示 | 提供了评估新辅助治疗有效性的新视角，并通过单细胞水平分析揭示个体细胞差异 | 未明确提及具体研究限制，但属于技术应用综述而非实证研究 | 推动食管癌新辅助治疗策略的优化和个性化治疗发展 | 食管癌肿瘤微环境及接受新辅助治疗的患者群体 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞测序（sc-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1898 | 2025-10-06 |
Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf063
PMID:40391086
|
研究论文 | 开发了一个名为immunopipe的综合灵活的单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据分析流程 | 提供了首个同时整合分析scRNA-seq和scTCR-seq数据的综合流程，并包含用户友好的网页界面 | NA | 开发单细胞测序数据分析工具以促进对T细胞介导免疫和免疫疗法的理解 | 单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 1899 | 2025-10-06 |
A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655666
PMID:40475598
|
研究论文 | 构建了人类成人肺部的多模态空间和表观基因组图谱 | 整合了snRNA-seq和SNARE-seq2技术，首次在相同细胞核内同时分析染色质可及性和基因表达，并通过MERFISH空间转录组学定位了25种细胞群体 | 仅使用11名健康成年人的样本，样本规模相对有限 | 开发高分辨率肺部疾病易感空间生态位参考图谱 | 人类成人肺部组织 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞核RNA测序, 染色质可及性, 空间转录组, 蛋白质标记 | 49个肺组织块，746,047个细胞核，来自11名健康成年人 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | SNARE-seq2（同时检测染色质可及性和基因表达）, MERFISH（空间转录组学） |
| 1900 | 2025-10-06 |
Adhesion-Related Pathways and Functional Polarization of Astrocytes in Traumatic Brain Injury: Insights from Single-cell RNA Sequencing
2025-04-27, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-025-08858-w
PMID:40287916
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析创伤性脑损伤中星形胶质细胞的功能异质性和粘附相关通路的作用 | 首次系统揭示星形胶质细胞在创伤性脑损伤中的功能极化现象及粘附相关通路的关键调控作用 | 研究仅基于小鼠模型，需要人类样本验证；单细胞测序技术本身存在技术限制 | 探究创伤性脑损伤中星形胶质细胞功能异质性的调控机制 | 创伤性脑损伤小鼠模型的大脑皮层和海马体星形胶质细胞 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA测序数据 | 创伤性脑损伤小鼠模型的大脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |