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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2026-04-01 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics analysis reveals MYCN-UBE2C-TFRC signaling endows ferroptosis resistance in neuroectodermal tumors
2026-Mar-26, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3233-3
PMID:41915328
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学分析,揭示了MYCN-UBE2C-TFRC信号轴赋予神经外胚层肿瘤铁死亡抵抗的机制 | 首次发现了MYCN通过调控UBE2C表达,进而介导TFRC的泛素化降解,从而减少铁流入并赋予肿瘤细胞铁死亡抵抗的新机制 | NA | 探究MYCN扩增肿瘤中铁死亡抵抗的分子机制 | 神经外胚层肿瘤 | 数字病理学 | 神经外胚层肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CUT&Tag, 深度覆盖质谱蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1882 | 2026-04-01 |
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117053
PMID:41811846
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研究论文 | 本研究通过染色体报告系统探究细胞在受限条件下如何引发延迟但可遗传的染色体丢失,揭示了压缩对细胞分裂和染色体稳定性的影响 | 开发染色体报告系统(ChReporters)量化活细胞中罕见的可遗传染色体丢失,首次发现适度压缩可通过延长有丝分裂期诱导染色体错误分离,形成“有丝分裂记忆” | 研究主要关注短期压缩效应,长期遗传稳定性变化未充分探讨;体外压缩模型可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 探究机械压缩如何影响细胞染色体稳定性及其在癌症进化中的作用 | 活细胞(具体细胞类型未明确说明) | 细胞生物学 | 癌症(实体瘤) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1883 | 2026-04-01 |
Evaluating the Utilities of Foundation Models in Single-Cell Data Analysis
2026-Mar-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514490
PMID:41869863
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研究论文 | 本文通过八个下游任务的综合实验,评估了基础模型在单细胞测序数据分析中的性能,并提出了scEval框架用于评估训练过程 | 首次对十个单细胞基础模型进行系统性性能评估和比较,提出了scEval评估框架,并为单细胞基础模型的预训练和微调提供了指导方针 | 研究发现单细胞基础模型并非在所有任务中都优于任务特定方法,这挑战了开发单细胞分析基础模型的必要性 | 评估基础模型在单细胞测序数据分析中的效用和性能 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型(包括scGPT, Geneformer, CellFM等) | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1884 | 2026-04-01 |
CX3CL1-CX3CR1 signaling orchestrates malignant progression of prostate cancer through luminal progenitor-macrophage crosstalk
2026-Mar-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01179-5
PMID:41870750
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研究论文 | 本研究揭示了CX3CL1-CX3CR1信号轴在前列腺癌恶性进展中,通过管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞的相互作用,驱动免疫抑制和癌症干细胞样细胞扩增的关键机制 | 通过整合单细胞转录组学与基因工程小鼠模型,首次明确了CX3CL1-CX3CR1轴作为管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞间关键信号通路,在塑造促肿瘤免疫抑制微环境中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类前列腺癌中的完全转化性及临床适用性仍需进一步验证 | 识别驱动去势抵抗性前列腺癌进展和治疗抵抗的肿瘤微环境中关键细胞间信号轴 | 前列腺癌(特别是去势抵抗性前列腺癌)中的管腔祖细胞(luminal-2)和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤微环境与免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学,基因工程小鼠模型,原位同种异体移植模型 | NA | 单细胞RNA测序数据,体内表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1885 | 2026-04-01 |
Visinin-like protein 1 disrupts calcium homeostasis and promotes atrial fibrillation in human and rodent models
2026-Mar-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02615-6
PMID:41872178
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研究论文 | 本研究通过整合人类心房颤动患者和啮齿动物模型的转录组学与电生理学数据,揭示了视锥蛋白样蛋白1在破坏钙稳态和促进心房颤动中的关键作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 | 首次在心肌细胞中发现并证实VILIP-1通过依赖豆蔻酰化的运输机制增加钠钙交换体1的表面丰度,从而破坏钙稳态并诱发心房颤动,并发现两种FDA批准药物可通过靶向VILIP-1或其豆蔻酰化来减轻房颤易感性 | 研究主要基于动物模型和体外机制探索,在人类患者中的直接干预效果和长期安全性仍需进一步临床验证 | 探究视锥蛋白样蛋白1在心房颤动发生发展中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 人类心房颤动患者的心房组织、起搏诱导的大鼠心房颤动模型以及心房心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心房颤动 | bulk RNA测序、单细胞转录组学、电生理学分析 | NA | 转录组数据、电生理数据 | 人类AF患者和啮齿动物AF模型(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics | NA | NA |
| 1886 | 2026-04-01 |
A cell atlas of multiple liver organoids and the fetal liver based on scRNA-seq
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114955
PMID:41736863
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研究论文 | 本研究通过整合多个肝脏类器官和人类胎儿肝脏的单细胞RNA测序数据,构建了一个包含217,025个高质量细胞的统一肝脏类器官细胞图谱 | 首次构建了跨多个培养方案的肝脏类器官综合细胞图谱,并系统比较了类器官与胎儿组织之间的差异 | 类器官在造血谱系代表性方面存在不足 | 理解肝脏类器官生长过程中的细胞特征和调控网络,以促进肝脏发育和功能研究 | 肝脏类器官和人类胎儿肝脏 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 217,025个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1887 | 2026-04-01 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Mar-20, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
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研究论文 | 本研究通过整合RNA测序和单细胞转录组学,分析了宫颈癌在放化疗过程中的肿瘤细胞和免疫微环境变化,并探讨了MDM2抑制作为克服治疗抵抗的潜在策略 | 首次在宫颈癌中结合多队列纵向研究、RNA测序和单细胞转录组学,系统揭示了放化疗对肿瘤细胞和免疫微环境的动态重编程作用,并验证了MDM2抑制在增强放疗效果和重塑免疫景观中的新作用 | 研究主要基于临床前模型,尚未在大型临床试验中验证MDM2抑制与放化疗联合的疗效和安全性 | 探索宫颈癌放化疗过程中的细胞和分子变化机制,并寻找克服治疗抵抗的新靶点 | 人类宫颈肿瘤组织及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA测序, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多队列纵向研究样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1888 | 2026-04-01 |
Epigenetic and Transcriptional Regulatory Networks Underlying Psoriasis Pathogenesis
2026-Mar-17, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.03.003
PMID:41856313
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综述 | 本文深入综述了表观遗传调控在银屑病发病机制中的作用,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等关键机制 | 将表观遗传学定位为连接遗传风险、环境触发因素和治疗进展的桥梁,并探讨了靶向表观遗传调控因子和表观基因组编辑技术(如CRISPR融合系统)作为精准治疗策略的转化潜力 | 临床前模型的预测价值有限,且表观遗传谱存在可变性 | 探讨表观遗传和转录调控网络在银屑病发病机制中的作用 | 银屑病的表观遗传调控机制,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA | NA | 银屑病 | 表观遗传学分析,包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA研究 | NA | NA | NA | NA | 单细胞表观基因组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 1889 | 2026-04-01 |
TNFRSF21 Orchestrates Epithelial Keratinization and Tight Junction Integrity in Periodontitis-Associated Oral Mucosal Repair
2026-Mar-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48371
PMID:41914294
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研究论文 | 本研究探讨了TNFRSF21在牙周炎相关口腔黏膜修复中调控上皮角化和紧密连接完整性的关键作用 | 首次揭示TNFRSF21通过调控角蛋白表达和与APP相互作用,在牙周炎上皮修复中的核心调控机制 | 研究主要基于体外模型和小鼠实验,临床转化仍需进一步验证 | 阐明TNFRSF在牙周炎发病和进展中的作用,并探索上皮角化修复机制以开发临床治疗策略 | 牙周炎患者的牙龈组织、体外角化模型、小鼠皮肤伤口模型 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫共沉淀 | NA | RNA测序数据、蛋白质相互作用数据 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、小鼠伤口模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1890 | 2026-04-01 |
T cell development from expanded hematopoietic progenitors reveals initiation control by Lmo2 and Flt3L priming
2026-Mar-13, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw7765
PMID:41824555
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研究论文 | 本研究通过优化血清自由扩增系统,探索了小鼠T细胞发育的最早阶段,揭示了Lmo2和Flt3L在T细胞程序启动中的调控作用 | 开发了一种血清自由扩增系统用于造血干细胞和祖细胞样细胞,结合单细胞RNA测序验证了其正常T细胞分化能力,并首次揭示了Lmo2作为祖细胞和白血病相关因子显著抑制T细胞程序启动 | 研究仅基于小鼠模型,分化速度较新鲜祖细胞慢,且仅测试了23个转录因子的功能 | 探究小鼠T细胞发育的最早阶段及其调控机制 | 小鼠造血干细胞和祖细胞样细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,CRISPR敲除 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1891 | 2026-04-01 |
Spatial Transcriptomics of Early Tooth Morphogenesis in Formalin-fixed Paraffin-embedded Mouse Embryonic Tissue
2026-03-13, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70340
PMID:41911219
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研究论文 | 本文描述了一种适用于空间转录组学应用的、针对小鼠胚胎颅面组织的收集、固定和石蜡包埋的分步协议 | 开发了一种优化的方法,用于处理福尔马林固定石蜡包埋组织,以保持RNA完整性和组织形态,适用于高分辨率空间分析,并兼容测序和基于图像的空间转录组学平台 | 该方法主要针对小鼠胚胎组织,可能在其他物种或组织类型中需要进一步优化,且依赖于特定的空间转录组学平台 | 理解正常牙齿发育的调控机制,以及先天性牙齿疾病如牙齿发育不全、牙本质发育不全和釉质发育不全的病理基础 | 小鼠胚胎颅面组织,特别是早期牙齿形态发生过程中的细胞群 | 空间转录组学 | 先天性牙齿疾病 | 空间转录组学技术 | NA | 空间基因表达数据和组织图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1892 | 2026-04-01 |
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-026-04057-6
PMID:41781757
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研究论文 | 本研究通过组织学、超微结构和单细胞分析,揭示了胆囊炎症中免疫介导的重塑过程 | 首次结合单细胞RNA测序与超微结构分析,定义了急性与慢性胆囊炎症中不同的免疫-基质程序 | 样本量相对较小(41例患者),且未探讨炎症状态的时间动态变化 | 阐明急性与慢性胆囊炎症的细胞和结构特征,并连接上皮、免疫和基质改变 | 胆囊组织及血液样本,来自41名患者(包括12例急性胆囊炎和29例慢性胆石症) | 数字病理学 | 胆囊疾病 | 单细胞RNA测序,组织病理学,免疫组织化学,透射电子显微镜,靶向细胞因子表达分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织图像,血液样本 | 41例患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1893 | 2026-04-01 |
Organization and evolution of sex-biased gene expression in Drosophila adult sexual circuits
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.28.708756
PMID:41846957
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,探究了果蝇成年性行为电路中性别偏向基因表达的组织结构和进化模式 | 首次在细胞分辨率下,结合性别决定基因作为分子标记,系统分析了果蝇性行为电路的转录组景观和进化动态 | 研究主要基于转录组数据,未直接验证基因表达变化与行为表型的因果关系 | 探究性行为电路如何从共享发育蓝图进化以满足性别特异性适应需求 | 果蝇成年性行为电路中的细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1894 | 2026-04-01 |
Functional Type I and Type II interferon crosstalk restricts progenitor exhausted CD8 T cells through spatial exclusion and checkpoint enforcement
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.01.708869
PMID:41847035
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研究论文 | 本研究揭示了在慢性病毒感染中,I型和II型干扰素通过空间排斥和检查点强化协同限制前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)的机制 | 发现了一种先前未被识别的、空间编码的干扰素调控回路,该回路通过将Tpex隔离在富含PDL1的B细胞生态位并抑制T细胞来源的IFNγ来限制其扩增 | 研究主要基于慢性LCMV感染模型,在其他慢性感染或肿瘤环境中的普适性有待验证 | 探究I型和II型干扰素在慢性感染中如何协同调控CD8 T细胞的命运 | 慢性LCMV感染模型中的前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)及其与免疫微环境的相互作用 | 免疫学 | 慢性病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1895 | 2026-04-01 |
Oligodendrocyte Precursor Cells Shape Retinogeniculate Refinement Via a CHD8-Dependent Phagocytic Pathway
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.64
PMID:41914968
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研究论文 | 本研究揭示了少突胶质前体细胞(OPCs)在视觉发育关键期通过CHD8依赖的吞噬通路清除多余突触,从而塑造视网膜膝状体精细化的机制 | 首次鉴定OPCs为视觉发育关键期的主要突触吞噬细胞,并发现CHD8通过直接调控吞噬相关基因转录驱动此过程,将自闭症高风险基因与突触修剪功能异常联系起来 | 研究主要聚焦于小鼠视觉系统发育特定窗口期,其机制在其它脑区或发育阶段的普适性仍需验证 | 识别视觉发育关键期负责突触清除的主要胶质吞噬细胞,并阐明其调控的分子机制 | 小鼠背外侧膝状体核(dLGN)的胶质细胞和突触 | 神经科学 | 自闭症 | 三维成像、单细胞测序、基因组占据分析、体内电生理学评估 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 图像、转录组数据、电生理记录 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1896 | 2026-04-01 |
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Mar, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205134
PMID:41669898
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性及分子机制,以识别潜在治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与分子对接方法,首次在单细胞水平对比骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异,并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 | 研究基于公开数据集,可能受样本来源和技术限制;分子对接结果为计算模拟,需实验验证 | 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性、分子机制及潜在治疗靶点 | 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群,包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎, 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接 | t-SNE, UMAP | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1897 | 2026-04-01 |
Novel association of NAV3 with dilated cardiomyopathy and its role in cardiac fibrosis
2026-Mar-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00806.2025
PMID:41609618
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研究论文 | 本研究通过基因组关联分析发现NAV3基因与扩张型心肌病相关,并利用单细胞RNA-seq和体外实验揭示了NAV3在TGF-β1诱导的心脏成纤维细胞活化和纤维化中的新功能机制 | 首次将NAV3基因与扩张型心肌病的心脏纤维化联系起来,并发现其通过非经典信号通路(独立于SMAD2/3)和细胞周期调控来促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;机制研究尚未完全阐明NAV3调控的具体下游信号通路 | 探究NAV3基因在心脏病理生理学中的功能作用,特别是在扩张型心肌病相关心脏纤维化中的作用机制 | 人类心脏成纤维细胞(原代心室成纤维细胞) | 基因组学与细胞生物学 | 扩张型心肌病 | GWAS, 单细胞RNA-seq, RNA测序, Western blot, siRNA敲低 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | 未明确样本数量(使用已发表的人类心脏单细胞RNA-seq数据和原代细胞) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1898 | 2026-04-01 |
STGNET: extending panel coverage in imaging-based spatial transcriptomics using deep generative adversarial networks
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag122
PMID:41875024
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为STGNET的深度学习框架,通过结合生成对抗网络和图神经网络来扩展成像空间转录组学的基因面板覆盖范围 | 首次将多阶段生成对抗网络与空间感知图卷积网络相结合,通过整合物理细胞邻近性和转录相似性来优化基因插补,从而突破现有成像空间转录组技术基因面板有限的瓶颈 | 方法性能依赖于单细胞RNA测序数据的质量,且在极稀疏或噪声较大的空间转录组数据中可能面临挑战 | 开发一种能够扩展成像空间转录组学基因覆盖范围的深度学习工具,以促进更全面的空间生物学发现 | 成像空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 | 生成对抗网络,图卷积网络 | 空间基因表达数据 | 九个不同的空间转录组数据集 | NA | 成像空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1899 | 2026-04-01 |
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag084
PMID:41706646
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研究论文 | 本文提出了一种名为scKD的新方法,该方法结合了混合邻域增强对比学习和自知识蒸馏策略,用于提高单细胞RNA测序数据的聚类分析性能 | 首次将混合邻域增强对比学习模型与自知识蒸馏策略相结合,用于单细胞RNA测序数据分析,能够同时准确识别主要细胞类型和稀有细胞亚型 | 未明确说明方法在特定生物环境或疾病类型中的适用性限制,也未讨论计算资源需求 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类分析准确性,解决细胞异质性分析中的高维度、复杂性和噪声问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习, 知识蒸馏 | 基因表达数据 | 多个真实世界数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1900 | 2026-04-01 |
Loss of miR-29a/b1 cluster reprograms the tumor microenvironment and contributes to immunosuppression in lung cancer
2026-Feb-25, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1060
PMID:41739590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现,miR-29a/b1簇的缺失通过调控Enpp2/ATX等靶基因重塑肺癌肿瘤微环境,导致免疫抑制并影响PD-1抑制剂疗效 | 首次在Kras/p53驱动的肺癌模型中,通过单细胞RNA测序揭示miR-29缺失通过上调ATX等靶基因导致肿瘤微环境纤维化和免疫抑制,从而介导PD-1抑制剂耐药 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据来自公共数据库的回顾性分析,需要进一步临床验证 | 探究肺癌对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂产生耐药性的分子机制,并寻找克服耐药的新靶点 | Kras/p53驱动的肺癌小鼠模型、抗PD-1耐药肿瘤、公共数据库中的肺腺癌患者RNA测序数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量,包括抗PD-1耐药和敏感的小鼠肺癌模型及公共数据库患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |