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当前共找到 39013 篇文献,本页显示第 1881 - 1900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1881 2026-04-11
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学等方法,揭示了在抗逆转录病毒治疗期间,肠道相关淋巴组织中存在一种支持HIV/SIV病毒库持久性的空间组织化病毒微环境 首次定义了支持病毒库持久性的空间组织化病毒微环境,并揭示了其与肿瘤微环境的相似性 研究基于SIV感染的恒河猴模型,结果向人类HIV感染的转化需进一步验证 探究HIV/SIV在抗逆转录病毒治疗期间持久存在的机制,并识别病毒库持久性的决定因素 SIV感染的恒河猴肠道相关淋巴组织 空间转录组学 HIV/AIDS 空间转录组学,免疫PET/CT,免疫荧光显微镜,机器学习 机器学习 空间转录组数据,影像数据,显微镜图像 SIV感染的恒河猴 NA 空间转录组学 NA NA
1882 2026-04-11
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Hair Cell-Specific Molecular Responses to Polystyrene Nanoplastics in a Zebrafish Embryo Model
2026-Apr, Biotechnology and applied biochemistry IF:3.2Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组分析揭示了斑马鱼胚胎中毛细胞对聚苯乙烯纳米塑料的特异性分子响应 首次在斑马鱼胚胎模型中,通过单细胞RNA测序技术,系统揭示了毛细胞对聚苯乙烯纳米塑料暴露的特异性分子响应机制,包括细胞类型比例变化和基因表达调控 研究仅关注了聚苯乙烯纳米塑料在环境相关浓度下的短期暴露效应,未评估长期暴露或更高浓度下的毒性影响,且主要基于胚胎模型,成年个体的响应可能不同 探究聚苯乙烯纳米塑料对斑马鱼胚胎的生理和分子影响,评估其生态风险 斑马鱼胚胎 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未明确指定样本数量,但基于斑马鱼胚胎模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1883 2026-04-11
Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype
2026-Apr, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了胸膜间皮瘤中一种新的未定型分子表型与不良预后相关 发现了一种新型未定型恶性细胞状态,并鉴定了TGF-β和GAS6-AXL信号通路作为潜在驱动因子 需要进一步实验探索和临床验证来确认这些发现 识别胸膜间皮瘤恶性细胞状态的候选驱动因子和预后生物标志物 胸膜间皮瘤患者组织样本 数字病理学 胸膜间皮瘤 单细胞RNA测序, 外显子组测序, RNA测序, 光学基因组图谱, 空间转录组学, 组织学分析 NA 单细胞RNA测序数据, 外显子组数据, RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织学图像 来自40名患者的93个样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
1884 2026-04-11
LINC01116, a hypoxia-lncRNA marker of pathological lymphangiogenesis and poor prognosis in lung adenocarcinoma
2026-Apr, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究识别了LINC01116作为肺腺癌中缺氧诱导的长链非编码RNA,与不良预后和病理性淋巴管生成相关 首次将LINC01116确立为肺腺癌中缺氧微环境下的特异性淋巴管内皮细胞生物标志物,并揭示其在病理性淋巴管生成中的作用 在肿瘤细胞系中未发现LINC01116的明确调控作用,其具体分子机制仍需进一步探索 探究LINC01116在肺腺癌缺氧微环境及淋巴管生成中的功能与临床意义 肺腺癌患者队列、肺腺癌细胞系、淋巴管内皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交、CRISPRi、RNA干扰 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 肺腺癌患者队列(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1885 2026-04-11
Immune involvement in neuropsychiatric disorders: Insights from single-cell transcriptomic studies
2026-Apr, Psychiatry and clinical neurosciences IF:5.0Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学在神经精神疾病中免疫相关机制研究中的应用与发现 整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)技术,克服批量RNA测序的平均化效应,揭示神经精神疾病中细胞类型特异性免疫改变 单细胞转录组学方法仍面临技术挑战,如细胞捕获效率、数据解析复杂性以及样本处理偏差 探讨免疫系统在神经精神疾病中的作用机制,并整合批量与单细胞转录组学方法以弥补研究空白 精神疾病(如精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症、自闭症谱系障碍、注意力缺陷多动障碍)和神经系统疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病、路易体痴呆、多发性硬化症、抗NMDA受体脑炎) 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
1886 2026-04-11
Neuronal phenotypic alterations and the therapeutic potential of Anxa2 in traumatic brain injury recovery
2026-Apr, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了创伤性脑损伤(TBI)后神经元表型变化及其对恢复的影响,并发现Anxa2基因在TBI恢复中具有积极作用 通过单细胞RNA测序识别TBI后神经元表型变化,并首次验证Anxa2在TBI恢复中的治疗潜力 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;分子对接分析仅为预测性,需实验验证 探索TBI后神经元表型变化对恢复的影响,并评估Anxa2作为治疗靶点的潜力 小鼠皮质组织中的神经元 数字病理学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,分子对接分析 NA RNA测序数据 公开可用的GEO数据库中的小鼠皮质组织数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1887 2026-04-11
Liver sinusoidal endothelial TGF-β signaling accelerates partial endothelial-mesenchymal transition and MASH through Notch
2026-Apr, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究揭示了肝窦内皮细胞(LSECs)中TGF-β/Notch信号轴通过诱导部分内皮-间质转化(EndMT)驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的机制 发现了MASH中由LSECs通过TGF-β驱动的部分EndMT产生的新型双表型细胞群,并阐明了TGF-β/Notch串扰在其中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,未来需要在MASH患者队列中进行验证,并开发LSEC特异性递送系统 探究LSECs在MASH进展中的具体作用及其功能障碍的分子机制 肝窦内皮细胞(LSECs)、人脐静脉内皮细胞(HUVECs)、转基因小鼠模型 单细胞组学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH) 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠:每条件3-10只;原代LSECs:每条件3-6只;HUVECs用于体外实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1888 2026-04-11
Single-cell transcriptome profiling reveals herpesviral manipulation of host processes in spleen of gibel carp infected with a Cyvirus cyprinidallo2
2026-Apr, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了疱疹病毒在感染银鲫脾脏中如何操纵宿主细胞过程,并导致疾病发生 首次在银鲫中应用单细胞RNA测序技术解析疱疹病毒与宿主的相互作用,识别了巨噬细胞和壁细胞作为主要病毒易感细胞,并发现了病毒诱导的宿主细胞过程广泛抑制及免疫调节因子上调 研究仅聚焦于脾脏组织,可能未全面反映病毒在其他器官中的感染机制;功能验证部分可能有限,需进一步实验确认 解析疱疹病毒(Cavirus cyprinidallo2)与宿主银鲫的相互作用机制,以了解病毒如何操纵宿主细胞并导致疾病 感染疱疹病毒的银鲫脾脏组织 单细胞转录组学 疱疹病毒性造血坏死伴急性鳃出血 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但基于感染鱼脾脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1889 2026-04-11
Aggressive prostate cancer is associated with pericyte dysfunction
2026-Apr, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本文通过计算和实验方法揭示了前列腺癌中周细胞功能障碍的分子机制及其与肿瘤血管异常的关系 挑战了传统上认为肿瘤中周细胞数量减少的范式,转而强调其功能障碍,并发现TGF-β信号通路在此过程中的关键作用 研究主要基于人类前列腺癌样本和小鼠模型,可能未完全覆盖所有癌症类型或临床异质性 探究前列腺癌中周细胞在肿瘤血管生成和进展中的分子重编程机制 人类前列腺癌组织和小鼠模型中的周细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 人类前列腺癌样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1890 2026-04-11
Pleural Mesothelioma-A Novel Uncommitted Molecular Phenotype Identified by Multiomics, Histologic, and scRNA-Seq Profiling
2026-Apr, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer IF:21.0Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
1891 2026-04-11
Transcriptome-based cell type assignment for kidney cell culture models
2026-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种基于转录组的方法,通过将肾脏细胞系、原代细胞或组织的批量RNA-seq数据与单细胞RNA-seq数据集衍生的参考细胞类型进行匹配,以评估细胞系与其原生细胞类型的相似性 结合批量RNA-seq与单细胞参考数据集,利用基因表达秩相关和机器学习方法(如TabPFN)系统评估细胞系身份,并提供了两种互补的实现工具 方法主要依赖于转录组数据,可能未考虑表观遗传或蛋白质水平差异;验证策略虽全面,但可能受参考数据集质量和覆盖范围限制 开发并验证一种转录组学方法,以评估肾脏细胞系是否在基因表达上类似于其原生细胞类型,从而辅助细胞培养模型的选择和解释 人类和小鼠肾脏细胞系、原代细胞、微分离肾脏组织以及非肾脏阴性对照 生物信息学 肾脏疾病 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq) Random Forest, XGBoost, TabPFN 转录组数据 涉及两个人类和两个小鼠肾脏scRNA-seq数据集,以及多个肾脏细胞系和对照样本 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
1892 2026-04-11
Hapln1-HA signaling promotes progenitor cell proliferation and spinal cord regeneration
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过跨物种单细胞转录组学揭示了透明质酸修饰酶Hapln1在斑马鱼脊髓损伤后上调,并通过促进祖细胞增殖来增强脊髓再生能力 首次发现斑马鱼利用促再生ECM分子Hapln1增强祖细胞效能,区别于哺乳动物中抗再生ECM成分的主导作用 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的直接应用仍需进一步验证 探究细胞外基质在脊髓自发修复中的积极作用机制 成年斑马鱼脊髓损伤后的祖细胞 单细胞转录组学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1893 2026-04-11
Oligodendrocyte precursor cells-microglia crosstalk via BMP4 drives microglial neuroprotective response and mitigates Alzheimer's disease
2026-Mar-25, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本文揭示了少突胶质前体细胞通过分泌BMP4与微胶质细胞进行交流,从而驱动微胶质细胞的神经保护反应并减轻阿尔茨海默病病理 首次发现晚期少突胶质前体细胞(COPs)分泌的BMP4是调控微胶质细胞神经保护程序的关键信号,并阐明了其通过Smad1/5/8-Trem2通路直接调控疾病相关微胶质细胞(DAM)基因表达的分子机制 研究主要在5xFAD转基因小鼠模型中进行,其在人类阿尔茨海默病中的普适性及临床转化潜力有待进一步验证 探究少突胶质前体细胞与中枢神经系统免疫系统(特别是微胶质细胞)在阿尔茨海默病病理中的细胞间通讯机制 5xFAD转基因阿尔茨海默病小鼠模型、少突胶质前体细胞(OPCs/COPs)、微胶质细胞 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、基因敲除、腺相关病毒(AAV)介导的基因递送、免疫荧光染色 NA 基因表达数据、组织病理学图像 5xFAD转基因小鼠及对照小鼠(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1894 2026-04-11
Integrating Microscopy Methods to Study Gene and Protein Expression alongside Metal Ion Distribution and Speciation: A Case Study of Iron within Pyramidal Neurons from Distinct Hippocampal CA1 Subregions
2026-Mar-23, Chemical & biomedical imaging
研究论文 本研究通过整合多种显微分析方法,探究了海马CA1区不同亚区域中锥体神经元的铁离子分布、氧化状态、储存蛋白表达及基因表达通路,以揭示铁代谢与神经退行性疾病易感性的关联 首次将X射线荧光显微镜、XANES光谱、免疫荧光和空间转录组学四种技术结合,对海马CA1区特定脑区域的铁代谢组进行空间解析,揭示了侧向与内侧CA1神经元在铁代谢方面的关键差异 研究仅针对海马CA1区,样本范围有限,且为案例研究,可能需要更大样本量验证结果 探究铁离子在大脑健康及神经退行性疾病中的作用,特别是在海马CA1区的分布与代谢特征 海马CA1区(侧向和内侧)的锥体神经元 数字病理学 神经退行性疾病 X射线荧光显微镜,XANES光谱,免疫荧光,空间转录组学 NA 图像,光谱数据,基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1895 2026-04-11
Single-cell spatial multi-omics molecular pathology enabled by SuperFocus
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为SuperFocus的计算平台,用于从基于点的空间测量中生成与组织病理学整合的单细胞空间多组学数据,无需外部参考数据 SuperFocus平台结合了约束级联插补与特征级和细胞级质量控制评分,提高了准确性,并在基准数据集上比现有方法提升了28-73%的关键指标 NA 开发下一代分子病理学方法,将基因组尺度分子信息以单细胞分辨率投影到整个组织切片的组织病理学图像上 MALT淋巴瘤微环境、人类海马体基因调控程序、人类MASH中的脂毒性肝细胞状态,以及帕金森病小鼠脑中与神经传递和神经炎症相关的转录组-代谢组状态 数字病理学 MALT淋巴瘤, MASH, 帕金森病 空间转录组学, 空间ATAC-RNA, 空间CITE-seq, Visium-MALDI-MSI 约束级联插补模型 空间多组学数据, 组织病理学图像 NA 10x Genomics 单细胞空间多组学, 空间转录组学 Visium Visium-MALDI-MSI (SMA) 数据集
1896 2026-04-11
Contribution of cytotoxic CD8 T cells, neutrophils and type 1 interferon signaling to hyperinflammation in HIV-associated TB meningitis
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中的免疫细胞,揭示了以细胞毒性CD8 T细胞、高度活化的中性粒细胞和有害的I型干扰素信号为特征的高炎症免疫反应 首次在HIV相关结核性脑膜炎患者中,通过大规模单细胞RNA测序(188,983个细胞)系统揭示了脑脊液免疫微环境的细胞组成和功能特征,特别是发现了细胞毒性CD8 T细胞的主导地位、中性粒细胞的异常活化状态以及I型干扰素信号的有害作用 样本量相对有限(25名成人患者),且主要针对HIV阳性人群,结果可能无法完全推广到HIV阴性结核性脑膜炎患者;研究为观察性研究,需要进一步实验验证这些免疫特征的因果关系 阐明HIV相关结核性脑膜炎患者脑脊液中免疫失调的具体机制,特别是高炎症反应的细胞和分子基础 25名患有HIV相关结核性脑膜炎的成人患者的脑脊液细胞 单细胞组学 结核性脑膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 25名成人患者,共188,983个脑脊液细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1897 2026-04-11
TYK2 Inhibition with Deucravacitinib Improves Clinical Outcomes and Resolves Interferon-Driven Inflammation in Lichen Planopilaris
2026-Mar-22, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究通过一项临床试验,评估了口服TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发(LPP)的疗效,并利用bulk和单细胞RNA测序揭示了其通过抑制I型干扰素驱动的炎症通路发挥作用的机制 首次在LPP中应用选择性TYK2抑制剂deucravacitinib进行临床治疗,并联合bulk和单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率上阐明了治疗如何下调I型干扰素信号通路、CD8+ T细胞受体信号以及成纤维细胞-免疫细胞间的通讯 样本量较小(N=10),为单臂临床试验缺乏安慰剂对照,随访时间较短(24周) 评估TYK2抑制剂deucravacitinib治疗扁平苔藓样脱发(LPP)的临床疗效并探究其分子机制 经活检证实的扁平苔藓样脱发(LPP)患者 数字病理 皮肤疾病 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 10名LPP患者,采集治疗前和治疗后第4周的头皮活检配对样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1898 2026-04-11
LIFUS-driven engineered bacteria reprogram immunosuppressive niches via mechano-NOTCH signaling
2026-Mar-17, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过工程化改造沙门氏菌表达气囊,利用低强度聚焦超声产生局部机械力,重塑肿瘤微环境,并开发了一种用于过继性T细胞疗法的机械启动方法 首次将工程化细菌与低强度聚焦超声结合,通过机械力选择性调控肿瘤微环境中的Notch1-Jagged1信号轴,并基于此开发了增强T细胞疗效的机械启动策略 研究主要在临床前模型中进行,尚未在人体中验证其安全性和有效性;机械力作用的长期影响和潜在副作用仍需进一步评估 克服实体瘤中限制T细胞浸润和功能的基质与免疫屏障,增强过继性T细胞疗法的疗效 实体瘤微环境、工程化沙门氏菌VNP20009、气囊、癌症相关成纤维细胞、CD8 T细胞 肿瘤免疫治疗 实体瘤 单细胞RNA测序、工程细菌改造、低强度聚焦超声 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
1899 2026-04-11
Fibroblasts neurotrophin signaling sustains pathological vascular maturation in rheumatoid arthritis
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用高维空间转录组学揭示了神经生长因子信号在类风湿关节炎滑膜中驱动异常血管成熟的关键作用 首次发现神经生长因子信号通过激活NOTCH3和NGFR诱导滑膜成纤维细胞分化为壁细胞,从而维持RA滑膜中成熟血管的形成 研究主要基于体外组织外植体实验,缺乏体内动物模型验证 探究类风湿关节炎治疗失败机制,特别是滑膜成纤维细胞和血管内皮在驱动病理血管成熟中的作用 类风湿关节炎患者的滑膜组织 空间转录组学 类风湿关节炎 高维空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1900 2026-04-11
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为scDEcrypter的惩罚双向混合模型,用于解决单细胞RNA测序中病毒感染的差异表达分析问题 利用部分感染状态标签和细胞类型等额外变量,通过数据分割避免双重利用,实现快速基于似然的推断 NA 改进病毒感染单细胞RNA测序中的差异表达分析 病毒感染的单细胞RNA测序数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 惩罚双向混合模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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