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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1881 | 2026-02-26 |
Spatial Transcriptomics Uncovers Hybrid, Pro-Inflammatory and Pro-Fibrotic Cellular Niches in Pulmonary Granuloma of Patients with Chronic Sarcoidosis
2026-Jan-23, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,揭示了慢性结节病患者肺部肉芽肿内存在混合的促炎和促纤维化细胞微环境 | 首次在慢性结节病患者肺部肉芽肿中,通过空间转录组学精确定位了促炎和促纤维化的混合细胞微环境,并描述了其空间结构和基因表达特征 | 样本量较小(9个肺移植样本),且为横断面研究,无法确定这些细胞微环境在疾病进展中的动态变化 | 解析慢性结节病患者肺部肉芽肿内的细胞微环境组成和空间结构 | 慢性结节病患者的肺部肉芽肿组织 | 空间转录组学 | 结节病 | 空间转录组学,免疫组织荧光染色,RNA原位杂交 | NA | 空间基因表达数据,图像数据 | 9个来自结节病患者的含肉芽肿的肺移植样本,共分析了173个肉芽肿和30,587个基因表达点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Genomics Visium平台 |
| 1882 | 2026-02-26 |
DNAJB6 as an immuno-oncogenic hub in liver hepatocellular carcinoma: multi-omic profiling reveals prognostic significance and therapeutic vulnerability
2026-Jan-21, Journal of molecular histology
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s10735-026-10717-2
PMID:41559348
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了DNAJB6在肝细胞癌中的上调及其与不良预后和免疫反应的关联,并验证了其作为独立预后因子和治疗靶点的潜力 | 首次系统性地将DNAJB6与肝细胞癌的预后、免疫微环境(特别是髓源性抑制细胞和耗竭CD8 T细胞)及吉非替尼耐药性联系起来,并通过实验验证了其功能 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证,且临床样本量可能有限,需进一步扩大验证 | 探索DNAJB6在肝细胞癌中的表达、预后价值、免疫关联及作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者数据、HepG2细胞系、肝肿瘤组织样本 | 生物信息学与癌症研究 | 肝细胞癌 | 多组学数据分析、免疫组化、Western blot、siRNA干扰、细胞增殖迁移实验、凋亡检测 | NA | 多组学数据、图像数据、蛋白质数据、细胞实验数据 | 未明确指定样本数量,涉及肝细胞癌患者数据、HepG2细胞系和肝肿瘤组织 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1883 | 2026-02-26 |
Single-cell sequencing reveals that neutrophils mediate the inflammatory response in the placenta of women with GDM
2026-Jan-17, Journal of molecular histology
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s10735-025-10707-w
PMID:41546731
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了妊娠期糖尿病胎盘炎症中中性粒细胞的关键作用及其调控机制 | 首次通过单细胞测序构建GDM胎盘细胞图谱,识别出促炎中性粒细胞亚群及其分化轨迹,并发现精氨酸分解代谢和烟酸/烟酰胺代谢调控其功能 | 基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本来源和数量可能有限 | 阐明妊娠期糖尿病胎盘炎症的细胞机制 | 妊娠期糖尿病和对照孕妇的胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1884 | 2026-02-26 |
LncRNAs at the frontline of neuroimmune crosstalk in oral cancer
2026-Jan-06, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxag007
PMID:41660801
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综述 | 本综述探讨了长链非编码RNA(lncRNA)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)神经免疫相互作用中的关键调控作用 | 聚焦于lncRNA在OSCC中神经-免疫-癌症轴这一新兴概念的调控作用,强调了先前综述未涉及的神经免疫汇聚通路 | 缺乏OSCC特异性的功能研究、lncRNA活性的空间或单细胞分辨率数据,以及评估lncRNA驱动神经侵袭的体内模型有限 | 阐明lncRNA在OSCC神经免疫串扰中的调控机制,以发现新的生物标志物和治疗靶点 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC) | NA | 口腔癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1885 | 2026-02-26 |
DWGCN: distance-weighted graph convolutional network for robust spatial domain identification in spatial transcriptomics
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1779455
PMID:41736715
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研究论文 | 本文提出了一种距离加权图卷积网络(DWGCN),用于改进空间转录组学中的空间域识别,通过逆距离加权和点归一化增强局部敏感聚合 | DWGCN创新性地用逆距离加权和点归一化替代了传统均匀邻居分配,增强了局部敏感聚合,保留了自环优势,从而恢复空间图中的距离感知结构 | NA | 改进空间转录组学中的空间域识别,以更精确地描绘组织边界 | 空间转录组学数据中的空间域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间转录组学数据 | 四个真实和四个模拟空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1886 | 2026-02-26 |
From polygenic risk to digital twins: the future of personalised cardiovascular medicine
2026, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2026.1735094
PMID:41736831
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综述 | 本文综述了个性化心血管医学在基因组学、多组学、数字技术和治疗领域的进展,并讨论了转化差距及伦理与实施挑战 | 整合多组学平台、人工智能及新兴技术(如CRISPR基因编辑、单细胞测序和数字孪生模型),推动心血管医学从通用策略转向个性化主动预防与治疗 | 实际应用受限于监管不确定性、数据整合挑战、成本问题以及公平性和可及性担忧 | 探讨精准心脏病学如何利用基因组、分子和计算创新实现个体化心血管疾病护理 | 心血管疾病(CVD)的个性化预防、诊断和治疗策略 | 机器学习 | 心血管疾病 | 多组学平台(转录组学、蛋白质组学、代谢组学)、人工智能、机器学习、CRISPR基因编辑、单细胞测序、数字孪生建模 | 数字孪生模型 | 基因组数据、多组学数据、心血管影像、电子健康记录、可穿戴设备数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 1887 | 2026-02-26 |
Correction: Single-cell transcriptome analysis profiles cellular dynamics and transcriptional changes in diabetic wound tissues following ESWT treatment
2026, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2026.1772233
PMID:41736952
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correction | 本文是对一篇关于单细胞转录组分析在糖尿病伤口组织中ESWT治疗后细胞动态和转录变化研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1888 | 2026-02-26 |
Divergent CD45+ immune landscapes shape the lung tumor microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1765833
PMID:41737220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了两种不同肺癌模型中CD45+免疫细胞的组成、转录程序、代谢状态和细胞间通讯网络的差异 | 首次在单细胞分辨率下比较了两种不同基因型(LLC1和KrasLA2)肺癌模型中CD45+免疫细胞的免疫景观差异,并识别了基因型特异性的免疫脆弱性 | 研究仅基于小鼠模型,结果在人类肺癌中的适用性有待验证;样本量相对有限 | 阐明CD45+免疫细胞在肺癌肿瘤微环境中的异质性作用及其对肿瘤生物学的影响 | 来自健康肺、LLC1原位肿瘤和KrasLA2基因工程肿瘤的CD45+免疫细胞 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自三种条件(健康肺、LLC1肿瘤、KrasLA2肿瘤)的CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1889 | 2026-02-26 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal the differentiation drivers of gastric epithelial lineage progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1712830
PMID:41737224
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了胃癌发展过程中胃上皮谱系分化的驱动因素,特别是UPP1在连接幽门螺杆菌驱动的炎症与WNT介导的分化中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统描绘了从慢性胃炎到肠化生再到胃癌的谱系进展,并识别出UPP1作为上皮重编程和肠化生的关键调节因子 | 研究样本可能有限,且机制验证主要在细胞系和类器官中进行,需进一步在体内模型中确认 | 阐明胃癌发展过程中分子介导因子,特别是炎症与恶性转化之间的关联 | 胃黏膜样本,包括萎缩性胃炎、肠化生和胃癌病例,涵盖幽门螺杆菌阳性和阴性情况 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自萎缩性胃炎、肠化生和胃癌的胃黏膜样本,包括幽门螺杆菌阳性和阴性病例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1890 | 2026-02-26 |
Identification of Monocyte CD11c as a Potential Biomarker for Distinguishing Sepsis From Non-Infectious Inflammation and Predicting the Outcome of Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S557223
PMID:41737250
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞CD11c作为区分脓毒症与非感染性炎症及预测脓毒症预后的潜在生物标志物 | 首次通过CyTOF、单细胞RNA测序和流式细胞术多技术结合,验证了mCD11c在脓毒症诊断和预后中的优越性能,其AUC值(0.939)显著优于传统标志物 | 研究为单中心观察性队列,样本量有限,需更大规模的多中心研究验证结果并探索干预潜力 | 评估mCD11c作为脓毒症诊断和预后生物标志物的有效性 | 脓毒症患者、轻度感染患者、心血管手术后患者、康复脓毒症患者及健康对照者 | 数字病理学 | 脓毒症 | CyTOF, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 外周血样本 | 发现队列和验证队列(具体人数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1891 | 2026-02-26 |
Innovative approaches targeting innate immune cells to promote organ transplant tolerance
2026, Frontiers in transplantation
DOI:10.3389/frtra.2026.1776806
PMID:41737588
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综述 | 本文综述了针对先天免疫细胞以促进器官移植耐受的创新策略 | 提出了通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示先天免疫细胞异质性,并基于此开发选择性调节先天免疫反应而不损害整体免疫力的精准疗法 | NA | 探讨在最小化全身免疫抑制的同时实现长期移植物存活的策略 | 先天免疫细胞(包括中性粒细胞、单核细胞、巨噬细胞、树突状细胞、髓源性抑制细胞、先天淋巴样细胞、自然杀伤细胞和γδ T细胞) | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1892 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing and integrated bioinformatics reveal new mitochondrial biomarkers in sarcopenia
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1694362
PMID:41737830
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研究论文 | 本研究通过整合分析公共转录组数据集和单细胞RNA测序,发现了一个与线粒体功能相关的三基因标志物(CHCHD10、SAMM50、MDH2),可作为肌少症的早期诊断生物标志物 | 首次通过整合多组学数据和机器学习方法,鉴定出一个在多个独立队列中保守的、与线粒体功能障碍相关的三基因标志物,并构建了具有高诊断准确性的列线图预测模型 | 研究主要基于公共数据集进行生物信息学分析,尽管进行了体外验证,但缺乏大规模临床队列的直接验证 | 发现肌少症的早期诊断生物标志物 | 肌少症患者及对照的转录组数据、C2C12成肌细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、差异基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习、定量PCR | 列线图预测模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE1428, GSE117525, GSE167186, GSE111006, GSE111010, GSE111016),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1893 | 2026-02-26 |
Integrative Multi-Omics Identifies S100A4 as a Translational Hub Linking Environmental Bis(2-Ethylhexyl) Phthalate (DEHP) Exposure to Glioblastoma Risk
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/2385129
PMID:41737848
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研究论文 | 本研究通过整合多组学计算框架,揭示了环境污染物DEHP通过S100A4蛋白及脂质代谢轴影响胶质母细胞瘤风险的潜在机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、全蛋白质组/代谢组孟德尔随机化及分子动力学模拟,系统性地将环境毒物DEHP暴露与胶质母细胞瘤风险联系起来,并识别出S100A4作为关键翻译枢纽 | 所提出的机制联系仍为推断性,需要未来体外和体内实验直接验证DEHP对S100A4表达、功能及下游代谢重编程的影响 | 系统研究环境污染物DEHP与胶质母细胞瘤风险之间的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤(GBM)、环境污染物双(2-乙基己基)邻苯二甲酸酯(DEHP) | 计算生物学、生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 网络毒理学、单细胞转录组学、孟德尔随机化、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、分子对接、分子动力学模拟 | 基因组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO等11个独立队列的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1894 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing informs precision targeting of monogenic lupus associated with IKZF1 haploinsufficiency
2025-Dec-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70017
PMID:41392616
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探究了IKZF1单倍体不足驱动的单基因狼疮患者的免疫失调机制 | 首次利用单细胞RNA测序结合生物信息学分析,揭示了IKZF1单倍体不足患者中B细胞和T细胞的异常分化轨迹及IFN-JAK-STAT信号通路过度激活 | 研究仅基于一名儿科患者,样本量较小,可能限制结果的普遍性 | 探究单基因狼疮(IKZF1单倍体不足)的免疫失调机制,以指导精准靶向治疗 | IKZF1单倍体不足的儿科狼疮患者、无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 单细胞RNA测序数据 | 一名IKZF1单倍体不足患者、多例无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1895 | 2026-02-26 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑亚基DPF2通过调控CACNA1D介导的MAPK通路,在巨噬细胞炎症反应和肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2缺失通过改变组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me1)调控CACNA1D表达,进而影响细胞内钙水平和MAPK信号通路,最终调节巨噬细胞的炎症极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证的规模可能有限,且具体调控机制中涉及的转录因子或其他共调节因子尚未完全阐明 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应和肠道再生的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病(IBD)样本、患者来源的类器官 | 单细胞组学与空间转录组学 | 炎症性肠病(IBD) | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 未明确具体样本数量,但涉及小鼠模型、临床IBD样本和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1896 | 2026-02-26 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
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研究论文 | 本研究通过系统梳理过去四十年中与特定阅读障碍相关的候选基因,分析其进化保守性、发育表达模式和功能网络,以揭示阅读障碍的遗传基础 | 挑战了存在阅读特异性基因的观念,提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有大脑结构中的破坏,并识别了发育表达转换和功能网络 | 基于文献综述和生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本数据主要来自公共数据库,可能受限于数据覆盖范围 | 探究特定阅读障碍的遗传基础,填补阅读能力遗传结构理解的知识空白 | 175个与特定阅读障碍及阅读相关过程相关的候选基因 | 自然语言处理 | 特定阅读障碍 | 生物信息学分析,包括进化保守性分析、发育转录组分析和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | Allen Brain Atlas | 单细胞RNA-seq,发育转录组学 | NA | Allen Brain Atlas的发育和单细胞转录组数据集 |
| 1897 | 2026-02-26 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 本文系统总结了单细胞转录组学和表观基因组学方法在阿尔茨海默病研究中的应用,重点阐述了细胞类型和亚型特异性转录组改变的特征 | 整合单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学技术,揭示了疾病轨迹和跨病理阶段的细胞通讯网络,为精准医学提供了新见解 | 本文为综述文章,未报告原始实验数据,其总结依赖于现有研究的发现和局限性 | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解,并为通过识别新的治疗靶点和生物标志物实现精准医学铺平道路 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1898 | 2026-02-26 |
Leveraging RNA-seq deconvolution to improve complex in vitro model characterization
2025-09, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110510
PMID:40701251
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研究论文 | 本文评估了利用RNA-seq反卷积技术,结合公开单细胞RNA-seq数据集,从复杂体外模型的bulk RNA-seq数据预测细胞比例,以改进这些模型的表征 | 首次将RNA-seq反卷积技术应用于复杂体外模型(如肠道类器官和睾丸模型)的细胞组成分析,并评估了单细胞数据插补方法对反卷积准确性的提升效果 | 反卷积方法的准确性在不同分析中差异显著,且依赖于公开单细胞数据集的可用性和质量 | 开发新方法以表征复杂体外模型,用于毒理学和药物开发 | 基于干细胞的人肠道类器官CIVM和新生啮齿动物睾丸CIVM | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 反卷积模型 | bulk RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1899 | 2026-02-26 |
Cathepsin K as a key regulator of myocardial fibrosis in dilated cardiomyopathy and a promising therapeutic target
2025-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110421
PMID:40578558
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研究论文 | 本研究通过整合加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,揭示了组织蛋白酶K在扩张型心肌病心肌纤维化中的关键调控作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定出CTSK在心脏成纤维细胞中的特异性表达,并证实其通过PDGF-BB通路调控细胞增殖而非TGF-β1诱导的转分化 | CTSK敲低仅抑制PDGF-BB诱导的增殖,对TGF-β1诱导的肌成纤维细胞转分化无影响,其具体调控机制仍需进一步研究 | 探究扩张型心肌病中心肌纤维化的关键调控因子及潜在治疗靶点 | 扩张型心肌病患者心脏组织及体外培养的人心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 免疫荧光染色, Masson三色染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1900 | 2026-02-26 |
Genetic deficiency of EXOSC10 ribonuclease disrupts spermatogenesis and male fertility in mice
2025-07, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110364
PMID:40513949
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研究论文 | 本研究探讨了EXOSC10核糖核酸酶在小鼠雄性生殖细胞减数分裂中的关键作用,揭示其缺失导致精子发生障碍和雄性不育 | 首次在雄性生殖细胞中系统研究EXOSC10的功能,通过条件性敲除模型结合单细胞RNA测序技术,阐明其在减数分裂转录组调控中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的功能保守性尚未验证;单细胞测序样本量相对有限 | 探究EXOSC10核糖核酸酶在雄性生殖细胞减数分裂调控中的作用机制 | 小鼠雄性生殖细胞(特别是减数分裂前生殖细胞和精母细胞) | 生殖生物学 | 男性不育症 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及条件性敲除小鼠的生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |