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当前共找到 37368 篇文献,本页显示第 1881 - 1900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1881 2026-02-20
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合miRNA和转录组分析,揭示了人类膀胱癌中性别特异的分子差异及其调控机制 首次系统性地结合bulk mRNA/miRNA表达、生存模型和单细胞转录组分析,揭示了膀胱癌性别差异主要由常染色体基因的转录后调控驱动,而非性染色体剂量效应,并发现了与生存相关的性别特异性调控互作 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证所识别的调控机制;单细胞数据样本量相对有限 识别膀胱癌中性别特异的分子特征和调控互作,以阐明肿瘤生物学和临床结局性别差异的生物学机制 人类膀胱癌组织样本 生物信息学 膀胱癌 bulk mRNA测序, microRNA测序, 单细胞RNA-seq 差异表达分析, Kaplan-Meier生存分析, Cox比例风险模型 基因表达数据, 生存数据 数据来源于TCGA、GEO和GSA数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1882 2026-02-20
Senescence-induced endothelial-to-mesenchymal transition accelerates the subretinal fibrosis in neovascualr age-related macular degeneration
2026-Jan-22, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了衰老诱导的内皮-间质转化在新生血管性年龄相关性黄斑变性中加速视网膜下纤维化的机制 首次通过单细胞RNA测序数据揭示了衰老脉络膜毛细血管内皮细胞在视网膜下纤维化中的作用,并验证了衰老与内皮-间质转化的关联 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人类患者中进行直接验证 研究衰老内皮细胞如何通过内皮-间质转化促进新生血管性年龄相关性黄斑变性中的视网膜下纤维化 脉络膜毛细血管内皮细胞、Brown-Norway大鼠、INK-ATTAC小鼠、C57BL/6J小鼠、人脐静脉内皮细胞 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 年轻(2-3个月)和老年(18个月)C57BL/6J小鼠,激光诱导纤维化模型的Brown-Norway大鼠和INK-ATTAC小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1883 2026-02-20
Identification of Lupus Immune Complex-Driven Pathogenic Pro-inflammatory Monocytes and Macrophages in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了狼疮免疫复合物驱动促炎性单核细胞和巨噬细胞在系统性红斑狼疮中的异质性和功能 首次在单细胞水平上系统描述了狼疮免疫复合物刺激下促炎性单核细胞的转录组特征,并发现这些细胞在狼疮患者多个组织中的存在与扩增 研究主要基于体外刺激实验和已有数据集分析,需要进一步体内功能验证 探究系统性红斑狼疮中单核吞噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 人类单核细胞、巨噬细胞、狼疮患者皮肤、肾脏和外周血样本 单细胞组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 人类单核细胞体外培养样本及公开狼疮患者scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1884 2026-02-20
Single-Cell Mitochondrial Lineage Tracing Decodes Fate Decision and Spatial Clonal Architecture in Human Hematopoietic Organoids
2026-Jan-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究开发了一种利用单细胞RNA测序中天然线粒体转录本突变作为内源性遗传条形码的方法,以追踪人类多能干细胞在早期胚胎发生中的造血谱系命运决策和空间克隆结构 首次将天然线粒体体细胞突变重新用作内源性遗传条形码,结合合成谱系追踪和空间转录组学,构建了多模态框架来解码人类胚胎类器官中的克隆动态和命运决策 方法依赖于线粒体转录本的突变检测,可能受测序深度和变异识别精度限制,且主要在人类干细胞衍生模型中进行验证 开发一种可扩展、非侵入性的多模态框架,以解析人类干细胞衍生模型中组织自组织的克隆动态和命运决策机制 人类多能干细胞(hPSCs)及其衍生的造血类器官 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 动态系统模型 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
1885 2026-02-20
MANTIS: Analytics toolkit for spatial metabolomics with matching spatial transcriptomics data
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一个名为MANTIS的计算工具,用于分析配对的空间代谢组学与空间转录组学数据,以发现代谢物空间分布模式和基因-代谢物关系 首次提出一个统一框架,整合空间代谢组学、空间转录组学、细胞类型信息和空间域,强调空间统计和严格的假设检验,并引入基于专门置换测试的统计显著性评估策略,以控制代谢物分布的空间自相关 NA 开发一个分析工具,用于探索空间代谢组学与空间转录组学数据之间的生物学关系 配对的空间代谢组学与空间转录组学数据,包括空间域或细胞类型信息 空间组学 NA 空间代谢组学,空间转录组学 NA 空间代谢组学数据,空间转录组学数据 三个数据集,涵盖不同空间技术、组织和物种 NA 空间代谢组学,空间转录组学 NA NA
1886 2026-02-20
Genetic and embryonic transcriptome analyses reveal the molecular and developmental basis of Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser syndrome
2026-Jan-20, Journal of medical genetics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过基因和胚胎转录组分析揭示了Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征的分子和发育基础 整合外显子测序/基因组测序与单细胞RNA测序数据,识别了新的候选基因并揭示了潜在的双基因遗传模式 MRKHS的遗传病因仍不完全清楚,研究样本量有限 探究MRKHS的遗传病因和发育机制 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体,以及人类和小鼠胚胎后肾组织 遗传学与发育生物学 Mayer-Rokitansky-Küster-Hauser综合征 外显子测序,基因组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据 727名MRKHS患者和2504名女性对照个体,以及人类和小鼠胚胎后肾组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1887 2026-02-20
Tissue-specific and sex-biased glycoproteomic landscape of Schistosoma mansoni
2026-Jan-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学,对曼氏血吸虫成虫进行N-和O-糖蛋白组学及完整糖肽分析,揭示了组织特异性和性别偏向的糖基化模式 首次建立了曼氏血吸虫的糖基化数据库,识别了未分类糖链和HexA修饰,并通过RNA干扰靶向四种糖基转移酶证明了糖基化对寄生虫生存的关键作用 NA 解析曼氏血吸虫的糖蛋白组学特征,以支持基于糖链和糖蛋白的血吸虫病控制策略开发 曼氏血吸虫成虫(雄性和雌性) 糖蛋白组学 血吸虫病 N-和O-糖蛋白组学分析、完整糖肽分析、单细胞转录组学、RNA干扰 NA 蛋白质组学数据、转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1888 2026-02-20
3D reconstruction of spatial transcriptomics with spatial pattern enhanced graph convolutional neural network
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Spa3D的新方法,利用抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络从多个2D空间转录组切片重建3D空间结构,以提升空间域识别、细胞通讯分析和发育轨迹建模的准确性 首次提出结合抗泄漏傅里叶变换和图卷积神经网络进行3D空间转录组重建,克服了现有方法仅依赖2D坐标的局限,实现了在3D空间中的更精确分析 未明确提及方法在计算资源需求、处理大规模数据时的效率或对不同组织类型的适用性限制 开发一种能从2D空间转录组数据重建3D空间结构的方法,以更准确地分析空间域、空间可变基因、细胞间通讯和发育轨迹 空间转录组数据,特别是来自多个2D切片的数据 空间转录组学 NA 抗泄漏傅里叶变换,图卷积神经网络 图卷积神经网络 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1889 2026-02-20
SHEST: single-cell-level artificial intelligence from haematoxylin and eosin morphology for cell-type prediction and spatial transcriptomics reconstruction
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为SHEST的多任务分析框架,利用H&E染色形态学图像预测细胞组成并重建单细胞分辨率的空间基因表达 开发了一个统一的可解释框架,通过四重瓦片输入捕获核与上下文信息,结合邻域感知聚类算法过滤模糊细胞信号,并采用多任务优化策略处理空间转录组数据的稀疏性 NA 整合组织形态学与空间分子图谱以全面理解癌症进展 人类肺腺癌组织 数字病理学 肺癌 空间转录组学 多任务深度学习框架(包含共享形态编码器与两个任务特定头:分类器与重建器) H&E染色形态学图像,空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1890 2026-02-20
Decoding Vascular Cell Diversity: Single-Cell Approaches to Mechanisms of Vascular Disease
2026-Jan-02, Circulation research IF:16.5Q1
综述 本文综述了单细胞分析技术在血管细胞异质性研究中的应用,包括实验和计算方法,并探讨了这些方法如何揭示血管疾病的机制 应用单细胞或单核RNA测序技术识别罕见和疾病特异性细胞群体,结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序数据,提供细胞类型特异性疾病机制的新见解 NA 概述单细胞分析技术及其在血管细胞和血管疾病研究中的应用 血管细胞和组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, CRISPR扰动, 染色质可及性分析 NA RNA测序数据, 染色质可及性数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
1891 2026-02-20
Computational identification of necroptosis-related hub genes and therapeutic targets in dilated cardiomyopathy via integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing public cohorts
2026-Jan-02, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序公共队列数据,计算识别了扩张型心肌病中与坏死性凋亡相关的枢纽基因及潜在治疗靶点 首次整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq公共数据,系统性识别了DCM中与坏死性凋亡相关的5个枢纽基因,并构建了诊断模型和预测了潜在治疗药物 研究完全基于公开数据集,缺乏实验验证;样本来源和数量受限于公共数据库 识别与扩张型心肌病相关的坏死性凋亡枢纽基因,并预测潜在治疗药物 扩张型心肌病患者的心脏组织样本 生物信息学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq LASSO, 随机森林 基因表达数据 来自GEO数据库的公共队列数据集(GSE128095和GSE184899) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
1892 2026-02-20
Exploring the interconnection between PANoptosis and chronic inflammatory diseases: identifying key targets and therapeutic strategies for periodontitis and ulcerative colitis
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探索了PANoptosis(一种整合了细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡的程序性细胞死亡形式)在牙周炎和溃疡性结肠炎这两种慢性炎症性疾病中的共同分子机制,并鉴定了核心靶点基因 首次将PANoptosis概念与牙周炎和溃疡性结肠炎这两种不同解剖部位的慢性炎症性疾病联系起来,通过整合生物信息学分析、动物模型验证和单细胞RNA测序,系统性地鉴定了BAG3、LYN和APOE这三个核心靶点基因及其调控网络 研究主要基于公共数据库和动物模型,核心靶点基因在人体中的功能和治疗潜力仍需进一步的临床前和临床研究验证 识别牙周炎和溃疡性结肠炎的共同分子靶点和通路,探索PANoptosis相关基因与这两种疾病相关基因的相互作用,并预测潜在的治疗靶点和药物 牙周炎和溃疡性结肠炎相关的基因表达数据、PANoptosis相关基因、小鼠疾病模型 生物信息学 牙周炎, 溃疡性结肠炎 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, GO和KEGG富集分析, LASSO和SVM-RFE算法, 单细胞RNA测序, ceRNA网络构建, 分子对接模拟 LASSO, SVM-RFE 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的数据集(GSE16134用于牙周炎,GSE87466用于溃疡性结肠炎),以及实验性牙周炎和DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
1893 2026-02-20
Glial cells in dementia: From cellular dysfunction to therapeutic frontiers
2026 Jan-Dec, Cell transplantation IF:3.2Q2
综述 本文综述了神经胶质细胞在神经退行性痴呆中的作用,并提出了一个整合框架,探讨其从细胞功能障碍到治疗前沿的进展 提供了一个新颖的整合框架,将神经胶质细胞亚型在痴呆中的分子、细胞和环路水平病理中的相互关联角色进行映射,超越了以往孤立讨论胶质细胞功能障碍的综述 作为一篇综述,其局限性在于主要基于现有文献进行综合,未涉及新的原始实验数据或临床研究 旨在重新定义神经胶质细胞在神经退行性痴呆中的异质性和功能,并探讨靶向胶质细胞特异性通路的治疗策略 神经胶质细胞(包括星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞)在阿尔茨海默病和血管性痴呆等神经退行性痴呆中的作用 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学、胶质细胞成像 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1894 2026-02-20
The immunopathological crosstalk of diabetic periodontitis: Single-cell insights into monocyte dysregulation
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了糖尿病性牙周炎中单核细胞的免疫病理学交互作用及其功能失调机制 首次在单细胞水平上系统描述了糖尿病性牙周炎患者单核细胞的亚群变化、功能重编程和信号通路失调,并识别了关键的转录因子调控网络 研究样本量有限,且仅基于外周血单核细胞,未直接分析牙周组织中的免疫细胞,可能无法完全反映局部病理变化 探究糖尿病与牙周炎之间的免疫病理学交互作用,特别是单核细胞在其中的角色 健康对照者、牙周炎患者和糖尿病性牙周炎患者的外周血单核细胞 单细胞组学 牙周炎与2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自健康对照、牙周炎患者和糖尿病性牙周炎患者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1895 2026-02-20
Identification of key biomarkers of telomere-related genes in diabetic nephropathy via bioinformatic analysis
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定了糖尿病肾病中端粒相关基因的关键生物标志物 结合机器学习算法(LASSO回归和SVM-RFE)和单细胞测序技术,首次系统筛选并验证了糖尿病肾病中端粒相关基因如TRIM22、ELOVL4、NLGN4X和FOSB作为潜在诊断标志物和治疗靶点 研究主要依赖公共数据库的微阵列数据,样本来源和数量可能有限,且实验验证仅通过RT-PCR在有限样本中进行,需要更大规模的临床队列和功能实验进一步确认 探索糖尿病肾病的分子机制,以开发新的治疗靶点和诊断生物标志物 糖尿病肾病患者的基因表达数据、肾脏活检组织样本以及正常对照样本 生物信息学 糖尿病肾病 微阵列数据分析、机器学习算法(LASSO回归、SVM-RFE)、单细胞测序、RT-PCR LASSO回归、SVM-RFE 基因表达微阵列数据、单细胞测序数据 未明确指定具体样本数量,但使用了GEO数据库的微阵列数据、外部验证数据集以及DN和正常肾脏活检组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1896 2026-02-20
Macrophage Hypoxia Signaling Pathways and Their Roles in Sepsis
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
综述 本文综述了巨噬细胞缺氧信号通路(特别是HIF-1α)在脓毒症中的作用机制及潜在治疗策略 结合最新的单细胞转录组学数据和分子机制研究,系统性地探索了脓毒症的潜在治疗靶点和干预策略 关于缺氧信号通路影响巨噬细胞功能及疾病进展的具体机制和临床意义仍有许多未解之谜 总结缺氧相关信号通路对巨噬细胞功能及脓毒症病理过程的影响,为脓毒症精准治疗提供理论基础和研究方向 巨噬细胞 自然语言处理 脓毒症 单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1897 2026-02-20
The interaction between dendritic cells and T follicular helper cells drives inflammatory bowel disease: a review
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了树突状细胞与滤泡辅助性T细胞之间的双向相互作用在炎症性肠病发病机制中的核心作用 提出了DC-TFH细胞相互作用形成的自放大炎症回路是IBD发病的关键,并系统阐述了其分子机制及在不同疾病亚型中的特异性 该轴在疾病起始阶段的时间作用、与其他免疫通路的串扰以及从动物模型到人类疾病的转化仍存在挑战 阐明炎症性肠病的免疫发病机制,并探讨针对DC-TFH相互作用轴的治疗策略 树突状细胞、滤泡辅助性T细胞及其在肠道炎症微环境中的相互作用 NA 炎症性肠病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
1898 2026-02-20
Integrative bulk and single-cell transcriptomics link EZH2 to immunosuppressive programs and tumor-Treg crosstalk in castration-resistant prostate cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统描绘了EZH2在去势抵抗性前列腺癌中与免疫抑制程序及肿瘤-Treg细胞互作的关联 首次在晚期前列腺癌中系统整合bulk和单细胞转录组数据,揭示EZH2高表达与恶性细胞增殖状态、免疫抑制微环境及肿瘤-Treg细胞互作增强的关联,并通过EZH2抑制剂实验验证了其对相关转录程序的调控作用 研究主要基于转录组数据分析,功能性和因果机制尚需进一步实验验证,且样本队列可能受限于现有公共数据集 探究EZH2在去势抵抗性前列腺癌中的免疫调控作用及其与肿瘤微环境的相互作用 前列腺癌患者样本(包括TCGA-PRAD队列、转移性CRPC队列)及C42细胞系 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR NMF, 惩罚Cox模型, CellPhoneDB 转录组数据 多个bulk队列(TCGA-PRAD和独立转移性CRPC队列)及单细胞队列(GSE264573和独立CRPC队列),具体样本数未明确 NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
1899 2026-02-20
m6A demethylase-driven reprogramming of leukemia-associated macrophages predicts improved outcomes in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了m6A修饰调控因子在急性髓系白血病(AML)相关巨噬细胞重编程中的作用及其与患者预后的关联 首次在单细胞水平系统性地描绘了AML中巨噬细胞的m6A调控图谱,并阐明了不同m6A调控因子(写入器、擦除器、读取器)对巨噬细胞命运和功能极化的特异性影响,将m6A系统与肿瘤免疫微环境及临床预后联系起来 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证m6A调控因子的具体作用机制;样本量虽整合了多个队列,但异质性可能影响结论的普适性 探究m6A修饰调控因子在AML肿瘤免疫微环境中对巨噬细胞重编程的影响及其临床意义 急性髓系白血病(AML)患者的巨噬细胞 生物信息学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、生物信息学分析(Seurat、Harmony、Monocle3、CellChat、Metascape) NA 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据、临床样本基因表达数据 整合了来自129个患者队列的公共scRNA-seq数据集,并包含临床AML样本的验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1900 2026-02-20
CXCR6 defines a distinct resident state in γδ T cells for protecting from liver cirrhosis
2025-Dec-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞在健康状态下富集并产生IFN-γ和IL-2,但在肝硬化组织中显著减少,且其缺失与疾病严重程度相关,这些细胞通过FasL-Fas信号诱导肝星状细胞凋亡来限制纤维化进展 首次识别并表征了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞作为组织驻留记忆T细胞的一个独特亚群,并证明其在肝硬化中具有保护性作用,通过FasL-Fas信号通路抑制纤维化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且具体调控机制和临床应用潜力需进一步探索 探究γδ T细胞在肝纤维化发生和发展中的作用,特别是组织驻留记忆T细胞亚群的功能 肝脏中的γδ T细胞,特别是CD69+CXCR6+亚群,以及肝星状细胞 免疫学 肝硬化 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA RNA序列数据, 细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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