单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
18941 2024-08-05
Deciphering the sequential changes of monocytes/macrophages in the progression of IDD with longitudinal approach using single-cell transcriptome
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组分析阐明了单核细胞/巨噬细胞在间盘退变(IDD)进程中的变化 首次采用纵向研究方法系统描述了IDD进展中的免疫反应及单核细胞/巨噬细胞的不同亚群的变化 缺乏对其它免疫细胞类型变化的深入分析 研究IDD进展过程中单核细胞/巨噬细胞的时序变化及其与氧化应激的关系 针对退变的椎间盘组织中的不同细胞群体 数字病理学 间盘退变 单细胞测序,RNA测序,WGCNA,免疫浸润分析 NA 转录组数据 NA
18942 2024-08-05
Characterization of the microenvironment in different immune-metabolism subtypes of cervical cancer with prognostic significance
2023, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了宫颈癌不同免疫代谢亚型的微环境特征及其预后意义 识别出具有预后意义的宫颈癌分子亚型,并揭示了一个新的治疗靶点IMPDH1 本研究的局限性未详细说明 研究宫颈癌中免疫细胞浸润与代谢重编程的相互作用 研究对象为宫颈癌的免疫相关基因和代谢相关基因 数字病理学 宫颈癌 基因组测序,单细胞测序 无监督共识聚类 基因表达数据 使用了癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库中的数据
18943 2024-08-05
Development and validation of cuproptosis-related genes in synovitis during osteoarthritis progress
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文分析了在骨关节炎进程中与滑膜炎相关的铜死亡基因 首次探讨了铜死亡相关基因与滑膜炎及免疫细胞浸润之间的关系 缺乏直接临床验证和长期随访数据 研究铜死亡在滑膜炎中的作用及相关基因 研究五个铜死亡相关基因及其在滑膜中的表达 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA 微阵列数据 分析多个公开数据集,具体样本大小未说明
18944 2024-08-05
A systematic and comprehensive analysis of T cell exhaustion related to therapy in lung adenocarcinoma tumor microenvironment
2023, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 该文章对肺腺癌肿瘤微环境中的T细胞耗竭进行了系统和综合的分析 构建了一个基于TEX信号通路的风险模型以区分预后良好的患者和预后不良的患者 对T细胞耗竭的预后作用在恶性肺腺癌中的复杂性仍未完全理解 深入了解T细胞耗竭在肺腺癌免疫逃逸中的作用,以改善癌症免疫治疗 参与研究的498名肺腺癌患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 随机森林模型 基因表达数据 498名肺腺癌患者
18945 2024-08-05
Moxibustion improves hypothalamus Aqp4 polarization in APP/PS1 mice: Evidence from spatial transcriptomics
2023, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2
研究论文 本研究探讨了艾灸对APP/PS1小鼠下丘脑AQP4极化的影响 该研究首次通过空间转录组学技术揭示了艾灸改善下丘脑AQP4极化的机制 研究仅在APP/PS1小鼠模型中进行,缺乏对其他模型的验证 探讨艾灸是否能影响血脑屏障周围AQP4的极化 野生型小鼠、APP/PS1小鼠及接受艾灸干预的APP/PS1小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学 APP/PS1小鼠 基因表达数据 至少3种小鼠组别的样本
18946 2024-08-08
Combined scRNAseq and Bulk RNAseq Analysis to Reveal the Dual Roles of Oxidative Stress-Related Genes in Acute Myeloid Leukemia
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
研究论文 本文通过结合单细胞RNA测序(scRNAseq)和批量RNA测序(RNAseq)数据,揭示了氧化应激相关基因在急性髓系白血病(AML)中的双重作用 首次区分了具有不同功能的氧化应激相关基因,并构建了预测治疗反应的模型 NA 揭示氧化应激相关基因在急性髓系白血病发病和化疗耐药中的不同作用 急性髓系白血病细胞和正常细胞中的氧化应激功能 数字病理学 血液系统恶性肿瘤 单细胞RNA测序(scRNAseq),批量RNA测序(RNAseq) 机器学习方法 RNA序列数据 NA
18947 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals the immune microenvironment and signaling networks in cystitis glandularis
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究首次通过单细胞RNA测序技术,揭示了囊性膀胱炎的免疫微环境和信号网络 首次在囊性膀胱炎患者中进行单细胞RNA测序,揭示了新的细胞亚群和免疫细胞的激活差异 NA 全面描述囊性膀胱炎中的炎症免疫环境,为临床治疗提供基础 囊性膀胱炎患者的炎症组织和周围正常膀胱黏膜组织 数字病理学 囊性膀胱炎 单细胞RNA测序 NA 细胞 包括四个炎症组织和三个周围正常膀胱黏膜组织,共分离出18,869个细胞
18948 2024-08-08
Targeting macrophagic 17β-HSD7 by fenretinide for the treatment of nonalcoholic fatty liver disease
2023-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
研究论文 研究探讨了非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中巨噬细胞极化的分子调控机制,并评估了fenretinide作为17-HSD7抑制剂在NAFLD治疗中的潜在应用 首次揭示了17-HSD7在NAFLD中调控巨噬细胞M1极化的作用,并发现fenretinide作为潜在的NAFLD治疗药物 NA 研究17-HSD7在NAFLD中的作用及fenretinide的治疗潜力 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中的巨噬细胞极化及17-HSD7的作用 NA 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA RNA 野生型同窝仔鼠和巨噬细胞-17-HSD7敲除鼠,高脂饮食喂养6周
18949 2024-08-08
The Prognostic Model Established by the Differential Expression Genes Based on CD8+ T Cells to Evaluate the Prognosis and the Response to Immunotherapy in Osteosarcoma
2023, Mediators of inflammation IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过分析骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据,构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型,用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 首次构建了一个基于CD8+ T细胞差异表达基因的预后模型,用于评估骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 NA 探索一个能够准确评估骨肉瘤对免疫治疗反应的模型 骨肉瘤患者的预后和免疫治疗反应 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 多个骨肉瘤患者的单细胞RNA测序数据
18950 2024-08-08
Single-cell transcription analysis reveals the tumor origin and heterogeneity of human bilateral renal clear cell carcinoma
2023, Open life sciences IF:1.7Q3
研究论文 本研究通过分析来自基因表达 omnibus 数据库的单细胞转录组测序数据,揭示了人类双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源和异质性 首次通过单细胞转录组测序数据分析,揭示了双侧肾透明细胞癌的细胞类型、恶性评分、肿瘤微环境和细胞干性评分等方面的差异 研究仅基于单细胞转录组数据,未涉及其他类型的分子数据或临床数据 探究双侧肾透明细胞癌的肿瘤起源、微环境、细胞分子特征和肿瘤内异质性 双侧肾透明细胞癌的单细胞转录组数据 数字病理学 肾癌 单细胞转录组测序 NA 转录组数据 共包含来自左侧和右侧透明细胞肾细胞癌的7143个细胞
18951 2024-08-08
Comprehensive analysis to identify the influences of SARS-CoV-2 infections to inflammatory bowel disease
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞分析,探讨了COVID-19与炎症性肠病(IBD)之间的分子和细胞交集,以理解COVID-19对IBD患者的影响 本研究首次通过转录组和单细胞RNA测序数据,揭示了COVID-19与IBD之间的共同差异表达基因(DEGs)和免疫细胞类型比例的变化,为理解两者之间的关联提供了新的视角 本研究主要基于已有的RNA测序和单细胞RNA测序数据集,可能存在样本选择偏倚和数据集之间的异质性问题 探讨COVID-19感染对炎症性肠病(IBD)的影响及其分子机制 COVID-19与炎症性肠病(IBD)之间的共同差异表达基因和免疫细胞类型 数字病理学 炎症性肠病 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞数据 四个RNA测序数据集和两个单细胞RNA测序数据集
18952 2024-08-08
Single-cell RNA transcriptomics reveals differences in the immune status of alcoholic and hepatitis B virus-related liver cirrhosis
2023, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异 首次通过单细胞RNA测序揭示了酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异,并发现Galectin-9可能作为酒精性肝硬化治疗的新靶点 研究样本量较小,仅包括15个肝脏样本,可能影响结果的普遍性 探索酒精性和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态差异 酒精性肝硬化和乙型肝炎病毒相关肝硬化的免疫状态 数字病理学 肝硬化 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 15个肝脏样本,包括5个健康对照组、5个酒精性肝硬化患者组和5个乙型肝炎病毒相关肝硬化患者组
18953 2024-08-08
Single-cell transcriptomic profile of satellite glial cells in trigeminal ganglion
2023, Frontiers in molecular neuroscience IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了三叉神经节中卫星胶质细胞的转录组特征 首次揭示了三叉神经节中卫星胶质细胞的分子特征、异质性及其与神经元亚型的双向相互作用 NA 深入理解三叉神经节中卫星胶质细胞的转录特征及其与神经元的相互作用 三叉神经节中的卫星胶质细胞及其与神经元的相互作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 包含九种细胞集群,如神经元、卫星胶质细胞、有髓鞘施万细胞、无髓鞘施万细胞、免疫细胞等
18954 2024-08-08
Developmental deficits of MGE-derived interneurons in the Cntnap2 knockout mouse model of autism spectrum disorder
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究探讨了Cntnap2敲除小鼠模型中,源自内侧神经节隆起(MGE)的中间神经元在自闭症谱系障碍(ASD)中的发育缺陷 首次揭示了Cntnap2敲除小鼠中,MGE来源的中间神经元在发育过程中的细胞增殖增加和细胞死亡增多现象,以及Lhx6表达的胆碱能中间神经元的细胞和分子改变 NA 追踪纹状体发育中的中间神经元,并阐明其在Cntnap2敲除小鼠模型中的分子和生理改变 Cntnap2敲除小鼠模型中的中间神经元 神经科学 自闭症谱系障碍 Stereo-seq和单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
18955 2024-08-08
Acute injury to the mouse carotid artery provokes a distinct healing response
2023, Frontiers in physiology IF:3.2Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠颈动脉在导丝损伤后的愈合反应,重点关注了平滑肌细胞和成纤维细胞群体,并探讨了干细胞/内皮细胞/单核细胞(SEM)在损伤修复中的作用。 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了小鼠颈动脉损伤后的愈合过程,并识别了可能参与血管再生的SEM细胞。 研究仅限于小鼠模型,且未探讨SEM细胞在人体中的作用和潜在的治疗应用。 深入了解血管损伤后的愈合过程,特别是平滑肌细胞和SEM细胞在其中的作用。 小鼠颈动脉损伤后的组织愈合反应。 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠颈动脉组织样本
18956 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing analysis of human Alzheimer's disease brain samples reveals neuronal and glial specific cells differential expression
2023, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序分析了阿尔茨海默病患者大脑样本中的神经元和胶质细胞特异性差异表达 首次在单细胞水平上揭示了阿尔茨海默病患者大脑中不同细胞类型的转录组变化 未测量APOE状态、CERAD和THAL评分 识别阿尔茨海默病中受影响的特定神经元群体的独特转录网络 阿尔茨海默病患者大脑样本中的神经元和胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 从两个阿尔茨海默病患者和匹配的对照组中收集了超过25,000个单核
18957 2024-08-08
Single-cell RNA landscape of the special fiber initiation process in Bombax ceiba
2023-09-11, Plant communications IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了木棉树纤维细胞分化过程中的分子机制 发现了木棉树纤维细胞发育的独特机制,与传统棉花纤维启动过程不同 NA 揭示木棉树纤维细胞分化和发育的基因表达特征 木棉树纤维细胞的分化过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 15,567个高质量细胞
18958 2024-08-05
Improved in situ sequencing for high-resolution targeted spatial transcriptomic analysis in tissue sections
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 提出了一种改进的原位测序方法,用于在组织切片中进行高分辨率的靶向空间转录组分析 采用新的探针和条形码方法,结合先进的图像分析流程,提高了原位测序的信号强度和特异性 NA 旨在改进原位测序技术,以实现精准的空间基因表达轮廓分析 针对新鲜冷冻组织和福尔马林固定石蜡包埋组织切片的单细胞空间基因表达进行分析 数字病理学 NA 原位测序(IISS) NA 基因表达数据 NA
18959 2024-08-08
Chemoresistance in acute myeloid leukemia: An alternative single-cell RNA sequencing approach
2023-Aug, Hematological oncology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了急性髓系白血病(AML)细胞的遗传特征,以识别“7+3”诱导化疗耐药的潜在机制 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析AML细胞的遗传特征,揭示了化疗耐药AML细胞在早期造血过程中的提前积累现象 研究样本仅包括13名未经治疗的AML患者,可能不足以全面代表所有AML患者的情况 识别急性髓系白血病中“7+3”诱导化疗耐药的潜在机制 急性髓系白血病细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 13名未经治疗的AML患者,共28,950个AML细胞
18960 2024-08-08
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-Aug-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了免疫疗法和放疗诱导的肺损伤中衰老细胞谱系的变化 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了免疫疗法和放疗诱导的肺损伤中衰老细胞的积累及其病理机制 研究仅限于C57/BL6小鼠模型,尚未在人类中验证这些发现 探究免疫疗法和放疗诱导的肺损伤的细胞和分子机制 C57/BL6小鼠的肺组织 数字病理学 肺损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 75,396个细胞
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