单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
18921 2024-08-08
MiRNA and Potential Prognostic Value in Non-Smoking Females with Lung Adenocarcinoma by High-Throughput Sequencing
2023, International journal of general medicine IF:2.1Q2
研究论文 本研究旨在探索非吸烟女性肺腺癌中的预后相关差异表达miRNA,并建立预后模型 构建了一个基于三种差异表达miRNA的新型预后模型,用于预测非吸烟女性肺腺癌的生存情况 样本量较小,仅包含8个样本 探索非吸烟女性肺腺癌中的预后相关差异表达miRNA并建立预后模型 非吸烟女性肺腺癌患者 数字病理学 肺腺癌 miRNA测序 Cox回归分析 miRNA数据 8个非吸烟女性肺腺癌手术样本
18922 2024-08-08
Epstein-Barr virus DNA seropositivity links distinct tumoral heterogeneity and immune landscape in nasopharyngeal carcinoma
2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 研究探讨了Epstein-Barr病毒DNA血清阳性(Sero+)和血清阴性(Sero-)的鼻咽癌(NPC)在肿瘤异质性和免疫景观上的差异 通过单细胞RNA测序分析,揭示了Sero+和Sero- NPC在细胞组成和功能上的多细胞生态系统差异 研究样本量较小,可能影响结果的普遍性 阐明Epstein-Barr病毒DNA血清状态与鼻咽癌肿瘤微环境特征的关系,为合理免疫治疗策略的发展提供见解 Epstein-Barr病毒DNA血清阳性和阴性的鼻咽癌患者 数字病理学 鼻咽癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 28,423个细胞来自十个NPC样本和一个非肿瘤鼻咽组织
18923 2024-08-08
New perspective of skeletal stem cells
2022, Biomaterials translational
综述 本文综述了骨骼干细胞(SSCs)的空间和时间分布,以及近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 利用荧光激活细胞分选、谱系追踪和单细胞测序技术,研究了具有不同时空分布的SSCs的谱系轨迹 NA 探讨骨骼干细胞的空间和时间分布,并总结近年来对SSCs多样性和可塑性的研究进展 骨骼干细胞(SSCs)及其在不同组织中的分布和功能 干细胞生物学 NA 荧光激活细胞分选、谱系追踪、单细胞测序 NA 细胞 NA
18924 2024-08-08
Advances in understanding the formation and fate of B-cell memory in response to immunization or infection
2021, Oxford open immunology
综述 本文综述了近年来在理解免疫接种或感染后B细胞记忆形成和命运方面的进展 利用单细胞测序技术和其他尖端技术,提高了对生发中心内B细胞命运决策的研究分辨率和准确性 NA 探讨免疫记忆的形成机制及其对新病原体如严重急性呼吸综合征冠状病毒2的持久免疫潜力 B细胞记忆的形成和命运 免疫学 NA 单细胞测序技术 NA 细胞 NA
18925 2024-08-05
Single-cell profiling reveals various types of interstitial cells in the bladder
2023-Sep, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究揭示了膀胱中不同类型的间质细胞及其功能和位置 识别了膀胱组织中两种重要的间质细胞类型,并强调了其在正常生理、药物诱导损伤及衰老中的作用 该研究可能未探讨所有间质细胞的种类及其相互作用 探讨膀胱间质细胞的定位、分子标志物、功能与角色 人类、老鼠和大鼠膀胱组织的单细胞数据 数字病理学 NA 单细胞测序 NA NA 人类、老鼠和大鼠的膀胱组织样本
18926 2024-08-08
Decellularised spinal cord matrix manipulates glial niche into repairing phase via serglycin-mediated signalling pathway
2023-Sep, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本文研究了脱细胞脊髓基质(DSCM)通过serglycin介导的信号通路调控神经胶质微环境,促进脊髓损伤修复的机制 首次揭示了DSCM通过serglycin介导的信号通路逆转星形胶质细胞成熟,改变胶质微环境进入修复阶段 NA 探究DSCM调控胶质微环境在神经-胶质-血管单元中的机制 脱细胞脊髓基质(DSCM)、星形胶质细胞、神经前体细胞 神经科学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
18927 2024-08-05
Single-cell sequencing of entorhinal cortex reveals widespread disruption of neuropeptide networks in Alzheimer's disease
2023-08, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究揭示了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 首次使用单细胞转录组数据明确了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 研究可能受限于样本大小和选择偏差 探讨神经肽网络在阿尔茨海默病中的破坏情况 阿尔茨海默病中颞叶皮层的神经肽表达情况 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞转录组测序 机器学习 转录组数据 NA
18928 2024-08-08
GGC repeat expansion in NOTCH2NLC induces dysfunction in ribosome biogenesis and translation
2023-08-01, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 研究探讨了NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制,特别是在神经元内核包涵体病(NIID)中的作用 使用患者特异性的诱导多能干细胞(iPSC)衍生的三维大脑类器官(3DCOs)和细胞模型,揭示了NOTCH2NLC GGC重复序列扩展导致的核仁应激和核糖体生物发生及翻译功能障碍 NA 研究NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制 NOTCH2NLC基因中的GGC重复序列扩展及其在神经元内核包涵体病(NIID)中的作用 遗传学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 3D大脑类器官(3DCOs) RNA 使用患者特异性的诱导多能干细胞(iPSC)衍生的三维大脑类器官(3DCOs)和细胞模型进行研究
18929 2024-08-05
Phylogenetic placement of the protosteloid amoeba Microglomus paxillus identifies another case of sporocarpic fruiting in Discosea (Amoebozoa)
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology IF:2.1Q3
研究论文 该文章探讨了原昔体阿米巴Microglomus paxillus的系统发育定位,揭示了Discosea中 sporocarpic fruiting的另一个案例 通过单细胞转录组学分析,首次为Microglomus paxillus提供了系统发育信息,阐明了其与Discosea的亲缘关系 SSU rRNA序列的高度变异性限制了我们在丰富的分类数据集中进一步阐明M. paxillus的系统发育位置 澄清sporocarpic fruiting的进化背景 原昔体阿米巴Microglomus paxillus的个体样本 NA NA 单细胞转录组学 NA 蛋白编码标记数据 229个蛋白编码标记
18930 2024-08-05
Heterogeneity and plasticity of epithelial-mesenchymal transition (EMT) in cancer metastasis: Focusing on partial EMT and regulatory mechanisms
2023-Jun, Cell proliferation IF:5.9Q2
综述 这篇文章总结了癌症转移中上皮-间质转化(EMT)的异质性和动态特性 提出了肿瘤细胞如何调节自身以保持特定EMT转化状态的跷跷板模型,并强调了EMT异质性与胃癌预后不良的密切关系 文章回顾了EMT信号在临床应用中的当前状态和局限性 探讨EMT转化状态在肿瘤转移中的直接和间接作用 集中讨论部分EMT的特征、生物标志物和分子机制 数字病理学 胃癌 单细胞测序 NA NA NA
18931 2024-08-05
PDPN positive CAFs contribute to HER2 positive breast cancer resistance to trastuzumab by inhibiting antibody-dependent NK cell-mediated cytotoxicity
2023-05, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究识别了一种新的与 trastuzumab 抗药性相关的 PDPN 阳性 CAFs 亚群 首次发现 PDPN 阳性 CAFs 在 trastuzumab 抗药性肿瘤组织中富集,并通过分泌免疫抑制因子抑制 NK 细胞介导的 ADCC 研究中可能未全面评估所有类型的免疫反应和其他潜在的肿瘤微环境因素 研究 PDPN 阳性 CAFs 如何影响 HER2 阳性乳腺癌对 trastuzumab 的抗药性 HER2 阳性乳腺癌患者的肿瘤组织及其 CAFs 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序 NA 组织样本 NA
18932 2024-08-05
Distinct stage-specific transcriptional states of B cells derived from human tonsillar tissue
2023-04-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文研究了源自人类扁桃体的B细胞的不同阶段特异性转录状态 识别出一种我们认为之前未被描述的表达CCL4/CCL3化学趋化因子的B细胞亚群,并提出了一种基于调控网络推断和伪时间建模的计算方法 研究可能仅限于来源于扁桃体的B细胞,对其他组织的B细胞状态缺乏比较 探索扁桃体来源B细胞的激活和成熟状态 扁桃体来源的B细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 伪时间建模 NA NA
18933 2024-08-05
CD11c+ macrophages are proangiogenic and necessary for experimental choroidal neovascularization
2023-04-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文研究了CD11c+巨噬细胞在实验性脉络膜新生血管中的促血管生成作用。 该研究首次揭示了Spp1+巨噬细胞和CD11c+巨噬细胞的功能特性及其在脉络膜新生血管形成中的重要作用。 本文未提及对巨噬细胞异质性研究的临床应用和长期影响的评估。 研究CD11c+巨噬细胞在与neovascular AMD相关的脉络膜新生血管中的作用。 研究重点是小鼠模型中的免疫细胞和巨噬细胞群体。 数字病理学 老年性黄斑变性 单细胞RNA测序 激光诱导脉络膜新生血管模型 基因表达数据 使用了来自于WT和Ccr2-/-小鼠的免疫细胞样本
18934 2024-08-05
A miRNA/CXCR4 signaling axis impairs monopoiesis and angiogenesis in diabetic critical limb ischemia
2023-04-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究揭示了miR-181在糖尿病危重肢体缺血中的作用机制 探讨了miRNA/CXCR4信号轴在糖尿病患者中对单核细胞生成和血管生成的影响 尚需进一步研究以完全理解糖尿病与CLI之间的潜在机制 阐明糖尿病危重肢体缺血患者中miR-181的作用及其对单核细胞生成的影响 糖尿病患者及其在小鼠模型中的表现 数字病理学 下肢缺血 miRNA测序 小鼠模型 生物样本 糖尿病患者的血浆样本和高脂饮食下的miRNA-KO小鼠
18935 2024-08-05
Establishment of a risk score model for bladder urothelial carcinoma based on energy metabolism-related genes and their relationships with immune infiltration
2023-04, FEBS open bio IF:2.8Q3
研究论文 本文建立了基于能量代谢相关基因的膀胱尿路上皮癌风险评分模型,并探讨其与免疫浸润的关系 创新点在于构建了一个风险评分模型,该模型有效关联了能量代谢相关基因与膀胱尿路上皮癌患者的预后及免疫微环境 本研究的局限性在于未提供样本的详细 demographic 信息,可能影响模型的广泛适用性 研究目的是寻找膀胱尿路上皮癌患者的有效预后生物标志物 研究对象为膀胱尿路上皮癌患者及其相关基因信息 数字病理学 膀胱癌 RNA测序 Cox回归分析 基因表达数据 584个能量代谢相关基因样本
18936 2024-08-05
Deciphering inhibitory neuron development: The paths to diversity
2023-04, Current opinion in neurobiology IF:4.8Q1
评论 本文探讨了抑制性神经元的发育及其多样性的形成机制 该文章通过单细胞测序的新见解阐明了GABA能神经元多样性出现的机制 NA 阐明抑制性神经元发育过程中的命运决策与多样性形成 GABA能神经元及其前体细胞 神经生物学 NA 单细胞测序 NA NA NA
18937 2024-08-05
DZIP1 expressed in fibroblasts and tumor cells may affect immunosuppression and metastatic potential in gastric cancer
2023-Apr, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究探讨了DZIP1在胃癌中的作用及其在免疫抑制和转移潜力中的影响 发现DZIP1在肿瘤相关成纤维细胞和恶性上皮细胞中上调,并参与肿瘤微环境的形成 该研究可能受限于单细胞测序的样本选择和数据解析 研究DZIP1如何影响胃癌的免疫抑制环境和转移过程 研究对象包括肿瘤相关成纤维细胞和恶性胃癌细胞 数字病理学 胃癌 单细胞测序 NA NA NA
18938 2024-08-08
Novel TCF21high pericyte subpopulation promotes colorectal cancer metastasis by remodelling perivascular matrix
2023-04, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究探讨了肿瘤周细胞(TPCs)的异质性及其对结直肠癌(CRC)转移的影响 发现了新的TCF21high周细胞亚群,该亚群通过重塑血管周围基质促进结直肠癌的肝转移 NA 研究肿瘤周细胞在血行转移中的作用及其对结直肠癌转移的影响 结直肠癌患者的肿瘤周细胞及其与肝转移的关系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质免疫沉淀测序、亚硫酸氢盐测序 NA RNA序列 从结直肠癌患者中分离的肿瘤周细胞,包括有和无肝转移的患者
18939 2024-08-08
Cell selectivity in succinate receptor SUCNR1/GPR91 signaling in skeletal muscle
2023-04-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
研究论文 研究探讨了琥珀酸受体SUCNR1在骨骼肌中的细胞选择性和信号传导机制 首次揭示了SUCNR1在人类骨骼肌中不表达于肌肉纤维,而是与巨噬细胞群体共存,且M2极化巨噬细胞对SUCNR1激动剂有响应 研究未明确琥珀酸激活SUCNR1的具体细胞间通信方向性 旨在阐明SUCNR1在人类骨骼肌中的表达特性及其在运动适应性反应中的作用 人类骨骼肌中的SUCNR1表达及其在细胞层面的响应 NA NA 单细胞RNA测序, 荧光RNAscope NA 转录组数据 涉及人类骨骼肌、免疫、脂肪和肝脏组织样本
18940 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis of the mouse and primate ovaries reveals oocyte-specific expression patterns of risk genes in ovarian aging
2023-Apr, MedComm IF:10.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
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