单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 18901 - 18920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18901 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell characterisation of the immune heterogeneity of atherosclerosis identifies novel targets for immunotherapy
2023-02-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01540-2
PMID:36855107
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研究论文 | 本文通过整合多样本的测序结果，探讨了动脉粥样硬化中的免疫细胞异质性 | 通过增强的单细胞测序工作流程，识别出28种不同的免疫细胞亚群，并提供了新的免疫治疗靶点 | 研究可能受限于样本数量和种类的多样性 | 研究旨在揭示动脉粥样硬化中免疫细胞的异质性 | 研究对象为参与动脉粥样硬化过程的不同亚群免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个样本（确切样本数量未提供） |
| 18902 | 2024-08-05 |
Supplementation with α-ketoglutarate improved the efficacy of anti-PD1 melanoma treatment through epigenetic modulation of PD-L1
2023-02-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05692-5
PMID:36854755
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研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸对抗PD1黑色素瘤治疗的影响 | 研究首次阐明了α-酮戊二酸通过调节PD-L1的表观遗传机制改善抗PD1治疗效果 | 研究中涉及的样本量可能不足以全面验证结果的普遍性 | 提升抗PD1治疗黑色素瘤的疗效 | 健康对照者、抗PD1敏感的黑色素瘤小鼠和患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和前临床样本 | NA |
| 18903 | 2024-08-08 |
A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery
2023-Feb-28, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00991-y
PMID:36849879
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的计算生物学方法，用于评估子痫前期的风险并发现驱动基因 | 首次设计了一种使用单细胞转录组数据来识别病理细胞亚群并预测子痫前期风险的计算生物学方法，并开发了一个在线网络服务器以提高可访问性 | NA | 开发一种有效的机器学习方法来评估子痫前期的风险并发现相关的驱动基因 | 健康妊娠和早期发作子痫前期的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 集成学习框架 | 转录组数据 | 健康妊娠38周和早期发作子痫前期28-32周的样本 |
| 18904 | 2024-08-08 |
Automating iPSC generation to enable autologous photoreceptor cell replacement therapy
2023-02-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03966-2
PMID:36855199
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研究论文 | 本研究描述了使用Cell X精密机器人细胞培养平台实现临床级患者特异性iPSC的并行生产 | 开发了一种机器人iPSC生成平台和标准操作程序，用于生产高质量的光感受器前体细胞，符合当前的良好制造规范 | NA | 实现自体iPSC介导的光感受器细胞替换疗法 | 患者特异性iPSC的并行生产 | 细胞生物学 | 遗传性视网膜变性 | 细胞培养平台 | NA | 细胞 | NA |
| 18905 | 2024-08-05 |
A variational algorithm to detect the clonal copy number substructure of tumors from scRNA-seq data
2023-02-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36790-9
PMID:36841879
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研究论文 | 本文报告了一种快速的变分算法SCEVAN，用于从单细胞RNA测序数据中解卷肿瘤的克隆亚结构 | SCEVAN利用多通道分割算法，假设同一拷贝数克隆的所有细胞共享相同的断点，提供了一种新的分析肿瘤的方法 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在肿瘤微环境中的应用 | 不同肿瘤类型和技术下的106个样本及93,322个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分算法 | 细胞数据 | 106个样本，93,322个细胞 |
| 18906 | 2024-08-05 |
Mapping Spatiotemporal Heterogeneity in Tumor Profiles by Integrating High-Throughput Imaging and Omics Analysis
2023-Feb-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.2c06659
PMID:36844580
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综述 | 本文回顾了高通量成像和组学分析在肿瘤异质性映射中的应用 | 探讨了最新的技术趋势和生物学见解，结合了分子诊断和空间转录组学的发展 | 对异质性出现原因的理解仍然不完整，限制了从治疗角度管理异质性的能力 | 研究肿瘤内部异质性的动态演变 | 聚焦于肿瘤细胞类型和基质成分的异质性 | 数字病理学 | NA | 高通量分子成像、单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 18907 | 2024-08-05 |
Protoplast Preparation for Algal Single-Cell Omics Sequencing
2023-Feb-20, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms11020538
PMID:36838504
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review | 本文综述了制备藻类原生质体的方法，以便于单细胞测序的应用 | 创新点在于总结了藻类细胞壁的结构及化学成分，并介绍了多种制备藻类原生质体的先进方法 | 该综述主要集中在当前已知的制备方法，没有涉及新兴或未广泛应用的技术 | 探讨单细胞测序在真核藻类研究中的应用潜力 | 关注于绿藻门的藻类细胞壁和原生质体的制备 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及一些常用真核藻类的特定案例 |
| 18908 | 2024-08-08 |
Proteomic and single-cell landscape reveals novel pathogenic mechanisms of HBV-infected intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106003
PMID:36852159
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序、蛋白质组分析和单细胞RNA测序，揭示了HBV感染的肝内胆管癌（ICC）的新型致病机制 | 首次揭示了HBV感染的ICC患者中细胞间连接水平下降与上皮-间质转化（EMT）程序增加的关系，以及ICAM1肿瘤相关巨噬细胞与不良预后的关联 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨HBV感染对肝内胆管癌的致癌效应及其相关致病机制 | HBV感染的肝内胆管癌患者与非HBV感染的ICC患者 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、蛋白质数据、单细胞RNA数据 | 32名HBV感染的ICC患者和89名非HBV感染的ICC患者 |
| 18909 | 2024-08-08 |
The PD-L1 Expression and Tumor-Infiltrating Immune Cells Predict an Unfavorable Prognosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma and Adenosquamous Carcinoma
2023-Feb-09, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041398
PMID:36835933
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研究论文 | 研究探讨了肿瘤微环境中的PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞与胰腺导管腺癌及腺鳞癌患者预后之间的关系 | 首次详细分析了PD-L1表达和肿瘤浸润免疫细胞在胰腺导管腺癌及腺鳞癌中的临床意义 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 探究肿瘤微环境中的免疫细胞组成及其对胰腺癌预后的影响 | 胰腺导管腺癌和腺鳞癌患者的肿瘤微环境及免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 免疫组织化学, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 29例腺鳞癌患者和54例胰腺导管腺癌患者 |
| 18910 | 2024-08-08 |
The Role of Ferroptosis and Cuproptosis in Curcumin against Hepatocellular Carcinoma
2023-Feb-08, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules28041623
PMID:36838613
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研究论文 | 研究了姜黄素在肝细胞癌治疗中通过铁死亡和铜死亡机制的作用 | 开发了铜死亡潜力指数（CPI）并与铁死亡潜力指数（FPI）结合，用于定量分析姜黄素处理的肝细胞癌细胞 | NA | 探讨姜黄素在肝细胞癌治疗中的作用机制，特别是铁死亡和铜死亡的影响 | 姜黄素处理下的PLC、KMCH和Huh7细胞 | NA | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA），单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 702、515和721个差异表达基因分别来自姜黄素处理的PLC、KMCH和Huh7细胞，以及16种肝细胞癌亚型的单细胞转录组数据 |
| 18911 | 2024-08-05 |
Artificial Intelligence-Assisted Transcriptomic Analysis to Advance Cancer Immunotherapy
2023-Feb-06, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12041279
PMID:36835813
|
综述 | 本文总结了人工智能辅助的转录组技术在癌症免疫治疗中的应用和新发现 | 探讨了AI辅助转录组分析在理解肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫相关不良事件机制方面的新见解 | 没有提及具体的实验数据或示例支持的具体结果 | 旨在提高癌症免疫治疗的有效性和理解其机制 | 主要研究肿瘤异质性、肿瘤微环境及其对免疫治疗的影响 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 18912 | 2024-08-05 |
Complex hierarchical structures in single-cell genomics data unveiled by deep hyperbolic manifold learning
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277068.122
PMID:36849204
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的模型，用于在低维超曲面空间中可视化单细胞RNA-seq数据的复杂层级结构 | 创新点在于提出了scDHMap模型，它优化了用于处理稀疏单细胞计数数据的层级结构可视化 | 现有基于超曲面的方法存在基本限制，尚未针对稀疏单细胞计数数据进行优化 | 研究旨在使用低维超曲面空间可视化单细胞基因组数据中的复杂层次结构 | 研究对象为单细胞RNA-seq和单细胞ATAC-seq数据 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 深度学习模型 | 数据计数矩阵 | 广泛的模拟和真实实验 |
| 18913 | 2024-08-08 |
[Preliminary Results of Single-cell Transcriptome Sequencing in Renal Arterial Lesions of Takayasu Arteritis]
2023-Feb, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
DOI:10.3881/j.issn.1000-503X.15006
PMID:36861160
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在Takayasu动脉炎（TA）患者肾动脉病变中的初步应用 | 首次使用scRNA-seq技术探索TA患者肾动脉病变的细胞异质性，并比较了两种不同消化协议对细胞比例的影响 | 样本量较小，仅包括2名TA患者 | 探索scRNA-seq在TA患者肾动脉病变中的应用 | TA患者肾动脉病变的细胞组成 | 数字病理学 | Takayasu动脉炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 2名TA患者，共2920个细胞 |
| 18914 | 2024-08-05 |
Exploring the role of sphingolipid-related genes in clinical outcomes of breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1116839
PMID:36860848
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研究论文 | 本研究探讨了与鞘脂相关的基因在乳腺癌临床结果中的作用 | 本研究建立了一个基于七个鞘脂相关基因的乳腺癌预后模型，首次将这些基因与临床结果、肿瘤进展和免疫变化联系起来 | 本研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能存在样本选择和数据完整性方面的局限 | 研究乳腺癌患者临床结果与鞘脂代谢基因的关系 | 乳腺癌患者的临床数据与肿瘤细胞系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序分析 (scRNA-seq), Cox回归分析, Lasso回归分析 | 预后模型 | 基因表达数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌数据 |
| 18915 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq to construct prognostic signatures to explore the role of glutamine metabolism in breast cancer
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1135297
PMID:36843602
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA-seq和大规模RNA-seq来构建预后特征，以探讨谷氨酸代谢在乳腺癌中的作用 | 提出了一种全新的预后风险特征，基于与谷氨酸代谢相关的基因，能够提高乳腺癌患者的预后预测 | 本研究可能受到公共数据集的限制，可能缺乏特定人群的验证 | 探讨谷氨酸代谢在乳腺癌患者预后中的作用 | 乳腺癌患者，涉及谷氨酸代谢相关基因的研究 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | WGCNA，Cox模型 | 转录组数据 | NA |
| 18916 | 2024-08-05 |
TNFR2 expression predicts the responses to immune checkpoint inhibitor treatments
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1097090
PMID:36865537
|
研究论文 | 研究表明TNFR2的表达可以预测癌症患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 提出TNFR2作为预测免疫检查点抑制剂疗效的新生物标志物 | 研究的结果需要进一步验证以加强其可靠性 | 识别新的生物标志物以提高免疫检查点抑制剂疗法的疗效 | 重点研究TNFR2在肿瘤微环境中对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 分析的样本来自全癌症数据库的单细胞RNA-seq数据 |
| 18917 | 2024-08-05 |
iSC.MEB: an R package for multi-sample spatial clustering analysis of spatial transcriptomics data
2023, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbad019
PMID:36845201
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研究论文 | 本文介绍了iSC.MEB，一个用于空间转录组数据的多样本空间聚类分析的R软件包 | iSC.MEB结合了经验贝叶斯方法和隐藏马尔可夫随机场，允许用户同时估计批次效应并进行空间聚类 | NA | 提高空间转录组数据的分析能力 | 空间转录组数据集 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | 隐藏马尔可夫随机场 | 转录组数据 | 两个空间转录组数据集 |
| 18918 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Reveals Necroptosis-Related Prognostic Genes of Glioblastoma
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/2926655
PMID:36860730
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研究论文 | 这篇文章探讨了与凋亡相关的预后基因在神经胶质瘤中的作用 | 该研究识别了神经胶质瘤中的凋亡相关基因并构建了一个风险模型，提出了新的预后标志 | 样本仅来自手术样本，可能未能代表所有GBM患者 | 研究胃肠道肿瘤的凋亡作用及其对预后的影响 | 研究对象为神经胶质瘤（GBM）患者的组织样本 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 手术样本分析获得的样本数量未明确提及 |
| 18919 | 2024-08-08 |
High GNG4 predicts adverse prognosis for osteosarcoma: Bioinformatics prediction and experimental verification
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.991483
PMID:36845726
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研究论文 | 本研究旨在阐明GNG4在骨肉瘤中的生物学作用及其预后价值 | 首次通过生物信息学分析和实验验证，确定GNG4在骨肉瘤中的高表达作为致癌基因和可靠的预后标志物 | NA | 阐明GNG4在骨肉瘤中的生物学作用及其预后价值 | GNG4在骨肉瘤中的表达及其对预后的影响 | NA | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 58例骨肉瘤样本 |
| 18920 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the metabolic changes and the prognostic value of malignant hepatocyte subpopulations and predict new therapeutic agents for hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1104262
PMID:36860314
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了恶性肝细胞亚群的代谢变化及其预后价值，并预测了肝细胞癌的新治疗药物 | 利用单细胞RNA测序技术分析了肝细胞癌中的细胞亚群，并通过基因集富集分析探索了不同细胞亚群间的通路异质性 | NA | 探讨肝细胞癌中的代谢变化及其预后价值，并寻找新的治疗策略 | 肝细胞癌的细胞亚群及其代谢变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 转录组数据 | 使用了TCGA和GEO数据库中的数据，具体样本数量未详细说明 |