单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
18861 2024-08-07
A novel phenotype of B cells associated with enhanced phagocytic capability and chemotactic function after ischemic stroke
2023-Nov, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究识别了一种与缺血性中风后增强的吞噬能力和趋化功能相关的新型B细胞表型 发现了具有巨噬细胞样特性的B细胞,这些细胞表现出增强的吞噬和趋化功能,并上调了与吞噬作用相关的基因表达 NA 探讨B细胞在缺血性中风中的作用及其潜在的免疫治疗价值 B细胞在缺血性中风中的表型及其功能 NA 缺血性中风 单细胞RNA测序 NA 细胞 包括小鼠和人类创伤性脑损伤、阿尔茨海默病和胶质母细胞瘤的脑组织样本
18862 2024-08-05
Single-cell transcriptomics identifies perturbed molecular pathways in midbrain organoids using α-synuclein triplication Parkinson's disease patient-derived iPSCs
2023-Oct, Neuroscience research IF:2.4Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学识别帕金森病患者来源的中脑器官中受扰动的分子通路 首次深入分析SNCA三重拷贝、揭示多巴胺神经元中氧化磷酸化、翻译和内质网蛋白折叠的分子功能障碍 NA 研究中脑多巴胺神经元在帕金森病中的变化及其分子机制 通过来自健康和帕金森病患者的诱导性多能干细胞生成的中脑器官 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自健康和帕金森病捐赠者的iPSC生成的中脑器官
18863 2024-08-07
Comprehensive analyses of brain cell communications based on multiple scRNA-seq and snRNA-seq datasets for revealing novel mechanism in neurodegenerative diseases
2023-10, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究基于多组scRNA-seq和snRNA-seq数据,系统分析了大脑细胞间的通信,揭示了神经退行性疾病中的新机制 本研究整合了四种方法评估六种主要脑细胞类型间的配体-受体相互作用得分,并构建了阿尔茨海默病早期预测模型 NA 探索大脑细胞通信,揭示正常脑功能和神经退行性疾病中的生物学机制 大脑细胞通信,特别是神经退行性疾病中的细胞通信 数字病理学 神经退行性疾病 scRNA-seq, snRNA-seq NA RNA-seq数据 共提取了1,039,459个细胞,来自28个脑单细胞RNA测序(scRNA-seq)或单核RNA测序(snRNA-seq)数据集,包括12个人类和16个老鼠数据集
18864 2024-08-07
Secondary bile acids function through the vitamin D receptor in myeloid progenitors to promote myelopoiesis
2023-09-12, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本文研究了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓中的髓系前体细胞促进髓系生成的作用 首次揭示了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓髓系前体细胞中的作用,以及这种作用对骨髓造血和炎症疾病潜在影响的新机制 NA 探讨微生物代谢产物对造血作用的影响,特别是胆酸的作用及其机制 次级胆酸(脱氧胆酸和石胆酸)及其在骨髓髓系生成中的作用 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 骨髓细胞和造血干细胞及前体细胞
18865 2024-08-07
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and immune microenvironment of cervical precancerous lesions
2023-09, Cancer communications (London, England)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18866 2024-08-07
Identification of evolutionary mechanisms of myelomatous effusion by single-cell RNA sequencing
2023-08-08, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序分析了骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的转录组,以识别多发性骨髓瘤浆膜腔积液的进化机制 本研究首次定义了外周起始细胞(EMICs)并发现LILRB4在其中的上调,证实了LILRB4促进骨髓瘤细胞的体外迁移 研究样本量较小,仅涉及3名患者 探索多发性骨髓瘤浆膜腔积液的分子机制 骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 3名患者
18867 2024-08-05
Somatosensory neuron types and their neural networks as revealed via single-cell transcriptomics
2023-08, Trends in neurosciences IF:14.6Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学在脊髓后根神经节(DRG)神经元类型及其神经网络研究中的应用 整合了以往DRG转录组研究的发现,并提出进一步研究的建议 缺乏统一的分类标准,使得DRG神经元的类型鉴定存在困难 旨在全面了解DRG神经元的转录状态及其在生理和慢性疼痛中的作用 主要研究脊髓后根神经节中的不同类型神经元 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA NA NA
18868 2024-08-07
Mapping the transcriptional landscape of human white and brown adipogenesis using single-nuclei RNA-seq
2023-08, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 通过单核RNA测序技术研究人类白色和棕色脂肪细胞分化的转录组动态变化 首次使用单核RNA测序技术构建了人类白色和棕色脂肪细胞分化的高分辨率转录组图谱,并发现了新的转录因子TRPS1在脂肪细胞分化中的作用 研究仅限于单个个体的颈部区域细胞,可能无法完全代表所有人群 深入理解人类脂肪细胞分化的分子调控机制 人类白色和棕色脂肪细胞的分化过程 数字病理学 代谢疾病 单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA序列 超过20,000个正在分化的白色和棕色前脂肪细胞
18869 2024-08-05
Multimodal single-cell analysis of nonrandom heteroplasmy distribution in human retinal mitochondrial disease
2023-07-24, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本文研究了人类视网膜线粒体疾病中非随机的线粒体异质性分布现象 首次揭示了病态m.3243A>G等位基因在多种细胞类型中的分布模式及其对表型表现的影响 研究仅限于特定疾病(MELAS)和样本,可能无法普遍适用于所有线粒体疾病 探讨线粒体异质性在不同细胞类型中的分布及其与表型表达的关系 研究对象为视网膜细胞,包括来自MELAS患者和健康对照供体的细胞 数字病理学 线粒体疾病 单细胞RNA测序、线粒体单细胞ATAC测序及多模式单细胞测序 NA 细胞转录组、染色质可及性状态和异质性数据 涉及MELAS患者和健康对照供体的视网膜细胞
18870 2024-08-05
scDFC: A deep fusion clustering method for single-cell RNA-seq data
2023-07-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种新的单细胞深度融合聚类模型用于分析单细胞RNA-seq数据 通过引入属性特征聚类模块和结构注意力特征聚类模块,综合利用细胞属性和结构信息 未提及具体的局限性 旨在通过深度聚类方法研究肿瘤异质性 单细胞RNA-seq数据的细胞亚群体和肿瘤微环境 数字病理学 肿瘤 RNA-seq 深度学习聚类 基因表达数据 NA
18871 2024-08-05
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq unravels T cell-related prognostic risk model and tumor immune microenvironment modulation in triple-negative breast cancer
2023-07, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 这项研究揭示了三阴性乳腺癌中与T细胞相关的预后风险模型及肿瘤免疫微环境调节 首次整合分析单细胞RNA测序和大规模RNA测序,以建立和验证T细胞标记基因的预后风险模型 研究主要依赖公开数据库,可能存在数据偏差 加深对三阴性乳腺癌中T细胞异质性及其预后风险模型的理解 三阴性乳腺癌患者的T细胞及其与免疫微环境的关系 数字病理学 三阴性乳腺癌 scRNA-seq NA 细胞数据 25,932个细胞
18872 2024-08-05
Cerebellar axonopathy in Shivers horses identified by spatial transcriptomic and proteomic analyses
2023 Jul-Aug, Journal of veterinary internal medicine IF:2.1Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析识别出Shivers马的 cerebellar神经轴突病变 本研究揭示了Shivers马在侧小脑半球基因表达和蛋白质表达的区域特异性差异,强调了神经炎症与轴突退化的关系 研究样本量较小,仅包含5个Shivers马和4个对照马 分析Shivers马与对照马在基因和蛋白质表达上的差异 Shivers马(5匹)与对照马(4匹) 数字病理 NA 空间转录组学,串联质谱标记蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 9匹马(5匹Shivers马,4匹对照马)
18873 2024-08-07
Heritable transcriptional defects from aberrations of nuclear architecture
2023-Jul, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文探讨了核内微核和染色体桥等异常结构对遗传转录抑制的影响 首次识别微核和染色体桥作为遗传转录抑制的来源,并使用长时程活细胞成像和单细胞RNA测序技术进行验证 文中提到的转录抑制改变的穿透性异质性可能导致研究结果的解释存在一定的不确定性 揭示导致表观遗传变异的机制,特别是在癌症中的作用 癌细胞中的微核和染色体桥 NA 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确提及具体样本数量
18874 2024-08-05
A single-cell level comparison of human inner ear organoids with the human cochlea and vestibular organs
2023-06-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文展示了人类多能干细胞衍生的内耳类器官与人类耳蜗和前庭器官的比较 提出了利用单细胞转录组学评估内耳类器官的细胞类型异质性 当前组织培养模型缺乏足够的细胞类型多样性来研究内耳疾病 研究内耳类器官及其在内耳发育和疾病中的潜在应用 采用单细胞转录组学分析人类胎儿和成人内耳组织的细胞类型 数字病理学 耳部疾病 单细胞转录组学 内耳类器官 组织 NA
18875 2024-08-07
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文研究了一种异源初免-加强疫苗策略,使用自组装肽纳米颗粒TLR-7/8激动剂(SNP)疫苗初免和黑猩猩腺病毒(ChAdOx1)疫苗加强,以激活先天和适应性免疫,促进肿瘤消退。 首次证明了静脉注射异源初免-加强疫苗策略能有效增强CD8 T细胞反应和肿瘤消退,且这种效应依赖于I型IFN信号传导。 NA 研究一种新的异源初免-加强疫苗策略,以提高肿瘤治疗效果。 异源初免-加强疫苗策略对肿瘤免疫的影响。 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型MC38肿瘤
18876 2024-08-05
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human injured brain
2023-06-20, Cell reports. Medicine
research paper 本研究揭示了人类受损大脑中的代谢异质性 文章创新性在于结合空间转录组学和代谢研究,生成了一种全面的分子标记,展示了人类受伤大脑中多样的代谢变化 NA 旨在整合空间组织和功能方向的生物学理解 六名脑外伤患者的外科样本 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据及代谢物数据 六名脑外伤患者的外科样本
18877 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals ependymal subtypes related to cytoskeleton dynamics as the core driver of syringomyelia pathological development
2023-Jun-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究揭示了与细胞骨架动态相关的脑室细胞亚型,这些亚型是脊髓囊肿病理发展的核心驱动因素 首次通过单细胞转录组学分析揭示了脊髓囊肿中脑室细胞亚型的动态变化及其与细胞骨架的关系 在研究中仅使用了一种可逆模型,可能无法完全模拟所有临床特征 研究脊髓囊肿发生和发展过程中的时空病理改变 主要研究脑室细胞(EPCs)、少突胶质细胞谱系和小胶质细胞的动态变化 数字病理学 脊髓囊肿 单细胞转录组学 NA NA NA
18878 2024-08-05
Spatial Transcriptional Mapping Reveals Site-Specific Pathways Underlying Human Atherosclerotic Plaque Rupture
2023-06-13, Journal of the American College of Cardiology IF:21.7Q1
研究论文 本研究探讨了动脉粥样硬化斑块破裂的确切位置和潜在机制。 首次通过空间转录组学在动脉粥样硬化中确定了斑块破裂易感区域的转录特征。 研究主要集中在颈动脉斑块,可能无法广泛应用于其他类型的动脉粥样硬化。 研究动脉粥样硬化斑块破裂的机制并识别针对心血管事件的治疗靶点。 研究对象为人类颈动脉的动脉粥样硬化斑块。 数字病理学 心血管疾病 RNA测序 NA 组织样本 人类颈动脉斑块样本
18879 2024-08-07
[Applications and advances of spatial transcriptomics in oncology research]
2023-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18880 2024-08-05
Tox4 regulates transcriptional elongation and reinitiation during murine T cell development
2023-06-07, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了HMG蛋白Tox4在小鼠T细胞发育中的作用 首次揭示Tox4在小鼠T细胞发育中调控转录延长与重新启动的机制 研究主要集中在小鼠模型,可能存在物种间差异 探究Tox4在小鼠T细胞发育中的功能 小鼠模型中的T细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
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