单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38123 篇文献，本页显示第 18841 - 18860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18841 | 2025-01-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer
2024-May-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-48700-8
PMID:38782901
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，探讨了非小细胞肺癌中的肿瘤生态系统，特别是髓系细胞的作用 | 揭示了肿瘤中抗炎性巨噬细胞与NK细胞/T细胞之间的反向关系，以及巨噬细胞在肿瘤中的转录重编程现象 | 样本量相对较小，仅包括25名未接受治疗的患者 | 研究非小细胞肺癌肿瘤生态系统中的免疫细胞类型及其作用 | 25名未接受治疗的腺癌和鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 约900,000个细胞，来自25名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18842 | 2025-01-07 |
MUSTANG: Multi-sample spatial transcriptomics data analysis with cross-sample transcriptional similarity guidance
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100986
PMID:38800365
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSTANG的空间转录组数据分析框架，能够通过跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性进行多样本空间转录组数据的细胞去卷积 | MUSTANG框架创新性地结合了跨样本表达相似性信息共享和样本内基因表达模式的空间相关性，提升了多样本空间转录组数据的分析能力 | NA | 开发一种能够有效分析多样本空间转录组数据的框架，以揭示组织样本细胞特征中的生物学见解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 一个半合成空间转录组数据集和三个真实世界空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18843 | 2025-01-07 |
DeepDecon accurately estimates cancer cell fractions in bulk RNA-seq data
2024-May-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.100969
PMID:38800361
|
研究论文 | 本文介绍了DeepDecon，一种利用单细胞基因表达信息准确预测大块组织中癌细胞比例的深度神经网络模型 | DeepDecon通过迭代估计癌细胞比例的策略，提高了大块RNA-seq数据中细胞组成分解的准确性 | NA | 研究目的是提高大块RNA-seq数据中癌细胞比例的估计准确性 | 大块RNA-seq数据中的癌细胞比例 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 模拟和真实癌症数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18844 | 2025-01-07 |
Comprehensive integration of single-cell transcriptomic data illuminates the regulatory network architecture of plant cell fate specification
2024-May, Plant diversity
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.pld.2024.03.008
PMID:38798726
|
研究论文 | 本文通过整合63个已发表的单细胞转录组数据集，构建了一个全面的植物幼苗单细胞转录组图谱，揭示了细胞类型特异性基因调控网络 | 首次整合大量单细胞转录组数据，构建了涵盖广泛组织的植物细胞图谱，并系统性地构建了细胞类型特异性基因调控网络 | NA | 揭示植物细胞命运决定的调控网络架构 | 植物幼苗 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 整合了63个已发表的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18845 | 2025-01-07 |
Spatial transcriptomics in breast cancer: providing insight into tumor heterogeneity and promoting individualized therapy
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1499301
PMID:39749323
|
研究论文 | 本文综述了空间转录组学的关键技术方法、最新进展及其在乳腺癌中的应用，并讨论了当前空间转录组学方法的局限性和未来发展前景 | 空间转录组学解决了单细胞RNA测序缺乏空间信息的问题，能够定位和区分特定组织区域内功能基因的活跃表达，有助于识别新的乳腺癌亚型和空间区分特征，促进个体化精准治疗 | 当前空间转录组学方法仍存在局限性，未来需要进一步发展和改进 | 推进乳腺癌研究，全面理解肿瘤异质性、肿瘤微环境和耐药机制 | 乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18846 | 2025-01-07 |
New Posttranslational Modification Lactylation Brings New Inspiration for the Treatment of Rheumatoid Arthritis
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497240
PMID:39758940
|
综述 | 本文综述了乳酸化在类风湿性关节炎（RA）相关细胞和机制中的研究，为RA的发病机制、诊断和治疗提供了新的见解 | 提出了乳酸化作为一种新的翻译后修饰在RA中的关键作用，并发现了潜在的生物标志物 | 本文为综述文章，未涉及具体实验数据，缺乏直接的研究验证 | 探讨乳酸化在类风湿性关节炎中的作用及其潜在的治疗应用 | 类风湿性关节炎相关细胞，如成纤维样滑膜细胞（FLSs）和巨噬细胞 | 生物医学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18847 | 2025-01-07 |
Unveiling Ventilator-Associated Pneumonia: S100A8 as a Promising Biomarker Through Integrated RNA-Seq Analysis
2024, Journal of multidisciplinary healthcare
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/JMDH.S495121
PMID:39759083
|
研究论文 | 本研究通过整合RNA-Seq分析，揭示了S100A8作为呼吸机相关性肺炎（VAP）的潜在生物标志物 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析，筛选并验证了S100A8作为VAP诊断的潜在生物标志物，为VAP诊断提供了新的视角 | 样本量相对较小，仅分析了46个VAP样本和48个正常样本 | 探索VAP的发病机制并识别潜在的生物标志物 | 呼吸机相关性肺炎（VAP）患者 | 生物信息学 | 肺炎 | RNA-Seq, scRNA-seq, Western blot | NA | RNA序列数据 | 46个VAP样本和48个正常样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18848 | 2025-01-07 |
Spatially-resolved analyses of muscle invasive bladder cancer microenvironment unveil a distinct fibroblast cluster associated with prognosis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1522582
PMID:39759522
|
研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞术（IMC）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，分析了肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）微环境的空间异质性，并揭示了一个与预后相关的特定成纤维细胞簇 | 通过IMC和scRNA-seq技术结合空间转录组学（ST），首次揭示了MIBC微环境中特定成纤维细胞簇（S3）与内皮细胞之间的相互作用及其对预后的影响 | 样本量相对较小（40个组织样本），且研究结果需要进一步验证 | 评估MIBC微环境的空间异质性，并探索其临床意义 | 肌肉浸润性膀胱癌（MIBC）的微环境 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 成像质谱流式细胞术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | 机器学习算法 | 图像、RNA序列数据 | 40个组织样本中的185个感兴趣区域 | NA | NA | NA | NA |
| 18849 | 2025-01-07 |
Protocols for single-cell RNA-seq and spatial gene expression integration and interactive visualization
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102047
PMID:36853708
|
研究论文 | 本文提供了整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间基因表达数据的协议，并展示了如何创建交互式网络应用来可视化和分享结果 | 提供了使用Seurat和Giotto软件包整合scRNA-seq和空间转录组数据的详细协议，并展示了如何创建交互式网络应用 | 协议仅适用于特定数据集，可能不适用于所有类型的scRNA-seq和空间转录组数据 | 整合单细胞RNA测序和空间基因表达数据，以解析细胞类型分布 | 人类输尿管scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据，空间基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18850 | 2025-01-06 |
Increased lamina propria B cells play roles in fructose-induced hypertension of Dahl salt-sensitive rats
2025-Jan-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2024.123314
PMID:39675553
|
研究论文 | 本文研究了高果糖饮食对Dahl盐敏感大鼠高血压的影响，特别是肠道固有层B细胞的作用 | 通过单细胞RNA测序技术，首次揭示了高果糖饮食诱导的高血压中肠道固有层B细胞的作用 | 研究仅针对Dahl盐敏感大鼠，未涉及其他动物模型或人类样本 | 探讨高果糖饮食诱导的高血压中免疫细胞的作用 | Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠 | 免疫学 | 高血压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | Dahl盐敏感大鼠和Dahl盐抵抗大鼠，每组接受自来水或20%果糖溶液4周 | NA | NA | NA | NA |
| 18851 | 2025-01-06 |
Transcriptomic DN3 clock neuron subtypes regulate Drosophila sleep
2025-Jan-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr4580
PMID:39752484
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对果蝇大脑中的时钟神经元进行了全面的转录组细胞类型普查，特别关注了DN3神经元亚型及其在睡眠调节中的作用 | 首次对果蝇大脑中DN3时钟神经元进行了全面的转录组分析，揭示了其12个不同的基因表达簇，并发现这些神经元通过G蛋白偶联受体促进睡眠 | 研究主要集中于果蝇模型，结果在人类或其他哺乳动物中的适用性尚不明确 | 探索时钟神经元在睡眠调节中的作用 | 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 果蝇大脑中的DN3时钟神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 18852 | 2025-01-06 |
Inhibition of METTL14 overcomes CDK4/6 inhibitor resistance driven by METTL14-m6A-E2F1-axis in ERα-positive breast cancer
2025-Jan-03, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-024-03021-2
PMID:39754249
|
研究论文 | 本文研究了ERα阳性乳腺癌中CDK4/6抑制剂耐药性的机制，并提出了通过抑制METTL14来克服耐药性的策略 | 首次通过全基因组CRISPR/Cas9文库筛选结合单细胞测序技术，鉴定出METTL14是CDK4/6抑制剂敏感性的决定因素，并发现了一种新型METTL14抑制剂WKYMVM | 研究主要基于实验室模型和临床样本，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索ERα阳性乳腺癌中CDK4/6抑制剂耐药性的机制，并寻找克服耐药性的方法 | ERα阳性乳腺癌细胞和临床样本 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 全基因组CRISPR/Cas9文库筛选、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 临床样本和实验室模型 | NA | NA | NA | NA |
| 18853 | 2025-01-06 |
Specifically blocking αvβ8-mediated TGF-β signaling to reverse immunosuppression by modulating macrophage polarization
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03250-1
PMID:39743547
|
研究论文 | 本文研究了通过特异性阻断αvβ8介导的TGF-β信号通路来逆转免疫抑制，并通过调节巨噬细胞极化来抑制肿瘤生长 | 开发了一种特异性抗αvβ8抗体130H2，并通过单细胞RNA测序和冷冻电镜单颗粒分析揭示了其作用机制，证明了其在体内外的高效抗肿瘤效果 | αvβ8的表达谱仍存在争议，且抗αvβ8抗体的抗肿瘤机制尚未完全阐明 | 研究αvβ8在肿瘤中的表达及其在TGF-β信号通路中的作用，开发并评估特异性抗αvβ8抗体的抗肿瘤效果 | 人类肿瘤样本、小鼠模型、人类外周血单核细胞（PBMCs）、巨噬细胞、食蟹猴 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、冷冻电镜单颗粒分析、药代动力学研究 | NA | RNA测序数据、冷冻电镜图像、药代动力学数据 | 多种人类肿瘤样本、小鼠模型、人类PBMCs、食蟹猴 | NA | NA | NA | NA |
| 18854 | 2025-01-06 |
Molecular and spatial analysis of tertiary lymphoid structures in Sjogren's syndrome
2025-Jan-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54686-0
PMID:39747819
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学技术，研究了Sjogren综合征和干燥综合征患者小唾液腺中的三级淋巴结构，构建了其形成和功能关键成分的细胞和空间图谱 | 确认了成纤维细胞状态的存在，并识别了具有潜在免疫功能的周细胞/壁细胞状态，为自身免疫和癌症中与三级淋巴结构相关的情况提供了关键治疗线索 | NA | 研究三级淋巴结构在Sjogren综合征和干燥综合征中的形成和功能机制 | Sjogren综合征和干燥综合征患者的小唾液腺 | 分子生物学 | Sjogren综合征 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | RNA序列数据、蛋白质数据 | Sjogren综合征和干燥综合征患者的小唾液腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18855 | 2025-01-06 |
Trigger inducible tertiary lymphoid structure formation using covalent organic frameworks for cancer immunotherapy
2025-Jan-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55430-4
PMID:39747845
|
研究论文 | 本文探讨了使用共价有机框架（COF）诱导三级淋巴结构（TLS）形成以增强癌症免疫治疗效果的方法 | 利用共价有机框架（COF）诱导TLS形成，并通过单细胞测序分析揭示了其通过促进细胞因子过度分泌来实现的机制 | 研究仅在MC38和4MOSC1两种雌性肿瘤模型中进行验证，尚未在更广泛的肿瘤类型中测试 | 探索诱导TLS形成的有效策略以增强癌症免疫治疗效果 | 三级淋巴结构（TLS）和共价有机框架（COF） | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞测序分析 | MC38和4MOSC1雌性肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18856 | 2025-01-06 |
Spatiotemporal dynamics of early oogenesis in pigs
2025-Jan-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03464-8
PMID:39748324
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学（ST）技术，探索了猪早期卵子发生过程中的时空基因表达谱和卵巢微环境的空间组织 | 首次揭示了猪卵巢中生殖细胞在卵子发生过程中的“皮质到髓质”分布模式，并验证了NOTCH信号和细胞外基质蛋白在调控生殖细胞命运中的关键作用 | 研究主要基于猪模型，尽管与人类具有保守性，但仍需进一步验证其在人类中的适用性 | 探索早期卵子发生的时空动态及其调控机制 | 猪卵巢中的生殖细胞和体细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 猪卵巢组织 | NA | NA | NA | NA |
| 18857 | 2025-01-06 |
Gastric cancer-derived exosomal let-7 g-5p mediated by SERPINE1 promotes macrophage M2 polarization and gastric cancer progression
2025-Jan-02, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03269-4
PMID:39748408
|
研究论文 | 本研究揭示了胃癌细胞通过SERPINE1调控外泌体let-7 g-5p转移，促进巨噬细胞M2极化的新机制 | 首次发现SERPINE1通过调控外泌体let-7 g-5p转移促进巨噬细胞M2极化，为胃癌免疫治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，临床转化仍需进一步验证 | 揭示胃癌细胞中SERPINE1驱动恶性表型和M2巨噬细胞极化的分子机制，为选择性靶向M2极化TAMs提供新的治疗靶点 | 胃癌细胞和巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞测序、外泌体干预实验、小RNA测序、Western blotting、CoIP实验、蛋白质芯片、ChIP实验、双荧光素酶报告实验 | NA | 转录组数据、临床数据、单细胞测序数据、外泌体RNA数据 | 胃癌组织和邻近组织样本、小鼠异种移植肿瘤模型 | NA | NA | NA | NA |
| 18858 | 2025-01-06 |
Pan-cancer drivers of metastasis
2025-Jan-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02182-w
PMID:39748426
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了六种癌症类型中转移性和非转移性肿瘤的基因调控程序，揭示了驱动转移进展的核心基因特征和转录因子网络 | 发现了SP1和KLF5作为关键调控因子，分别在多个癌症类型的转移过程中发挥驱动和抑制作用，并揭示了SP1在癌细胞生存、侵袭性生长和转移定植中的角色 | 研究样本仅限于六种癌症类型，可能无法完全代表所有癌症的转移机制 | 揭示跨癌症转移的核心基因调控程序 | 六种癌症类型中的转移性和非转移性肿瘤 | 癌症研究 | 癌症 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 超过200名患者的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18859 | 2025-01-06 |
Uncovering NK cell sabotage in gut diseases via single cell transcriptomics
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0315981
PMID:39752457
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了自然杀伤（NK）细胞在肠道疾病中的破坏作用，并比较了溃疡性结肠炎（UC）和结直肠癌（CRC）的免疫病理反应 | 首次通过单细胞RNA测序数据集分析了UC和CRC患者结肠组织中的免疫细胞特征，并揭示了UC和CRC中NK细胞介导的免疫反应及其特异性通路 | 研究样本量未明确说明，且未探讨其他免疫细胞在UC和CRC中的潜在作用 | 揭示UC和CRC的免疫微环境及NK细胞介导的免疫反应，为免疫治疗提供潜在靶点 | 健康供体、UC患者和CRC患者的结肠组织 | 单细胞转录组学 | 溃疡性结肠炎、结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、激光共聚焦显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像数据 | 未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 18860 | 2025-01-06 |
Macrophage HERC6 Promotes NAFLD: Integrated Analyses of Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptome
2025-Jan-01, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了HERC6相关免疫反应与非酒精性脂肪肝病（NAFLD）之间的关系，并筛选了新型治疗药物 | 结合孟德尔随机化和单细胞转录组分析，揭示了HERC6在NAFLD中的关键作用，并筛选出潜在治疗药物 | 研究主要依赖于公开数据集，可能受限于数据的质量和样本量 | 探索HERC6相关免疫反应与NAFLD的关系，并筛选治疗药物 | NAFLD患者及肥胖患者的肝脏样本 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | 孟德尔随机化、单细胞RNA测序、药物敏感性评估 | NA | RNA测序数据 | 公开数据集GSE168933和GSE83452中的肝脏样本 | NA | NA | NA | NA |