单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 18821 - 18840 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18821 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics reveals age-associated immune landscape of glioblastoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1028775
PMID:36761752
|
研究论文 | 本研究揭示了与年龄相关的胶质母细胞瘤的免疫景观。 | 开发了一种基于机器学习的方法，整合公共单细胞RNA测序数据集，建立了胶质母细胞瘤中免疫细胞的综合图谱。 | 年龄相关的免疫异质性和预后在胶质母细胞瘤中仍然没有得到充分研究。 | 探讨胶质母细胞瘤与年龄相关的免疫微环境之间的关系。 | 包括不同年龄段的胶质母细胞瘤患者的免疫细胞及其对预后的影响。 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多个公共大规模单细胞RNA测序数据集 |
| 18822 | 2024-08-05 |
Comprehensive Bioinformatics Analysis Reveals PTPN1 (PTP1B) Is a Promising Immunotherapy Target Associated with T Cell Function for Liver Cancer
2023, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2023/1533794
PMID:36741874
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研究论文 | 本研究探讨了PTPN1（PTP1B）在肝癌中的免疫学相关性和功能 | 识别PTPN1作为一种新的免疫检查点，并揭示其在肝癌中的免疫调节作用 | 对PTPN1在肝癌中作为免疫调节因子的影响的研究有限 | 研究PTPN1在肝癌中的免疫相关功能与临床预后 | 使用TCGA和ICGC数据库的肝癌患者表达谱和临床信息 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA-seq | Cox回归分析 | 基于基因表达的数据 | 使用TCGA和ICGC数据库以及GEO数据库中的多个样本数据 |
| 18823 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals melanocytes may promote inflammation in chronic wounds through cathepsin G
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1072995
PMID:36755572
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素细胞可能通过猫啉G促进慢性创伤中的炎症 | 首次发现黑色素细胞能够合成并分泌猫啉G，并且这一过程可能促进慢性创伤中的炎症 | 尚未明确黑色素细胞与慢性创伤中其他细胞相互作用的具体机制 | 提供慢性创伤愈合过程中的新见解 | 研究慢性创伤愈合中的表皮细胞间相互作用变化 | 数字病理学 | 慢性创伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 18824 | 2024-08-08 |
Combination of single-cell and bulk RNA seq reveals the immune infiltration landscape and targeted therapeutic drugs in spinal cord injury
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1068359
PMID:36742334
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研究论文 | 本研究结合单细胞和批量RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后免疫浸润景观及靶向治疗药物 | 首次通过结合单细胞和批量RNA测序技术，识别了脊髓损伤亚急性期的免疫枢纽基因和靶向治疗药物 | NA | 旨在识别脊髓损伤亚急性期的免疫枢纽基因和靶向治疗药物，以促进神经再生 | 脊髓损伤后的免疫微环境，特别是巨噬细胞/小胶质细胞的作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus数据库的批量RNA测序数据集（GSE5296和GSE47681）和单细胞RNA测序数据集（GSE189070），以及T9脊髓损伤小鼠模型进行体内实验 |
| 18825 | 2024-08-08 |
Oxidative Stress Response Biomarkers of Ovarian Cancer Based on Single-Cell and Bulk RNA Sequencing
2023, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2023/1261039
PMID:36743693
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量RNA测序数据，探索卵巢癌中氧化应激反应相关的生物标志物 | 首次利用单细胞RNA测序技术结合批量RNA测序数据，构建了一个与氧化应激反应相关的风险评分模型，用于预测卵巢癌患者的预后和免疫治疗反应 | 研究仅使用了公开数据库中的数据，未涉及临床样本的验证 | 探索卵巢癌中氧化应激反应相关的生物标志物，以预测患者的预后和免疫治疗反应 | 卵巢癌患者的氧化应激反应相关生物标志物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据来自GSE146026，批量RNA测序数据来自TCGA和GTEx数据库 |
| 18826 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals the COL11A1+ fibroblasts are cancer-specific fibroblasts that promote tumor progression
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1121586
PMID:36744260
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，发现并命名了一种肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs），这些细胞在肿瘤组织中特异性存在，并可能通过调节细胞外基质重塑和抗肿瘤免疫反应促进肿瘤进展。 | 首次发现并命名了COL11A1+成纤维细胞为肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs），并揭示了其功能和特异性膜标记物。 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和免疫组化染色，未来需更多临床试验验证CSFs作为治疗靶点的有效性。 | 旨在识别促进肿瘤进展的成纤维细胞群，阐明其功能并确定其特异性膜标记物，以实现精准靶向治疗。 | 肿瘤特异性成纤维细胞（CSFs）及其在肿瘤进展中的作用。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个肿瘤和邻近正常组织的单细胞RNA测序数据集 |
| 18827 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis Reveals Distinct Immunological and Prognostic Characteristics of CD276/B7-H3 in Pan-Cancer
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S395553
PMID:36756390
|
研究论文 | 本文通过公共数据库和临床组织标本探讨并验证了CD276在多种肿瘤中的mRNA和蛋白表达水平，评估了其在肿瘤免疫学和预后中的作用。 | 首次进行了关于CD276在肿瘤免疫学和预后方面的系统性全面泛癌分析。 | NA | 探讨CD276在肿瘤免疫学和预后中的作用及其生物学功能和相关通路。 | CD276在多种肿瘤中的表达及其与临床特征、免疫特征的关系。 | 数字病理学 | NA | 单变量Cox回归分析、Kaplan-Meier分析、GSEA、CCK-8实验 | NA | mRNA、蛋白、scRNA-seq数据 | 多个肿瘤队列来自TCGA数据库及临床组织标本 |
| 18828 | 2024-08-08 |
Corrigendum: Single-cell RNA sequencing reveals the difference in human normal and degenerative nucleus pulposus tissue profiles and cellular interactions
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1108743
PMID:36760364
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18829 | 2024-08-08 |
Hallmarks of crustacean immune hemocytes at single-cell resolution
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1121528
PMID:36761772
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对虾和龙虾这两种代表性甲壳类动物的免疫血细胞异质性进行了表征，并首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 首次在单细胞分辨率下对甲壳类动物的血细胞和免疫血细胞进行了分类 | 由于形态学分类的限制，无脊椎动物免疫血细胞的类型尚未分类 | 确定甲壳类动物的免疫血细胞类型 | 虾和龙虾的免疫血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 虾和龙虾分别包含11和12种类型的血细胞 |
| 18830 | 2024-08-08 |
Phenotypic plasticity of malignant T cells in blood and skin of a Sézary syndrome patient revealed by single cell transcriptomics
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1090592
PMID:36761972
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，研究了塞扎里综合征患者血液和皮肤中恶性T细胞的表型可塑性。 | 首次在单细胞水平上比较了塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中恶性T细胞的转录组，揭示了这些细胞在不同微环境中的功能异质性。 | 研究仅基于单一患者的样本，可能限制了结果的普遍性。 | 比较塞扎里综合征患者血液和皮肤样本中单细胞的转录组，以揭示恶性T细胞的表型可塑性。 | 塞扎里综合征患者的血液和皮肤样本中的恶性T细胞。 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一患者 |
| 18831 | 2024-08-08 |
Mapping the tumor microenvironment in bladder cancer and exploring the prognostic genes by single-cell RNA sequencing
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1105026
PMID:36741702
|
研究论文 | 本研究使用10X单细胞RNA测序技术分析了七份膀胱肿瘤组织及其对应的正常组织，构建了膀胱癌肿瘤微环境图谱，并探索了与预后相关的关键基因 | 首次构建了膀胱癌的完整肿瘤微环境图谱，并细分了膀胱癌上皮细胞的14个亚群，揭示了高度的肿瘤内异质性 | NA | 探索膀胱癌肿瘤微环境并识别与预后相关的关键基因 | 膀胱癌肿瘤组织及其对应的正常组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 10X单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七份膀胱肿瘤组织（三份非肌肉侵袭性膀胱癌和四份肌肉侵袭性膀胱癌）及七份对应的正常组织 |
| 18832 | 2024-08-08 |
Deconvolution of Focal Segmental Glomerulosclerosis Pathophysiology Using Transcriptomics Techniques
2021-Oct, Glomerular diseases
DOI:10.1159/000518404
PMID:36751384
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研究论文 | 本文利用转录组学技术对局灶节段性肾小球硬化症的病理生理进行了解卷积分析 | 文章介绍了新的转录组学技术，如下一代测序技术，包括RNA测序和单细胞转录组学，这些技术有助于发现新的临床应用生物标志物 | NA | 旨在通过转录组学技术识别可应用于临床实践的基因表达生物标志物 | 局灶节段性肾小球硬化症患者 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大型患者队列 |
| 18833 | 2024-08-05 |
Defining the cellular complexity of the zebrafish bipotential gonad
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524593
PMID:36712047
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研究论文 | 研究揭示了斑马鱼双潜性生殖腺发育过程中的细胞复杂性和相互作用 | 首次通过转基因报告和单细胞测序分析明确不同关键细胞类型到达斑马鱼生殖腺的时间 | 研究仅限于斑马鱼，可能不适用于其他物种的生殖腺发育研究 | 阐明早期双潜性生殖腺发育中的基本步骤和细胞类型 | 斑马鱼的双潜性生殖腺及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 215个唯一表达的基因 |
| 18834 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing: Inhibited Notch2 signalling underlying the increased lens fibre cells differentiation in high myopia
2023-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13412
PMID:36717696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞的转录组图谱，揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系。 | 首次揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系，并验证了NOTCH2在高度近视晶状体上皮细胞中的下调作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 探究高度近视中晶状体纤维细胞分化增加的细胞过程及其涉及的信号通路。 | 高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞。 | 数字病理学 | 高度近视 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 50,375个单细胞 |
| 18835 | 2024-08-08 |
Colony-stimulating factor 1 positive (CSF1+ ) secretory epithelial cells induce excessive trophoblast invasion in tubal pregnancy rupture
2023-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13408
PMID:36721079
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析输卵管-滋养层界面，探讨了输卵管异位妊娠破裂的机制 | 首次揭示了CSF1+分泌上皮细胞在输卵管异位妊娠破裂中的作用，以及CSF1与CSF1R配对刺激EVT侵袭和巨噬细胞积累的机制 | 研究仅限于单细胞转录组测序分析，未涉及其他可能的细胞间通讯机制 | 探讨输卵管异位妊娠破裂的机制，为早期妊娠中REP的治疗提供新的研究方向和治疗策略 | 输卵管异位妊娠破裂中的细胞谱和细胞间通讯 | NA | 输卵管异位妊娠 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 包括输卵管异位妊娠破裂、流产性输卵管异位妊娠和宫内妊娠患者 |
| 18836 | 2024-08-05 |
Inhibition of phosphoglycerate kinase 1 attenuates autoimmune myocarditis by reprogramming CD4+ T cell metabolism
2023-06-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad029
PMID:36726197
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研究论文 | 该研究揭示了磷酸甘油酸激酶1（PGK1）在CD4+ T细胞代谢中的调节作用以及其对实验性自身免疫性心肌炎的影响 | 研究首次表明PGK1通过调节糖酵解和PDHK1-ROS轴来影响CD4+ T细胞和Th17细胞的分化 | 本研究主要集中在小鼠模型中，临床数据的验证尚不足 | 阐明PGK1在CD4+ T细胞激活和实验性自身免疫性心肌炎中的作用机制 | 该研究对象为BALB/c小鼠及心肌炎患者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 研究涉及BALB/c小鼠和心肌炎患者的CD4+ T细胞 |
| 18837 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic survey of cell diversity and functional changes in yak hearts at different altitude
2023-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202200345
PMID:36739517
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术研究了不同海拔高度下牦牛心脏的细胞多样性和功能变化 | 揭示了牦牛心脏中特定细胞群体在不同海拔的基因表达差异及其适应高原低氧环境的机制 | 研究主要集中在牦牛心脏，缺乏与其他物种的比较分析 | 探索牦牛在不同海拔下心脏细胞的功能变化及其适应机制 | 牦牛心脏中的平滑肌细胞和血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同海拔的牦牛心脏细胞群体，具体样本数量未说明 |
| 18838 | 2024-08-08 |
Single-cell Expression Atlas Reveals Cell Heterogeneity in the Creeping Fat of Crohn's Disease
2023-06-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izac266
PMID:36715181
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在爬行脂肪中发现了一种高表达脂蛋白脂肪酶的特定血管内皮细胞亚群，并鉴定了一种新的与炎症相关且与肠道纤维化相关的成纤维细胞亚群FC3 | NA | 揭示克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病发展中的作用 | 爬行脂肪组织中的细胞组成及其在克罗恩病进展中的潜在机制 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 67,064个细胞来自3对手术切除的爬行脂肪组织及其未受累的肠系膜脂肪组织样本，以及6对肠系膜脂肪组织样本通过免疫荧光验证 |
| 18839 | 2024-08-08 |
Clonal Kinetics and Single-Cell Transcriptional Profiles of T Cells Mobilized to Blood by Acute Exercise
2023-06-01, Medicine and science in sports and exercise
DOI:10.1249/MSS.0000000000003130
PMID:36719647
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研究论文 | 研究急性运动如何影响血液中T细胞的克隆动力学和单细胞转录组特征 | 首次揭示急性运动通过优先动员最主要的克隆群，促进寡克隆T细胞受体谱，并发现这些克隆对已知病毒抗原具有特异性，并显示出细胞毒性、激活和凋亡相关基因的不同表达 | NA | 探究急性运动对T细胞受体谱和转录组变化的影响 | 健康志愿者的外周血单个核细胞 | NA | NA | 深度TCR-β链测序和串联单细胞RNA测序 | NA | DNA和RNA | 健康志愿者完成分级自行车运动实验，采集静息、运动中和运动后1小时的外周血单个核细胞样本 |
| 18840 | 2024-08-05 |
Review of single-cell RNA-seq data clustering for cell-type identification and characterization
2023-05, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.078965.121
PMID:36737104
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA-seq数据聚类方法，用于细胞类型的识别和特征化。 | 提供了对现有单细胞RNA-seq数据聚类方法的深入见解和比较，以及聚类方法的优势和局限性。 | 聚类方法的性能可能会受到模拟数据和多种单细胞转录组数据集的限制。 | 探讨和评估单细胞RNA-seq数据聚类方法，以促进细胞类型的识别。 | 现有单细胞RNA-seq数据聚类方法及其相关的处理技术。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个单细胞转录组数据集 |