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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18801 | 2025-10-07 |
E2F1 Promotes the Occurrence of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma and Serves as a Prognostic Biomarker
2025-Feb, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-05097-w
PMID:39565537
|
研究论文 | 本研究探讨E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能及预后价值 | 首次结合转录组和单细胞测序数据系统分析E2F1在HNSCC中的预后价值及免疫调控作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索E2F1在头颈部鳞状细胞癌中的生物学功能和预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | Lasso-Cox回归模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18802 | 2025-10-07 |
Integrated analysis and systematic characterization of the regulatory network for human germline development
2025-Feb, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.11.005
PMID:39571792
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研究论文 | 通过整合多组学数据构建人类原始生殖细胞数据库并系统解析其调控网络 | 首次系统整合人类原始生殖细胞发育不同阶段的多组学数据,构建了hPGCdb数据库并识别了关键转录因子和调控网络 | 人类原始生殖细胞发育过程难以直接观察,主要依赖已有数据整合分析 | 解析人类原始生殖细胞发育的调控机制 | 人类原始生殖细胞(PGCs) | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPRi | NA | 基因组学数据 | 581个RNA-seq样本, 54个ATAC-seq样本, 45个ChIP-seq样本, 69个单细胞RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 18803 | 2025-10-07 |
TRAIL induces podocyte PANoptosis via death receptor 5 in diabetic kidney disease
2025-Feb, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2024.10.026
PMID:39571905
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研究论文 | 本研究揭示TRAIL通过死亡受体5诱导足细胞发生PANoptosis在糖尿病肾病中的关键作用 | 首次发现TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞PANoptosis中的核心作用机制 | 样本量较小(3例正常 vs 3例DKD),主要依赖小鼠模型验证 | 探究TRAIL/DR5信号通路在糖尿病肾病足细胞损伤中的作用机制 | 人类肾脏样本、培养的人足细胞、糖尿病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, siRNA沉默, 基因过表达 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 3例正常人肾脏样本, 3例糖尿病肾病患者肾脏样本, 多种糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18804 | 2025-10-07 |
A Study on the Inflammatory Response of the Brain in Neurosyphilis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202406971
PMID:39574316
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学分析,揭示了神经梅毒中炎症介导脑损伤的机制 | 首次通过整合蛋白质组学和单细胞转录组学方法鉴定出Toll样/NF-κB信号通路是神经梅毒中枢神经系统损伤的关键通路,并发现单核细胞来源的巨噬细胞是关键的炎症反应细胞 | 未明确说明样本数量和具体实验设计的局限性 | 探究神经梅毒中炎症介导脑损伤的分子机制 | 神经梅毒患者的中枢神经系统和外周血炎症细胞 | 神经科学 | 神经梅毒 | 蛋白质组学, 单细胞转录组学, 体外脑类器官模型 | 体外脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 18805 | 2025-10-07 |
High CD44 expression and enhanced E-selectin binding identified as biomarkers of chemoresistant leukemic cells in human T-ALL
2025-Feb, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-024-02473-7
PMID:39580584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了T细胞急性淋巴细胞白血病中化疗耐药细胞的特征标志物 | 首次在人类T-ALL中发现具有高CD44表达和增强E-选择素结合能力的化疗耐药白血病细胞群体 | 样本量相对有限(39例人类T-ALL样本),需要更大规模研究验证 | 探索T-ALL化疗耐药机制并识别相关生物标志物 | 人类T-ALL细胞和患者样本 | 单细胞组学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 39例人类T-ALL样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18806 | 2025-10-07 |
Fibroblastic reticular cells generate protective intratumoral T cell environments in lung cancer
2025-Jan-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.10.042
PMID:39566495
|
研究论文 | 本研究揭示了肺腺癌中表达CCL19的成纤维网状细胞通过形成相互连接的T细胞环境调控抗肿瘤免疫应答的机制 | 首次发现成纤维网状细胞在肿瘤微环境中形成专门的T细胞生态位,并阐明其起源于壁层和外膜祖细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究肿瘤微环境中成纤维网状细胞对T细胞免疫应答的调控机制 | 非小细胞肺癌患者样本和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序,细胞命运图谱分析 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 人类非小细胞肺癌样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18807 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Analyses Reveal Heterogeneity of DNAM-1 Receptor-Ligand Interactions That Instructs Intratumoral γδT-cell Activity
2025-Jan-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-1509
PMID:39514370
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞分析揭示DNAM-1受体-配体相互作用的异质性如何指导肿瘤内γδT细胞活性 | 首次系统揭示CD112/CD155表达比例通过调控DNAM-1受体表达影响γδT细胞功能分化的机制 | 研究主要聚焦神经母细胞瘤,在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤细胞配体CD112和CD155如何通过DNAM-1受体调控γδT细胞活化 | 神经母细胞瘤肿瘤微环境中的γδT细胞和肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序, 空间代谢组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 代谢组数据 | 神经母细胞瘤患者样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18808 | 2025-10-07 |
MobiChIP: a compatible library construction method of single-cell ChIP-seq based droplets
2025-Jan-13, Molecular omics
IF:3.0Q3
DOI:10.1039/d4mo00111g
PMID:39513632
|
研究论文 | 开发了一种基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法MobiChIP | 开发了兼容现有测序平台的单细胞ChIP-seq文库构建方法,无需定制引物即可实现稳健的核小体扩增和灵活测序 | NA | 开发单细胞表观遗传分析工具以阐明表观遗传异质性 | 外周血单个核细胞(PBMCs)和不同组织或物种的样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | 表观基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞ChIP-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | 基于液滴的单细胞ChIP-seq文库构建方法 |
| 18809 | 2025-10-07 |
Enhanced BMP Signaling Alters Human β-Cell Identity and Function
2025-Jan, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400470
PMID:39499224
|
研究论文 | 本研究探讨增强的BMP信号通路在炎症诱导的人类β细胞功能衰竭和身份丧失中的作用 | 首次发现炎症因子通过激活BMP信号通路损害β细胞功能,并提出BMP信号可作为糖尿病治疗新靶点 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索炎症环境下β细胞功能衰竭的分子机制 | 人类胰岛β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组测序, qPCR | NA | 基因表达数据 | 原代人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18810 | 2025-10-07 |
Deep learning-based models for preimplantation mouse and human embryos based on single-cell RNA sequencing
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02511-3
PMID:39543284
|
研究论文 | 开发基于单细胞RNA测序的深度学习模型,用于识别小鼠和人类胚胎发育过程中的细胞类型、谱系和状态 | 利用深度学习工具整合和分类多个单细胞转录组数据集,建立能够无偏倚识别细胞类型并同时确定模型所用基因集的分类模型 | 研究材料难以获取和处理,主要依赖公开可用数据 | 定义小鼠和人类胚胎细胞类型、谱系和状态,为早期胚胎发生提供动态参考 | 小鼠和人类早期胚胎发育及多能干细胞模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的小鼠和人类胚胎发育阶段数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18811 | 2025-10-07 |
Integrated proteomics and scRNA-seq analyses of ovarian cancer reveal molecular subtype-associated cell landscapes and immunotherapy targets
2025-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02894-2
PMID:39548315
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞RNA测序分析,揭示了卵巢癌分子亚型相关的细胞景观和免疫治疗靶点 | 首次结合蛋白质组学和单细胞RNA测序对卵巢癌进行综合分析,识别了四种具有临床意义的蛋白质组亚型,并发现CD40作为C2亚型的特异性预后因子 | 样本量相对有限,特别是单细胞RNA测序仅包含8个肿瘤样本 | 探索卵巢癌分子亚型与治疗意义之间的联系 | 154例上皮性卵巢癌肿瘤样本、29例正常输卵管样本和8例额外卵巢癌肿瘤 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 质谱蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 154个肿瘤样本 + 29个正常样本 + 8个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 18812 | 2025-10-07 |
The role of FOXK2-FBXO32 in breast cancer tumorigenesis: Insights into ribosome-associated pathways
2025-Jan, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15482
PMID:39552461
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研究论文 | 本研究探讨FOXK2-FBXO32轴在乳腺癌肿瘤发生中的作用及其在核糖体相关通路中的机制 | 首次通过单细胞测序分析FOXK2基因在泛癌中的表达模式,并发现其下游基因FBXO32与癌症免疫应答的关联 | 需要进一步研究FOXK2和FBXO32在癌症中的具体作用机制,以及靶向FOXK2治疗癌症的潜在益处 | 寻找能够预测肿瘤免疫治疗效果和预后的新生物标志物 | 多种癌症类型(前列腺癌、子宫内膜癌、膀胱癌、结直肠癌、胰腺癌、胃癌、肺癌、甲状腺癌)的肿瘤和癌旁组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, bulk RNA-seq, ChIP-seq, 免疫浸润分析算法 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 18813 | 2025-10-07 |
Novel integrated multiomics analysis reveals a key role for integrin beta-like 1 in wound scarring
2025-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00322-3
PMID:39558136
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型空间多组学方法,揭示了整合素β样1在伤口瘢痕形成中的关键作用 | 开发了整合空间转录组学与单细胞RNA测序的高分辨率空间多组学方法,首次发现Itgbl1在成纤维细胞介导的瘢痕形成中的核心机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探索伤口修复过程中分子与空间组织的相互关系,揭示瘢痕形成的分子机制 | 小鼠模型、人类和小鼠原代成纤维细胞 | 空间生物学 | 皮肤创伤修复 | 空间转录组学,scRNA-Seq | NA | 转录组数据,空间表达数据 | PU.1缺陷小鼠模型和转基因小鼠实验 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 18814 | 2025-10-07 |
Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02501-5
PMID:39562752
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研究论文 | 开发了一种利用传统寡核苷酸微阵列进行空间转录组分析的新方法Array-seq | 将传统DNA微阵列重新用于空间转录组分析,实现了低成本、易操作且可扩展的空间分子研究平台 | NA | 开发易于采用、低成本且可扩展的空间转录组分析工具 | 小鼠组织切片、多器官切片、连续切片和完整人类器官 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 下一代测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 微阵列技术 | Array-seq | 基于定制设计探针的微阵列载玻片,包含侧翼有共同序列的独特条形码 |
| 18815 | 2025-10-07 |
Cryptotanshinone alleviates immunosuppression in endometriosis by targeting MDSCs through JAK2/STAT3 pathway
2025-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2024.156227
PMID:39580997
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研究论文 | 本研究探讨了隐丹参酮通过JAK2/STAT3通路调控髓源性抑制细胞,从而缓解子宫内膜异位症免疫抑制的机制 | 首次证明隐丹参酮通过靶向JAK2/STAT3通路调节MDSCs,是治疗子宫内膜异位症的潜在天然化合物 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化价值需进一步验证 | 研究隐丹参酮通过JAK2/STAT3信号通路调节MDSCs的治疗潜力及其对EMS免疫微环境和病灶生长的影响 | 子宫内膜异位症患者组织样本、C57BL/6J小鼠模型、骨髓源性MDSCs | 生物医学研究 | 子宫内膜异位症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、网络药理学分析、表面等离子共振、细胞热位移分析、流式细胞术、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | 使用公共数据库GSE141549和GSE213216数据,建立小鼠模型进行体内外验证 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 18816 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell aging atlas of healthy mammary tissues reveals shared epigenomic and transcriptomic signatures of aging and cancer
2025-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00751-8
PMID:39587369
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率构建健康乳腺组织衰老图谱,揭示衰老与癌症共享的表观基因组和转录组特征 | 首次在单细胞分辨率系统揭示乳腺组织衰老过程中的转录组和表观基因组重编程,并发现衰老特征与人类乳腺癌的潜在联系 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究衰老如何影响乳腺组织细胞和分子程序,及其与癌症发生的关联 | 小鼠乳腺组织中的上皮细胞、基质细胞和免疫细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18817 | 2025-10-07 |
PKMζ, a Brain-specific PKCζ Isoform, is Required for Glycolysis and Myofibroblastic Activation of Hepatic Stellate Cells
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101429
PMID:39542399
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研究论文 | 本研究揭示了脑特异性PKCζ异构体PKMζ在肝星状细胞糖酵解和肌成纤维细胞活化中的关键作用 | 首次发现PKMζ通过磷酸化VASP促进Glut1在质膜上的锚定,驱动肝星状细胞的代谢重编程和活化 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚未在人类肝脏疾病中进行临床验证 | 阐明肝星状细胞中葡萄糖转运蛋白Glut1在质膜上锚定/停靠的分子机制 | 人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移瘤相关成纤维细胞 | 细胞生物学 | 肝纤维化、结直肠肝转移 | RT-PCR、Western blotting、免疫荧光、shRNA、过表达、生物素化、2-NBDG检测、Seahorse糖酵解压力测试、位点定向突变、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 | 原代人源和鼠源肝星状细胞、结直肠肝转移患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 18818 | 2025-10-07 |
A comprehensive human embryo reference tool using single-cell RNA-sequencing data
2025-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02493-2
PMID:39543283
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研究论文 | 开发了一个基于单细胞RNA测序数据的综合人类胚胎参考工具,用于评估人类胚胎模型 | 整合了六个已发表的人类胚胎数据集,构建了首个从受精卵到原肠胚发育阶段的通用参考工具 | 依赖于已发表数据集,可能受原始数据质量和注释准确性的限制 | 建立人类胚胎发育的标准化参考工具,用于胚胎模型的验证和评估 | 人类胚胎发育过程(从受精卵到原肠胚阶段) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | Uniform Manifold Approximation and Projection (UMAP) | 单细胞转录组数据 | 整合六个已发表人类数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18819 | 2025-10-07 |
Identification of novel metabolism-related biomarkers of Kawasaki disease by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1541939
PMID:40276515
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别川崎病的新型代谢相关生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析川崎病中胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关特征基因,并利用机器学习算法鉴定出VIM、CLIC1和ITGB2作为新型诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在川崎病发病机制中的具体功能 | 识别川崎病中与胆汁酸代谢和脂肪酸代谢相关的特征细胞和基因,探索其在疾病发病机制中的作用 | 川崎病患者免疫细胞(单核细胞和自然杀伤细胞) | 生物信息学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 实时定量PCR, ROC曲线分析 | hdWGCNA, 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 公共数据集GSE1687323和GSE68004,验证数据集GSE73461 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18820 | 2025-10-07 |
Pan-cancer analysis identified CD248 as a potential target for multiple tumor types
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1554632
PMID:40276611
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研究论文 | 通过泛癌分析鉴定CD248作为多种肿瘤类型的潜在治疗靶点 | 首次通过多数据库整合分析和实验验证,系统性地揭示了CD248在泛癌中的表达特征、预后价值及功能机制 | 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接证据 | 探索CD248在多种肿瘤类型中的表达模式、临床意义和生物学功能 | 多种肿瘤类型(重点关注头颈鳞状细胞癌)及相应细胞系 | 生物信息学 | 泛癌分析 | qRT-PCR, Western blot, transwell assay, scratch wound healing assay, EdU assay, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 临床预后数据, 单细胞测序数据 | 多种肿瘤数据库数据及HNSC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |