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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2026-04-11 |
Loss of Tumor-Infiltrating Lymphocytes and Poor Response to Immunotherapy in IDH GOF Mutant Melanoma
2026-Apr-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195384
PMID:41955022
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研究论文 | 本研究探讨了IDH GOF突变黑色素瘤患者对免疫检查点阻断疗法反应差的原因,通过分析临床、免疫和转录组数据揭示了IDH突变与免疫排斥及DNA甲基化紊乱的关联 | 首次在人类黑色素瘤中表征IDH GOF突变的作用,揭示了其与肿瘤微环境中免疫浸润减少和免疫治疗抵抗的关联 | 未明确说明样本量大小,且IDH突变在黑色素瘤中的机制仍需进一步验证 | 探究IDH GOF突变黑色素瘤对免疫治疗抵抗的机制 | IDH GOF突变黑色素瘤患者及其肿瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, DNA甲基化测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1862 | 2026-04-11 |
Multi-Omics Graph Attention Network for Key Gene Prediction in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Apr-09, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3682485
PMID:41955157
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研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的多模态框架,整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和影像组学数据,用于预测三阴性乳腺癌的关键基因 | 创新点在于首次将scRNA-seq、scATAC-seq和影像组学数据通过图注意力网络整合,利用多模态图结构捕捉跨模态调控相互作用,并采用集成多层感知机进行患者预后分层 | NA | 开发一个可解释的多模态生物标志物发现框架,用于三阴性乳腺癌的个性化治疗 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | scRNA-seq, scATAC-seq, 影像组学 | 图注意力网络, 集成多层感知机 | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据, 影像特征数据 | 外部TCGA-TNBC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1863 | 2026-04-11 |
Sonodynamic Therapy Attenuates TLR4/NF-κB Signaling in Epicardial Adipose Tissue of Atrial Fibrillation: Insights from Animal Models, scRNA-seq, and Mendelian Randomization
2026-Apr-09, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001825
PMID:41955609
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研究论文 | 本研究探讨了声动力疗法(SDT)通过靶向TLR4/NF-κB信号通路,减轻心房颤动(AF)模型心外膜脂肪组织(EAT)中巨噬细胞介导的炎症反应,并评估其临床转化潜力 | 首次结合动物模型、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和孟德尔随机化方法,系统验证了SDT通过调控TLR4/NF-κB通路(特别是CXCL8)减轻EAT炎症,为AF治疗提供了新的靶向策略 | 研究主要基于兔AF模型,临床样本量有限,SDT在人体中的长期安全性和疗效仍需进一步验证 | 探究声动力疗法(SDT)对心房颤动(AF)中心外膜脂肪组织(EAT)炎症的调控作用及潜在治疗机制 | 兔AF模型、人类心外膜脂肪组织(EAT)及右心耳组织样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、网络药理学、Western blot、RT-qPCR、免疫组化(RAM11)、Masson染色、孟德尔随机化 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像数据 | 兔AF模型分组(假手术组、起搏组、SDT组)及人类EAT与右心耳单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1864 | 2026-04-11 |
Neuronal Subtype-Specific Ribosomal Protein mRNA Expression
2026-Apr-09, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080954.126
PMID:41956739
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术,分析了小鼠大脑皮层和海马体的单细胞RNA-seq数据,揭示了神经元亚型中核糖体蛋白mRNA表达的特定模式 | 首次在神经元亚型水平上全面绘制核糖体蛋白基因表达图谱,揭示了兴奋性与抑制性神经元之间以及不同神经元亚类之间的差异表达模式 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他物种中的普适性尚需验证;且仅关注mRNA表达水平,蛋白质翻译活性的直接关联未深入探讨 | 探究核糖体蛋白mRNA在神经元亚型中的表达组织,以理解其超越经典翻译功能的调控作用 | 小鼠大脑皮层和海马体的神经元亚型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 基于多个单细胞RNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明,但覆盖了小鼠大脑皮层和海马体的神经元亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 研究中使用了两种独立的单细胞技术:Smart-seq2和10x Genomics,但未指定10x Genomics的具体产品细节,推测为10x Chromium单细胞3'或类似平台 |
| 1865 | 2026-04-11 |
Podoplanin-defined tumour plasticity and CCR7-mediated lymphatic metastasis in triple-negative breast cancer
2026-Apr-09, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-026-03402-4
PMID:41957138
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌中podoplanin定义的肿瘤可塑性与CCR7介导的淋巴转移之间的关系 | 揭示了缺氧促进的PDPN表达与CCR7功能在淋巴转移中的协同作用,并提出了联合CCR7-PDPN评分作为淋巴结阳性患者预后指标的新方法 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系数据,人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究三阴性乳腺癌中肿瘤细胞可塑性与淋巴转移的机制 | 三阴性乳腺癌细胞系、小鼠模型和人类肿瘤样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, 转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA-seq数据 | 包括小鼠模型、细胞系和METABRIC乳腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1866 | 2026-04-11 |
CD73high fibroblasts orchestrate keratinocyte inflammation in the psoriasis-associated epithelial immune microenvironment
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71323-0
PMID:41957361
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研究论文 | 本研究通过代谢组学、单细胞和空间转录组学分析,揭示了CD73高表达成纤维细胞通过腺苷介导角质形成细胞炎症,在银屑病相关上皮免疫微环境中的作用机制 | 首次发现CD73高表达成纤维细胞亚群通过代谢微环境与角质形成细胞相互作用,调控上皮炎症,为靶向成纤维细胞-角质形成细胞串扰的治疗策略提供了原理证明 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本,人类临床转化需进一步验证;机制细节如腺苷具体代谢途径有待深入探索 | 探究银屑病中上皮免疫微环境的代谢失调机制,特别是成纤维细胞与角质形成细胞间的相互作用 | 银屑病患者皮肤样本、咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠皮肤炎症模型 | 数字病理学 | 银屑病 | 代谢组学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 银屑病患者样本和小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1867 | 2026-04-11 |
Single-cell and spatial transcriptomics analyses reveal tumor microenvironment-driven proliferation of NF2-associated vestibular schwannomas
2026-Apr-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03799-y
PMID:41957607
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1868 | 2026-04-11 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to reveal the spatiotemporal dynamics of retinal cells during ischemia-reperfusion injury progression in rats
2026-Apr-09, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01571-6
PMID:41957682
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1869 | 2026-04-11 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
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研究论文 | 本文开发了一种快速共分化平台,利用人诱导多能干细胞生成具有生物响应性的结肠样肠道组织补片 | 开发了一种新型早期阶段hiPSC共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系,简化了流程并减少了动物产品使用 | 研究仍处于早期阶段,需要进一步开发以用于临床治疗 | 开发可移植的肠道黏膜组织移植物,以辅助肠道疾病愈合 | 人诱导多能干细胞及其衍生的肠道细胞谱系 | 再生医学 | 肠道疾病 | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据、蛋白质表达数据 | 多个hiPSC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1870 | 2026-04-11 |
Guanylate-binding proteins balance iNOS/Arg-1 in myeloid cells during L. major infection and promote host defense to infection
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02825-25
PMID:41805192
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白(Gbps)在利什曼原虫感染期间对宿主巨噬细胞免疫反应的调控作用 | 揭示了Gbps通过平衡iNOS/Arg-1表达调控巨噬细胞极化,其保护作用不依赖于Gbp定位于寄生虫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;Gbps的具体信号通路机制尚未完全阐明 | 阐明Gbps在皮肤利什曼病感染期间对宿主免疫防御的调控机制 | C57BL/6小鼠、骨髓来源巨噬细胞、单核细胞 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据 | Gbp敲除小鼠和C57BL/6对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1871 | 2026-04-11 |
Comprehensive immune profiling reveals IFN-γ signaling in T cells mediates parasite phagocytosis in a rodent malaria model
2026-Apr-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03938-25
PMID:41810957
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研究论文 | 本研究通过啮齿动物疟疾模型和综合转录组学分析,揭示了IFN-γ信号在T细胞中通过增强T细胞-单核细胞相互作用,介导寄生虫吞噬,从而在疟疾相关肺部病理中发挥关键作用 | 首次在疟疾模型中结合流式细胞术、时间序列批量转录组学和空间转录组学,系统描绘了肺部免疫景观,并发现IFN-γ信号通过调控T细胞-单核细胞相互作用影响寄生虫吞噬,特别是鉴定出具有高吞噬能力的CD8表达促炎单核细胞亚群 | 研究基于啮齿动物模型,结果在人类疟疾中的直接适用性需进一步验证;空间转录组学等技术可能受分辨率限制,未能完全解析细胞间相互作用的精细机制 | 阐明疟疾相关肺部病理的免疫机制,特别是IFN-γ信号在T细胞中的作用及其对寄生虫清除的影响 | 啮齿动物疟疾模型中的肺部免疫细胞,特别是T细胞和单核细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术、时间序列批量转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 1872 | 2026-04-11 |
Hypoxia-inducible factor signaling regulates embryonic interneuron development, GRIN2B expression and adult cortical function
2026-Apr-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2026.01.007
PMID:41650955
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导因子(HIF)信号通路在胚胎中间神经元发育、GRIN2B表达及成年皮层功能中的非经典作用 | 首次发现HIF信号通过调节Lhx6阳性中间神经元前体增殖和直接激活GRIN2B基因,影响PV中间神经元生成和皮层环路成熟 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;单细胞转录组学分析可能受样本量限制 | 探究HIF信号在抑制性神经元发育和皮层功能中的作用机制 | 小鼠内侧神经节隆起(MGE)来源的中间神经元前体及成年皮层PV中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、条件性基因敲除、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据、图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠胚胎和成年皮层组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1873 | 2026-04-11 |
Gut microbiota-derived indole-3-lactic acid suppresses anti-PD-1 efficacy in esophageal squamous cell carcinoma
2026-Apr-08, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.02.019
PMID:41881017
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研究论文 | 本研究揭示了唾液乳杆菌通过产生吲哚-3-乳酸抑制抗PD-1免疫疗法在食管鳞状细胞癌中疗效的机制 | 首次将特定肠道菌(唾液乳杆菌)及其代谢产物(吲哚-3-乳酸)与ESCC免疫治疗耐药性联系起来,并阐明其通过AhR/NF-κB信号通路抑制NKG7⁺CD8⁺ Tpex细胞的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接验证仍需进一步扩大样本量;未探讨其他可能共存的菌群或代谢物影响 | 探究肠道菌群影响食管鳞状细胞癌抗PD-1免疫疗法疗效的机制 | 食管鳞状细胞癌患者、人源化微生物组小鼠模型、原位ESCC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 人源化微生物组小鼠模型、原位肿瘤小鼠模型 | 粪便样本、单细胞转录组数据 | 122例ESCC患者粪便样本(含两个验证队列) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1874 | 2026-04-11 |
Identification and comparison of orthologous cell types from primate embryoid bodies shows limits of marker gene transferability
2026-Apr-08, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105398
PMID:41949281
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研究论文 | 本研究通过分析四种灵长类动物胚胎样体的单细胞RNA测序数据,开发了一种半自动化计算流程来识别跨物种的同源细胞类型,并揭示了物种间标记基因的可转移性有限 | 开发了结合分类和基于标记的聚类注释的半自动化计算流程,首次在四种灵长类动物胚胎样体数据中系统识别同源细胞类型并评估标记基因的跨物种保守性 | 研究仅基于体外诱导多能干细胞衍生的胚胎样体模型,未涵盖体内发育环境;物种数量有限(四种灵长类),且细胞类型为连续发育谱系,增加了注释难度 | 开发跨物种同源细胞类型识别方法并评估标记基因的跨物种可转移性 | 人类、猩猩、食蟹猴和恒河猴的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分类与聚类分析的计算流程 | 单细胞转录组数据 | 四种灵长类物种的诱导多能干细胞衍生的胚胎样体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1875 | 2026-04-11 |
Mapping plant cell-type-specific responses to environmental stresses
2026-Apr-08, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.03.003
PMID:41956877
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综述 | 本文综述了单细胞/核RNA测序和空间转录组学在绘制植物细胞类型特异性响应环境胁迫转录程序方面的最新进展 | 利用单细胞和空间转录组学技术,在空间、时间和细胞类型特异性维度上解析植物对胁迫的响应,弥补了传统批量RNA测序的不足 | NA | 通过高分辨率技术加深对植物细胞水平响应环境胁迫的理解,以推动气候智能型农业策略的发展 | 植物细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞/核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 1876 | 2026-04-11 |
Prostaglandin E2-driven dedifferentiation of Schwann cells leads to perineural invasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-07, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02648-x
PMID:41946682
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌(PDAC)中前列腺素E2(PGE₂)驱动雪旺细胞去分化,进而促进神经周围浸润(PNI)的新机制 | 首次通过整合RNA-seq、空间转录组学和单细胞分析,发现PNI区域去分化雪旺细胞的富集,并阐明PDAC来源的PGE₂通过驱动雪旺细胞去分化及分泌促侵袭因子(LIF和ADAMTS-1)促进PNI的旁分泌轴 | 研究主要基于体外共培养模型和临床样本分析,体内动物模型的验证可能有限 | 阐明胰腺导管腺癌中神经周围浸润的分子机制,以寻找新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者临床样本、雪旺细胞、胰腺癌细胞系(PANC-1和BxPC-3) | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞分析, 共培养实验, 3D共培养模型, 功能实验 | 体外共培养模型, 3D共培养模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | 临床样本(具体数量未明确说明) | NA | RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 1877 | 2026-04-11 |
Effect of aging on rat testicular interstitial compartment: functional losses in endothelial and mesenchymal cells and activation of immune cells
2026-Apr-07, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag089
PMID:41955433
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组化技术,分析了年轻与老年BN大鼠睾丸间质细胞的调控图谱和细胞间相互作用,揭示了衰老过程中间质细胞的功能丧失和免疫细胞激活的机制 | 首次建立了衰老大鼠睾丸间质细胞的调控细胞图谱,揭示了衰老过程中间质细胞异质性和随机性变化,以及从先天免疫向适应性免疫转变的转录组学特征 | 研究仅基于大鼠模型,可能不完全适用于人类衰老过程,且样本量有限,未涉及更广泛的年龄组或物种比较 | 探究衰老对大鼠睾丸间质细胞功能的影响及细胞间相互作用的机制 | 年轻(3个月)和老年(21个月)BN大鼠的睾丸间质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 年轻和老年BN大鼠睾丸间质细胞(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1878 | 2026-04-11 |
Ammonia Detoxification Inhibits Liver Metastasis by Reshaping Hepatic Microenvironment
2026-Apr-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521098
PMID:41933927
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研究论文 | 本研究揭示了病理性氨积累通过重塑肝脏微环境促进肝转移,并提出L-鸟氨酸-L-天冬氨酸作为潜在治疗策略 | 首次发现病理性氨积累是肝转移微环境形成的关键驱动因素,并验证了氨解毒剂LOLA的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化效果需进一步验证 | 探究肝转移的分子机制并开发有效治疗策略 | 肝转移微环境、氨代谢、免疫细胞 | 肿瘤生物学 | 肝转移癌 | 代谢组学、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 代谢数据、基因表达数据 | 肝转移小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1879 | 2026-04-11 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞、空间和克隆图谱,解析了颅骨板发育过程中的谱系分离动态 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪技术,揭示了颅骨板与邻近祖细胞形成连续转录景观,并发现域边界细胞存在双潜能状态 | 研究主要聚焦于发育早期阶段,对后期分化成熟过程的机制解析相对有限 | 阐明脊椎动物颅骨板的身份决定、多样化及进化起源机制 | 脊椎动物颅骨板及其邻近祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1880 | 2026-04-11 |
Circulating Immune Cells are Associated with Non-Inflammatory Pain in Rheumatoid Arthritis
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715669
PMID:41959259
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研究论文 | 本研究通过分析类风湿关节炎患者的循环免疫细胞,揭示了其与非炎症性疼痛(即中枢敏化或伤害可塑性疼痛)的关联 | 首次在关节炎症已得到控制的类风湿关节炎患者中,结合定量感觉测试、患者报告结果和多参数流式细胞术及单细胞RNA测序,系统性地将循环免疫细胞特征与非炎症性疼痛联系起来 | 样本量较小(共39例,其中单细胞RNA测序仅22例),且为观察性研究,无法确定因果关系 | 表征与类风湿关节炎患者中枢敏化疼痛相关的免疫细胞状态改变 | 类风湿关节炎患者 | NA | 类风湿关节炎 | 多参数光谱流式细胞术,单细胞RNA测序,定量感觉测试 | NA | 流式细胞术数据,单细胞RNA测序数据,问卷调查数据,临床测试数据 | 39名类风湿关节炎患者(其中22名进行了单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |