单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1861 - 1880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2025-09-06 |
ROS and Drp1-mediated mitochondrial fission contributes to the hyposalivation caused by Sjögren's disease
2025-Sep-04, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003727
PMID:40908878
|
研究论文 | 本研究探讨了活性氧（ROS）和Drp1介导的线粒体分裂在干燥综合征（SjD）导致唾液分泌减少中的作用，并评估了靶向线粒体分裂的治疗潜力 | 首次通过单细胞测序揭示SjD下颌下腺氧化应激损伤机制，并证实Drp1及其Ser616位点在介导线粒体功能障碍中的关键作用，以及使用Mdivi-1导管内灌注改善唾液分泌的创新治疗方法 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床适用性尚需验证；治疗方法的长期安全性和有效性有待进一步评估 | 阐明ROS和线粒体动力学在干燥综合征相关唾液分泌减少中的作用，并探索靶向线粒体分裂的治疗效果 | 干燥综合征小鼠模型的下颌下腺组织和腺体上皮细胞 | NA | 干燥综合征 | 单细胞测序，线粒体功能评估，分子抑制剂治疗 | NA | 测序数据，生理指标数据，细胞功能数据 | 干燥综合征小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | NA | NA | NA |
| 1862 | 2025-10-06 |
SARC028 Samples Reveal an Interplay between TGF-β, IFN Signaling, and Low HLA Class I Expression as Contributors to Ewing Sarcoma Checkpoint Blockade Resistance
2025-Sep-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3882
PMID:40627445
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研究论文 | 本研究通过分析SARC028临床试验中尤文肉瘤患者免疫治疗前后的配对活检样本，揭示了TGF-β信号增强、IFN信号减弱和HLA I类低表达共同导致免疫检查点抑制剂耐药的机制 | 首次在尤文肉瘤中通过空间多组学技术识别出与免疫治疗耐药相关的特定细胞邻域特征 | 样本量有限，仅基于SARC028临床试验的活检样本 | 探究尤文肉瘤对PD1抑制剂耐药的免疫微环境特征 | 尤文肉瘤患者治疗前后的配对肿瘤活检样本 | 数字病理 | 尤文肉瘤 | 多重免疫荧光、空间蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 图像、蛋白质表达数据、基因表达数据 | SARC028临床试验中尤文肉瘤患者的配对活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 1863 | 2025-09-06 |
The transcriptional regulation of NUPR1 expression by MYC is implicated in the regulation of ferroptosis in human spermatogonial stem cells
2025-Sep-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05818-2
PMID:40892246
|
研究论文 | 本研究探讨NUPR1和MYC在人类精原干细胞铁死亡调控中的作用及其作为非梗阻性无精子症治疗靶点的潜力 | 首次揭示MYC通过直接结合NUPR1启动子调控其表达，从而影响精原干细胞铁死亡过程 | 研究主要基于体外细胞实验和测序数据分析，缺乏体内动物模型验证 | 阐明非梗阻性无精子症中铁死亡的分子调控机制 | 人类精原干细胞和非梗阻性无精子症患者睾丸组织 | 生殖医学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、染色质免疫沉淀(ChIP)、免疫荧光分析、环己酰亚胺追踪实验 | NA | 单细胞转录组数据、微阵列数据、基因表达数据 | 非梗阻性无精子症和梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1864 | 2025-09-06 |
Skin Explorer: an interactive single-cell RNA-seq resource for healthy human skin
2025-Sep-02, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.025
PMID:40907604
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1865 | 2025-10-06 |
Multi-omics and Single Cell Sequencing Analyses Reveal Associations of Mitophagy-Related Genes Predicting Clinical Prognosis and Immune Infiltration Characteristics in Osteosarcoma
2025-Sep, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01280-w
PMID:39264525
|
研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞测序分析，揭示了线粒体自噬相关基因与骨肉瘤临床预后及免疫浸润特征的关联 | 首次报道线粒体自噬在骨肉瘤中的作用，建立了基于线粒体自噬相关基因的新型预后评分系统，并通过单细胞测序探索了其在骨肉瘤细胞亚型中的分布特征 | 样本量相对有限（基于公共数据库），需要进一步实验验证 | 探索线粒体自噬相关基因在骨肉瘤预后预测和免疫浸润中的作用 | 骨肉瘤患者和骨肉瘤细胞 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序，多组学分析，LASSO-多变量Cox回归算法，体外实验 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据，临床预后数据，单细胞测序数据 | 基于TARGET和GEO数据库的骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq，多组学分析 | NA | NA |
| 1866 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts are associated with neo-adjuvant treatment response in oesophageal adenocarcinoma
2025-Sep, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03080-8
PMID:40640495
|
研究论文 | 本研究探讨癌症相关成纤维细胞在食管腺癌新辅助治疗反应中的作用 | 首次在食管腺癌中系统分析新辅助治疗对肿瘤微环境中成纤维细胞的影响，并鉴定出三种肌成纤维细胞表型 | 样本量相对有限（26例患者），体外模型仅能部分重现体内观察到的表型 | 研究肿瘤微环境成分特别是癌症相关成纤维细胞在新辅助治疗反应中的作用机制 | 食管腺癌患者肿瘤组织和患者来源的细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 组织病理学分析 | 预后模型, 体外共培养模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 组织病理图像 | 26例食管腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1867 | 2025-09-06 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of cholesterol biosynthesis into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110859
PMID:40816003
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示胆固醇生物合成与免疫治疗反应预测及生存预后的新关联 | 首次构建并验证了胆固醇生物合成相关特征（CB.SIG），并发现TNFRSF10B作为预测免疫治疗反应的泛癌生物标志物 | 基于公开数据集的分析，需进一步实验验证 | 探究胆固醇生物合成与免疫检查点抑制剂反应性的关系并开发预测模型 | 泛癌患者样本（包括非小细胞肺癌和乳腺癌细胞系） | 计算生物学 | 泛癌（多种癌症类型） | scRNA-seq, CRISPR筛选, 空间转录组学, 免疫组化 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个scRNA-seq数据集、30个TCGA泛癌队列、9个ICI转录组队列、17个CRISPR数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 1868 | 2025-09-06 |
SynchDP: A correlation based sequence alignment algorithm for synchronizing longitudinal clinical data
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110853
PMID:40825256
|
研究论文 | 提出一种基于相关性的动态规划算法SynchDP，用于对齐和同步不规则采样的临床时间序列数据 | 开发了能够处理不同长度和采样率的临床时间序列的新型对齐算法，并能从头组装代表性模式 | NA | 解决临床时间序列数据的对齐问题，以量化疾病进展相似性并发现生物标志物 | COVID-19患者的纵向严重程度数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 动态规划算法，单细胞转录组分析 | 动态规划 | 临床时间序列数据，基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1869 | 2025-09-06 |
Applications and prospects of spatial transcriptomics in prostate cancer research: A narrative review
2025-Sep, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000288
PMID:40894285
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在前列腺癌研究中的应用与前景，重点探讨其在肿瘤微环境、异质性和临床意义方面的价值 | 系统总结了空间转录组学在前列腺癌这一相对研究较少领域的应用潜力，并提出了未来研究方向 | 现有研究仍较为有限，需要更多实证数据支持 | 概述空间转录组学技术原理及其在前列腺癌研究中的应用现状和发展前景 | 前列腺癌肿瘤组织 | 数字病理 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1870 | 2025-09-06 |
PDPN+ cancer-associated fibroblasts correlate with the neoadjuvant immunotherapy response in gastric cancer
2025-Sep, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250475
PMID:40895767
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研究论文 | 本研究探讨PDPN+癌症相关成纤维细胞（CAFs）与胃癌新辅助免疫治疗反应的相关性 | 首次鉴定PDPN作为CAFs亚群的标志物，并验证其与免疫治疗疗效的负相关性 | 样本来源限于特定临床试验和公共数据库，需进一步扩大验证 | 预测胃癌患者对新辅助免疫治疗的反应 | 胃癌患者组织样本和类器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, Western blot, 多重免疫组化/免疫荧光 | GC-PDOs（胃癌患者来源类器官） | 基因表达数据、蛋白质表达数据、影像数据 | 多个公共数据库（TCGA-STAD等）及临床试验NCT04208347的胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1871 | 2025-09-06 |
The Pdgfd-Pdgfrb axis orchestrates tumor-nerve crosstalk in pancreatic cancer
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672505
PMID:40909696
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研究论文 | 本研究揭示了Pdgfd-Pdgfrb信号轴在胰腺癌中介导肿瘤-神经交互作用并促进神经周围侵袭的机制 | 首次发现Pdgfd信号通过协调癌细胞、神经元和胶质细胞的多方面相互作用促进神经侵袭，并证明该轴可作为治疗靶点 | NA | 探究胰腺导管腺癌中肿瘤-神经相互作用的分子机制及其对神经周围侵袭的影响 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的肿瘤细胞、神经及胶质细胞 | 肿瘤微环境研究 | 胰腺癌 | 全转录组测序、单细胞空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1872 | 2025-09-06 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-Aug-30, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
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研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢异常 | 首次结合转录组、蛋白质组和空间代谢组学动态追踪AD模型星形胶质细胞代谢变化，并验证人类早期AD样本的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证需进一步扩展 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞的分子动态变化 | APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞，以及人类脑组织样本 | 多组学分析 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物空间分布数据 | 5个时间点（2/4/6/9/12月龄）的小鼠模型，人类早期AD与对照脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1873 | 2025-09-06 |
Cross-species analysis identifies genotype-driven vulnerabilities in lung adenocarcinoma
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.24.671070
PMID:40909610
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研究论文 | 通过跨物种单细胞分析揭示肺腺癌基因型驱动的肿瘤微环境特征和代谢依赖性 | 首次通过人鼠跨物种保守性分析揭示致癌基因突变对肿瘤微环境的特异性免疫印记 | 样本量有限（57例人类和18例小鼠样本），需进一步验证 | 解析肺腺癌主要基因突变亚型对肿瘤细胞和微环境的特异性影响 | 人类和小鼠肺腺癌样本 | 计算生物学 | 肺腺癌 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | 跨物种比较分析 | 单细胞转录组数据 | 57例人类样本和18例小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1874 | 2025-09-06 |
Prognostic Value and Immune Characterization of Genes Associated with Childhood Acute Leukemia applying Single-Cell RNA Sequencing
2025-Aug-27, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究整合单细胞和批量转录组数据，识别儿童急性淋巴细胞白血病中关键的B细胞亚群和相关分子作为生物标志物 | 首次应用单细胞RNA测序技术结合多组学分析构建儿童急性白血病的预后风险模型并探索其免疫调控机制 | 样本量较小（仅2例患者和3例健康对照），需要更大规模验证 | 探究儿童急性淋巴细胞白血病的预后生物标志物和免疫特征 | 儿童急性淋巴细胞白血病患者和健康儿童骨髓样本 | 生物信息学 | 儿童急性白血病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 功能富集分析, 伪时间轨迹分析, 细胞通讯分析 | Cox回归, LASSO回归 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 2例预B细胞高倍体ALL患者, 3例健康儿童骨髓样本, 511例cALL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 1875 | 2025-09-06 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
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研究论文 | 提出基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测细胞在不同环境变化下的转录组响应 | 首次将扩散模型应用于跨细胞类型的转录组变化预测，支持连续去噪和语义特征整合以捕捉瞬态细胞状态 | 未明确说明模型在处理极端罕见细胞类型或超高维数据时的局限性 | 预测细胞在环境刺激（如放疗、药物处理）下的转录组动态变化，加速疾病机制研究和药物发现 | 多种细胞类型（包括血管类器官）对环境刺激的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序，扩散模型 | 扩散模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及细胞分化、基因扰动和药物响应等多场景数据 | NA | NA | NA | NA |
| 1876 | 2025-09-06 |
High-Resolution Spatial Transcriptomics Reveals Fibroblast and Neuroimmune Microenvironments in Endometriosis Lesions
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.20.671344
PMID:40909522
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研究论文 | 本研究通过高分辨率空间转录组学揭示了子宫内膜异位症病灶中的成纤维细胞和神经免疫微环境 | 首次建立人类卵巢和腹膜病灶的精确空间转录组图谱，发现跨病灶类型的共享空间特征并验证上皮-神经元相互作用组 | NA | 探究子宫内膜异位症疼痛症状和疾病进展的机制 | 人类卵巢和腹膜子宫内膜异位症病灶 | 空间转录组学 | 子宫内膜异位症 | 空间转录组学，3D共培养模型 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1877 | 2025-09-06 |
Single-Cell Network Analysis Identifies CLEC4E as a Key Mediator of Proinflammatory mDC Responses in Influenza Infection
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.21.671587
PMID:40909530
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研究论文 | 本研究通过单细胞网络分析发现CLEC4E是流感感染中促炎性mDC反应的关键介质 | 采用整合单细胞共表达网络方法，首次识别出CLEC4E作为调节病理性炎症反应的上游驱动因子 | NA | 揭示流感感染中特定免疫细胞内的关键分子驱动机制 | 髓样树突状细胞(mDCs)和流感感染模型 | 生物信息学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序，网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 流感感染患者的独立单细胞数据集和小鼠流感模型 | NA | NA | NA | NA |
| 1878 | 2025-09-06 |
The spleen tyrosine kinase inhibitor entospletinib resolves inflammation to promote repair following acute kidney injury
2025-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189601
PMID:40857403
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研究论文 | 研究脾酪氨酸激酶抑制剂entospletinib在急性肾损伤后通过缓解炎症促进修复的作用机制 | 首次证明选择性SYK抑制剂entospletinib可靶向白细胞表达的SYK，阻断促炎巨噬细胞活化，从而解决肾炎症并促进修复 | 研究基于小鼠模型，人类临床应用效果尚需进一步验证 | 探索entospletinib在急性肾损伤向慢性肾病转变过程中的治疗潜力及机制 | 小鼠肾脏（单侧肾缺血再灌注损伤模型） | 肾脏病学 | 急性肾损伤与慢性肾病 | 单细胞RNA测序、数字空间分析、活体显微镜、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据、影像数据 | 小鼠肾脏样本（14天内动态分析） | NA | NA | NA | NA |
| 1879 | 2025-09-06 |
SCAN-ACT: adoptive T cell therapy target discovery through single-cell transcriptomics
2025-Aug-14, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01514-9
PMID:40814001
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研究论文 | 开发SCAN-ACT计算流程，利用单细胞转录组学数据发现和优先排序用于过继性T细胞疗法的靶点 | 提出首个整合单细胞RNA测序和多组学数据的综合性计算流程，支持单特异性CAR-T靶点、双特异性布尔逻辑门控CAR-T靶点对及肽-MHC TCR-T靶点的系统发现 | NA | 加速实体瘤过继性T细胞疗法（ACT）的靶点发现与开发 | 软组织肉瘤（STS）和胶质母细胞瘤的肿瘤相关靶点 | 计算生物学 | 软组织肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学数据分析 | 计算流程（pipeline） | 单细胞转录组数据，多组学数据 | 986,749个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 1880 | 2025-10-06 |
Paracrine Orchestration of Tumor Microenvironment Remodeling Induced by GLO1 Potentiates Lymph Node Metastasis in Breast Cancer
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500722
PMID:40492378
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境的重塑机制，并发现GLO1在促进淋巴管生成和转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统描绘乳腺癌淋巴结转移的完整生态系统，发现GLO1通过维持GSH和ROS平衡促进转移的新机制 | 样本量相对有限（23名患者的28个淋巴结样本），需要更大规模研究验证 | 探究乳腺癌淋巴结转移中肿瘤微环境重塑的分子机制 | 乳腺癌患者的淋巴结样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 23名患者的28个淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |