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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1861 | 2026-02-20 |
Comparative analysis of key phagocytic genes in humans and mice using machine learning integrated with single-cell RNA sequencing
2026-Feb-05, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序与机器学习,比较了小鼠和人类脑出血后小胶质细胞的吞噬基因差异,揭示了物种特异性的吞噬模式 | 首次结合单细胞RNA测序与机器学习模型(如XGBoost)系统比较小鼠与人类脑出血后小胶质细胞的吞噬基因,识别出物种特异性关键基因(如小鼠Tlr2和人类CLEC7A) | 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本可能受限于单细胞测序的技术偏差;物种间差异的机制需进一步实验探索 | 比较小鼠和人类脑出血后小胶质细胞的吞噬基因差异,以揭示物种特异性反应模式 | 小鼠和人类脑出血后的小胶质细胞 | 机器学习 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1862 | 2026-02-20 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-Feb, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞的协调者,在中枢神经系统免疫网络中的作用及其在健康和疾病中的相关性 | 强调了单细胞转录组学技术揭示的巨胶质细胞在免疫信号通路中的参与,挑战了传统上认为免疫功能仅限于免疫细胞的观念 | NA | 探讨巨胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的意义 | 星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1863 | 2026-02-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the protective role of renal Cx3cr1+ macrophages in cisplatin-induced acute kidney injury
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70302
PMID:41147753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾巨噬细胞亚群在顺铂诱导的急性肾损伤中的异质性,并发现Cx3cr1+巨噬细胞亚群通过AXL-GAS6信号轴促进凋亡细胞清除,从而发挥肾脏保护作用 | 首次在顺铂诱导的急性肾损伤模型中系统解析肾巨噬细胞的单细胞转录组异质性,并鉴定出具有保护功能的Cx3cr1+巨噬细胞亚群及其作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体中的验证尚不充分;单细胞测序样本量有限,可能未覆盖所有巨噬细胞亚群 | 探究急性肾损伤过程中肾巨噬细胞亚群的分类、功能及其在肾脏修复中的作用机制 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾脏组织及巨噬细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,细胞耗竭实验,过继转移实验,细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠肾脏组织(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1864 | 2026-02-20 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术,重构了肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)连续谱,识别了五种EMT状态,并揭示了混合E/M状态与高转移潜力和不良预后的关联 | 首次在肺腺癌中系统性地重建了EMT连续谱,识别了关键的混合E/M状态及其调控网络,并开发了基于EMT连续谱特征的风险分层模型 | 研究样本量较小(仅10名患者),且未在独立队列中进行广泛验证,可能限制了结果的普适性 | 旨在阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭和预后的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹推断技术 | 单细胞RNA测序数据 | 来自10名肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1865 | 2026-02-20 |
New insights into macrophage heterogeneity in renal injury and repair
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70369
PMID:41396841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤不同阶段的异质性及其在肾脏损伤与修复中的关键作用 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统解析了急性肾损伤中巨噬细胞的动态变化,并识别出四个不同的肾脏巨噬细胞亚群,明确了单核来源巨噬细胞在损伤进展中的促炎作用和肾脏驻留Cx3cr1巨噬细胞通过AXL-GAS6信号介导的胞葬作用促进修复的机制 | 研究主要基于顺铂诱导的急性肾损伤模型,可能无法完全代表其他类型肾损伤的巨噬细胞异质性,且未深入探讨巨噬细胞亚群间的相互作用或长期影响 | 探究巨噬细胞在急性肾损伤中的异质性及其在肾脏损伤与修复过程中的具体功能 | 顺铂诱导的急性肾损伤模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1866 | 2026-02-20 |
A fibroblast-like endothelial cell state promotes atherosclerosis via C/EBPβ-activated TGF-β signaling
2026-Feb, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00684-x
PMID:41495247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠主动脉在动脉粥样硬化过程中内皮细胞向成纤维细胞样状态转变的分子机制,并识别C/EBPβ作为驱动这一表型转换的关键转录因子 | 首次在动脉粥样硬化血管中识别出一个独特的成纤维细胞样内皮细胞群体,并阐明C/EBPβ通过激活TGF-β信号通路驱动内皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞状态动态 | 探究动脉粥样硬化过程中内皮细胞表型可塑性的分子机制 | 小鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1867 | 2026-02-20 |
Deciphering the Heterogeneity of Pulmonary Macrophages in Response to Fine Particles
2026-Feb, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202507293
PMID:41504080
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研究论文 | 本研究通过开发双标记金纳米颗粒模型,结合荧光激活细胞分选和单细胞RNA测序技术,揭示了肺部巨噬细胞亚群对细颗粒物响应的异质性及其功能多样性 | 开发了一种新型双标记金纳米颗粒模型,用于捕获细颗粒物响应性细胞亚群,并结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地鉴定了14个具有部分重叠但功能各异的巨噬细胞亚群,特别是突出了AMs_3、AMs_7和recMacs_4亚群在颗粒物响应中的关键作用 | 研究主要基于金纳米颗粒模型,可能无法完全模拟真实环境中细颗粒物的复杂成分和效应;样本来源和规模可能有限,需进一步验证在更广泛人群或疾病模型中的普适性 | 探究肺部细胞对吸入细颗粒物的响应异质性,特别是识别关键的响应性细胞亚群及其功能特征 | 肺部巨噬细胞,包括肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞和间质巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1868 | 2026-02-20 |
Exploration of the mechanism of anlotinib in reversing PD-1 immunotherapy resistance: insights from single-cell sequencing
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01000-3
PMID:41571876
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序探索了安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序建立并解析了penpulimab耐药模型,揭示了安罗替尼通过重编程肿瘤免疫微环境来逆转耐药的具体细胞与分子靶点 | 研究为临床前模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 探索安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 免疫检查点抑制剂耐药的肿瘤模型 | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1869 | 2026-02-20 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
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研究论文 | 本研究构建了一个整合双模态的人类视网膜细胞图谱,包含转录组和染色质可及性数据 | 整合了来自125名不同祖先背景捐赠者的约390万个细胞,包括未发表数据,识别了超过130种细胞类型,并分析了跨细胞类型的转录组、染色质和基因调控网络差异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 约390万个细胞来自125名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1870 | 2026-02-20 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内给予人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体(hiPSC-NSC-EVs)来抑制老年海马体中的炎症小胶质细胞转录组以及NLRP3和cGAS-STING信号通路,从而改善神经炎症老化和认知功能 | 首次在晚期中年小鼠模型中,通过鼻内给予hiPSC-NSC-EVs,系统性地证明了其能抑制海马体的神经炎症老化,并鉴定出外泌体中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)分别靶向抑制NLRP3炎症小体和STING通路 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证;长期疗效和安全性有待进一步评估;特定miRNA的作用机制需更深入探究 | 评估hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马体神经炎症老化的抑制作用及其对认知功能的改善效果 | 晚期中年(18个月大)的雄性和雌性C57BL6/J小鼠,以及基因工程RAW细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外细胞实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据 | C57BL6/J小鼠(具体数量未明确),基因工程RAW细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1871 | 2026-02-20 |
Regnase-1-mediated regulation of neutrophils modulates SARS-CoV-2 pneumonia
2026-Feb, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013969
PMID:41662396
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研究论文 | 本研究揭示了Regnase-1通过调节中性粒细胞的干扰素反应影响SARS-CoV-2 MA10株感染抵抗力的机制 | 首次发现Regnase-1通过靶向Tsc22d3基因的3'UTR抑制干扰素反应负调控因子,从而调节中性粒细胞功能影响病毒性肺炎进程 | 研究使用小鼠适应毒株MA10而非原始人类毒株,且机制研究主要聚焦中性粒细胞,未全面评估其他免疫细胞的作用 | 探究Regnase-1在SARS-CoV-2感染免疫调控中的作用机制 | Regnase-1+/-基因修饰小鼠及其中性粒细胞 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1872 | 2026-02-20 |
SpaLSTF: Diffusion-based generative model with BiLSTM and XCA-Transformer for spatial transcriptomics imputation
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013954
PMID:41666195
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研究论文 | 本文提出了一种名为SpaLSTF的新方法,利用条件扩散模型结合BiLSTM和XCA-Transformer,通过单细胞RNA测序数据增强空间转录组学数据的基因表达填补 | SpaLSTF采用条件扩散模型,结合BiLSTM网络捕获细胞状态间的上下文依赖,并设计XCA-Transformer机制高效计算基因表达间的注意力系数,以准确预测噪声 | 方法依赖于参考单细胞RNA测序数据,可能受数据质量和匹配度影响,且未明确讨论计算复杂度或处理大规模数据的效率 | 增强空间转录组学数据的基因表达填补,以克服稀疏基因检测和不完整表达覆盖的限制 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 条件扩散模型,BiLSTM,Transformer | 基因表达数据 | 十二个跨平台数据集,涵盖多种组织和器官 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1873 | 2026-02-20 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 本研究提出了一种基于广义估计方程(GEE)的统计方法,用于空间转录组学数据中的差异表达基因识别,并通过模拟和真实数据验证了其优于传统Wilcoxon秩和检验的性能 | 首次将广义估计方程(GEE)框架引入空间转录组学差异分析,通过考虑空间相关性解决了传统非参数方法假阳性率高的问题 | 研究主要基于模拟和有限癌症数据集验证,未在更广泛的组织类型或疾病中测试;方法实现依赖于R包,可能对非专业用户存在使用门槛 | 开发更稳健的统计方法以准确识别空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | 乳腺癌,前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程(GEE),Wilcoxon秩和检验,z检验 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1874 | 2026-02-20 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子CREB5在脊髓损伤后通过调控ApoL6抑制神经元铁死亡的分子机制 | 首次揭示了CREB5通过增强ApoL6转录活性调控脂滴代谢,从而抑制神经元铁死亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类样本中验证,且具体信号通路细节有待进一步阐明 | 阐明脊髓损伤后抑制神经元铁死亡的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型和原代神经元 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1875 | 2026-02-20 |
Cytochrome P450 Cyp2s1 regulation of the intestinal metabolome and microbiome
2026-Feb, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.007
PMID:41120053
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研究论文 | 本研究揭示了细胞色素P450酶Cyp2s1在肠道稳态和炎症中的关键作用,发现其通过AhR信号通路调节肠道代谢组和微生物组 | 首次将Cyp2s1鉴定为AhR诱导基因,并阐明其通过调节代谢组和微生物组影响肠道炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人体中的直接功能验证尚需进一步研究 | 探究Cyp2s1在肠道稳态和炎症性肠病中的作用机制 | 小鼠结肠类器官、Caco-2细胞、IBD患者活检组织、Cyp2s1转基因和敲除小鼠 | NA | 炎症性肠病 | 非靶向代谢组学、微生物组测序、单细胞RNA测序、SCENITH检测 | NA | 代谢组数据、微生物组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种结肠炎小鼠模型和IBD患者活检组织 | NA | 单细胞RNA测序、宏基因组测序 | NA | NA |
| 1876 | 2026-02-20 |
The Effects of Hypertension on Signaling Dynamics in Rare Renal Cell Types
2026-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.23.701352
PMID:41659614
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高血压对小鼠肾脏中罕见细胞类型(淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和支持细胞)信号动态的影响 | 首次在高血压模型中系统比较了肾脏罕见细胞类型间的基线信号传导差异,并发现了一种新型多能性支持细胞群体 | 研究基于小鼠模型,尚未在人体样本中验证;信号网络分析为计算预测,需要实验验证 | 探究高血压对肾脏罕见细胞类型信号传导动态的影响机制 | 小鼠肾脏中的淋巴管内皮细胞、髓系免疫细胞和新发现的支持细胞 | 单细胞组学 | 高血压相关肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NicheNet信号网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含血管紧张素II诱导和盐敏感性两种高血压模型小鼠及其对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1877 | 2026-02-20 |
Single-cell transcriptomics uncover RNF130-mediated TNF-α pathway activation and worenine synergy with paclitaxel in breast cancer
2026-Jan-24, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-026-02057-5
PMID:41580768
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了RNF130在乳腺癌中通过激活TNF-α通路促进肿瘤进展,并发现中药成分沃瑞宁与紫杉醇具有协同抗肿瘤作用 | 首次系统性地揭示了E3泛素连接酶RNF130在TNBC中的具体功能和分子机制,特别是通过单细胞转录组学发现其在恶性上皮细胞群中的富集以及与肿瘤免疫逃逸表型的关联,并创新性地筛选了中药成分沃瑞宁作为RNF130的靶向抑制剂 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,缺乏大规模临床样本验证,且沃瑞宁的具体作用机制和安全性需进一步探索 | 探究RNF130在三阴性乳腺癌中的表达模式、预后意义、分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌细胞、小鼠模型、TCGA和GEO数据库中的转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组数据分析、体外细胞实验、体内小鼠模型 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个乳腺癌样本及其肝转移样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1878 | 2026-01-26 |
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07621-w
PMID:41580850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1879 | 2026-02-20 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Commensal Microbes Amplify Sex-Specific Immune Programming in the Murine Lung
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.700627
PMID:41648295
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了共生微生物如何放大小鼠肺部性别特异性免疫编程 | 首次探索了共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用,并揭示了微生物暴露如何放大固有的免疫性别二态性 | 研究仅在小鼠模型中进行,结果需在人类中进一步验证;未具体鉴定影响性别差异的关键微生物种类 | 探究共生微生物在塑造性别特异性肺部免疫中的作用机制 | 雄性及雌性小鼠的肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 雄性及雌性小鼠,分别在SPF(无特定病原体)和GF(无菌)条件下饲养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1880 | 2026-02-20 |
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06364-1
PMID:41578172
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研究论文 | 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器,旨在高效处理来自不同平台和测序数据类型的新一代测序数据 | zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡,并在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上表现出显著的运行时性能提升 | NA | 开发一种高效且可扩展的无参考FASTQ压缩器,以减轻存储和传输负担 | FASTQ数据,包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | FASTQ文件 | 15个代表性数据集,涵盖四种测序数据类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |