单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38791 篇文献，本页显示第 18761 - 18780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18761 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics-aided localization for single-cell transcriptomics with STALocator
2025-Feb-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101195
PMID:39904340
|
研究论文 | 开发了一种名为STALocator的空间转录组学辅助定位工具，用于将单细胞转录组数据定位到对应的空间转录组数据中 | 提出首个利用空间转录组数据辅助单细胞转录组定位的方法，能够增强基因表达模式并预测全基因组基因表达数据 | 未明确说明方法在更广泛组织类型或数据质量较差情况下的适用性 | 解决单细胞转录组数据缺乏空间信息的问题，实现单细胞在空间上的精确定位 | 单细胞转录组数据和空间转录组数据 | 空间转录组学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，荧光原位杂交 | STALocator | 基因表达数据，空间位置数据 | 模拟数据、人脑数据和鳞状细胞癌数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Slide-seqV2，Xenium | Slide-seqV2空间转录组技术，Xenium原位分析技术 |
| 18762 | 2025-10-07 |
Inferring cell trajectories of spatial transcriptomics via optimal transport analysis
2025-Feb-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101194
PMID:39904341
|
研究论文 | 本研究开发了SpaTrack方法，通过最优传输分析整合空间转录组数据中的基因表达和空间位置信息来推断细胞分化轨迹 | 首次将最优传输理论应用于空间转录组数据分析，能够同时整合基因表达和空间位置信息来重建细胞分化轨迹 | NA | 开发能够从空间转录组数据中推断细胞分化轨迹的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18763 | 2025-10-07 |
Dynamic transcriptomic and regulatory networks underpinning the transition from fetal primordial germ cells to spermatogonia in mice
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13755
PMID:39329203
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠雄性生殖细胞从原始生殖细胞向精原细胞转变过程中的转录动态和调控网络 | 首次系统揭示了PGC向SPG转变过程中的全局超转录特征，鉴定出315个高活性调控因子，并验证了非转录因子TAGLN2在精原干细胞维持和分化中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类生殖细胞发育中的适用性需要进一步验证 | 阐明雄性生殖细胞发育过程中从原始生殖细胞向精原细胞转变的分子机制 | 小鼠雄性生殖细胞和性腺细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠雄性生殖细胞发育图谱数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18764 | 2025-10-07 |
Applications and emerging challenges of single-cell RNA sequencing technology in tumor drug discovery
2025-Feb, Drug discovery today
IF:6.5Q1
DOI:10.1016/j.drudis.2025.104290
PMID:39828052
|
综述 | 概述单细胞RNA测序技术在肿瘤药物发现中的应用及面临的挑战 | 系统总结scRNA-seq技术在肿瘤药物研发各阶段（机制阐明、靶点识别、药物筛选、药效与耐药性研究）的创新应用 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探讨scRNA-seq技术在肿瘤药物开发中的应用前景与挑战 | 肿瘤药物研发过程 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18765 | 2025-10-07 |
Exosome-based targeted delivery of NF-κB ameliorates age-related neuroinflammation in the aged mouse brain
2025-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-024-01388-8
PMID:39833561
|
研究论文 | 本研究评估了装载不可降解IκB的外泌体通过抑制NF-κB核转位来改善老年小鼠脑部神经炎症的治疗效果 | 首次利用外泌体递送不可降解IκB特异性靶向巨噬细胞和小胶质细胞，并揭示其通过调节免疫细胞互作缓解年龄相关神经炎症的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床应用中验证 | 开发针对年龄相关神经炎症的新型治疗方法 | 老年小鼠脑部组织及免疫细胞（巨噬细胞、小胶质细胞、T细胞、B细胞） | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠脑部样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18766 | 2025-10-07 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2025-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012747
PMID:39919147
|
研究论文 | 开发了一种无需超参数调整的广义对比主成分分析方法，用于比较高维数据集间的差异模式 | 提出了广义对比主成分分析(gcPCA)，解决了传统cPCA需要超参数调整和不对称处理条件的问题 | 未在论文摘要中明确说明具体局限性 | 开发一种灵活、无需超参数的高维数据对比分析方法 | 高维生物数据集，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | II型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 广义对比主成分分析(gcPCA) | 高维数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18767 | 2025-02-23 |
EPB41L4A-AS1 regulates cervical cancer by proliferative cells: mendelian randomization and single-cell transcriptomics analyses
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-949
PMID:39974380
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，探讨了增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 首次揭示了EPB41L4A-AS1通过调控增殖细胞在宫颈癌中的作用 | 研究主要基于单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，未涉及临床试验验证 | 探讨增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 宫颈癌组织中的增殖细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化、MTT、流式细胞术、GSEA、WGCNA | NA | 单细胞转录组数据 | 宫颈癌组织与健康组织的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18768 | 2025-02-23 |
By integrating single-cell RNA sequencing and bulk RNA sequencing, plasma cells signature and tertiary lymphoid structures were verified to contribute to outcome in lung adenocarcinoma
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1746
PMID:39974398
|
研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，验证了浆细胞特征和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的作用 | 结合单细胞RNA测序和批量RNA测序技术，首次系统性地探讨了浆细胞和三级淋巴结构在肺腺癌预后中的具体作用 | 研究主要依赖于公开数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 探讨三级淋巴结构和浆细胞在肺腺癌预后中的作用 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据, 临床信息 | 来自GEO和TCGA数据库的肺腺癌患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18769 | 2025-10-07 |
Classifying cell cycle states and a quiescent-like G0 state using single-cell transcriptomics
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.16.589816
PMID:38659838
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率细胞周期分类器ccAFv2，用于单细胞转录组数据中细胞周期状态和静止样G0状态的分类 | 能够区分六个细胞周期状态和一个静止样G0状态，并包含可调参数过滤不确定分类，在分类更多状态的同时性能优于或相当于现有方法 | G0、G1和Late G1状态在神经上皮细胞类型中表现良好，但在其他细胞类型中准确性较低 | 开发高精度的细胞周期状态分类工具 | 人类神经干细胞及来自三个胚层的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 细胞周期分类器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 18770 | 2025-10-07 |
Exploring the cellular and molecular basis of murine cardiac development through spatiotemporal transcriptome sequencing
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf012
PMID:39960664
|
研究论文 | 利用空间转录组测序技术探索小鼠心脏发育过程并构建早期心脏发育的时空细胞图谱 | 首次构建了小鼠早期心脏发育的全面时空细胞图谱，揭示了心脏细胞谱系的空间组织和关键基因动态变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 探索小鼠心脏发育的细胞和分子基础 | 小鼠心脏发育过程 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18771 | 2025-02-23 |
The landscape of cell regulatory and communication networks in the human dental follicle
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1535245
PMID:39974190
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人类牙囊的细胞组成和调控网络，揭示了牙囊在发育和生物学功能中的复杂调控机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面解析了人类牙囊的细胞组成和基因调控网络，揭示了血管和免疫细胞在牙囊生物学活动中的相互作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 揭示人类牙囊的细胞组成和调控机制，以理解其在牙周组织发育和生物学功能中的作用 | 人类牙囊 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18772 | 2025-02-23 |
Research hotspots and frontiers in the tumor microenvironment of colorectal cancer: a bibliometric study from 2014 to 2024
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1525280
PMID:39975599
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究现状、热点和未来趋势 | 首次对2014年至2024年间结直肠癌肿瘤微环境的研究进行文献计量分析，揭示了该领域的研究热点和未来趋势 | 研究仅基于Web of Science核心合集数据库，可能未涵盖所有相关文献 | 提供结直肠癌肿瘤微环境领域的当前研究状态、热点和未来趋势的全面图景 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 748篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 18773 | 2025-10-07 |
Genetic inference and single cell expression analysis of potential targets in heart failure and breast cancer
2024-Oct-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06010-y
PMID:39460820
|
研究论文 | 通过遗传推断和单细胞表达分析探索心力衰竭与乳腺癌的潜在遗传靶点 | 整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统揭示ITM2B基因在乳腺癌中的功能作用 | 研究样本量未明确说明，体外实验仅针对MCF7细胞系，缺乏体内验证 | 探索心力衰竭和乳腺癌的潜在遗传靶点并验证其因果关系 | 心力衰竭和乳腺癌相关的遗传变异及ITM2B基因 | 生物信息学 | 乳腺癌,心血管疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18774 | 2025-10-07 |
Astrocytes Modulate a Specific Paraventricular Thalamus→Prefrontal Cortex Projection to Enhance Consciousness Recovery from Anesthesia
2024-Aug-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1808-23.2024
PMID:38926088
|
研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过调控丘脑室旁核→前额叶皮层特定神经通路促进七氟醚麻醉后意识恢复的新机制 | 首次发现星形胶质细胞Kir4.1通道在麻醉恢复中的关键作用，并鉴定出丘脑室旁核中两种不同的谷氨酸能神经元亚型 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未验证在雌性动物中的适用性；机制研究主要集中于PVT-mPFC通路 | 探索星形胶质细胞在麻醉后意识恢复中的调控机制 | 雄性小鼠的丘脑室旁核星形胶质细胞和谷氨酸能神经元 | 神经科学 | 麻醉相关意识障碍 | 单细胞RNA测序,电生理记录,膜片钳技术 | 动物模型 | 基因表达数据,电生理数据 | 雄性小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18775 | 2025-10-07 |
Pharmacological suppression of the OTUD4/CD73 proteolytic axis revives antitumor immunity against immune-suppressive breast cancers
2024-Mar-26, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176390
PMID:38530357
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现OTUD4/CD73蛋白水解轴是治疗免疫抑制性三阴性乳腺癌的潜在靶点，并开发了特异性抑制剂ST80 | 首次揭示OTUD4通过去泛素化稳定CD73的机制，开发了特异性抑制剂ST80，并证明其能增强抗PD-L1疗法的效果 | 研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验 | 开发针对免疫抑制性乳腺癌的新型免疫治疗策略 | 三阴性乳腺癌(TNBC)及其肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析，空间转录组学，实验验证 | NA | 多组学数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18776 | 2025-10-07 |
Steatosis drives monocyte-derived macrophage accumulation in human metabolic dysfunction-associated fatty liver disease
2023-Nov, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100877
PMID:37869071
|
研究论文 | 本研究探讨了代谢功能障碍相关脂肪肝病中巨噬细胞异质性与肝脏脂肪变性的关系 | 首次在人类MAFLD中系统描述巨噬细胞亚群组成，发现单核细胞源性巨噬细胞与肝脏脂肪变性程度相关，并揭示其在脂质摄取中的独特作用 | 样本量较小（n=21），单细胞RNA测序仅对3个样本进行，缺乏长期随访数据 | 研究人类MAFLD早期阶段巨噬细胞异质性及其与肝脏脂肪变性的关系 | 接受减重手术的21名参与者的肝组织样本及小鼠肝脂肪变性模型 | 单细胞生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光，H&E显微镜，MRI，电子显微镜 | NA | 基因表达数据，图像数据，临床数据 | 21名人类参与者，其中3个样本进行单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18777 | 2025-10-07 |
Spatial and single-nucleus transcriptomic analysis of genetic and sporadic forms of Alzheimer's Disease
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550282
PMID:37546983
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病的遗传性和散发性形式 | 首次结合空间转录组学和单细胞核RNA测序技术，同时研究散发性AD和唐氏综合征相关AD，并进行跨物种比较 | 样本数量未明确说明，研究主要聚焦于早期和晚期AD阶段 | 探索阿尔茨海默病的转录组特征及其在空间和细胞类型水平的变化 | 人类皮质样本（早期AD、晚期AD、唐氏综合征相关AD）和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞核RNA测序，淀粉样斑块成像 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18778 | 2025-10-07 |
SEC-seq: association of molecular signatures with antibody secretion in thousands of single human plasma cells
2023-06-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39367-8
PMID:37322036
|
研究论文 | 开发了一种名为SEC-seq的新方法，能够在单细胞水平上将抗体分泌量与表面标志物和转录组信息关联 | 利用含腔水凝胶纳米小瓶捕获细胞分泌物，首次实现了在数千个单个人类浆细胞中同时分析IgG分泌量、表面标志物和转录组 | NA | 建立分泌功能与分子特征关联的分析方法 | 人类B细胞和浆细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质分泌数据,表面标志物数据 | 数千个单个人类浆细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | SEC-seq（分泌组关联单细胞测序） |
| 18779 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of bulk RNA and single-cell sequencing data reveals a liquid-liquid phase separation signature for clear cell renal cell carcinoma
2025-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149313
PMID:39921047
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞测序数据，建立了一个基于液-液相分离相关基因的透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应预测标志 | 首次构建了基于液-液相分离相关基因的ccRCC预后特征，并验证了其与免疫浸润、免疫治疗反应的关系 | NA | 建立透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应预测标志 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 单变量Cox回归, LASSO算法 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 18780 | 2025-10-07 |
Proliferation of renal macrophage via MR/CSF1 pathway induced with aldosterone and inhibited by esaxerenone
2025-Mar-06, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114208
PMID:39923576
|
研究论文 | 本研究探讨醛固酮通过MR/CSF1通路诱导肾脏巨噬细胞增殖的机制及其抑制剂的影响 | 首次揭示醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖主要来源于驻留巨噬细胞且以M1亚型为主，并阐明MR/CSF1通路的关键调控作用 | 巨噬细胞的高度可塑性和异质性使得增殖细胞的起源和亚型仍存在部分不明确之处 | 探究醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖机制及治疗策略 | 肾脏巨噬细胞 | 病理生理学 | 肾脏疾病 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞测序 | NA | 细胞图像、流式数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |