单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 18701 - 18720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18701 | 2024-08-05 |
Transcriptome age of individual cell types in Caenorhabditis elegans
2023-02-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2216351120
PMID:36812209
|
研究论文 | 本研究分析了线虫在发育过程中个体细胞类型的转录组年龄 | 首次探讨了小时glass模式与不同细胞类型转录组年龄变异的关系 | 未深入研究特定细胞在转录组年龄变化中的作用 | 研究线虫在发育不同阶段的转录组年龄 | 线虫的各种细胞类型 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 128种神经元类型的转录组数据 |
| 18702 | 2024-08-08 |
Defining and targeting tumor-associated macrophages in malignant mesothelioma
2023-02-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2210836120
PMID:36821580
|
研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞（TAM）在恶性间皮瘤中的起源和治疗靶点 | 首次鉴定了两种不同的巨噬细胞群体，并证实了通过条件性删除Dicer1基因选择性耗竭M2样TAM可以促进肿瘤排斥 | NA | 开发恶性间皮瘤的治疗靶点 | 肿瘤相关巨噬细胞（TAM）及其在恶性间皮瘤中的作用 | NA | 恶性间皮瘤 | 转录组和单细胞RNA测序分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠腹腔和胸腔中的两种巨噬细胞群体 |
| 18703 | 2024-08-08 |
Integrated multi-omics analyses and functional validation reveal TTK as a novel EMT activator for endometrial cancer
2023-02-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03998-8
PMID:36829176
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析和功能验证，揭示了TTK作为子宫内膜癌中新的上皮-间质转化（EMT）激活因子的新角色。 | 首次全面研究了与子宫内膜癌发展相关的癌症-睾丸抗原（CTA）基因的表达和临床意义，并发现了TTK在子宫内膜癌中的新致癌功能。 | 研究主要基于TCGA和GEO数据库的数据，可能需要进一步的实验验证。 | 探讨TTK在子宫内膜癌中的临床相关性、生物学作用和分子机制。 | 子宫内膜癌样本和细胞。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 生物信息学方法 | NA | 基因组、转录组和表观遗传数据 | 使用了来自TCGA数据库的子宫内膜癌样本和GEO数据库的单细胞数据。 |
| 18704 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of the stepwise progression of head and neck cancer
2023-02-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36691-x
PMID:36828832
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研究论文 | 该文章研究了头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）从正常组织到转移肿瘤的逐步演进过程中的肿瘤细胞异质性及其相互作用 | 通过单细胞RNA测序，提出了在白斑病变中可以识别出病理检查未检测到的原位癌细胞，并揭示了与不良预后相关的细胞类型亚群 | 在摘要中未提及任何具体的研究限制 | 阐明HNSCC进程中细胞间相互作用的病理生物学新见解 | 人头颈部鳞状细胞癌的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 18705 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in orthopedic research
2023-Feb-24, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00245-0
PMID:36828839
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在骨科疾病研究中的应用，包括细胞亚群、基因及其在疾病发展中的潜在机制 | 介绍了单细胞RNA测序技术在骨科疾病研究中的新应用，提供了细胞异质性、新细胞亚型、功能性子簇、潜在分子机制、细胞命运转换和细胞间相互作用的信息 | NA | 深入阐明骨科疾病的具体机制，并提供新的治疗策略 | 骨科疾病，包括骨关节炎、腰椎间盘突出、类风湿性关节炎、骨折、肌腱损伤、脊髓损伤、异位骨化、骨肉瘤等 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因数据 | NA |
| 18706 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profiling of the developing brain revealed cell-type and brain-region specificity in a mouse model of prenatal stress
2023-Feb-24, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09186-8
PMID:36829105
|
研究论文 | 本研究使用RNA-seq技术探索了孕期慢性不可预测的轻度应激（CUMS）暴露后小鼠胎儿大脑基因表达的变化 | 首次提供了孕期慢性应激后整个胎儿大脑转录组改变的无偏数据源，并报告了发育中大脑在应对孕期环境压力时的细胞类型和脑区特异性的脆弱性 | NA | 探索孕期应激对小鼠胎儿大脑基因表达的影响及其细胞类型和脑区特异性 | 小鼠胎儿大脑在孕期慢性应激后的基因表达变化 | 数字病理学 | 精神障碍 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠胎儿大脑样本 |
| 18707 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals niche-specific enrichment and vulnerabilities of radial glial stem-like cells in malignant gliomas
2023-02-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36707-6
PMID:36823172
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研究论文 | 本研究揭示了恶性胶质瘤中放射状胶质干细胞样细胞的特定栖息地富集和脆弱性。 | 通过结合短读和长读空间转录组学，首次对胶质瘤潜在的细胞状态和栖息地特征进行了空间剖析。 | 缺乏对空间组织在疾病进展中的时间动态分析。 | 研究恶性胶质瘤不同栖息地中的细胞状态和调控程序。 | 主要研究放射状胶质干细胞样细胞及其在胶质瘤栖息地的富集情况。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 空间转录组学 | 人类神经干细胞衍生的正位胶质瘤模型 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 18708 | 2024-08-05 |
The amniotic fluid proteome changes with term labor and informs biomarker discovery in maternal plasma
2023-02-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-28157-3
PMID:36823217
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研究论文 | 本文利用一种适配体基础平台表征了1,310种羊水蛋白，并发现其在足月分娩时发生显著变化 | 提出了羊水蛋白组在足月分娩期间的变化，并为生物标志物的发现提供了新的见解 | 未系统评估羊水蛋白变化与母体血浆中蛋白质变化之间的具体机制 | 探索足月分娩期间羊水蛋白组的变化及其在母体血浆中的反映 | 主要研究对象为羊水中的蛋白质及其与母体血浆中的变化 | 数字病理学 | NA | 适配体基础平台 | NA | 蛋白质组数据 | 1,310种羊水蛋白 |
| 18709 | 2024-08-05 |
Reconstructing clonal tree for phylo-phenotypic characterization of cancer using single-cell transcriptomics
2023-02-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36202-y
PMID:36813776
|
研究论文 | 本研究介绍了一种整合大规模基因组数据与单细胞RNA测序数据的高保真克隆树重建方法 | 提出了PhylEx方法，能够以较高的准确性重建克隆树，并超越了现有的表达聚类方法 | 尚未提及具体的局限性 | 通过重建克隆树以深入了解癌症的演化机制和功能状态 | 研究对象为高分级浆液性卵巢癌细胞系及乳腺癌数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据和RNA测序数据 | 合成数据和特征明确的高分级浆液性卵巢癌细胞系数据集 |
| 18710 | 2024-08-05 |
Metagenomic and single-cell RNA-Seq survey of the Helicobacter pylori-infected stomach in asymptomatic individuals
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.161042
PMID:36810249
|
研究论文 | 本研究深入描述了无症状Helicobacter pylori感染者的胃部微生物和免疫细胞环境 | 发现无症状H. pylori感染者胃部ILC3s占主导地位，且NKp44+ ILC3s比例显著增加 | 研究主要集中于无症状个体，可能无法普遍适用于其他人群 | 深入了解H. pylori感染时胃部微生物群和免疫细胞的变化 | 无症状H. pylori感染者和未感染者的胃组织样本 | 数字病理学 | NA | 宏基因组测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、荧光显微镜 | NA | 组织样本 | 收集了人类胃组织样本 |
| 18711 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic dissection of the cellular and molecular events underlying the triclosan-induced liver fibrosis in mice
2023-02-22, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00441-3
PMID:36814339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，深入解析了三氯生诱导的小鼠肝脏纤维化的细胞和分子机制 | 首次提供了三氯生响应的小鼠肝脏单细胞图谱，并详细描绘了三氯生诱导的肝毒性和纤维化的关键细胞和分子过程 | NA | 阐明三氯生在初始阶段对肝脏毒性作用的细胞和分子机制 | 三氯生诱导的小鼠肝脏纤维化 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过76,000个细胞，属于13种主要细胞类型 |
| 18712 | 2024-08-05 |
An adverse tumor-protective effect of IDO1 inhibition
2023-02-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.100941
PMID:36812891
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研究论文 | 本文探讨了IDO1抑制对黑色素瘤细胞在T细胞攻击下的保护作用 | 揭示了IDO1抑制对黑色素瘤细胞的负面保护作用，并探讨了相关机制 | 研究集中于黑色素瘤细胞，结果可能不适用于其他类型肿瘤 | 重新审视IDO1在肿瘤细胞中的作用 | 黑色素瘤细胞及其对T细胞来源的干扰素-γ的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序和核糖体剖析 | 单细胞测序 | 生物分子数据 | 包括患者黑色素瘤样本 |
| 18713 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Macrophages Are Involved in the Pathogenesis of Human Sporadic Acute Type A Aortic Dissection
2023-02-20, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13020399
PMID:36830768
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研究论文 | 本研究通过scRNA-seq分析了巨噬细胞在成人散发性急性A型主动脉夹层（ATAAD）中的作用 | 揭示了巨噬细胞在ATAAD病理进程中的异质性及其特定亚群的炎症作用 | 样本量较小，仅包括九名患者 | 研究巨噬细胞在成人散发性急性A型主动脉夹层中的作用 | 来自六名ATAAD患者和三名心脏移植供体的主动脉壁组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 组织样本 | 九个样本，来自六名ATAAD患者和三名心脏移植供体 |
| 18714 | 2024-08-08 |
Single cell and lineage tracing studies reveal the impact of CD34+ cells on myocardial fibrosis during heart failure
2023-02-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03256-0
PMID:36805782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术，探讨了CD34+细胞在心脏衰竭过程中的心肌纤维化作用及其机制 | 首次揭示了非骨髓来源的CD34+细胞在心脏肥大中的细胞动态变化，以及这些细胞在心肌纤维化中的关键作用 | NA | 深入研究CD34+细胞在心脏衰竭中的命运和分化机制，探索其干预策略 | CD34+细胞在心脏衰竭中的作用及其对心肌纤维化的影响 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 59,505个来自小鼠心脏的单细胞和22,537个来自人类心脏的单细胞 |
| 18715 | 2024-08-08 |
GSDME-mediated pyroptosis promotes the progression and associated inflammation of atherosclerosis
2023-02-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36614-w
PMID:36807553
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研究论文 | 本研究通过生成ApoE和GSDME双缺陷小鼠模型，探讨GSDME介导的焦亡在动脉粥样硬化进展及其相关炎症中的作用。 | 首次揭示了GSDME在动脉粥样硬化中的作用及其通过STAT3的转录调控机制。 | NA | 研究GSDME介导的焦亡在动脉粥样硬化进展中的作用及其潜在治疗价值。 | ApoE和GSDME双缺陷小鼠模型，以及人动脉粥样硬化单细胞转录组。 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | ApoE和GSDME双缺陷小鼠，人动脉粥样硬化样本 |
| 18716 | 2024-08-08 |
Transcriptional heterogeneity in human diabetic foot wounds
2023-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.16.528839
PMID:36824808
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了非糖尿病和糖尿病患者的慢性足溃疡，揭示了糖尿病足溃疡中转录变化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病足溃疡中的转录变化，包括角质形成细胞分化减少、成纤维细胞功能和谱系改变以及巨噬细胞代谢、炎症和细胞外基质生产缺陷 | NA | 探究糖尿病足溃疡的细胞和分子机制 | 非糖尿病和糖尿病患者的慢性足溃疡 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过400万美国患者和全球超过700万患者的数据 |
| 18717 | 2024-08-08 |
Stepwise fate conversion of supporting cells to sensory hair cells in the chick auditory epithelium
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106046
PMID:36818302
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了鸡基底乳头在毛细胞再生过程中支持细胞向毛细胞的命运转换机制 | 本文首次通过单细胞RNA测序揭示了支持细胞向毛细胞命运转换的动态基因表达变化和伪时间轨迹分析 | NA | 确定支持细胞向毛细胞转换的机制 | 鸡基底乳头中的支持细胞和毛细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18718 | 2024-08-08 |
A quantitative evaluation of topological motifs and their coupling in gene circuit state distributions
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106029
PMID:36824273
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算框架，用于系统地、高通量地定量评估转录调控电路模体及其耦合对动态生物系统功能的影响 | 该框架能够识别四节点基因电路、电路模体及其耦合，这些是导致各种基因表达状态分布的原因，包括从单细胞RNA测序数据中得出的分布 | NA | 旨在更好地理解基因调控机制在创建和维持细胞状态中的作用 | 转录调控电路模体及其耦合对动态生物系统功能的影响 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18719 | 2024-08-08 |
E2F1 Mediates SOX17 Deficiency-Induced Pulmonary Hypertension
2023-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.15.528740
PMID:36824855
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研究论文 | 研究探讨了SOX17缺乏在肺动脉高压（PH）发展中的作用及其机制 | 首次报道了SOX17基因变异在特发性肺动脉高压（PAH）发病机制中的具体作用 | 研究主要基于小鼠模型和人类肺组织样本，可能需要更多临床数据验证 | 探究SOX17缺乏在肺动脉高压发展中的作用 | 人类肺组织、内皮细胞及Sox17基因敲除小鼠 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 细胞 | 包括IPAH患者的肺组织和内皮细胞，以及Sox17基因敲除小鼠 |
| 18720 | 2024-08-08 |
The pseudokinase Trib1 regulates the transition of exhausted T cells to a KLR + CD8 + effector state and its deletion improves checkpoint blockade
2023-Feb-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.16.528833
PMID:36824931
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研究论文 | 研究通过删除伪激酶Trib1，调节耗竭T细胞向KLR+ CD8+效应状态的转变，并改善检查点阻断疗法的效果 | 首次证明删除伪激酶Trib1可以促进耗竭T细胞向KLR+ CD8+效应状态的转变，并增强检查点抑制剂疗法的效果 | NA | 研究调节耗竭T细胞向效应状态转变的分子机制，并探索其对检查点阻断疗法的影响 | 耗竭T细胞及其向效应状态的转变 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、RNA速度分析和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |