单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 18681 - 18700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18681 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of entorhinal cortex reveals widespread disruption of neuropeptide networks in Alzheimer's disease
2023-08, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.12979
PMID:36825405
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研究论文 | 本研究揭示了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 | 首次使用单细胞转录组数据明确了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 | 研究可能受限于样本大小和选择偏差 | 探讨神经肽网络在阿尔茨海默病中的破坏情况 | 阿尔茨海默病中颞叶皮层的神经肽表达情况 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 18682 | 2024-08-08 |
GGC repeat expansion in NOTCH2NLC induces dysfunction in ribosome biogenesis and translation
2023-08-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad058
PMID:36825461
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研究论文 | 研究探讨了NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制，特别是在神经元内核包涵体病（NIID）中的作用 | 使用患者特异性的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的三维大脑类器官（3DCOs）和细胞模型，揭示了NOTCH2NLC GGC重复序列扩展导致的核仁应激和核糖体生物发生及翻译功能障碍 | NA | 研究NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制 | NOTCH2NLC基因中的GGC重复序列扩展及其在神经元内核包涵体病（NIID）中的作用 | 遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 3D大脑类器官（3DCOs） | RNA | 使用患者特异性的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的三维大脑类器官（3DCOs）和细胞模型进行研究 |
| 18683 | 2024-08-05 |
Phylogenetic placement of the protosteloid amoeba Microglomus paxillus identifies another case of sporocarpic fruiting in Discosea (Amoebozoa)
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12971
PMID:36825799
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研究论文 | 该文章探讨了原昔体阿米巴Microglomus paxillus的系统发育定位，揭示了Discosea中 sporocarpic fruiting的另一个案例 | 通过单细胞转录组学分析，首次为Microglomus paxillus提供了系统发育信息，阐明了其与Discosea的亲缘关系 | SSU rRNA序列的高度变异性限制了我们在丰富的分类数据集中进一步阐明M. paxillus的系统发育位置 | 澄清sporocarpic fruiting的进化背景 | 原昔体阿米巴Microglomus paxillus的个体样本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 蛋白编码标记数据 | 229个蛋白编码标记 |
| 18684 | 2024-08-05 |
Heterogeneity and plasticity of epithelial-mesenchymal transition (EMT) in cancer metastasis: Focusing on partial EMT and regulatory mechanisms
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13423
PMID:36808651
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综述 | 这篇文章总结了癌症转移中上皮-间质转化（EMT）的异质性和动态特性 | 提出了肿瘤细胞如何调节自身以保持特定EMT转化状态的跷跷板模型，并强调了EMT异质性与胃癌预后不良的密切关系 | 文章回顾了EMT信号在临床应用中的当前状态和局限性 | 探讨EMT转化状态在肿瘤转移中的直接和间接作用 | 集中讨论部分EMT的特征、生物标志物和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 18685 | 2024-08-05 |
PDPN positive CAFs contribute to HER2 positive breast cancer resistance to trastuzumab by inhibiting antibody-dependent NK cell-mediated cytotoxicity
2023-05, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2023.100947
PMID:36812747
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研究论文 | 本研究识别了一种新的与 trastuzumab 抗药性相关的 PDPN 阳性 CAFs 亚群 | 首次发现 PDPN 阳性 CAFs 在 trastuzumab 抗药性肿瘤组织中富集，并通过分泌免疫抑制因子抑制 NK 细胞介导的 ADCC | 研究中可能未全面评估所有类型的免疫反应和其他潜在的肿瘤微环境因素 | 研究 PDPN 阳性 CAFs 如何影响 HER2 阳性乳腺癌对 trastuzumab 的抗药性 | HER2 阳性乳腺癌患者的肿瘤组织及其 CAFs | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 组织样本 | NA |
| 18686 | 2024-08-05 |
Distinct stage-specific transcriptional states of B cells derived from human tonsillar tissue
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.155199
PMID:36809296
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研究论文 | 本文研究了源自人类扁桃体的B细胞的不同阶段特异性转录状态 | 识别出一种我们认为之前未被描述的表达CCL4/CCL3化学趋化因子的B细胞亚群，并提出了一种基于调控网络推断和伪时间建模的计算方法 | 研究可能仅限于来源于扁桃体的B细胞，对其他组织的B细胞状态缺乏比较 | 探索扁桃体来源B细胞的激活和成熟状态 | 扁桃体来源的B细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间建模 | NA | NA |
| 18687 | 2024-08-05 |
CD11c+ macrophages are proangiogenic and necessary for experimental choroidal neovascularization
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168142
PMID:36821388
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研究论文 | 本文研究了CD11c+巨噬细胞在实验性脉络膜新生血管中的促血管生成作用。 | 该研究首次揭示了Spp1+巨噬细胞和CD11c+巨噬细胞的功能特性及其在脉络膜新生血管形成中的重要作用。 | 本文未提及对巨噬细胞异质性研究的临床应用和长期影响的评估。 | 研究CD11c+巨噬细胞在与neovascular AMD相关的脉络膜新生血管中的作用。 | 研究重点是小鼠模型中的免疫细胞和巨噬细胞群体。 | 数字病理学 | 老年性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | 激光诱导脉络膜新生血管模型 | 基因表达数据 | 使用了来自于WT和Ccr2-/-小鼠的免疫细胞样本 |
| 18688 | 2024-08-05 |
A miRNA/CXCR4 signaling axis impairs monopoiesis and angiogenesis in diabetic critical limb ischemia
2023-04-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.163360
PMID:36821386
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研究论文 | 本研究揭示了miR-181在糖尿病危重肢体缺血中的作用机制 | 探讨了miRNA/CXCR4信号轴在糖尿病患者中对单核细胞生成和血管生成的影响 | 尚需进一步研究以完全理解糖尿病与CLI之间的潜在机制 | 阐明糖尿病危重肢体缺血患者中miR-181的作用及其对单核细胞生成的影响 | 糖尿病患者及其在小鼠模型中的表现 | 数字病理学 | 下肢缺血 | miRNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本 | 糖尿病患者的血浆样本和高脂饮食下的miRNA-KO小鼠 |
| 18689 | 2024-08-05 |
Establishment of a risk score model for bladder urothelial carcinoma based on energy metabolism-related genes and their relationships with immune infiltration
2023-04, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.13580
PMID:36814419
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研究论文 | 本文建立了基于能量代谢相关基因的膀胱尿路上皮癌风险评分模型，并探讨其与免疫浸润的关系 | 创新点在于构建了一个风险评分模型，该模型有效关联了能量代谢相关基因与膀胱尿路上皮癌患者的预后及免疫微环境 | 本研究的局限性在于未提供样本的详细 demographic 信息，可能影响模型的广泛适用性 | 研究目的是寻找膀胱尿路上皮癌患者的有效预后生物标志物 | 研究对象为膀胱尿路上皮癌患者及其相关基因信息 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 基因表达数据 | 584个能量代谢相关基因样本 |
| 18690 | 2024-08-05 |
Deciphering inhibitory neuron development: The paths to diversity
2023-04, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2023.102691
PMID:36805715
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评论 | 本文探讨了抑制性神经元的发育及其多样性的形成机制 | 该文章通过单细胞测序的新见解阐明了GABA能神经元多样性出现的机制 | NA | 阐明抑制性神经元发育过程中的命运决策与多样性形成 | GABA能神经元及其前体细胞 | 神经生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 18691 | 2024-08-05 |
DZIP1 expressed in fibroblasts and tumor cells may affect immunosuppression and metastatic potential in gastric cancer
2023-Apr, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.109886
PMID:36805200
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研究论文 | 本研究探讨了DZIP1在胃癌中的作用及其在免疫抑制和转移潜力中的影响 | 发现DZIP1在肿瘤相关成纤维细胞和恶性上皮细胞中上调，并参与肿瘤微环境的形成 | 该研究可能受限于单细胞测序的样本选择和数据解析 | 研究DZIP1如何影响胃癌的免疫抑制环境和转移过程 | 研究对象包括肿瘤相关成纤维细胞和恶性胃癌细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 18692 | 2024-08-08 |
Novel TCF21high pericyte subpopulation promotes colorectal cancer metastasis by remodelling perivascular matrix
2023-04, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-327913
PMID:36805487
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤周细胞（TPCs）的异质性及其对结直肠癌（CRC）转移的影响 | 发现了新的TCF21high周细胞亚群，该亚群通过重塑血管周围基质促进结直肠癌的肝转移 | NA | 研究肿瘤周细胞在血行转移中的作用及其对结直肠癌转移的影响 | 结直肠癌患者的肿瘤周细胞及其与肝转移的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序、亚硫酸氢盐测序 | NA | RNA序列 | 从结直肠癌患者中分离的肿瘤周细胞，包括有和无肝转移的患者 |
| 18693 | 2024-08-08 |
Cell selectivity in succinate receptor SUCNR1/GPR91 signaling in skeletal muscle
2023-04-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00009.2023
PMID:36812387
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研究论文 | 研究探讨了琥珀酸受体SUCNR1在骨骼肌中的细胞选择性和信号传导机制 | 首次揭示了SUCNR1在人类骨骼肌中不表达于肌肉纤维，而是与巨噬细胞群体共存，且M2极化巨噬细胞对SUCNR1激动剂有响应 | 研究未明确琥珀酸激活SUCNR1的具体细胞间通信方向性 | 旨在阐明SUCNR1在人类骨骼肌中的表达特性及其在运动适应性反应中的作用 | 人类骨骼肌中的SUCNR1表达及其在细胞层面的响应 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 荧光RNAscope | NA | 转录组数据 | 涉及人类骨骼肌、免疫、脂肪和肝脏组织样本 |
| 18694 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of the mouse and primate ovaries reveals oocyte-specific expression patterns of risk genes in ovarian aging
2023-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.209
PMID:36818017
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18695 | 2024-08-08 |
An artificial intelligence network-guided signature for predicting outcome and immunotherapy response in lung adenocarcinoma patients based on 26 machine learning algorithms
2023-Apr, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13409
PMID:36822595
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研究论文 | 本研究基于26种机器学习算法，通过分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种肿瘤浸润免疫细胞相关的特征评分，用于预测肺腺癌患者的生存结果和免疫治疗反应 | 本研究首次开发了一种基于免疫细胞特异性基因的模型，该模型在预测肺腺癌患者的生存结果和免疫治疗反应方面表现优于先前建立的168种特征 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测肺腺癌患者的生存结果和免疫治疗反应 | 肺腺癌患者的生存结果和免疫治疗反应 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 五个独立数据集的肺腺癌患者 |
| 18696 | 2024-08-08 |
scSTAR reveals hidden heterogeneity with a real-virtual cell pair structure across conditions in single-cell RNA sequencing data
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad062
PMID:36813563
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研究论文 | 本文介绍了scSTAR方法，通过构建真实-虚拟细胞对结构，分析跨条件下的单细胞RNA测序数据中的细胞状态转换 | scSTAR方法通过最大化两个特征空间之间的协方差，使用偏最小二乘法和最小平方误差方法，克服了现有方法在细胞状态短期演化上的限制 | NA | 研究细胞状态转换在时间解析生物现象中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态转换 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 偏最小二乘法，最小平方误差方法 | RNA测序数据 | 11种癌症数据来自The Cancer Genome Atlas Program |
| 18697 | 2024-08-05 |
HSP70 regulates lipid metabolism of decidual macrophages to maintain normal pregnancy
2023-03, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2023.103829
PMID:36805906
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研究论文 | 本研究探讨了HSP70如何通过调节决策巨噬细胞的脂质代谢维持正常妊娠 | 揭示了HSP70在维持正常妊娠中的新机制，尤其是在反复流产患者的巨噬细胞功能调节中 | 仅限于使用单细胞测序数据，缺乏大规模临床样本验证 | 研究HSP70在维持正常妊娠和调节决策巨噬细胞代谢中的角色 | 研究对象为正常妊娠和反复流产患者的决策巨噬细胞 | 数字病理学 | 反复流产 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3579个巨噬细胞 |
| 18698 | 2024-08-08 |
CLAIRE: contrastive learning-based batch correction framework for better balance between batch mixing and preservation of cellular heterogeneity
2023-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad099
PMID:36821425
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的批量校正框架CLAIRE，旨在优化批量混合与细胞异质性保留之间的平衡 | 提出了两种互补策略：构建策略和细化策略，以改进正样本对的适当性，从而实现更优的混合-异质性权衡 | NA | 改进单细胞RNA测序数据集整合中的批量效应去除与生物异质性保留 | 单细胞RNA测序数据集的批量校正 | 机器学习 | NA | 对比学习 | 深度神经网络 | RNA测序数据 | 涉及六个真实数据集 |
| 18699 | 2024-08-08 |
scGCL: an imputation method for scRNA-seq data based on graph contrastive learning
2023-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad098
PMID:36825817
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研究论文 | 本文提出了一种基于图对比学习的scRNA-seq数据插补方法scGCL | scGCL结合图对比学习和零膨胀负二项分布（ZINB）来估计缺失值，并通过对比学习总结全局和局部语义信息，增强目标节点的表示 | NA | 旨在减少scRNA-seq数据的技术噪声并促进下游分析 | scRNA-seq数据的基因表达水平插补 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 图对比学习 | 自编码器 | scRNA-seq数据 | 14个scRNA-seq数据集 |
| 18700 | 2024-08-08 |
Microglial subpopulations with distinct transcriptome signatures vary across brain regions in the resting mouse brain
2023-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2022.12.010
PMID:36828616
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在静息状态下的脑中识别出具有独特转录组特征的微胶质亚群，并探讨了这些亚群在不同脑区的分布及其与微胶质激活的关系 | 首次揭示了静息状态下脑中微胶质亚群的异质性及其与微胶质激活的关系 | NA | 探究微胶质亚群在生理条件下的异质性及其与微胶质激活的关系 | 小鼠脑中的微胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |