单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 18641 - 18660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18641 | 2024-08-05 |
Generation of a single-cell B cell atlas of antibody repertoires and transcriptomes to identify signatures associated with antigen specificity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106055
PMID:36852274
|
研究论文 | 这篇文章描述了通过单细胞测序技术生成小鼠B细胞抗体库和转录组的单细胞B细胞图谱。 | 文章首次揭示了年轻小鼠中存在的克隆扩展和类转换的抗原特异性B细胞，并探索了与抗原特异性相关的基因表达特征。 | 整合多种抗体库特征未能区分抗原特异性与非特异性B细胞，表明对B细胞选择过程的理解仍不完整。 | 研究B细胞克隆选择、扩展与抗原特异性之间的关系。 | 小鼠B细胞及其抗体库和转录组。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据, 抗体序列数据 | 100,000个B细胞 |
| 18642 | 2024-08-08 |
Computational approach to evaluate scRNA-seq data quality and gene body coverage with SkewC
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.102038
PMID:36853658
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SkewC的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据质量评估工具，该工具基于基因体覆盖率及其偏斜度作为每个单细胞的质量指标 | SkewC能够区分典型细胞和偏斜细胞，且不依赖于生成数据的基础技术 | NA | 开发和评估单细胞RNA测序数据质量的新方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因体覆盖率数据 | NA |
| 18643 | 2024-08-08 |
Protocol for multi-modal single-cell RNA sequencing on M. tuberculosis-infected mouse lungs
2023-03-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102102
PMID:36853694
|
研究论文 | 本文开发了一种技术，用于从活体感染了结核分枝杆菌（Mtb）的肺巨噬细胞中进行多模态单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 该协议同时获取每个感染细胞的转录组、表面标记表达和细菌表型 | NA | 阐明不同免疫细胞如何参与控制或促进结核分枝杆菌感染的进展 | 感染了结核分枝杆菌的肺巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 多模态单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自小鼠、非人类灵长类动物和人类感染的组织 |
| 18644 | 2024-08-08 |
Sertoli cells are the source of stem cell factor for spermatogenesis
2023-03-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200706
PMID:36861441
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和一系列荧光报告小鼠，研究了支持细胞在精子发生中作为干细胞因子（Scf）的生理来源的作用 | 首次系统地研究了睾丸间质细胞中关键生长因子的表达模式，并证明了支持细胞是Scf的生理来源，对精子发生至关重要 | NA | 探究支持细胞在精子发生中作为干细胞因子（Scf）的生理来源的作用 | 支持细胞、干细胞因子（Scf）、精子发生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一系列荧光报告小鼠 |
| 18645 | 2024-08-05 |
Innate immune cell activation causes lung fibrosis in a humanized model of long COVID
2023-03-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2217199120
PMID:36848564
|
研究论文 | 这篇文章探讨了先天免疫细胞激活引起的肺纤维化，尤其是在长新冠模型中 | 揭示了长新冠肺部纤维化的特定免疫特征及其与疾病严重性相关的标志性基因 | 尚未提及具体的临床试验阶段或患者样本的多样性 | 研究COVID-19后引起的肺纤维化的免疫机制与治疗方法 | 使用长新冠小鼠模型来分析免疫响应与肺纤维化的关系 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞转录组学和单细胞质量细胞术 | JUN小鼠模型 | 生物样本 | NA |
| 18646 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals dynamics of human B cell differentiation and identifies novel B and antibody-secreting cell intermediates
2023-03-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83578
PMID:36861964
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了人类B细胞向抗体分泌细胞（ASCs）的分化过程，并发现了新的B细胞和ASCs中间体 | 首次在体外模型中鉴定出类似于生发中心的细胞群，并可能通过替代分化途径发展成记忆B细胞，从而重现体内人类生发中心反应 | NA | 深入理解控制ASCs分化的信号，以设计调节抗体形成的策略 | 人类幼稚B细胞向ASCs的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 18647 | 2024-08-08 |
Transcriptomic profile comparison reveals conservation of ionocytes across multiple organs
2023-03-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-30603-1
PMID:36864051
|
研究论文 | 本文通过比较先前发表的表达FOXI1的细胞的转录组图谱，评估了多种器官中离子细胞的相似性，并识别了离子细胞家族的核心转录组特征 | 首次在多种器官中发现并比较了表达FOXI1的细胞，揭示了离子细胞在多个哺乳动物器官中的保守性 | NA | 评估不同器官中离子细胞的相似性，并识别其核心转录组特征 | 人类和/或小鼠的肾脏、气道、附睾、胸腺、皮肤、内耳、唾液腺和前列腺中的FOXI1+细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类和小鼠的多个器官的数据集 |
| 18648 | 2024-08-05 |
Thyroid-stimulating hormone receptor signaling restores skeletal muscle stem cell regeneration in rats with muscular dystrophy
2023-03, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.add5275
PMID:36857434
|
研究论文 | 本研究揭示了促甲状腺激素受体信号传导在改善肌肉萎缩症大鼠肌肉干细胞再生中的作用 | 首次发现EOM中的促甲状腺激素受体与肌肉干细胞衰老和再生相关 | 研究仅基于动物模型，尚需临床试验验证 | 探讨促甲状腺激素受体在肌肉再生中的潜在治疗作用 | Duchenne肌肉萎缩症患者及大鼠模型 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组分析 | 大鼠模型 | 样本组织样本 | DMD患者和大鼠模型的样本 |
| 18649 | 2024-08-05 |
Gene expression variability across cells and species shapes the relationship between renal resident macrophages and infiltrated macrophages
2023-Mar-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05198-z
PMID:36858955
|
研究论文 | 本研究揭示了肾脏组织驻留巨噬细胞与浸润巨噬细胞之间关系的基因表达变异性 | 首次分析了不同物种肾脏巨噬细胞的转录差异和表达变异，揭示了其独特的基因调控网络 | 对信号通路的理解仍然不够全面，可能存在未考虑的因素 | 阐明肾脏巨噬细胞的演化过程及相关信号通路 | 对人、鼠和大鼠的肾脏组织驻留和浸润巨噬细胞进行单细胞转录组分析 | 数字病理 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种物种的肾脏巨噬细胞样本 |
| 18650 | 2024-08-08 |
Scientific Advancements That Empower Us to Understand CRS Pathophysiology
2023-Mar, American journal of rhinology & allergy
IF:2.5Q1
DOI:10.1177/19458924221148026
PMID:36848272
|
综述 | 本文综述了近年来科学技术的进步如何帮助我们更好地理解慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）的病理生理机制 | 介绍了新型科学技术的应用，如3D细胞培养和单细胞RNA测序，以深入解析CRSwNP中的细胞相互作用和基因表达 | 动物模型在复制鼻息肉形成方面相对有限 | 总结和强调最新的科学进展，以丰富我们对CRSwNP的理解 | CRSwNP的分子和细胞机制 | NA | 慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 18651 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis deciphers key transitional signatures associated with oncogenic evolution in human intramucosal oesophageal squamous cell carcinoma
2023-03, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1203
PMID:36855810
|
research paper | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了人黏膜内食管鳞状细胞癌中与致癌进化相关的关键过渡特征。 | 本研究首次在单细胞水平上系统描述了人黏膜内食管鳞状细胞癌的细胞图谱，并发现了与转移和血管生成相关的新型恶性细胞亚群。 | 研究需要新鲜且高质量的标本，这些标本通常来自内镜下切除的组织，这限制了研究的广泛应用。 | 旨在系统描述人黏膜内食管鳞状细胞癌的细胞图谱。 | 人黏膜内食管鳞状细胞癌的细胞图谱。 | digital pathology | 食管鳞状细胞癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 共分析了164,715个细胞。 |
| 18652 | 2024-08-08 |
Lineage plasticity enables low-ER luminal tumors to evolve and gain basal-like traits
2023-03-01, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01621-8
PMID:36859337
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研究论文 | 研究探讨了低雌激素受体（ER）表达的管腔型乳腺癌如何通过谱系可塑性获得基底样特征 | 发现低ER表达的管腔型乳腺癌中，SOX10作为潜在的驱动因子，促使肿瘤细胞获得新的管腔-基底表型，增加了肿瘤内部的管腔-基底异质性 | NA | 研究乳腺癌亚型的分子特征及其对治疗决策和预后预测的影响 | 低雌激素受体表达的管腔型乳腺癌及其向基底样特征的转变 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤模型进行谱系追踪研究 |
| 18653 | 2024-08-08 |
Kif5a Regulates Mitochondrial Transport in Developing Retinal Ganglion Cells In Vitro
2023-03-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.3.4
PMID:36862119
|
研究论文 | 本研究探讨了Kif5a蛋白在体外培养的视网膜神经节细胞发育过程中对线粒体运输的调控作用 | 首次揭示了Kif5a在视网膜神经节细胞发育过程中对线粒体前向和逆向运输的影响 | 研究仅限于体外实验，未来需进一步探索Kif5a在活体视网膜神经节细胞中的作用 | 理解线粒体在视网膜神经节细胞成熟过程中的运输动态及其调控机制 | 视网膜神经节细胞的线粒体运输 | NA | NA | 免疫淘选、MitoTracker染色、活细胞成像、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自不同发育阶段的大鼠的初级视网膜神经节细胞 |
| 18654 | 2024-08-08 |
Single-cell proteomics enabled by next-generation sequencing or mass spectrometry
2023-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01791-5
PMID:36864196
|
review | 本文讨论了通过质谱和测序方法在单细胞水平检测蛋白质的挑战，并回顾了这些技术的最新进展 | 提出了技术进步和互补方法的空间，以最大化两类技术的优势 | NA | 探讨单细胞蛋白质组学技术的发展和应用 | 单细胞蛋白质检测技术 | digital pathology | NA | NGS, mass spectrometry | NA | protein | large numbers of single cells |
| 18655 | 2024-08-05 |
Bulk and single-cell characterisation of the immune heterogeneity of atherosclerosis identifies novel targets for immunotherapy
2023-02-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01540-2
PMID:36855107
|
研究论文 | 本文通过整合多样本的测序结果，探讨了动脉粥样硬化中的免疫细胞异质性 | 通过增强的单细胞测序工作流程，识别出28种不同的免疫细胞亚群，并提供了新的免疫治疗靶点 | 研究可能受限于样本数量和种类的多样性 | 研究旨在揭示动脉粥样硬化中免疫细胞的异质性 | 研究对象为参与动脉粥样硬化过程的不同亚群免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个样本（确切样本数量未提供） |
| 18656 | 2024-08-05 |
Supplementation with α-ketoglutarate improved the efficacy of anti-PD1 melanoma treatment through epigenetic modulation of PD-L1
2023-02-28, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05692-5
PMID:36854755
|
研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸对抗PD1黑色素瘤治疗的影响 | 研究首次阐明了α-酮戊二酸通过调节PD-L1的表观遗传机制改善抗PD1治疗效果 | 研究中涉及的样本量可能不足以全面验证结果的普遍性 | 提升抗PD1治疗黑色素瘤的疗效 | 健康对照者、抗PD1敏感的黑色素瘤小鼠和患者 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 临床数据和前临床样本 | NA |
| 18657 | 2024-08-08 |
A cost-effective machine learning-based method for preeclampsia risk assessment and driver genes discovery
2023-Feb-28, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-00991-y
PMID:36849879
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的计算生物学方法，用于评估子痫前期的风险并发现驱动基因 | 首次设计了一种使用单细胞转录组数据来识别病理细胞亚群并预测子痫前期风险的计算生物学方法，并开发了一个在线网络服务器以提高可访问性 | NA | 开发一种有效的机器学习方法来评估子痫前期的风险并发现相关的驱动基因 | 健康妊娠和早期发作子痫前期的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 妊娠疾病 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | 集成学习框架 | 转录组数据 | 健康妊娠38周和早期发作子痫前期28-32周的样本 |
| 18658 | 2024-08-08 |
Automating iPSC generation to enable autologous photoreceptor cell replacement therapy
2023-02-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-03966-2
PMID:36855199
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研究论文 | 本研究描述了使用Cell X精密机器人细胞培养平台实现临床级患者特异性iPSC的并行生产 | 开发了一种机器人iPSC生成平台和标准操作程序，用于生产高质量的光感受器前体细胞，符合当前的良好制造规范 | NA | 实现自体iPSC介导的光感受器细胞替换疗法 | 患者特异性iPSC的并行生产 | 细胞生物学 | 遗传性视网膜变性 | 细胞培养平台 | NA | 细胞 | NA |
| 18659 | 2024-08-05 |
A variational algorithm to detect the clonal copy number substructure of tumors from scRNA-seq data
2023-02-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-36790-9
PMID:36841879
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研究论文 | 本文报告了一种快速的变分算法SCEVAN，用于从单细胞RNA测序数据中解卷肿瘤的克隆亚结构 | SCEVAN利用多通道分割算法，假设同一拷贝数克隆的所有细胞共享相同的断点，提供了一种新的分析肿瘤的方法 | NA | 研究单细胞RNA测序技术在肿瘤微环境中的应用 | 不同肿瘤类型和技术下的106个样本及93,322个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分算法 | 细胞数据 | 106个样本，93,322个细胞 |
| 18660 | 2024-08-05 |
Mapping Spatiotemporal Heterogeneity in Tumor Profiles by Integrating High-Throughput Imaging and Omics Analysis
2023-Feb-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.2c06659
PMID:36844580
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综述 | 本文回顾了高通量成像和组学分析在肿瘤异质性映射中的应用 | 探讨了最新的技术趋势和生物学见解，结合了分子诊断和空间转录组学的发展 | 对异质性出现原因的理解仍然不完整，限制了从治疗角度管理异质性的能力 | 研究肿瘤内部异质性的动态演变 | 聚焦于肿瘤细胞类型和基质成分的异质性 | 数字病理学 | NA | 高通量分子成像、单细胞组学、空间转录组学 | NA | NA | NA |