单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27574 篇文献，本页显示第 18621 - 18640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18621 | 2024-08-05 |
Transcriptional and open chromatin analysis of bovine skeletal muscle development by single-cell sequencing
2023-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13430
PMID:36855961
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序分析了牛骨骼肌发育的转录和开放染色质特征 | 采用scRNA-seq和scATAC-seq揭示了牛骨骼肌不同细胞类型和转录调控的动态特征 | 未提及具体限制 | 理解牛骨骼肌发育过程中的细胞异质性和转录及表观遗传调控 | 发育阶段的牛骨骼肌细胞类型及其分子特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 在三个发育阶段识别的多种细胞类型，包括脂肪细胞、内皮细胞等 |
| 18622 | 2024-08-05 |
Cell-type profiling of the sympathetic nervous system using spatial transcriptomics and spatial mapping of mRNA
2023-08, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.577
PMID:36840366
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学和mRNA的空间映射，分析了交感神经系统的细胞类型轮廓 | 创新性地结合了Slide-seq空间转录组学和单细胞RNA-seq，揭示了周围交感神经节内的神经祖细胞的分子特征 | 技术限制仍然妨碍了神经祖细胞群体的分子鉴定 | 探索交感神经系统的分子组成和细胞类型特征 | 新鲜冷冻小鸡躯干组织中神经祖细胞的分子鉴定 | 数字病理学 | NA | Slide-seq空间转录组学、单细胞RNA-seq、HiPlex RNAscope荧光原位杂交 | NA | 组织样本 | 新鲜冷冻小鸡躯干组织样本 |
| 18623 | 2024-08-05 |
RNA helicase DHX15 exemplifies a unique dependency in acute leukemia
2023-08-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282066
PMID:36861414
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研究论文 | 该研究探讨了RNA解旋酶DHX15在急性淋巴细胞白血病中的独特依赖性 | 首次系统性评估了DHX15作为T-ALL依赖因子的独特功能及其在肿瘤细胞存活和白血病发生中的重要性 | 目前仍不清楚其它潜在的RNA结合蛋白在T-ALL转化中的角色 | 研究DHX15在T细胞急性淋巴母细胞白血病中的作用及其机制 | T细胞急性淋巴母细胞白血病及相关小鼠模型 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 功能分析，转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 多个小鼠T-ALL模型 |
| 18624 | 2024-08-08 |
SCMcluster: a high-precision cell clustering algorithm integrating marker gene set with single-cell RNA sequencing data
2023-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad004
PMID:36848584
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研究论文 | 本文提出了一种名为SCMcluster的高精度单细胞聚类算法，该算法结合标记基因集与单细胞RNA测序数据进行特征提取和构建集成聚类模型 | SCMcluster算法通过整合两个细胞标记数据库与scRNA-seq数据进行特征提取，并构建基于共识矩阵的集成聚类模型，提高了聚类精度 | NA | 开发一种高精度的单细胞聚类算法，以解决单细胞RNA测序数据中的噪声和稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类模型 | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据集，分别来自人和小鼠组织 |
| 18625 | 2024-08-05 |
A Circular RNA Expressed from the FAT3 Locus Regulates Neural Development
2023-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03253-7
PMID:36840844
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研究论文 | 这篇文章探讨了来自FAT3位点的环状RNA在神经发育中的调节作用 | 首次展示circFAT3在神经干细胞分化过程中对细胞类型形成和神经元发育的关键调控 | 关于circFAT3在脑发育中具体机制的理解仍然有限 | 研究circFAT3在神经发育中的功能 | 人类胚胎干细胞及其分化为神经前体细胞的过程 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30和90天分化的脑类器官 |
| 18626 | 2024-08-08 |
Studying the mechanism underlying lipid metabolism in osteosarcoma based on transcriptomic RNA sequencing and single-cell data
2023-06, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3491
PMID:36847293
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研究论文 | 本研究基于转录组RNA测序和单细胞数据，探讨了脂质代谢在骨肉瘤中的机制 | 提供了一种基于单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据的骨肉瘤新分型方法，并从脂质代谢角度探讨了其潜在机制 | NA | 旨在基于脂质代谢和单细胞RNA测序数据，为骨肉瘤提供新的分型方法并探讨其发病和进展的潜在机制 | 骨肉瘤的脂质代谢机制 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 使用了单细胞RNA测序数据和三个微阵列表达谱数据 |
| 18627 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of the immune microenvironment reveals macrophage reprogramming and the potential dual macrophage-targeted strategy in multiple myeloma
2023-06, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18708
PMID:36852636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了多发性骨髓瘤（MM）肿瘤微环境（TME）在疾病进展中的变化，并探索了针对肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的双重治疗策略。 | 研究首次展示了MM-TME的单细胞图谱，并发现了TAMs的重新编程现象，提出了结合抗CD47抗体和MIF抑制剂的双重巨噬细胞靶向治疗策略。 | NA | 旨在展示多发性骨髓瘤肿瘤微环境在疾病进展中的图谱，并探索针对肿瘤微环境的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境及肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 不同疾病阶段的样本 |
| 18628 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity, microenvironment, and drug-resistance mechanisms of recurrent glioblastoma
2023-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15773
PMID:36853018
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了复发性胶质母细胞瘤的肿瘤异质性、微环境及耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下绘制了复发性和耐药性胶质母细胞瘤的转录组图谱，并探讨了其耐药机制 | 研究样本仅来自六份肿瘤组织，样本量较小 | 旨在揭示复发性胶质母细胞瘤的肿瘤异质性、微环境及耐药机制 | 复发性和耐药性胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六份肿瘤组织，分别来自三位原发性胶质母细胞瘤患者和三位复发性胶质母细胞瘤患者 |
| 18629 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of oral masticatory and lining mucosa-derived mesenchymal stromal cells
2023-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13799
PMID:36864739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的人体间充质基质细胞的异质性 | 本研究首次揭示了咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的间充质基质细胞在转录水平上的差异，并识别出11种不同的细胞亚群 | 研究样本仅来自三位个体，可能影响结果的普遍性 | 揭示体外培养的人体间充质基质细胞的异质性 | 咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自三位个体的硬腭和牙槽黏膜的细胞 |
| 18630 | 2024-08-08 |
Reversal of Lactate and PD-1-mediated Macrophage Immunosuppression Controls Growth of PTEN/p53-deficient Prostate Cancer
2023-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3350
PMID:36862086
|
研究论文 | 本文研究了PTEN/p53缺陷型前列腺癌中乳酸和PD-1介导的巨噬细胞免疫抑制的逆转机制，并探讨了联合治疗策略的效果。 | 本文首次揭示了乳酸减少通过抑制巨噬细胞中的组蛋白乳酸化来激活其抗癌吞噬作用，并提出了联合ADT和PD-1抑制剂的治疗策略。 | 研究主要基于基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析，需要在临床试验中进一步验证。 | 阐明ADT/PI3K-AKT轴阻断的耐药机制，并开发针对PTEN缺陷型mCRPC的有效联合治疗策略。 | PTEN/p53缺陷型前列腺癌及其治疗策略。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 使用10X Genomics平台对人类mCRPC样本进行单细胞RNA测序 |
| 18631 | 2024-08-08 |
T-cell dysregulation and inflammatory process in Gcn2 (Eif2ak4-/-)-deficient rats in basal and stress conditions
2023-05-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00460.2021
PMID:36852942
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研究论文 | 研究Gcn2缺陷大鼠在基础和应激条件下的T细胞失调和炎症过程 | 首次探讨了Gcn2缺陷大鼠在氨基酸剥夺条件下的肺部分子和细胞反应，以及与hPVOD病理生理学相关的表型变化 | NA | 探讨Gcn2缺陷大鼠在基础和应激条件下的免疫稳态和hPVOD发展的机制 | Gcn2缺陷大鼠的肺部 | NA | 肺高压 | RNA测序，单细胞RNA测序，流式细胞术，组织成像，Western blot | NA | RNA | 三组Gcn2缺陷大鼠的肺部样本 |
| 18632 | 2024-08-08 |
Myeloid-specific deletion of activating transcription factor 6 alpha increases CD11b+ macrophage subpopulations and aggravates lung fibrosis
2023-05, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12637
PMID:36862017
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research paper | 研究激活转录因子6α（ATF6α）在特发性肺纤维化（IPF）中对肺泡巨噬细胞亚群组成和功能的影响 | 首次探讨了ATF6α在肺损伤和纤维化过程中对肺泡巨噬细胞亚群的影响，并揭示了其对纤维化进程的负面作用 | 研究仅在特定的小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨ATF6α在肺纤维化中的作用及其对肺泡巨噬细胞亚群的影响 | 特发性肺纤维化患者和ATF6α缺陷小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 包括IPF患者的肺组织和循环单核细胞，以及ATF6α缺陷小鼠的肺泡巨噬细胞 |
| 18633 | 2024-08-08 |
A combinatorial panel for flow cytometry-based isolation of enteric nervous system cells from human intestine
2023-04-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202255789
PMID:36852936
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研究论文 | 本文介绍了一种用于从人肠道中通过流式细胞术分离肠神经系统细胞的组合标记面板 | 该研究提出了一种新的标记组合CD56/CD90/CD24，用于更特异性和高分辨率地标记肠神经系统细胞 | 研究中发现的神经元和胶质细胞标记物的共表达现象，主要由神经元片段驱动，这可能影响细胞类型的纯度 | 开发一种高效的方法来分离和富集人肠神经系统细胞，以便进行单细胞RNA测序 | 人肠神经系统中的神经元和胶质细胞 | NA | NA | 流式细胞术（FACS） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 18634 | 2024-08-05 |
Microanatomy of the metabolic associated fatty liver disease (MAFLD) by single-cell transcriptomics
2023-04, Journal of drug targeting
IF:4.3Q1
DOI:10.1080/1061186X.2023.2185626
PMID:36847649
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研究论文 | 该文章通过单细胞转录组学研究代谢相关脂肪肝病的微观结构 | 首次通过单细胞分析确定了与NASH相关的差异基因，并识别了潜在的生物标志物 | 未深入探讨生物标志物的具体机制和临床应用 | 旨在识别代谢相关脂肪肝病中的关键基因及其潜在的临床应用 | 主要研究对象是来自正常和脂肪变性小鼠肝脏的单细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞数据 | 30,038个单细胞 |
| 18635 | 2024-08-05 |
Deoxynivalenol induces intestinal injury: insights from oxidative stress and intestinal stem cells
2023-Apr, Environmental science and pollution research international
DOI:10.1007/s11356-023-26084-4
PMID:36856999
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review | 本文探讨了脱氧尼维伦醇对肠道的影响，特别是其在氧化压力和肠道干细胞扩展中的作用 | 提出了脱氧尼维伦醇在诱导氧化应激和影响肠道干细胞扩展中的新见解 | 缺乏具体的实验数据支持所述的机制和方法 | 研究脱氧尼维伦醇对肠道的损伤机制及其对肠道干细胞的影响 | 关注脱氧尼维伦醇对肠道干细胞和氧化压力的影响 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 文献综述 | NA |
| 18636 | 2024-08-08 |
Single-cell chemokine receptor profiles delineate the immune contexture of tertiary lymphoid structures in head and neck squamous cell carcinoma
2023-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216105
PMID:36841416
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了头颈鳞状细胞癌中47种白细胞亚群，并通过多重免疫组织化学技术描绘了与三级淋巴结构相关的趋化因子受体细胞图谱 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组织化学技术详细描绘了头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构的免疫细胞组成和趋化因子受体分布 | NA | 旨在重建头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构的免疫架构，以促进抗肿瘤免疫反应 | 头颈鳞状细胞癌中的三级淋巴结构及其免疫细胞组成 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 47种白细胞亚群 |
| 18637 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals changes in BCG vaccine-injected mice modeling tuberculous meningitis brain infection
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112177
PMID:36862557
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研究论文 | 该研究通过单细胞分析揭示了BCG疫苗注射的小鼠在结核性脑膜炎感染中的变化 | 首次展示了小鼠中M. bovis感染的单细胞转录组，增强了对结核性脑膜炎脑部感染及其神经并发症的理解 | 研究仅在小鼠模型中进行，可能无法完全转化到人类的情况中 | 探索结核性脑膜炎感染中脑部的单细胞转录组变化 | 使用小鼠模型研究BCG疫苗注射后对脑部感染的影响 | 数字病理学 | 结核性脑膜炎 | 10X Genomics单细胞测序 | NA | 细胞转录组数据 | 涉及多种细胞类型，共计15种 |
| 18638 | 2024-08-08 |
Tcf21 marks visceral adipose mesenchymal progenitors and functions as a rate-limiting factor during visceral adipose tissue development
2023-03-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112166
PMID:36857185
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研究论文 | 本文报道了在腹腔脂肪组织（VAT）中特异性存在的Tcf21谱系细胞（Tcf21 LCs），这些细胞在VAT发育和扩张中起动态作用，并探讨了Tcf21在脂肪生成中的调控机制。 | 首次发现Tcf21谱系细胞在腹腔脂肪组织中的特异性存在，并通过多组学分析构建了调控Tcf21 LCs活性的基因调控网络。 | NA | 研究Tcf21在腹腔脂肪组织发育中的作用及其对脂肪生成的调控机制。 | Tcf21谱系细胞及其在腹腔脂肪组织中的功能。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18639 | 2024-08-08 |
Multi-organ single-cell analysis reveals an on/off switch system with potential for personalized treatment of immunological diseases
2023-03-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.100956
PMID:36858042
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研究论文 | 本文通过多器官单细胞RNA测序分析了胶原诱导关节炎小鼠模型，揭示了一个复杂的分子交互网络，该网络在不同器官中表现出高度异质性的表达变化，并提出了一种“开/关”开关系统，该系统可能用于个性化治疗免疫介导的炎症性疾病。 | 首次通过多器官单细胞RNA测序揭示了免疫介导炎症性疾病中的“开/关”开关系统，并展示了其在个性化治疗中的潜在应用。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证该系统的有效性和普遍性。 | 揭示免疫介导炎症性疾病中的分子机制，并探索个性化治疗的新策略。 | 免疫介导的炎症性疾病（IMIDs）及其分子机制和治疗策略。 | 基因组学 | 免疫介导的炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过600份系统性红斑狼疮患者的血清样本 |
| 18640 | 2024-08-05 |
STEEL enables high-resolution delineation of spatiotemporal transcriptomic data
2023-03-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad068
PMID:36857617
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研究论文 | 本文提出了一种无监督的基于流形学习的算法STEEL，用于从空间转录组数据中识别领域 | STEEL在空间转录组数据中实现了高分辨率的细微结构表征，并能够将多个单独分析的组织切片整合为一个较大的数据集 | 在高珠密度但低转录检测效率的Slide-seq数据集中，STEEL的表现依然存在局限性 | 研究空间转录组技术中的领域识别和基因表达图谱重建 | 马鼠早期胚胎的空间转录组数据，包括外胚层、中胚层和内胚层的组织发展 | 数字病理 | NA | 空间转录组技术 | 无监督学习模型 | 转录组数据 | 空间转录组数据集来源于10X Visium平台和Slide-seq数据集 |