单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 18601 - 18620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18601 | 2024-08-05 |
Prognostic values of tissue-resident CD8+T cells in human hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Apr-06, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03009-6
PMID:37024870
|
研究论文 | 该研究分析了组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 | 首次系统描述了肝细胞癌和肝内胆管癌中CD8+T细胞的表达及其预后相关性 | 本研究的样本量和单细胞RNA测序分析可能存在选择偏倚 | 探讨组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 | 人类肝细胞癌和肝内胆管癌中的组织驻留CD8+T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重免疫组化（mIHC）和成像分析 | NA | 组织样本 | 使用了肝细胞癌和肝内胆管癌的组织微阵列 |
| 18602 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microevolution of the Stickleback Immune System
2023-04-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evad053
PMID:37039516
|
研究论文 | 本研究揭示了三刺鱼免疫系统微进化的特征 | 首次创建了三刺鱼的综合免疫细胞图谱，并展示了免疫细胞类型之间显著的变异 | 研究的样本量相对较小，仅包含来自三个种群的九条鱼 | 探讨三刺鱼种群间免疫系统的微进化 | 三刺鱼（Gasterosteus aculeatus）和寄生虫感染相关免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 九条鱼，来自三个不同的种群 |
| 18603 | 2024-08-05 |
Cynomolgus monkey embryo model captures gastrulation and early pregnancy
2023-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.009
PMID:37028403
|
研究论文 | 构建了与人类胚胎形态和转录组相似的猕猴胚胎模型，观察其发育潜力 | 首次展示了猕猴胚胎在体外发生胃肠形成与体内早期妊娠的能力 | 未对比不同胚胎发展阶段的各种模型 | 探讨猕猴胚胎的发育潜力并在伦理上对人类胚胎研究进行替代 | 猕猴胚胎模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞、胚胎组织 | 使用猕猴胚胎模型进行的多次实验，具体样本量未说明 |
| 18604 | 2024-08-08 |
FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5'-end single-cell RNA sequencing
2023-04-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02893-1
PMID:37024957
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控技术的组合索引方法FIPRESCI，用于大规模5'端单细胞RNA测序 | FIPRESCI方法通过大规模样本复用，将液滴微流控系统的通量提高了十倍以上 | NA | 开发一种超高通量的5'端单细胞RNA测序方法 | 小鼠胚胎和12名癌症患者的外周血T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | 约100,000个单细胞转录组 |
| 18605 | 2024-08-08 |
Matters arising: Insufficient evidence that pancreatic β cells are derived from adult ductal Neurog3-expressing progenitors
2023-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.003
PMID:37028408
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研究论文 | 本文对Gribben等人关于成年胰腺导管细胞作为内分泌前体的结论提出质疑，并通过实验数据支持成年胰腺β细胞并非源自导管细胞的观点 | 提出对现有胰腺β细胞起源理论的重新解释，挑战了传统的观点 | 依赖于特定的Cre线标记方法，可能存在标记错误和分类错误的问题 | 探讨胰腺β细胞的起源，对糖尿病再生疗法具有重要意义 | 胰腺β细胞及其可能的前体细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 未具体说明样本数量 |
| 18606 | 2024-08-05 |
Localized nuclear reaction breaks boron drug capsules loaded with immune adjuvants for cancer immunotherapy
2023-04-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37253-x
PMID:37019890
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研究论文 | 本文研究了一种通过局部核反应激活的硼胶囊与免疫佐剂联用的癌症免疫疗法 | 本研究工程化了一种中子激活的硼胶囊，能够增强BNCT和免疫佐剂的协同效果，以引发强效的抗肿瘤免疫反应 | 目前缺乏对其抗肿瘤效果的进一步临床研究 | 探讨硼中子捕获疗法的抗肿瘤免疫响应 | 采用女性小鼠肿瘤模型进行研究 | 数字病理学 | 癌症 | BNCT | NA | NA | 使用女性小鼠肿瘤模型进行观察 |
| 18607 | 2024-08-05 |
clusterMaker2: a major update to clusterMaker, a multi-algorithm clustering app for Cytoscape
2023-Apr-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05225-z
PMID:37020209
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研究论文 | clusterMaker2是clusterMaker的重大更新，提供多种算法用于生物数据集的聚类分析 | 引入了新的算法类别，如节点排名和降维，增强了与Cytoscape的集成 | NA | 旨在提供易于使用的工具以分析和可视化现代生物数据集 | 对酵母热休克表达实验数据集进行重新分析 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 数据集 | NA |
| 18608 | 2024-08-08 |
Schwann Cells Are Key Regulators of Corneal Epithelial Renewal
2023-04-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.4.7
PMID:37036418
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研究论文 | 本研究探讨了施万细胞在维持和再生角膜上皮细胞更新中的关键作用 | 首次明确了角膜轴突包裹的施万细胞在角膜上皮细胞稳态和再生更新中的重要作用 | NA | 研究施万细胞在角膜上皮细胞更新中的作用 | 施万细胞和角膜上皮细胞 | NA | NA | 原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了转基因小鼠和去神经化的大鼠角膜样本进行研究 |
| 18609 | 2024-08-08 |
Sox11 is enriched in myogenic progenitors but dispensable for development and regeneration of skeletal muscle
2023-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.30.534956
PMID:37034612
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析，探讨了转录因子Sox11在肌肉干细胞分化和功能中的作用 | 发现Sox11在肌肉干细胞分化过程中表达增加，但在静止和衰老的肌肉干细胞中表达减少 | Sox11在肌肉发生中的具体功能尚未明确 | 研究Sox11在肌肉干细胞分化和肌肉再生中的作用 | 肌肉干细胞（MuSCs）及其在骨骼肌发育和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 年轻和老年小鼠的肌肉再生样本 |
| 18610 | 2024-08-08 |
Endothelial cells are a key target of IFN-g during response to combined PD-1/CTLA-4 ICB treatment in a mouse model of bladder cancer
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.28.534561
PMID:37034778
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了在小鼠膀胱癌模型中，联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗对不同细胞类型的响应机制 | 首次揭示了内皮细胞在IFN-γ信号传导中作为ICB治疗响应的关键介质 | NA | 探索联合PD-1/CTLA-4免疫检查点阻断治疗在个体细胞类型中的响应机制 | 小鼠膀胱癌模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 包含三种条件：未治疗的肿瘤、治疗的肿瘤和CD4+ T细胞耗竭后治疗的肿瘤 |
| 18611 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome dataset of human and mouse in vitro adipogenesis models
2023-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.27.534456
PMID:37034809
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研究论文 | 本文介绍了人类和小鼠体外脂肪形成模型的单细胞转录组数据集，通过单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 首次提供了3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成过程中的单细胞转录组数据，有助于理解细胞间基因表达的变异性。 | NA | 研究人类和小鼠体外脂肪形成过程中的分子调控和细胞间基因表达的变异性。 | 3T3-L1和SGBS细胞在脂肪形成前后的转录变化。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 混合的3T3-L1和SGBS细胞 |
| 18612 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing-Based Validation of T Cell-Associated Diagnostic Model Genes and Drug Response in Crohn's Disease
2023-Mar-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076054
PMID:37047025
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研究论文 | 该研究旨在通过单细胞测序验证与T细胞相关的克罗恩病诊断模型基因及其药物反应 | 首次将单细胞表达谱数据与T细胞标记基因的诊断与药物反应相结合 | 样本数量较少，可能影响研究结果的广泛适用性 | 进一步探索克罗恩病的诊断及T细胞标记基因表达的药物预测 | 22例克罗恩病或正常样本的单细胞表达谱数据 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序 | TNF中心的5基因诊断模型 | 单细胞表达谱数据 | 22个样本 |
| 18613 | 2024-08-05 |
Single-cell mapping of N6-methyladenosine in esophageal squamous cell carcinoma and exploration of the risk model for immune infiltration
2023, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2023.1155009
PMID:37025404
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研究论文 | 本研究探讨了N6-甲基腺苷（m6A）在食道鳞状细胞癌中的分布及其对免疫浸润的风险模型的构建 | 首次在食道鳞状细胞癌中进行单细胞m6A映射，构建了与免疫浸润相关的风险模型 | 缺乏对m6A具体机制的深入探讨 | 研究m6A在食道癌发展中的作用及其机制 | 174名食道鳞状癌患者的RNA-seq和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 食道癌 | RNA-seq | NA | 基因序列数据 | 174个食道鳞状癌患者的样本以及4个单细胞样本 |
| 18614 | 2024-08-05 |
Disease modeling of ADAMTS9-related nephropathy using kidney organoids reveals its roles in tubular cells and podocytes
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1089159
PMID:37035301
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研究论文 | 本研究揭示了ADAMTS9在肾小管细胞和足细胞中的功能角色。 | 识别到新的复合杂合ADAMTS9变异，探讨其在肾脏疾病中的作用。 | 本研究主要集中在ADAMTS9的功能，未探讨其他相关基因的影响。 | 研究ADAMTS9缺失与肾小管病及肾小球病之间的关系。 | 研究两名患有肾小管病的NPHP-RC兄妹的ADAMTS9突变。 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 肾脏类器官 | 基因表达 | 2名兄妹 |
| 18615 | 2024-08-05 |
Identification of an immune subtype-related prognostic signature of clear cell renal cell carcinoma based on single-cell sequencing analysis
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1067987
PMID:37035172
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研究论文 | 本研究构建了一个与免疫亚型相关的预后模型，以预测透明细胞肾细胞癌患者的预后 | 首次基于单细胞测序分析定义了ccRCC的免疫亚型相关基因，并构建了一个包含五个基因的预后模型 | 该研究可能缺乏多中心大样本验证以确保模型的普适性 | 旨在预测透明细胞肾细胞癌患者的预后并为治疗策略提供指导 | 聚焦于透明细胞肾细胞癌患者及其免疫亚型特征 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | Cox回归和Lasso回归模型 | 基因表达数据 | 包含TCGA和GEO数据库中的ccRCC患者数据 |
| 18616 | 2024-08-05 |
Mitochondria-associated gene expression perturbation predicts clinical outcomes and shows potential for targeted therapy in neuroblastoma
2023, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2023.1094926
PMID:37025299
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研究论文 | 本文探讨了与线粒体相关的基因表达扰动如何预测神经母细胞瘤的临床结果，并展示其作为靶向治疗的潜力 | 提出了线粒体相关蛋白（MAPs）在神经母细胞瘤中的关键作用，并识别出一组独立于MYCN扩增状态的MAP基因标志 | 对线粒体相关蛋白在神经母细胞瘤中作用的全面研究仍然不足，需进一步探索 | 研究线粒体相关基因在神经母细胞瘤中的表达及其与临床结局的关系 | 神经母细胞瘤患者的线粒体相关基因 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 分析了1,712个MAP基因及相关的细胞系和人类初级T细胞 |
| 18617 | 2024-08-05 |
Benchmarking of Nanopore R10.4 and R9.4.1 flow cells in single-cell whole-genome amplification and whole-genome shotgun sequencing
2023, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2023.03.038
PMID:37025654
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研究论文 | 该文章评估了R10.4流动单元在癌细胞分析中的优势和缺陷。 | 这是首次通过使用ONT R10.4和R9.4.1 MinION流动单元对单细胞全基因组测序进行基准测试。 | 文章未提及具体的样本多样性或其他类型的癌细胞分析局限性。 | 评估新一代测序技术在癌症基因组学和表观基因组学研究中的应用。 | 该研究主要针对人类非小细胞肺癌细胞系HCC78进行分析。 | 基因组学 | 肺癌 | NGS | NA | 基因组数据 | 单细胞样本 |
| 18618 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA analysis to identify five cytokines signaling in immune-related genes for melanoma survival prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1148130
PMID:37026000
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析五种细胞因子信号在黑色素瘤生存预后中的作用 | 首次构建并验证了基于单细胞RNA测序数据的机器学习模型，具有成为新治疗靶点和预后生物标志物面板的潜力 | NA | 评估细胞因子信号在与免疫相关基因中的预测价值，以便诊断和治疗黑色素瘤患者 | 黑色素瘤患者及其免疫相关基因的细胞因子信号 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归 | RNA-seq数据 | NA |
| 18619 | 2024-08-08 |
A novel 7-chemokine-genes predictive signature for prognosis and therapeutic response in renal clear cell carcinoma
2023, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2023.1120562
PMID:37021054
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研究论文 | 本研究旨在建立一个针对肾透明细胞癌（ccRCC）的7种趋化因子基因预测签名，以评估患者的预后和治疗反应 | 本研究首次构建了基于7种趋化因子基因的预测签名，并验证了其在ccRCC中的预后价值和治疗反应预测能力 | 需要进一步的临床试验来验证该预测签名在实际治疗中的应用效果 | 建立一个趋化因子基因签名，用于评估肾透明细胞癌的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | LASSO算法 | mRNA测序数据 | 526名肾透明细胞癌患者（263名训练组样本和263名验证组样本） |
| 18620 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and stem cells of vascular endothelial cells in blood vessel formation and homeostasis: Insights from single-cell RNA sequencing
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1146399
PMID:37025170
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞与血管生成及稳态关系研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术发现了新的动脉、静脉和毛细血管内皮细胞的分子特征，以及先前未被识别的特殊内皮细胞亚型 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在血管内皮细胞异质性和内皮干细胞研究中的应用前景 | 血管内皮细胞的异质性和内皮干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及多种小鼠组织和人体器官 |