单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 18581 - 18600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18581 | 2024-08-08 |
A Personalized Low-Rank Subspace Clustering Method Based on Locality and Similarity Constraints for scRNA-seq Data Analysis
2023-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2023.3247723
PMID:37027680
|
研究论文 | 本文提出了一种基于局部和相似性约束的个性化低秩子空间聚类方法PLRLS，用于单细胞RNA测序数据分析 | 引入局部结构约束以捕捉数据的局部结构信息，并利用分数函数提取细胞间的相似性信息，增强了模型的聚类性能 | NA | 开发针对scRNA-seq数据特性的聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 低秩表示（LRR） | 表达谱 | 实际scRNA-seq数据集 |
| 18582 | 2024-08-08 |
Deciphering the immune heterogeneity dominated by natural killer cells with prognostic and therapeutic implications in hepatocellular carcinoma
2023-05, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106872
PMID:37030269
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了肝细胞癌中自然杀伤细胞的标记基因，并基于这些基因建立了预测预后和免疫治疗效果的签名 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别了80个与预后相关的自然杀伤细胞标记基因，并建立了基于五个基因的预后签名-NKscore，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | NA | 研究肝细胞癌中自然杀伤细胞的异质性及其对预后和治疗的影响 | 肝细胞癌患者的自然杀伤细胞及其在免疫微环境中的作用 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO-COX和逐步回归分析 | 基因数据 | 使用TCGA-LIHC数据集进行分析 |
| 18583 | 2024-08-08 |
Myocardial Biomechanics and the Consequent Differentially Expressed Genes of the Left Atrial Ligation Chick Embryonic Model of Hypoplastic Left Heart Syndrome
2023-May, Annals of biomedical engineering
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s10439-023-03187-0
PMID:37032398
|
研究论文 | 本研究通过有限元建模和单细胞RNA测序分析了左心房结扎（LAL）鸡胚心脏模型中的心肌生物力学和基因表达变化 | 首次详细描述了LAL模型中心肌生物力学的变化及其对基因表达的影响 | NA | 旨在阐明左心发育不良综合征（HLHS）模型中的心肌生物力学和基因表达变化 | 鸡胚心脏模型中的心肌生物力学和基因表达 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 有限元建模，单细胞RNA测序 | 有限元模型 | 图像，基因表达数据 | 鸡胚心脏样本，包括LAL和对照组 |
| 18584 | 2024-08-08 |
Effects of Univariate Stiffness and Degradation of DNA Hydrogels on the Transcriptomics of Neural Progenitor Cells
2023-04-26, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.2c13373
PMID:37029734
|
研究论文 | 研究使用DNA及其对映体制备的单一刚度调节水凝胶对神经前体细胞命运决策的影响 | 采用DNA及其对映体制备具有单一刚度调节的水凝胶，实现了对细胞微环境机械特性的精确操控 | 研究主要关注水凝胶的刚度和降解对细胞行为的影响，未涉及其他可能的机械信号调节因素 | 探究细胞外基质（ECM）模拟水凝胶的机械信号如何调节神经前体细胞的行为 | 神经前体细胞（NPCs）及其在三维环境中的命运决策 | 生物医学工程 | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | RNA | 一系列具有不同刚度的DNA水凝胶 |
| 18585 | 2024-08-08 |
Nanoplastics Shape Adaptive Anticancer Immunity in the Colon in Mice
2023-04-26, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c00644
PMID:37043775
|
研究论文 | 本研究探讨了纳米塑料（NPs）对小鼠肠道微环境和结直肠癌发展的影响 | 首次揭示了口服聚乙烯纳米塑料通过破坏溶酶体引发IL-1β产生巨噬细胞的活化，进而影响结肠Treg和Th17细胞的分化，促进肿瘤生长 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究纳米塑料摄入与结直肠癌发生之间的潜在联系 | 纳米塑料对肠道微环境和结直肠癌的影响 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 18586 | 2024-08-08 |
Nodal coordinates the anterior-posterior patterning of germ layers and induces head formation in zebrafish explants
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112351
PMID:37018074
|
研究论文 | 本文展示了通过应用区域性Nodal梯度于斑马鱼动物极外植体，可以生成模拟原肠运动关键细胞运动的结构，并评估了该结构的细胞命运动态和模式化过程。 | 首次展示了通过区域性Nodal梯度诱导斑马鱼外植体形成前-后模式化的胚层和头部结构，并鉴定了具有轴诱导能力的Nodal靶基因。 | NA | 研究如何完全模拟原肠运动细胞运动和协调胚层模式化以诱导头部形成的方法。 | 斑马鱼动物极外植体及其细胞命运和模式化过程。 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析和原位杂交技术 | NA | 基因表达数据 | 105个Nodal靶基因中的14个具有轴诱导能力，其中5个在斑马鱼胚胎腹侧过表达时能诱导完整或部分头部结构。 |
| 18587 | 2024-08-08 |
Elements of divergence in germline determination in closely related species
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106402
PMID:37020963
|
研究论文 | 本研究通过阶段匹配的单细胞RNA测序数据集，比较了两种近缘海胆物种的原始生殖细胞（PGCs）中的基因表达差异 | 揭示了两种海胆物种在生殖细胞基因表达上的多种差异，并发现了一种3'UTR元件在限制关键基因产物转录后调控中的作用 | NA | 探讨近缘物种间生殖细胞决定过程中的差异 | 两种海胆物种的原始生殖细胞（PGCs） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 两种海胆物种的原始生殖细胞（PGCs） |
| 18588 | 2024-08-05 |
Structural and functional properties of mSWI/SNF chromatin remodeling complexes revealed through single-cell perturbation screens
2023-04-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.03.013
PMID:37028419
|
研究论文 | 本文揭示了mSWI/SNF染色质重塑复合体的结构和功能特性 | 通过单细胞干扰筛选，首次明确了mSWI/SNF亚单位在基因表达中的独特贡献 | 对于某些亚单位的特定功能和与疾病的关联尚未完全定义 | 研究mSWI/SNF复合体的组成亚单位对基因调控和病理的影响 | 针对mSWI/SNF亚单位的个体及组合进行CRISPR-Cas9敲除筛选 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肿瘤样本的表达谱 |
| 18589 | 2024-08-08 |
Identification of a broadly fibrogenic macrophage subset induced by type 3 inflammation
2023-04-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add8945
PMID:37027478
|
研究论文 | 本研究利用人类肝脏和肺部的单细胞RNA测序数据，识别出一种在III型炎症诱导下产生的新型广泛纤维化巨噬细胞亚群 | 首次识别出一种高度特异性的巨噬细胞群体，并赋予其在跨物种和组织中的促纤维化作用 | NA | 旨在识别人类纤维化组织中的关键巨噬细胞群体，以开发新的纤维化治疗方法 | 人类和鼠类的肝脏及肺部纤维化中的巨噬细胞 | NA | 纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的肝脏及肺部样本 |
| 18590 | 2024-08-08 |
CD34+ cell-derived fibroblast-macrophage cross-talk drives limb ischemia recovery through the OSM-ANGPTL signaling axis
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add2632
PMID:37043578
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术，研究了CD34+细胞在缺血肢体恢复中的作用及其与巨噬细胞的相互作用。 | 首次提供了人类和小鼠正常及缺血肢体组织的精确单细胞图谱，并揭示了骨髓来源的巨噬细胞在缺血部位的迁移及其在组织再生中的作用。 | NA | 探讨CD34+细胞在缺血肌肉微环境中的分化潜力和功能角色。 | CD34+细胞及其在缺血肢体恢复中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的正常及缺血肢体组织 |
| 18591 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights intratumor heterogeneity and intercellular network featured in adamantinomatous craniopharyngioma
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adc8933
PMID:37043580
|
研究论文 | 本研究通过整合分析44,038个单细胞转录组数据，揭示了 adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）中的肿瘤内异质性和肿瘤微环境（TME）特征 | 本研究首次定义了四种主要的肿瘤细胞状态，揭示了ACP的组织病理学特征和未知的细胞图谱，并识别出与免疫浸润和神经损伤相关的独特少突胶质细胞谱系 | NA | 揭示adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征，以改善临床诊断和治疗策略 | adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）的细胞图谱和生物学特征 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 44,038个单细胞 |
| 18592 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics in ovarian cancer identify a metastasis-associated cell cluster overexpressed RAB13
2023-04-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04094-7
PMID:37046345
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学研究卵巢癌中的转移相关细胞群体，并识别出其过表达的RAB13 | 本研究首次发现C4细胞亚群与卵巢癌转移及预后不良密切相关，并确认RAB13为其关键标记基因 | 研究的样本数量较少，可能对结果的泛化能力产生影响 | 研究卵巢癌的转移机制及找到新的治疗靶点 | 卵巢癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 12个样本 |
| 18593 | 2024-08-05 |
Predictive and robust gene selection for spatial transcriptomics
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37392-1
PMID:37045821
|
研究论文 | 本文介绍了一种灵活的深度学习框架PERSIST，用于为空间转录组学研究挑选信息丰富的基因目标 | 本文的创新点在于提出了PERSIST框架，能够通过参考scRNA-seq数据优化选择小型基因面板 | 没有提到具体的限制因素 | 研究空间转录组学中如何优化基因选择 | 包含不同脑区、物种和scRNA-seq技术的数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | PERSIST | 基因表达数据 | 涉及不同脑区和物种的多组数据集 |
| 18594 | 2024-08-05 |
PUREE: accurate pan-cancer tumor purity estimation from gene expression data
2023-04-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04764-8
PMID:37041233
|
研究论文 | 本文开发了PUREE，一个从肿瘤基因表达数据中推断肿瘤纯度的工具 | PUREE采用弱监督学习方法，能够对未见肿瘤类型和群体的肿瘤样本进行泛化预测 | NA | 研究肿瘤纯度及其对肿瘤异质性的影响 | 7864个固体肿瘤样本的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 弱监督学习 | 基因表达数据 | 7864个固体肿瘤样本 |
| 18595 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals novel clonally expanded monocytes associated with IL1β-IL1R2 pair in acute inflammatory demyelinating polyneuropathy
2023-04-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32427-5
PMID:37041166
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性炎症性脱髓鞘多发性神经病（AIDP）患者的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型及其与IL1β-IL1R2细胞间通讯的关系。 | 首次在AIDP患者中发现了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型，并观察到IL1β-IL1R2细胞间通讯的增加。 | 本研究为单中心前瞻性研究，样本量较小，需要进一步的多中心研究来验证结果。 | 通过分析AIDP患者PBMCs的单细胞图谱，加深对吉兰-巴雷综合征（GBS）患者外周免疫细胞组成的理解，并为未来研究提供理论基础。 | 急性炎症性脱髓鞘多发性神经病（AIDP）患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 5名AIDP患者和3名健康对照 |
| 18596 | 2024-08-05 |
A single-cell, time-resolved profiling of Xenopus mucociliary epithelium reveals nonhierarchical model of development
2023-04-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add5745
PMID:37027470
|
研究论文 | 这篇文章揭示了蛙类粘液纤毛上皮的发育模式及其细胞类型的形成 | 揭示了粘液纤毛上皮的非等级性发育模式和多能早期上皮祖细胞的功能 | 未深入探讨粘液纤毛上皮发育的所有分子机制 | 研究粘液纤毛上皮的发育过程及其细胞命运获取机制 | 研究从多能状态到成熟阶段的粘液纤毛上皮细胞 | 数字病理 | 慢性呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA成像 | 多能早期上皮祖细胞到成熟细胞的多阶段样本 |
| 18597 | 2024-08-05 |
Ancient ubiquitous protein 1 (AUP1) is a prognostic biomarker connected with TP53 mutation and the inflamed microenvironments in glioma
2023-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02912-y
PMID:37029364
|
研究论文 | 这篇文章研究了古老普遍蛋白1 (AUP1) 在胶质瘤中的预后作用及其与TP53突变和炎性微环境的关系 | 发现AUP1与TP53状态、肿瘤突变负担以及肿瘤增殖相关并首次评估其在胶质瘤中的角色 | 未能发现AUP1抑制与自噬活性改变之间的直接联系，可能需要进一步研究 | 探讨AUP1在胶质瘤中的作用及其作为预后生物标记的潜力 | 主要研究胶质瘤及其相关临床标志物 | 数字病理学 | 胶质瘤 | mRNA测序、蛋白质组学、全外显子组测序和免疫组化染色 | U87MG细胞系 | mRNA、蛋白质、临床案例 | 78个临床案例和多个数据集的单细胞测序数据 |
| 18598 | 2024-08-08 |
N,N-Dimethyl-3β-hydroxycholenamide attenuates neuronal death and retinal inflammation in retinal ischemia/reperfusion injury by inhibiting Ninjurin 1
2023-Apr-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02754-5
PMID:37029422
|
研究论文 | 研究N,N-二甲基-3β-羟基胆甾胺（DMHCA）通过抑制Ninjurin 1减轻视网膜缺血/再灌注损伤中的神经元死亡和视网膜炎症 | 首次揭示了DMHCA通过抑制Ninjurin 1在视网膜缺血/再灌注损伤中的神经保护作用，并提供了单细胞RNA测序的新见解 | 文章未提及具体的局限性 | 探讨DMHCA在视网膜缺血/再灌注损伤中的效果及其分子机制 | DMHCA处理的小鼠视网膜缺血/再灌注损伤及DMHCA处理后的微胶质细胞 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 18599 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of cuproptosis-related immune biomarker signature to enhance prognostic accuracy in gastric cancer
2023-04-07, Aging
DOI:10.18632/aging.204646
PMID:37036489
|
研究论文 | 本研究探讨了铜依赖性程序性细胞死亡机制——铜死亡相关免疫基因（CRIGs）在胃癌（GC）中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 | 首次揭示了CRIGs在胃癌中的功能，并建立了一个有效的铜死亡相关免疫生物标志物签名，用于准确预测胃癌患者的长期生存 | NA | 挖掘铜死亡相关免疫基因在胃癌中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 | 胃癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, 免疫组织化学 | Cox和LASSO分析 | 转录组数据, 临床信息 | 数据来自TCGA, GTEx, 和GEO数据库 |
| 18600 | 2024-08-05 |
Identification of cell barcodes from long-read single-cell RNA-seq with BLAZE
2023-04-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02907-y
PMID:37024980
|
研究论文 | 文章介绍了BLAZE，这是一种用于仅依赖纳米孔长读长单细胞RNA测序数据识别细胞条形码的方法 | BLAZE准确高效地识别10x细胞条形码，而不依赖于匹配的短读数据 | NA | 旨在简化长读单细胞RNA测序并提高结果质量 | 长读单细胞RNA测序数据中的细胞条形码 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 长读RNA测序数据 | NA |