单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 29104 篇文献，本页显示第 1841 - 1860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2025-05-29 |
Immunotyping the Tumor Microenvironment Reveals Molecular Heterogeneity for Personalized Immunotherapy in Cancer
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417593
PMID:40433880
|
research paper | 开发了一种名为TMEclassifier的机器学习工具，用于将肿瘤微环境（TME）分类为三种亚型，以指导个性化免疫治疗 | 首次提出了一种高度可访问、高通量的方法来定义肿瘤微环境的异质性，并通过机器学习工具TMEclassifier对癌症进行分类 | 虽然在小鼠模型和前瞻性胃癌队列中验证了TMEclassifier的预测能力，但还需要在更广泛的癌症类型和更大样本中进行验证 | 研究肿瘤微环境的异质性，以指导个性化免疫治疗策略 | 肿瘤微环境（TME）及其在癌症免疫治疗中的作用 | machine learning | cancer | bulk RNA sequencing, single-cell RNA sequencing | machine-learning tool (TMEclassifier) | RNA sequencing data | 前瞻性胃癌队列（TIMES-001）及其他多样本队列 |
| 1842 | 2025-05-29 |
Blood Biomarker-Based Predictive Indicator for Liver Metastasis in Alpha-Fetoprotein-Producing Gastric Cancer and Multi-Omics Tumor Microenvironment Insights
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503499
PMID:40433893
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于血液生物标志物的预测指标（ANLiM评分），用于预测甲胎蛋白产生性胃癌（AFPGC）患者的肝转移风险，并通过多组学分析揭示了肝转移AFPGC的免疫抑制性肿瘤微环境特征 | 结合AFP和中性粒细胞-淋巴细胞比率（NLR）开发了新型预测指标ANLiM评分，并通过单细胞RNA测序等技术首次揭示了AFPGC肝转移的免疫微环境特征 | 回顾性研究设计可能引入选择偏倚，样本量相对有限（317例） | 开发AFPGC肝转移预测工具并探索其肿瘤微环境特征 | 甲胎蛋白产生性胃癌（AFPGC）患者 | 肿瘤学 | 胃癌 | 全外显子组测序、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | 多变量逻辑回归模型、列线图 | 临床数据、基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 317例AFPGC患者 |
| 1843 | 2025-05-29 |
Single-Cell Analysis Reveals that Vitamin C Inhibits Bone Metastasis of Renal Cancer via Cell Cycle Arrest and Microenvironment Remodeling
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501011
PMID:40433925
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了维生素C通过细胞周期阻滞和微环境重塑抑制肾癌骨转移的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了维生素C在骨转移微环境中的抗肿瘤作用，并提出了维生素C与CXCR2拮抗剂联合治疗的新策略 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探索维生素C抑制肾癌骨转移的分子机制及其治疗潜力 | 肾癌细胞及其骨转移微环境 | 肿瘤学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨转移模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球体来源的肾癌细胞 |
| 1844 | 2025-05-29 |
PROS1-MERTK Axis Drives Tumor Microenvironment Crosstalk and Progression in Papillary Thyroid Microcarcinoma
2025-May-28, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413474
PMID:40433916
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了PROS1-MERTK轴在甲状腺微小乳头状癌（PTMC）进展中的关键作用 | 首次揭示了PROS1-MERTK信号通路通过旁分泌和自分泌机制加速PTMC进展，并鉴定出NFYB和FOXP2作为PROS1转录的激活剂 | 样本量较小（19个手术组织标本），且仅针对PTMC进行研究 | 探索甲状腺微小乳头状癌（PTMC）进展的分子机制和生物标志物 | 15名患者的19个手术组织标本，包括癌旁组织、非进展性PTMC、进展性PTMC和进展性PTC | 肿瘤生物学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | 19个手术组织标本（来自15名患者） |
| 1845 | 2025-05-29 |
Single-cell targeted transcriptomics reveals subset-specific immune signatures differentiating asymptomatic and cardiac patients with chronic Chagas disease
2025-May-28, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf269
PMID:40434116
|
研究论文 | 通过单细胞靶向转录组学揭示了慢性查加斯病无症状患者和心脏病患者亚群特异性免疫特征 | 首次应用免疫基因靶向单细胞RNA测序技术，揭示了慢性查加斯病不同临床形式患者的免疫细胞亚群特异性基因表达模式 | 研究仅基于外周血单个核细胞(PBMCs)，未涉及其他组织或更广泛的样本 | 揭示慢性查加斯病不同临床形式(无症状和心脏病)患者的免疫特征差异 | 慢性查加斯病患者的外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 查加斯病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自无症状(IND)和心脏病(CCC)患者的外周血单个核细胞样本 |
| 1846 | 2025-05-29 |
Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging
2025-May-28, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70119
PMID:40434135
|
研究论文 | 研究昼夜节律基因BMAL1在甲状腺衰老过程中对细胞衰老的调控作用 | 揭示了BMAL1基因下调通过抑制NFKBIA表达加速甲状腺细胞衰老和损害激素合成的新机制 | NA | 探究甲状腺衰老的分子和功能特征及其与甲状腺激素合成的关系 | 人类甲状腺组织和小鼠模型 | 分子生物学 | 甲状腺疾病 | scRNA-seq, 转录组测序 | 甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 年轻、中年和老年组的人类甲状腺组织 |
| 1847 | 2025-05-29 |
Polyamine acetylation mediates crosstalk between cancer cells and myeloid cells to promote mesenchymal/plurimetabolic states in glioblastoma
2025-May-27, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf128
PMID:40424600
|
研究论文 | 本研究探讨了多胺乙酰化在胶质母细胞瘤(GBM)中介导癌细胞与髓系细胞间的代谢串扰，促进间充质/多代谢状态的作用 | 首次揭示了SAT1及其产物N1-乙酰精胺在连接肿瘤细胞与肿瘤相关巨噬细胞/髓系细胞(TAMs)代谢活动中的新作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，人类临床样本验证仍需进一步研究 | 探究多胺代谢重编程如何影响GBM亚型分类的恶性细胞内在和微环境依赖的生物学过程 | 人类和小鼠GBM肿瘤及细胞系 | 肿瘤代谢 | 胶质母细胞瘤 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | 人类和小鼠GBM肿瘤及细胞系(具体数量未明确说明) |
| 1848 | 2025-05-29 |
Epithelial cell dynamics: Key drivers of type 2 inflammation in eosinophilic chronic rhinosinusitis
2025-May-26, Auris, nasus, larynx
DOI:10.1016/j.anl.2025.05.009
PMID:40424830
|
research paper | 本文探讨了鼻窦黏膜上皮细胞在嗜酸性慢性鼻窦炎（ECRS）中作为2型炎症关键驱动因素的作用 | 强调了上皮细胞在ECRS发病机制中的关键作用，而非传统认为的免疫细胞，并探讨了针对IL-4/IL-13和IL-5信号通路的新型生物制剂的潜力 | ECRS的发病机制在患者群体中存在异质性，这使得开发通用疗法变得复杂 | 探索上皮细胞亚群在维持组织修复和慢性炎症平衡中的作用，以开发针对性干预措施 | 嗜酸性慢性鼻窦炎（ECRS）患者的上皮细胞和免疫细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞转录组学和空间转录组学技术 | NA | NA | NA |
| 1849 | 2025-05-29 |
[New technologies serve as accelerators for breakthroughs in modern acupuncture research]
2025-May-25, Zhen ci yan jiu = Acupuncture research
DOI:10.13702/j.1000-0607.20250380
PMID:40390610
|
综述 | 本文系统回顾了现代针灸研究的历史，强调了早期电生理和生化技术对针灸客观效应的验证，以及自20世纪50年代以来研究对针灸镇痛机制、经络现象、穴位-内脏器官关联和穴位功效模式的阐明 | 强调了当代技术从系统、有机方法到细胞、分子和遗传方法在推动现代针灸研究中的作用，并展望了单细胞测序、空间转录组学、神经影像学、人工智能和医工交叉等新兴技术在针灸研究中的潜在应用 | 未具体说明当前研究的局限性 | 探讨现代针灸研究的发展历程及未来技术应用方向 | 针灸-艾灸的客观效应、镇痛机制、经络现象、穴位-内脏器官关联和穴位功效模式 | 医学工程交叉 | NA | 电生理、生化技术、单细胞测序、空间转录组学、神经影像学、人工智能 | NA | NA | NA |
| 1850 | 2025-05-29 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-May-22, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
|
研究论文 | 通过增强子驱动的基因调控网络揭示转录因子在肿瘤微环境中调控T细胞适应和分化的机制 | 利用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多组学数据，揭示了KLF2和BATF转录因子在调控Trm样TIL形成中的关键作用 | 研究基于模型和小样本数据，可能无法完全反映人类肿瘤微环境的复杂性 | 探究肿瘤微环境中T细胞适应和分化的调控机制 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）中的CD8 T细胞 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组数据、表观遗传数据 | 模型中的T细胞受体（TCR）匹配的CD8 T细胞 |
| 1851 | 2025-05-29 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-May-08, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
|
研究论文 | 本研究探讨了CTNNB1外显子3突变在子宫内膜样子宫内膜癌(EECs)中β-连环蛋白(β-catenin)蛋白不同定位对下游基因表达的影响 | 首次揭示了β-连环蛋白在细胞核内或膜/细胞质中的不同定位会导致EECs中产生不同的转录谱，并发现了一个新的治疗靶点TROP2 | 研究仅关注CTNNB1外显子3突变的EECs，未涉及其他突变类型或其他类型子宫内膜癌 | 探究β-连环蛋白不同亚细胞定位对EECs转录谱的影响 | 携带CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌(EECs) | 肿瘤分子生物学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，但研究了肿瘤内具有核和非核β-连环蛋白定位的不同区域 |
| 1852 | 2025-05-29 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2025-May, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
|
research paper | 本研究揭示了6p22.2区域与中国汉族人群1型糖尿病(T1D)风险的关系，并确定了该区域内的因果变异及靶基因 | 发现了功能性变异rs9379874通过调节BTN3A1表达影响T细胞功能，为T1D的基因组风险图谱提供了新见解 | 未发现rs4320356变异与胰岛功能或自身免疫显著相关 | 揭示6p22.2风险区域与T1D亚群及相关临床特征的关联，并确定该区域的因果变异和靶基因 | 中国汉族人群中的T1D患者和健康对照 | 基因组学 | 1型糖尿病 | GWAS、双荧光素酶报告基因检测、eQTL分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、临床数据 | 2608例T1D患者和4814例健康对照 |
| 1853 | 2025-05-29 |
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Apr-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001360
PMID:40262132
|
研究论文 | 使用AI技术对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)中的肝纤维形态进行表型分析，以揭示其分子改变 | 开发了基于AI的FibroNest算法，首次全面表征了MASLD中肝纤维形态表型及其相关分子改变，并发现FibroPC4与HCC发生的基因特征相关 | 样本量相对较小(94例)，且仅针对MASLD患者 | 揭示MASLD中肝纤维形态表型与分子改变的关系 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)患者的肝活检样本 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 多层组学分析、空间单细胞转录组(CosMx) | FibroNest算法 | 图像、转录组数据 | 94例MASLD肝活检样本(其中12例并发HCC) |
| 1854 | 2025-05-29 |
Anti-Peptidylarginine Deiminase 4 Autoantibodies Derived From Patients With Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Apr-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
|
研究论文 | 本研究探讨了类风湿性关节炎(RA)患者中抗肽基精氨酸脱亚胺酶4(PAD4)自身抗体的致病机制，通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎 | 揭示了抗PAD4抗体通过结合单核细胞触发炎症级联反应，促进免疫细胞募集至关节和T细胞激活，最终导致滑膜成纤维细胞激活和更严重的关节炎 | 研究主要基于胶原诱导的关节炎小鼠模型和体外培养的人类单核细胞，可能不完全反映人类RA的复杂病理过程 | 阐明抗PAD4抗体在RA发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养 | 胶原诱导的关节炎(CIA)小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明样本数量，但使用了人类外周血单核细胞和RA患者的单细胞RNA测序数据集 |
| 1855 | 2025-05-29 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析了22名口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本，探讨了肿瘤基质细胞在肿瘤微环境中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 首次揭示了免疫化疗应答者中SELP高内皮小静脉和APOD肌成纤维癌相关成纤维细胞的显著上调，以及STMN1毛细血管内皮细胞的下降，这些变化特异于免疫化疗组 | 样本量较小（仅22名患者），且仅针对口腔鳞状细胞癌 | 探讨肿瘤基质细胞在肿瘤微环境中的作用及其与免疫治疗反应的关系 | 22名口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22名口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤样本 |
| 1856 | 2025-05-29 |
Neuroinflammatory pathways and potential therapeutic targets in neonatal post-hemorrhagic hydrocephalus
2025-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-024-03733-z
PMID:39725707
|
review | 本文综述了新生儿出血后脑积水（PHH）的分子病理生理学及新兴治疗方法 | 探讨了神经炎症通路、免疫介质及调控基因在PHH中的作用，并评估了基因组学、表观基因组学和蛋白质组学技术在识别关键分子靶点中的应用 | 新兴疗法如间充质干细胞干预在新生儿群体中的安全性及其对大脑发育的潜在影响尚未解决 | 研究PHH的病理生理学机制并探索针对性治疗方法 | 新生儿出血后脑积水（PHH）及其相关分子机制 | 神经科学 | 新生儿疾病 | 全基因组/外显子测序、蛋白质组学、表观遗传学、单细胞转录组学 | NA | 分子数据 | NA |
| 1857 | 2025-05-29 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
|
research paper | 该研究探讨了小肠组织中组织驻留记忆CD8 T细胞（T细胞）的多样性及其空间时间印记机制 | 揭示了小肠不同组织微环境如何驱动T细胞的表型异质性，并开发了新的计算方法和基因扰动策略来研究T细胞的分化 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的空间转录组学，可能不完全反映人体内的全部复杂性 | 探究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源及其在小肠中的空间分布 | 组织驻留记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | NA | 空间转录组学、光学编码基因扰动策略 | NA | 转录组数据、空间分布数据 | 人类样本和小鼠模型 |
| 1858 | 2025-05-29 |
A comprehensive spatio-cellular map of the human hypothalamus
2025-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08504-8
PMID:39910307
|
research paper | 该研究通过单核测序和空间转录组学技术，构建了一个全面的人类下丘脑空间细胞转录图谱'HYPOMAP' | 首次结合单核测序和空间转录组学技术，对人类下丘脑进行全面的转录组分析，并发现了一些与BMI相关的基因 | 研究主要基于转录组数据，可能未涵盖所有细胞类型和功能的复杂性 | 构建人类下丘脑的空间细胞转录图谱，并探索其与代谢等疾病的关系 | 人类下丘脑细胞 | 生物信息学 | 代谢疾病 | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 433,369个人类下丘脑细胞 |
| 1859 | 2025-05-29 |
Annexin A's Life in Pan-Cancer: Especially in Glioma Immune Cells
2025-Feb-26, Neuromolecular medicine
IF:3.3Q2
DOI:10.1007/s12017-024-08827-9
PMID:40011350
|
research paper | 该研究通过整合多组学数据和单细胞测序分析，全面评估了ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达模式和功能影响，特别关注胶质母细胞瘤 | 研究发现ANXA2和ANXA4主要由GBM中的M2巨噬细胞表达，并揭示了它们与胶质瘤中巨噬细胞和CD4+静止记忆T细胞存在的强相关性 | 研究中使用的分析工具之间存在差异，强调了使用多种方法准确识别差异表达基因的必要性 | 研究ANXA家族在癌症中的预后意义，特别是在胶质瘤免疫细胞中的作用 | ANXA2和ANXA4在多种癌症中的表达和功能，特别关注胶质母细胞瘤和低级别胶质瘤 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 多组学数据整合、单细胞测序分析 | NA | 基因组数据、单细胞测序数据 | 来自The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集 |
| 1860 | 2025-05-29 |
Integrating spatial transcriptomics and snRNA-seq data enhances differential gene expression analysis results of AD-related phenotypes
2024-Nov-18, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.11.18.24317499
PMID:39606364
|
research paper | 该研究通过整合空间转录组学（ST）和单核RNA测序（snRNA-seq）数据，增强了阿尔茨海默病（AD）相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达（DGE）分析的能力 | 结合ST和snRNA-seq数据，利用深度学习工具CelEry推断细胞的空间位置，并进行皮层层特异性（CLS）和细胞类型特异性（CTS）DGE分析，发现了传统CTS DGE分析无法检测到的AD相关基因和通路 | 研究依赖于推断的空间位置信息，可能存在一定的误差，且样本量虽大但仍局限于特定脑区（DLPFC） | 增强AD相关表型的空间信息细胞类型特异性差异基因表达分析能力 | 阿尔茨海默病（AD）相关的β-淀粉样蛋白、缠结密度和认知衰退表型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学（ST）、单核RNA测序（snRNA-seq）、深度学习 | 线性混合回归模型 | 基因表达数据 | 436个死后大脑的DLPFC组织样本，约150万细胞 |