单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 1841 - 1860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1841 | 2026-02-27 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
|
研究论文 | 本研究通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序技术，构建了人类卵巢的细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序，首次在人类卵巢中揭示了卵泡发育的分子程序及激素和细胞外基质重塑活动的空间变异 | 样本量较小，仅涉及少数绝经前捐赠者，可能限制了结果的普适性 | 研究卵巢的功能单元和细胞间空间相互作用，以增进对生育和内分泌健康的理解 | 人类卵巢组织，包括卵母细胞、卵泡膜细胞、颗粒细胞等细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | 来自5名捐赠者的卵巢组织，包括257个区域的空间转录组数据和21,198个细胞的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1842 | 2026-02-27 |
Insights for disease modeling from single-cell transcriptomics of iPSC-derived Ngn2-induced neurons and astrocytes across differentiation time and co-culture
2024-Apr-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-024-01867-4
PMID:38566045
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析，研究了iPSC衍生的Ngn2诱导神经元和星形胶质细胞在分化时间和共培养条件下的同质性、相似性及其在神经精神疾病建模中的应用 | 结合公共单细胞RNA-seq数据和体内发育脑数据，首次系统评估了hiPSC-N和hiPSC-A的谱系起源、成熟度及共培养效应，并构建了集成网络资源平台 | 研究揭示了细胞模型的异质性和局限性，可能不完全模拟体内复杂环境，需进一步优化 | 评估iPSC衍生神经元和星形胶质细胞模型在神经精神疾病研究中的适用性和优化策略 | 人诱导多能干细胞衍生的Ngn2诱导神经元(hiPSC-N)和星形胶质细胞(hiPSC-A) | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1843 | 2026-02-27 |
Multi-organ single-cell transcriptomics of immune cells uncovered organ-specific gene expression and functions
2024-03-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-03152-z
PMID:38538617
|
研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞转录组数据集，揭示了健康供体14个器官中免疫细胞的器官特异性基因表达和功能差异 | 首次大规模整合多器官单细胞转录组数据，系统识别了免疫细胞在器官间的特异性基因表达模式，如肾脏中的GTPX3和胸腺中的DNTT与ACVR2B，并关联了转录因子活性和代谢通路 | 研究基于公开数据集进行荟萃分析，可能受原始数据质量和批次效应影响；样本来源限于健康供体，未涵盖疾病状态 | 探究不同人类器官中驻留免疫细胞的独特基因表达特征和功能 | 114,275个CD45+免疫细胞，来源于健康供体的14个器官 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 114,275个免疫细胞，来自14个器官的健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1844 | 2026-02-26 |
Monocytes acquire a tumor-associated IL1B program upon encountering patient-derived colon cancer organoids
2026-Dec-31, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2026.2633012
PMID:41723598
|
研究论文 | 本研究通过建立患者来源的结肠癌类器官与原代人单核细胞的共培养系统，揭示了单核细胞在肿瘤微环境中获得IL1B相关程序化表型的机制 | 首次利用患者来源的结肠癌类器官与原代人单核细胞共培养系统模拟肿瘤微环境中的细胞互作，并发现单核细胞获得一种独立于肿瘤突变谱或分子亚型的IL1B程序化表型 | 研究基于体外共培养系统，可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境；样本来源仅限于微卫星稳定型结直肠癌患者 | 解析结直肠癌中肿瘤相关单核细胞/巨噬细胞的表型异质性及其功能调控机制 | 患者来源的结肠癌类器官、原代人单核细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 微卫星稳定型结直肠癌患者的类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1845 | 2026-02-26 |
Spatial transcriptomics reveals the molecular signatures of prodromal and advanced α-synucleinopathy
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114845
PMID:41736854
|
研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术，揭示了α-突触核蛋白病在啮齿动物模型和帕金森病患者中的分子特征，包括能量代谢通路的变化和特定信号标记的识别 | 首次结合空间转录组学与帕金森病患者微阵列数据，系统揭示了α-突触核蛋白病从前期到晚期阶段的分子动态变化，并识别出与病理进展一致的生物标记 | 研究基于转基因小鼠模型和有限的帕金森病患者队列，可能无法完全反映人类疾病的复杂性，且空间转录组学技术分辨率有限 | 探究α-突触核蛋白病在帕金森病中的分子机制和进展标志，为生物标记发现和靶向治疗提供依据 | 转基因M83小鼠模型的脑组织切片以及四个独立帕金森病患者队列的微阵列数据集 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学，微阵列分析 | NA | 空间转录组数据，微阵列数据 | 转基因M83小鼠模型脑切片及四个独立帕金森病患者队列数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1846 | 2026-02-26 |
A cell atlas of multiple liver organoids and the fetal liver based on scRNA-seq
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114955
PMID:41736863
|
研究论文 | 本研究通过整合多个scRNA-seq数据集，构建了一个包含217,025个高质量细胞的统一肝脏类器官细胞图谱，并与人类胎儿肝脏数据进行比较分析 | 首次构建了跨多个培养方案的肝脏类器官综合细胞图谱，并系统比较了类器官与胎儿组织在细胞组成和信号通路上的差异 | 类器官中造血谱系细胞代表性不足，可能限制了其在模拟完整肝脏发育方面的应用 | 理解人类肝脏类器官生长过程中的细胞特征和调控网络，以促进肝脏发育和功能研究 | 人类肝脏类器官和胎儿肝脏组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 217,025个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1847 | 2026-02-26 |
Neural network-assisted RNA velocity imputation for empowering transcript dynamics-based analyses
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114909
PMID:41736867
|
研究论文 | 本文提出了一种名为NARVI的深度学习框架，用于通过神经网络辅助RNA速度插补，以解决现有RNA速度估计工具因技术限制或模型假设而无法计算大量基因速度的问题 | 利用深度学习学习可计算基因的表达模式与速度之间的关系，从而准确估计原本无法计算的基因速度，扩展了基于转录动力学的下游分析范围 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 解决RNA速度估计工具在单细胞转录组数据分析中因技术限制或模型假设导致的基因速度计算缺失问题，以增强基于转录动力学的下游分析能力 | 单细胞转录组数据集中的基因速度估计 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架（神经网络） | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞转录组数据集（未指定具体样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1848 | 2026-02-26 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Mar-06, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和多重免疫组化技术，揭示了肿瘤细胞来源的IFN通过诱导巨噬细胞表达SPP1，形成免疫抑制微环境，从而导致PARP抑制剂耐药的机制 | 首次在空间层面揭示了IFN-SPP1轴在PARP抑制剂耐药中的作用，并证明SPP1可作为治疗靶点和预后生物标志物 | 研究主要基于卵巢癌样本和HRD小鼠模型，在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究PARP抑制剂耐药的机制，并寻找克服耐药的治疗策略 | 高级别浆液性卵巢癌患者样本和HRD小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据, 图像数据 | 来自前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析平台 |
| 1849 | 2026-02-26 |
High-throughput proteomics uncovers molecular clusters and biomarkers of severity in bullous pemphigoid
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70252
PMID:41392513
|
研究论文 | 本研究通过高通量蛋白质组学分析，揭示了天疱疮（BP）中局部和全身炎症反应的分子特征，并识别了与疾病严重程度相关的生物标志物 | 首次使用Olink Target 96炎症面板全面分析BP的皮肤和血清蛋白质组，识别出CCL13等关键炎症蛋白，并基于蛋白质组数据定义了两种分子亚型，揭示了BP的生物学异质性 | 样本量相对较小（29例皮肤活检和27例匹配血清），且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 全面分析BP的局部和系统性炎症反应，探索其与疾病严重程度、临床特征和治疗结果的关联 | 天疱疮患者的皮肤活检和血清样本，以及健康对照样本 | 蛋白质组学 | 天疱疮 | Olink Target 96炎症面板蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | 主成分分析、无监督聚类、差异表达分析、基因集富集分析、k-means聚类 | 蛋白质组数据、转录组数据 | 29例BP皮肤活检、27例匹配血清样本、14例健康对照 | Olink | 高通量蛋白质组学，单细胞RNA测序 | Olink Target 96 Inflammation panel | Olink Target 96炎症面板用于蛋白质组分析，公开可用的单细胞RNA测序数据集用于外部验证 |
| 1850 | 2026-02-26 |
Multi-omics analysis identifies SMPD1 as a key contributor in sphingolipid pathway for Type 2 diabetes pathogenesis
2026-Mar, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01727-7
PMID:41428198
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析，确定SMPD1是2型糖尿病发病机制中鞘脂代谢通路的关键贡献因子 | 整合基因组、转录组和代谢组数据，并结合孟德尔随机化分析与体内实验，首次系统性地证实了SMPD1在2型糖尿病发病中的因果作用和致病机制 | 研究主要基于小鼠模型和部分人类数据，需要在更广泛的人类队列中进行验证；对SMPD1影响下游信号通路的分子机制探索尚不全面 | 识别和表征导致2型糖尿病发病的关键鞘脂通路成分 | 2型糖尿病患者、代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）患者的肝脏组织、瘦型和ob/ob肥胖小鼠模型 | 多组学分析 | 2型糖尿病 | 多组学整合分析、孟德尔随机化分析、全基因组关联研究（GWAS）、体内实验 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | 涉及人类GWAS数据、T2D患者血液代谢组数据、MASLD肝脏组织bulk和单细胞RNA-seq数据集，以及瘦型和ob/ob小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1851 | 2026-02-26 |
Molecular analysis of tumor recurrence using established cancer stem cell-line and drug discovery
2026-Mar, International journal of clinical oncology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s10147-025-02948-2
PMID:41557221
|
研究论文 | 本文通过开发LGR5特异性单克隆抗体和建立具有干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123，研究了癌症干细胞在肿瘤复发中的作用，并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能有效抑制复发 | 开发了LGR5特异性单克隆抗体和高灵敏度免疫荧光方法，建立了维持干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123及体外复发模型，并通过单细胞RNA测序和小分子筛选发现BMH-21作为新型抑制剂 | 未明确说明样本量或临床验证的局限性，研究主要基于细胞系和模型系统 | 阐明癌症干细胞在结直肠癌复发中的作用机制，并开发预防肿瘤复发的新疗法 | 结直肠癌干细胞、LGR5标记物、PLR123细胞系、肿瘤复发模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、小分子筛选 | 体外复发模型 | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1852 | 2026-02-26 |
Correction to "A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data"
2026-03, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.70023
PMID:41676320
|
correction | 本文是对先前发表的关于单细胞RNA测序数据与ATAC测序数据整合方法比较文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1853 | 2026-02-26 |
Distribution and Levels of Insulin-like Growth Factor 2 Receptor Across Mouse Brain Cell Types
2026-Mar, Receptors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/receptors5010001
PMID:41725679
|
研究论文 | 本研究通过免疫荧光染色和单细胞RNA测序数据比较，系统评估了成年雄性C57BL/6J小鼠大脑中胰岛素样生长因子2受体在不同脑细胞类型和脑区的分布与表达水平 | 首次全面揭示了IGF-2R蛋白在多种脑细胞类型中的特异性分布，特别是在兴奋性和抑制性神经元中的高富集，以及其在树突和轴突区室中的定位 | 研究仅限于成年雄性C57BL/6J小鼠，未涵盖其他年龄、性别或物种，且依赖公开的单细胞RNA测序数据库进行mRNA表达比较 | 探究IGF-2R在大脑不同细胞类型和亚细胞区室中的分布与表达水平，以增进对其在脑功能和疾病中作用的理解 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的大脑组织，包括海马体和皮质区域 | 神经科学 | 神经发育和神经退行性疾病 | 双重和多重免疫荧光染色，单细胞RNA测序数据分析 | NA | 图像数据，公开的RNA测序数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1854 | 2026-02-26 |
Chromatin accessibility landscapes define stromal cell identities across tissues
2026-Feb-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09720-w
PMID:41735542
|
研究论文 | 本研究利用单细胞ATAC测序技术绘制了小鼠多种组织的染色质可及性图谱，揭示了染色质可及性在定义基质细胞身份中的关键作用 | 首次在多种组织中系统绘制单细胞染色质可及性图谱，并证明染色质可及性特征可用于追溯基质细胞的组织来源 | 研究仅限于小鼠模型，人类组织的验证尚需进一步研究 | 探索不同组织中染色质可及性景观及其在细胞身份调控中的作用 | 小鼠九种组织中的51,248个细胞 | 表观基因组学 | NA | 单细胞ATAC测序 | NA | 表观基因组数据 | 51,248个细胞，来自九种小鼠组织 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1855 | 2026-02-26 |
SPP1+ neutrophil and exhausted CD8⁺ T cells infiltration predicting the early recurrence of hepatocellular carcinoma patients after R0 resection
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004998
PMID:41738622
|
研究论文 | 本研究通过整合临床数据、单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据，揭示了与肝细胞癌术后早期复发高风险相关的肿瘤微环境特征，特别是SPP1⁺中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞的浸润及其相互作用 | 首次系统性地结合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据，识别出SPP1⁺中性粒细胞亚型与耗竭CD8⁺ T细胞在肝细胞癌早期复发患者肿瘤微环境中的关键作用及其空间共定位，并揭示了它们通过SPP1-CD44等轴介导的免疫抑制机制 | 研究样本量相对有限（如scRNA-seq仅涉及28个HCC样本），且主要基于回顾性队列分析，需要前瞻性研究进一步验证 | 探究肝细胞癌术后早期复发的肿瘤微环境细胞异质性及其免疫学机制 | 肝细胞癌患者及其肿瘤组织、外周血样本 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 临床数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 批量RNA测序数据 | 402例患者（临床分析），28个HCC样本（scRNA-seq发现队列），17个HCC组织和7个匹配外周血样本（scRNA-seq验证队列），365例患者（TCGA-LIHC验证队列） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1856 | 2026-02-26 |
Research trends of tumor-associated macrophages in colorectal cancer: a bibliometric analysis
2026-Feb-25, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004422
PMID:41738620
|
文献计量分析 | 本文通过文献计量学方法，系统分析了结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的研究趋势与前沿 | 首次对结直肠癌TAMs研究领域进行全面的文献计量与可视化分析，识别了关键研究集群和未来方向 | 分析基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献；文献计量方法主要反映趋势，不涉及具体机制验证 | 描绘结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究格局与新兴前沿 | 全球范围内关于结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞的研究出版物 | 文献计量学 | 结直肠癌 | 文献计量分析、可视化分析（VOSviewer、CiteSpace） | NA | 文献元数据 | 2861篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 1857 | 2026-02-26 |
Single-cell transcriptomics unveils the immunologic landscape of anti-PD-1-associated indirect drug-induced liver injury
2026-Feb-25, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-026-02370-z
PMID:41739156
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了抗PD-1治疗诱导的间接药物性肝损伤的免疫学机制 | 首次在荷瘤条件下提供了抗PD-1诱导肝损伤小鼠模型中肝脏微环境的单细胞图谱，揭示了代谢重编程和促纤维化表型，并发现NETosis激活与肝损伤进展密切相关 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限，且机制探索可能未涵盖所有病理因素 | 探究免疫检查点抑制剂（特别是抗PD-1）引起的肝损伤（ILICI）的病理机制 | C57BL/6J小鼠的Lewis肺癌模型及患者肝组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型组和对照组，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1858 | 2026-02-26 |
Single-cell Spatial Transcriptomics Reveals Hepatocyte Reprogramming in Fontan Associated Liver Disease
2026-Feb-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198823
PMID:41734025
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术，揭示了Fontan相关肝病中肝细胞的重编程现象，特别是在晚期纤维化阶段 | 首次在FALD中应用单细胞空间转录组学，识别出具有细胞应激和冗余区域基因表达的独特肝细胞亚群，并发现WNT2信号异常驱动肝细胞区域破坏 | 样本量较小（早期和晚期纤维化各1例用于ST分析），且为横断面研究，难以确定因果关系 | 探究Fontan相关肝病的病理生理学机制，特别是肝细胞重编程和纤维化进展 | FALD患者的肝移植组织样本，包括早期和晚期纤维化阶段 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学，免疫荧光染色，原位杂交 | 无监督聚类分析，CellChat分析 | 空间转录组数据，图像数据 | ST分析：2例FALD患者（早期和晚期纤维化各1例）；免疫荧光验证：18例FALD组织 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMxTM Spatial Molecular Imaging | 使用6000个基因的原位杂交进行CosMxTM空间分子成像 |
| 1859 | 2026-02-26 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Feb-24, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
|
研究论文 | 本研究探讨了炎症小体适配蛋白ASC在轻度闭合性头部损伤模型中如何促进持续性神经炎症和轻度认知障碍 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了ASC在闭合性头部损伤后主要在小胶质细胞簇中选择性表达，并证实其在持续性神经炎症和认知障碍中的关键作用 | 研究基于小鼠模型，结果可能无法完全转化到人类；仅关注了ASC蛋白，其他炎症小体成分的作用未深入探讨 | 探究炎症小体相关基因在闭合性头部损伤模型中的细胞表达和功能意义 | 小鼠闭合性头部损伤模型，特别是皮质组织中的小胶质细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1860 | 2026-02-26 |
In Silico Reconstruction of Primary and Metastatic Tumor Architecture using Geographic Information System-Augmented Spatial Transcriptomics
2026-Feb-24, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3161
PMID:41734374
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为GIS-ROTA的计算框架，利用地理信息系统增强的空间转录组学数据，对原发性和转移性肿瘤的架构进行计算机重建 | 开发了一种生物信息学分析框架，首次在识别空间域之前考虑生物学功能，结合通路或细胞类型富集分析与空间自相关测量，直接提供可解释性并减少传统聚类方法的主观性 | NA | 揭示肿瘤微环境中细胞群之间的相互作用、肿瘤异质性及治疗反应的空间功能模式 | 原发性和转移性雌激素受体阳性乳腺癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 地理信息系统增强的计算重建框架 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |