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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1841 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveals distinct cell type dynamics following opioid dependence in mice with the common human variant in the μ-opioid receptor, Oprm1 A118G
2025-Aug-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7199524/v1
PMID:40894067
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了携带人类μ-阿片受体A118G变体的小鼠在阿片依赖后不同细胞类型的动态变化 | 首次结合空间转录组学系统评估A118G变异对阿片依赖中细胞动态的影响,发现神经胶质细胞而非神经元功能障碍在遗传风险中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,人类样本验证尚需进行;A118G变异的确切分子机制仍未完全阐明 | 探究μ-阿片受体A118G基因变异如何影响阿片依赖风险的神经生物学机制 | 携带人类Oprm1 A118G变体的小鼠模型 | 空间转录组学 | 阿片使用障碍 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 阿片暴露小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1842 | 2025-10-06 |
TET2-mutant myeloid cells mitigate Alzheimer's disease progression via CNS infiltration and enhanced phagocytosis in mice
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.006
PMID:40609533
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研究论文 | 本研究发现TET2突变的克隆性造血可通过外周髓系细胞浸润减轻阿尔茨海默病进展 | 首次揭示TET2特异性突变(而非其他CH驱动因子)对AD的保护作用,并阐明其通过增强髓系细胞脑内浸润和吞噬功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型和UK Biobank数据,人类直接证据有限 | 探究克隆性造血与阿尔茨海默病的相互作用机制 | TET2突变髓系细胞、AD小鼠模型、人诱导多能干细胞衍生小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,iPSC分化,骨髓移植 | 小鼠AD模型 | 基因测序数据,行为学数据,病理学数据 | UK Biobank人群数据,小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1843 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Changes in Patient-Derived Glioma and U87 Glioblastoma Cell Cultures Infected with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact
2025-07-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146983
PMID:40725231
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溶瘤病毒VV-GMCSF-Lact感染人胶质瘤细胞后的转录组变化 | 首次在单细胞水平比较患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞和U87胶质母细胞瘤细胞对溶瘤病毒的转录反应 | 研究仅针对特定溶瘤病毒株VV-GMCSF-Lact,未与其他病毒疗法比较 | 探究溶瘤病毒治疗胶质瘤的细胞特异性反应机制 | 患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞、U87胶质母细胞瘤细胞系 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源胶质瘤细胞培养物和U87细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1844 | 2025-10-06 |
Chronic Alcohol Consumption Enhances the Differentiation Capacity of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells into Osteoclast Precursors
2025-Jul-17, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.06.010
PMID:40683559
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研究论文 | 本研究探讨慢性酒精消费如何增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力 | 首次在非人灵长类动物模型中揭示慢性酒精消费通过改变HSPCs的分化倾向促进破骨细胞生成的新机制 | 研究仅使用恒河猴模型,未在人类样本中验证 | 探究慢性酒精消费对骨代谢失衡的影响机制 | 恒河猴造血干细胞和祖细胞及其分化产物 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序,光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 恒河猴模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1845 | 2025-10-06 |
Inflammatory, Functional, and Compositional Changes of the Uterine Immune Microenvironment in a Lymphangioleiomyomatosis Mouse Model
2025, Journal of cellular immunology
DOI:10.33696/immunology.7.227
PMID:40893807
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术探究淋巴管平滑肌瘤病小鼠模型中子宫免疫微环境的炎症、功能和组成变化 | 首次在子宫特异性Tsc2基因敲除小鼠模型中揭示子宫自然杀伤细胞功能失调促进LAMCore细胞肺转移的新机制 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究淋巴管平滑肌瘤病中子宫免疫微环境变化与肿瘤细胞转移的关系 | 子宫特异性Tsc2基因敲除小鼠模型中的子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, ELISA, 流式细胞术, 免疫组化, 功能实验 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质浓度数据, 细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1846 | 2025-10-06 |
Deciphering cellular heterogeneity and pathway dynamics in urinary samples: a UMAP-Based approach to understanding acute kidney injury
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573469
PMID:40900831
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研究论文 | 本研究通过UMAP分析尿液单细胞RNA测序数据,揭示急性肾损伤中的细胞异质性和ECM相关通路变化 | 首次在AKI尿液样本中应用UMAP分析细胞异质性,并发现MAPK1在ECM通路中的关键调控作用 | 使用公开数据集,样本量有限,需要进一步实验验证临床意义 | 探索急性肾损伤尿液样本中的细胞组成和基因表达模式 | AKI和非AKI患者的尿液单核细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | UMAP | 单细胞基因表达数据 | 公开数据集GSE180595中的AKI和非AKI患者尿液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1847 | 2025-10-06 |
PI3 as a Common Hub Gene Linking Atopic Dermatitis and Ulcerative Colitis Through Immune Cell Recruitment Mechanisms
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527507
PMID:40901026
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析发现PI3是连接特应性皮炎和溃疡性结肠炎的关键枢纽基因,揭示了两种疾病共享的免疫细胞招募机制 | 首次通过多组学分析识别PI3作为AD和UC的共同枢纽基因,并验证其在免疫细胞招募中的核心作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索特应性皮炎和溃疡性结肠炎之间的共同发病机制和分子连接 | 特应性皮炎和溃疡性结肠炎患者样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎,溃疡性结肠炎 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 机器学习算法,WGCNA,PPI网络分析 | 基因表达数据 | 来自GSE121212和GSE75214数据集的样本 | NA | RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
1848 | 2025-10-06 |
Tumor associated neutrophils promote prostate cancer progression by mediating neutrophil trap secretion through PSMA1- NF-κB-HIF-1α signaling axis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1467357
PMID:40901472
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研究论文 | 本研究通过整合临床数据分析、机器学习模型和单细胞测序技术,揭示了肿瘤相关中性粒细胞通过PSMA1-NF-κB-HIF-1α信号轴介导中性粒细胞陷阱分泌促进前列腺癌进展的新机制 | 首次发现PSMA1-NF-κB-HIF-1α信号轴调控中性粒细胞陷阱形成的新机制,并建立了基于6个基因的前列腺癌预后预测模型 | 回顾性研究设计,样本量未明确说明,需要在更大规模的前瞻性研究中验证 | 探索肿瘤相关中性粒细胞在前列腺癌进展中的作用机制并建立预后预测模型 | 前列腺癌患者临床数据、前列腺癌类器官模型 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、LASSO回归分析、机器学习、多变量回归分析、反卷积算法 | LASSO回归、机器学习模型 | 临床数据、基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1849 | 2025-10-06 |
Elevated THOC5 expression in liver cancer and its implications for tumor progression and therapeutic response
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1596120
PMID:40901498
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研究论文 | 本研究探讨THOC5基因在多种癌症中的表达及其在肝细胞癌中的预后价值和治疗意义 | 首次系统分析THOC5在多种癌症中的表达模式,揭示其在肝细胞癌中的预后价值及与免疫治疗反应的关系 | 主要依赖公共数据集和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 研究THOC5基因在癌症中的表达特征、预后价值及治疗意义 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(LIHC) | 癌症生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 免疫组化, 蛋白质组分析, 伤口愈合实验, Transwell迁移实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 公共数据集中的多种癌症样本,肝细胞癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | NA |
1850 | 2025-10-06 |
Uncovering key biomarkers, potential therapeutic targets and development of deep learning model in heart failure
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0330780
PMID:40901835
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研究论文 | 通过生物信息学分析和深度学习模型识别心力衰竭的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 结合多种生物信息学方法识别出四个关键基因,并首次开发基于卷积神经网络的诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索心力衰竭的分子机制并开发诊断模型 | 心力衰竭相关基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析, 单细胞RNA测序, 分子对接 | CNN | 基因表达数据 | 公共数据库中的心力衰竭相关样本 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
1851 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Integration with Machine Learning and Molecular Docking Reveals Crosstalk Mechanisms and Drug Candidates in Metastatic Melanoma and Vitiligo
2025, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S533281
PMID:40904412
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研究论文 | 本研究通过多组学整合与机器学习方法揭示了转移性黑色素瘤与白癜风之间的相互作用机制并筛选潜在治疗药物 | 首次系统阐明转移性黑色素瘤与白癜风之间的遗传互作机制,建立基于枢纽基因的预后模型并筛选靶向治疗化合物 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 阐明转移性黑色素瘤与白癜风的相互作用机制并开发个性化治疗方案 | 转移性黑色素瘤和白癜风相关基因及患者数据 | 机器学习 | 黑色素瘤,白癜风 | 差异表达分析,WGCNA,单细胞RNA测序,分子对接 | 机器学习算法,AUCell算法,CellChat分析 | 基因表达数据,单细胞数据 | 来自GEO和TCGA数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1852 | 2025-10-06 |
Exploring immunological alterations of B cells in peripheral immunity via single-cell RNA sequencing: insights into primary membranous nephropathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1622395
PMID:40904455
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序探索原发性膜性肾病患者外周免疫中B细胞的免疫学改变 | 首次在单细胞水平揭示PMN患者B细胞的异质性和功能多样性,发现亚群0浆细胞和B10调节性B细胞在疾病发病机制中的独特作用 | 样本量较小(6例患者和3例健康对照),需要更大规模研究验证发现 | 探索原发性膜性肾病中B细胞的免疫致病机制 | 原发性膜性肾病患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例PMN患者和3例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1853 | 2025-10-06 |
From trash to treasure: tumor draining lymph nodes as a multi-omics goldmine in cancer therapy
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1636942
PMID:40904508
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综述 | 探讨肿瘤引流淋巴结在癌症治疗中的双重角色及其多组学研究价值 | 提出“淋巴结多模态保护研究(LNMPR)”概念,强调通过整合空间转录组学、单细胞分析等多组学技术解析淋巴结免疫动态 | NA | 系统梳理肿瘤引流淋巴结生物学功能的演变历程及其在癌症治疗中的临床意义 | 肿瘤引流淋巴结(TDLNs) | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 空间转录组学, 单细胞分析, 成像技术 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
1854 | 2025-10-06 |
SPINK1 facilitates tumor progression via the EGFR/JAK/STAT3 axis in oral squamous cell carcinoma: insights from single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1585277
PMID:40904507
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示SPINK1通过EGFR/JAK/STAT3轴促进口腔鳞状细胞癌进展的分子机制 | 首次在单细胞水平阐明SPINK1在OSCC中的双重作用机制,包括肿瘤发生和免疫调节功能 | 未明确说明样本数量和具体实验平台细节 | 阐明SPINK1在口腔鳞状细胞癌中的功能作用和分子机制 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞系 | 单细胞转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫印迹, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1855 | 2025-10-06 |
An immune-focused supplemental alignment pipeline captures information missed from dominant single-cell RNA-seq analyses, including allele-specific MHC-I regulation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1596760
PMID:40861433
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研究论文 | 开发了一种名为nimble的补充比对工具,用于捕获传统单细胞RNA-seq分析中遗漏的免疫相关信息 | 通过自定义基因空间和可定制评分标准,能够恢复标准分析中丢失的复杂免疫基因数据,包括等位基因特异性MHC-I调控 | NA | 提高单细胞RNA-seq数据分析的准确性和完整性,特别关注免疫相关基因 | 单细胞RNA-seq数据中的免疫基因表达,包括主要组织相容性复合体和杀伤细胞免疫球蛋白样受体 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA-seq, 伪比对 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
1856 | 2025-10-06 |
Single-cell analyses reveal that monocyte gene expression profiles influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2024-Nov-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.12.623270
PMID:39605411
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞基因表达谱影响急性治疗队列中HIV-1病毒库大小 | 首次通过无偏倚高通量单细胞RNA测序揭示单核细胞基因表达与HIV-1病毒库大小的负相关关系 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 研究宿主基因表达差异是否调节抑制性ART期间HIV-1病毒库大小 | 急性感染期开始ART治疗的HIV-1感染者外周血单核细胞 | 单细胞基因组学 | 艾滋病 | 单细胞RNA测序,完整前病毒DNA检测 | NA | 单细胞基因表达数据 | 14名主要队列参与者 + 38名独立验证队列参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1857 | 2025-10-06 |
Liquid Biopsy for Proliferative Diabetic Retinopathy: Single-Cell Transcriptomics of Human Vitreous Reveals Inflammatory T-Cell Signature
2024 Nov-Dec, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2024.100539
PMID:39220810
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析增生性糖尿病视网膜病变患者玻璃体液,揭示炎症性T细胞特征 | 首次在疾病状态下对人类玻璃体进行单细胞转录组表征,发现PDR玻璃体主要由T细胞组成 | 样本量较小(5例患者6只眼睛),为病例系列研究 | 通过阐明PDR患者玻璃体的单细胞图谱,识别可靶向的细胞类型和相应信号通路 | 接受玻璃体切除术的PDR患者的玻璃体和外周血样本 | 数字病理 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例成人患者(6只眼睛)的玻璃体细胞和外周血单核细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | Chromium 10x | 基于液滴的单细胞RNA测序平台 |
1858 | 2025-10-06 |
MultiSC: a deep learning pipeline for analyzing multiomics single-cell data
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae492
PMID:39376034
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研究论文 | 提出了一种名为MultiSC的深度学习流程,用于分析多组学单细胞数据 | 开发了首个能够有效整合三种组学数据(基因表达、染色质可及性、转录因子蛋白表达)的多组学单细胞分析流程 | NA | 解决多组学单细胞数据整合分析工具缺乏的问题 | 多组学单细胞数据 | 机器学习 | NA | NEAT-seq | 多模态约束自编码器, 矩阵分解模型, 多元线性回归 | 多组学数据(基因表达、染色质可及性、蛋白表达) | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
1859 | 2025-10-06 |
The choroid plexus synergizes with immune cells during neuroinflammation
2024-Sep-05, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2024.07.002
PMID:39089253
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研究论文 | 本研究通过活体双光子成像和单细胞转录组学揭示了脉络丛在神经炎症中与免疫细胞协同作用的机制 | 首次发现脉络丛上皮细胞会短暂特化以滋养免疫细胞,并协调其招募、存活和分化,同时调控紧密连接以控制血脑屏障通透性 | 研究使用LPS诱导的脑膜炎小鼠模型,可能与人类疾病存在物种差异 | 阐明脉络丛在神经炎症调控中的分子机制 | 清醒小鼠的脉络丛组织和免疫细胞 | 神经科学 | 脑膜炎 | 纵向双光子成像, 单细胞转录组学 | LPS诱导的脑膜炎小鼠模型 | 影像数据, 转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1860 | 2025-10-06 |
HA-1-targeted T-cell receptor T-cell therapy for recurrent leukemia after hematopoietic stem cell transplantation
2024-09-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024105
PMID:38683966
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研究论文 | 本研究评估了靶向HA-1抗原的T细胞受体T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的安全性和可行性 | 首次开发针对次要组织相容性抗原HA-1的TCR-T疗法用于移植后白血病复发治疗 | 研究样本量较小(9例患者),且非为评估疗效而设计 | 评估HA-1 TCR-T细胞疗法在造血干细胞移植后复发白血病患者中的可行性和安全性 | 造血干细胞移植后复发白血病和髓系肿瘤患者 | 细胞治疗 | 白血病 | 单细胞RNA测序,T细胞受体基因转移 | NA | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 9例造血干细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |