单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 18521 - 18540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18521 | 2024-08-08 |
PCSK9, a novel immune and ferroptosis related gene in abdominal aortic aneurysm neck
2023-04-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-33287-9
PMID:37055467
|
研究论文 | 研究探讨了PCSK9基因在腹主动脉瘤颈部的作用及其与免疫检查点和铁死亡相关基因的关联 | 首次发现PCSK9在腹主动脉瘤颈部的高表达，并揭示了其与免疫检查点和铁死亡相关基因的相互作用 | 研究仅基于GSE47472和GSE164678两个数据集，样本量相对较小 | 探究PCSK9在腹主动脉瘤颈部的作用及其潜在机制 | PCSK9基因在腹主动脉瘤颈部的表达及其与免疫检查点和铁死亡相关基因的关系 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 14名腹主动脉瘤患者和8名捐赠者的数据集，以及CaCl诱导的腹主动脉瘤样本的单细胞RNA测序数据 |
| 18522 | 2024-08-08 |
Hpgd affects the progression of hypoxic pulmonary hypertension by regulating vascular remodeling
2023-Apr-13, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-023-02401-y
PMID:37055764
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，探讨Hpgd基因在低氧性肺动脉高压（HPH）中的调控作用及其对血管重塑的影响。 | 首次揭示Hpgd基因在HPH中的调控作用，并通过实验验证其对肺动脉内皮细胞增殖、凋亡、粘附和血管生成能力的影响。 | 研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的动物模型实验来验证Hpgd在HPH中的作用。 | 探讨Hpgd基因在低氧性肺动脉高压中的作用及其对血管重塑的调控机制。 | Hpgd基因在低氧性肺动脉高压中的作用及其对肺动脉内皮细胞的影响。 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 523个关键基因通过单细胞测序数据识别，41个关键基因通过批量RNA测序数据识别 |
| 18523 | 2024-08-08 |
Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis
2023-Apr-13, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222
PMID:37060557
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了HIV感染者外周血单个核细胞的转录变化 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了HIV感染对免疫细胞转录变化的影响 | NA | 研究HIV感染对免疫细胞转录变化的影响 | HIV感染者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自HIV感染者的外周血单个核细胞 |
| 18524 | 2024-08-08 |
Coronary Artery Disease Risk Gene PRDM16 is Preferentially Expressed in Vascular Smooth Muscle Cells and a Potential Novel Regulator of Smooth Muscle Homeostasis
2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.03.535461
PMID:37066230
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研究论文 | 本研究通过分析增强子组蛋白标记H3K27ac ChIP-seq数据，发现冠状动脉疾病风险基因PRDM16在血管平滑肌细胞中优先表达，并可能作为平滑肌细胞稳态的新调控因子。 | 首次揭示了PRDM16在血管疾病进展中的未知功能，并证实其在血管平滑肌细胞中的优先表达及其对平滑肌细胞稳态的调控作用。 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，未来需要进一步研究PRDM16在病理条件如动脉粥样硬化中的作用。 | 通过筛选超级增强子调控的转录因子，识别血管平滑肌细胞稳态的新调控因子。 | 血管平滑肌细胞及其在冠状动脉疾病中的表型转换。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | ChIP-seq, RNA-seq, qRT-PCR, 蛋白质印迹 | NA | 序列数据 | 包括多个动脉组织样本、Prdm16 SMC特异性敲除小鼠及主动脉组织样本。 |
| 18525 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory macrophages impair skeletal muscle regeneration in ischemic-damaged limbs by inducing precocious differentiation of satellite cells
2023-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.01.535211
PMID:37066299
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了慢性肢体威胁性缺血（CLTI）中骨骼肌再生失败的关键机制，发现缺血损伤组织中富含促炎性巨噬细胞，并揭示了肌肉卫星细胞（MuSCs）的过早分化及其与炎症微环境的细胞间信号交流缺陷。 | 首次提供了来自CLTI患者和鼠模型的骨骼肌单细胞转录组图谱，强调了巨噬细胞和炎症在调节CLTI中肌肉再生中的关键作用。 | NA | 探讨慢性肢体威胁性缺血中骨骼肌再生失败的关键机制。 | 来自CLTI患者和鼠模型的骨骼肌组织。 | NA | 外周动脉疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 来自相同CLTI患者的缺血和非缺血肌肉组织，以及鼠CLTI模型。 |
| 18526 | 2024-08-08 |
Molecular Physiological Evidence for the Role of Na+-Cl- Co-Transporter in Branchial Na+ Uptake in Freshwater Teleosts
2023-Apr-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076597
PMID:37047570
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研究论文 | 本研究通过活体检测平台（扫描离子选择电极技术，SIET）揭示了淡水硬骨鱼鳃中Na-Cl共转运蛋白（Ncc）在Na吸收中的作用 | 首次通过单细胞转录组分析和免疫荧光技术鉴定了斑马鱼鳃中表达Ncc2的细胞为特定类型的离子细胞（NCC离子细胞），并证明了长期低Na淡水暴露下斑马鱼鳃中Ncc2表达和NCC离子细胞数量的增加及鳃Na吸收能力的增强 | 由于鳃功能测定的局限性，关于Ncc在鳃Na吸收中的作用仍缺乏令人信服的分子生理学证据 | 揭示鳃中Ncc在Na吸收中的作用 | 淡水硬骨鱼的鳃 | 生理学 | NA | 扫描离子选择电极技术（SIET） | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼 |
| 18527 | 2024-08-08 |
Single cell transcriptomics reveals reduced stress response in stem cells manipulated using localized electric fields
2023-Apr, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2023.100601
PMID:37063248
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了批量电穿孔和局部电穿孔对小鼠神经干细胞基因表达的影响 | 发现局部电穿孔不会导致广泛的细胞死亡或激活细胞应激反应途径，适合多日输送协议 | NA | 探讨批量电穿孔和局部电穿孔对敏感干细胞生理的影响 | 小鼠神经干细胞的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18528 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptome atlas of the maturing zebrafish telencephalon
2023-04, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277278.122
PMID:37072188
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研究论文 | 本文通过综合分析约64,000个单细胞转录组数据，描绘了斑马鱼端脑从幼体到成体的九种主要神经细胞类型及其标记基因 | 发现了斑马鱼与小鼠神经细胞类型的保守性和缺失性，以及在成年前脑中显著扩张的几种细胞类型 | NA | 揭示斑马鱼端脑神经细胞类型的转录特征及其发育时间线 | 斑马鱼端脑的神经细胞类型及其发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约64,000个细胞，来自6天、15天和成体的端脑 |
| 18529 | 2024-08-08 |
Intratumoral tertiary lymphoid structure (TLS) maturation is influenced by draining lymph nodes of lung cancer
2023-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-005539
PMID:37072348
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研究论文 | 研究探讨了肺肿瘤引流淋巴结（TDLN）对非小细胞肺癌（NSCLC）内肿瘤内三级淋巴结构（TLS）成熟的影响 | 首次研究了肿瘤引流淋巴结与肿瘤内三级淋巴结构成熟之间的关系 | 研究样本仅限于接受手术的616名患者，可能无法代表所有NSCLC患者的情况 | 探讨肿瘤引流淋巴结对肿瘤内三级淋巴结构成熟的影响及其机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学，多重免疫荧光和流式细胞术 | Cox比例风险回归模型，逻辑回归模型 | 组织切片 | 616名接受手术的非小细胞肺癌患者 |
| 18530 | 2024-08-08 |
Identification of distinct tumor cell patterns with single-cell RNA sequencing integrating primary lung adenocarcinoma and brain metastasis tumor
2023-Mar-31, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-107
PMID:37057123
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，整合原发性肺腺癌和脑转移瘤的数据，分析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 本研究首次整合了原发性肺腺癌和脑转移瘤的单细胞RNA测序数据，揭示了脑转移瘤细胞的高度异质性及其潜在的恶性细胞来源 | 研究样本量较小，仅包括8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在解析肿瘤细胞的异质性并识别潜在的治疗靶点 | 肺腺癌及其脑转移瘤的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8名未经治疗的肺腺癌脑转移患者及10个原发性肺腺癌样本及其匹配的正常组织 |
| 18531 | 2024-08-05 |
Single-Cell Isolation Microfluidic Chip Based on Thermal Bubble Micropump Technology
2023-Mar-30, Sensors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/s23073623
PMID:37050683
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研究论文 | 本研究介绍了一种基于热气泡微泵技术的微流体芯片，用于单细胞的分离。 | 该方法通过匹配流道的流阻实现单细胞分离，无需注射泵和蠕动泵，大大简化了操作流程。 | 目前单细胞的捕获率约为75%，尚未实现100%的捕获率。 | 研究旨在开发一种高通量的单细胞分离技术。 | 研究对象为单细胞，包括细胞悬浮液和聚苯乙烯微珠。 | 数字病理学 | NA | 热气泡微泵技术 | 微流体芯片 | 细胞悬液、微珠 | 多个单细胞和聚苯乙烯微珠样本 |
| 18532 | 2024-08-05 |
Data-driven microscopy allows for automated context-specific acquisition of high-fidelity image data
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100419
PMID:37056378
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研究论文 | 本文介绍了一种数据驱动显微镜技术，可以自动获取背景特定的高保真图像数据。 | 提出了一种数据驱动显微镜(DDM)框架，结合实时的人群特征化，能够根据人群背景进行高保真成像。 | 尚未明确提及限制 | 研究目标是提高显微成像的质量和可重复性，特别是在样本人群背景下。 | 研究对象为细胞迁移和感染过程中感兴趣的事件。 | 数字病理学 | NA | 显微镜成像 | NA | 图像 | NA |
| 18533 | 2024-08-08 |
A robust and efficient microvascular isolation method for multimodal characterization of the mouse brain vasculature
2023-03-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100431
PMID:37056377
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research paper | 本文开发了一种快速简单的脑血管片段分离方法，无需转基因报告基因，适用于多种实验模式 | 该方法能够快速简单地分离脑血管片段，适用于单细胞分析、蛋白质印迹和原代细胞培养等多种实验模式 | NA | 研究与疾病相关的脑血管变化 | 小鼠脑血管 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 22,515个细胞 |
| 18534 | 2024-08-05 |
Epi-Impute: Single-Cell RNA-seq Imputation via Integration with Single-Cell ATAC-seq
2023-Mar-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24076229
PMID:37047200
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Epi-Impute的计算方法，用于通过整合表达和编程组学数据来解决单细胞RNA-seq数据中的丢失现象 | Epi-Impute利用单细胞ATAC-seq数据作为额外的信息来源，以减少丢失现象的数量，特别适用于稀疏的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 提出一种新的方法来改进单细胞RNA-seq数据的缺失值填补 | 单细胞RNA-seq数据和单细胞ATAC-seq数据 | 数字病理学 | NA | NA | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 18535 | 2024-08-08 |
ERS International Congress 2022: highlights from the Basic and Translational Science Assembly
2023-Mar, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00561-2022
PMID:37077558
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综述 | 本文综述了2022年欧洲呼吸学会国际大会中基础与转化科学会议的亮点内容 | 提出了人类肺细胞图谱(HLCA)作为健康人类肺部的新参考点，并结合单细胞RNA测序和空间数据，发现了新的细胞类型/状态和生态位 | NA | 探讨呼吸事件从出生到老年对气候变化相关空气质量变化的影响，以及转化研究中确定的哮喘新治疗靶点和免疫调节机制 | 呼吸事件、气候变化、空气质量、肺部疾病、哮喘治疗 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 空间数据 | NA |
| 18536 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of platelets from patients with periodontitis and diabetes
2023-Feb, Research and practice in thrombosis and haemostasis
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.rpth.2023.100099
PMID:37063767
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研究论文 | 本研究分析了牙周炎患者和同时患有牙周炎与2型糖尿病患者的血小板表达谱，以探讨牙周炎诱导的血小板转录组特征及糖尿病的修饰效应 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析了牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板转录组，揭示了血小板在疾病状态下的分子变化 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨牙周炎及牙周炎合并2型糖尿病对血小板转录组的影响 | 牙周炎患者、牙周炎合并2型糖尿病患者的血小板 | NA | 牙周炎, 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11名健康供体，10名牙周炎患者，6名牙周炎合并2型糖尿病患者 |
| 18537 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling of GP2-enriched pancreatic progenitors to simultaneously create acinar, ductal, and endocrine organoids
2023, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.78323
PMID:37064874
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研究论文 | 本文对富含GP2的胰腺祖细胞进行单细胞分析，以同时创建腺泡、导管和内分泌类器官 | 引入了一种新型的胰腺祖细胞分化平台，采用综合化合物筛选和先进的计算工具，提高了多能性祖细胞的产生效率 | 没有明确提到实验的限制 | 研究人类多能干细胞向多能胰腺祖细胞的转化，探讨胰腺不同谱系的生成 | GP2富集的胰腺祖细胞，研究其多谱系潜力和细胞间通讯信号 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种PP亚群体的细胞，具体样本数量未提及 |
| 18538 | 2024-08-05 |
Corrigendum: Single-cell RNA-seq analysis reveals cellular functional heterogeneity in dermis between fibrotic and regenerative wound healing fates
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175360
PMID:37063891
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更正 | 该文章更正了之前关于单细胞RNA测序分析的内容 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18539 | 2024-08-05 |
TNFα aggravates detrimental effects of SARS-CoV-2 infection in the liver
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1151937
PMID:37063909
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研究论文 | 本文分析了TNFα在SARS-CoV-2感染中对肝脏的有害影响 | 研究发现肝脏中TNFα的表达增加与病人死亡率升高相关 | 当前尚不清楚这些免疫介质在SARS-CoV-2感染过程中对患者生存的具体影响 | 探讨在SARS-CoV-2感染过程中肝脏中TNFα信号的作用及其对患者生存的影响 | 对45名因SARS-CoV-2感染去世患者进行尸检分析 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 患者生物样本数据 | 45名因SARS-CoV-2感染去世的患者 |
| 18540 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing depicts metabolic changes in children with aplastic anemia
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1075408
PMID:37064094
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了儿童再生障碍性贫血的代谢变化 | 该研究首次揭示再生障碍性贫血患者T淋巴细胞和自然杀伤细胞的代谢异常路径 | 研究中没有提及样本的具体数量和来源的详细信息 | 探讨再生障碍性贫血中免疫细胞的代谢异常及其可能的治疗策略 | 儿童再生障碍性贫血患者及健康供体 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |