单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 18521 - 18540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18521 | 2024-08-07 |
scDALI: modeling allelic heterogeneity in single cells reveals context-specific genetic regulation
2022-01-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02593-8
PMID:34991671
|
研究论文 | 本文开发了scDALI计算框架，结合细胞状态信息与单细胞测序数据的等位基因定量，以表征细胞状态特异性的遗传效应 | scDALI框架能够整合细胞状态信息与单细胞测序数据的等位基因定量，从而捕捉细胞类型和状态间的遗传变异功能影响多样性 | NA | 研究遗传变异在不同细胞类型和状态中的功能影响 | 果蝇胚胎发育中的scATAC-seq数据和人类iPSCs分化中的scRNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 计算框架 | 测序数据 | 果蝇胚胎和人类iPSCs的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18522 | 2024-08-07 |
Mammalian Digit Tip Regeneration: Moving from Phenomenon to Molecular Mechanism
2022-01-04, Cold Spring Harbor perspectives in biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a040857
PMID:34312249
|
综述 | 本文综述了哺乳动物指尖再生的当前知识状态，讨论了胚芽的来源和形成以及单细胞RNA测序带来的分子标记和细胞组成的最新见解 | 探讨了指尖再生的分子机制，并讨论了已知的分子途径在肢体发育中如何为指尖再生研究提供信息 | NA | 深入理解哺乳动物指尖再生的分子机制 | 指尖再生的胚芽结构及其分子标记和细胞组成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18523 | 2024-08-07 |
Sensei: how many samples to tell a change in cell type abundance?
2022-Jan-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04526-5
PMID:34983369
|
research paper | 本文开发了一种名为Sensei的新方法，用于确定在单细胞研究中检测细胞类型丰度变化所需的样本数量和细胞数量 | Sensei扩展了t检验并使用beta-二项分布模型来模拟细胞丰度，为确定样本大小提供了数学准确性和实用指南 | NA | 解决在受控研究中确定检测细胞类型丰度变化所需样本大小的统计挑战 | 细胞类型丰度变化 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing, mass cytometry | beta-binomial distribution | single-cell data | 超过20种细胞类型和30种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 18524 | 2024-08-07 |
Dexamethasone modulates immature neutrophils and interferon programming in severe COVID-19
2022-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-021-01576-3
PMID:34782790
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和血浆蛋白质组学技术，探讨了地塞米松在严重COVID-19中对未成熟中性粒细胞和干扰素编程的调节作用 | 发现COVID-19相关ARDS中存在由干扰素和前列腺素信号调节的特定中性粒细胞状态，地塞米松能改变这些中性粒细胞状态并重塑细胞间相互作用 | 研究主要集中在男性患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示地塞米松在严重COVID-19中的作用机制，为开发针对性的免疫疗法提供依据 | 严重COVID-19患者中的中性粒细胞及其对地塞米松的反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，血浆蛋白质组学 | NA | RNA序列，蛋白质 | 具体样本数量未在摘要中明确 | NA | NA | NA | NA |
| 18525 | 2024-08-07 |
Long non-coding RNAs (lncRNAs) NEAT1 and MALAT1 are differentially expressed in severe COVID-19 patients: An integrated single-cell analysis
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0261242
PMID:35007307
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了长非编码RNA NEAT1和MALAT1在重症COVID-19患者中的差异表达情况 | 首次综合分析了来自重症和轻症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据，揭示了NEAT1和MALAT1在不同病情中的差异表达 | 研究仅限于特定的细胞类型和基因，可能需要更广泛的细胞和基因分析以全面理解其在COVID-19中的作用 | 揭示重症与轻症COVID-19患者之间的关键炎症差异因子 | 长非编码RNA NEAT1和MALAT1在COVID-19患者中的表达情况 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括来自重症和轻症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗细胞和外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18526 | 2024-08-07 |
Optimization of Long-Term Human iPSC-Derived Spinal Motor Neuron Culture Using a Dendritic Polyglycerol Amine-Based Substrate
2022 Jan-Dec, ASN neuro
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/17590914211073381
PMID:35023784
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于树枝状聚甘油胺（dPGA）基质的方法，用于延长人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的脊髓运动神经元（MNs）的长期培养 | 使用dPGA涂层培养皿，使得MNs更适合长期研究细胞活力、分子身份和自发网络电生理活动 | 目前hiPSC衍生的MN应用常受限于我们监测MN形态、存活和其他功能特性的能力 | 改善hiPSC衍生的MN的长期培养条件，以促进人类MN生物学和疾病的研究 | 人诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的脊髓运动神经元（MNs） | NA | 脊髓性肌萎缩症，肌萎缩侧索硬化症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18527 | 2024-08-07 |
An atlas of dynamic peripheral blood mononuclear cell landscapes in human perioperative anaesthesia/surgery
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.663
PMID:35061932
|
研究论文 | 本研究探讨了围手术期麻醉对患者免疫细胞动态变化的影响，通过单细胞测序技术分析了外周血单个核细胞（PBMCs）的响应。 | 首次报道了围手术期麻醉/手术对循环免疫细胞时间表型的影响，并提供了单细胞层面的解决方案。 | NA | 研究围手术期麻醉对患者免疫系统的具体影响，特别是免疫细胞的动态变化。 | 外周血单个核细胞（PBMCs）及其在围手术期对麻醉的响应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | PBMCs样本在麻醉和手术前1天、麻醉后0小时、24小时和48小时采集。 | NA | NA | NA | NA |
| 18528 | 2024-08-07 |
Evaluation of deep convolutional neural networks for in situ hybridization gene expression image representation
2022, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0262717
PMID:35073334
|
研究论文 | 本文评估了深度卷积神经网络在原位杂交基因表达图像表示中的应用 | 提出了一种对比学习任务——基因重识别，以计算原位杂交图像的表示，并在模型中实现了显著的改进 | NA | 更好地捕捉人类大脑皮层中基因表达的复杂模式 | 原位杂交图像中的基因表达强度和模式 | 计算机视觉 | 精神分裂症 | 深度卷积神经网络 | CNN | 图像 | 约1000个基因的数据集，来自42个个体；第二个数据集包含78个基因，来自53个个体 | NA | NA | NA | NA |
| 18529 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling of T and B cell repertoires following SARS-CoV-2 mRNA vaccine
2021-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153201
PMID:34935643
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和功能性检测，比较了接种两剂SARS-CoV-2 mRNA疫苗后与无症状康复者之间的体液和细胞免疫反应 | 本研究发现接种疫苗后富集了针对刺突蛋白的B细胞、激活的CD4+ T细胞以及强大的抗原特异性多功能CD4+ T细胞反应 | 尽管观察到克隆扩增的CD8+ T细胞，但其反应相对较弱且变化较大 | 探究接种SARS-CoV-2 mRNA疫苗后的转录和免疫谱变化 | T细胞和B细胞的免疫谱 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 18530 | 2024-08-07 |
Volumetric compression develops noise-driven single-cell heterogeneity
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2110550118
PMID:34916290
|
研究论文 | 本文研究了物理压缩对非小细胞肺癌细胞异质性的影响，并通过单细胞转录组测序和单分子荧光原位杂交技术进行了验证 | 首次揭示了物理微环境对单细胞异质性的贡献，并展示了机械刺激通过改变转录动力学影响细胞命运决定的机制 | NA | 探讨物理微环境对单细胞异质性的影响及其机制 | 非小细胞肺癌细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18531 | 2024-08-07 |
Impact of chemotherapy and immunotherapy on the composition and function of immune cells in COVID-19 convalescent with gynecological tumors
2021-12-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203739
PMID:34862879
|
研究论文 | 研究了化疗和免疫治疗对COVID-19康复者中妇科肿瘤患者免疫细胞组成和功能的影响 | 发现COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞分子特征与无肿瘤的COVID-19患者相似，且抗PD-L1治疗能显著增强NK细胞和T细胞的细胞毒性评分及T细胞的克隆扩增 | 样本量较小，仅包括3名健康捐赠者、4名COVID-19患者和4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | 探讨COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫记忆及其对化疗和免疫治疗的响应 | COVID-19康复者中妇科肿瘤患者的免疫细胞 | NA | 妇科肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本 | 3名健康捐赠者，4名COVID-19患者，4名COVID-19合并妇科肿瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18532 | 2024-08-07 |
Clinical and therapeutic relevance of cancer-associated fibroblasts
2021-12, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00546-5
PMID:34489603
|
综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞（CAFs）在肿瘤发展和治疗中的临床相关性和治疗意义 | 通过单细胞RNA测序和新型小鼠模型，增加了对CAF多样性的理解 | 不同CAF群体的上下文依赖角色及其可互换的可塑性仍大多未知 | 探讨CAFs在癌症进展中的作用及其作为预后因子和治疗靶点的价值 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的复杂相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18533 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals B cell-related molecular biomarkers for Alzheimer's disease
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00714-8
PMID:34880454
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自4名阿尔茨海默病（AD）患者和2名正常对照的外周血单个核细胞（PBMCs），探索了AD患者PBMCs中的差异细胞亚群，并发现了B细胞的显著减少。 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了与AD进展相关的B细胞分子标志物，并通过功能实验验证了B细胞在AD早期阶段的作用。 | 研究样本量较小，且仅限于AD患者和正常对照，未来研究需要扩大样本量并考虑更多疾病阶段和人群。 | 探索阿尔茨海默病中与B细胞相关的分子标志物，以促进AD进展的临床识别。 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）和B细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4名AD患者（早期2名，晚期2名）和2名正常对照，以及43名AD患者和41名正常受试者 | NA | NA | NA | NA |
| 18534 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome atlas of human mesenchymal stem cells exploring cellular heterogeneity
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.650
PMID:34965030
|
研究论文 | 本研究利用大规模并行多重单细胞RNA测序技术，构建了超过13万个单个间充质干细胞的转录组图谱，以评估其异质性 | 首次构建了人类间充质干细胞的综合单细胞图谱，并发现了七个组织特异性和五个保守的MSC亚群，这些亚群具有不同的基因表达特征 | NA | 探索间充质干细胞的细胞异质性，以促进基于MSC的治疗效果的潜在改进 | 人类间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 超过13万个单个间充质干细胞转录组，来自多个组织和供体，包括正常骨髓（3个）、脂肪组织（3个）、脐带（2个）和真皮（3个） | NA | NA | NA | NA |
| 18535 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA Seq reveals cellular landscape-specific characteristics and potential etiologies for adolescent idiopathic scoliosis
2021-Dec, JOR spine
IF:3.4Q1
DOI:10.1002/jsp2.1184
PMID:35005449
|
研究论文 | 本研究通过高通量单细胞RNA测序技术，比较了青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观，揭示了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断，并通过细胞通信分析提供了骨细胞和软骨细胞分化功能障碍的可能发病机制。 | 首次通过单细胞分析揭示了AIS患者与健康受试者在细胞状态上的差异，并发现了AIS中特定MSC和CPC集群的分化中断。 | NA | 探讨青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者在脊椎松质骨组织的单细胞水平细胞景观差异及其潜在的病因。 | 青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者与健康受试者的脊椎松质骨组织。 | 数字病理学 | 青少年特发性脊柱侧弯 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | t-分布随机邻域嵌入（t-SNE） | 基因组范围的转录组数据 | AIS患者与健康受试者的脊椎松质骨组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18536 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics at subspot resolution with BayesSpace
2021-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00935-2
PMID:34083791
|
research paper | 本文介绍了BayesSpace，一种完全贝叶斯统计方法，用于增强空间转录组数据的分辨率和聚类分析 | BayesSpace利用空间邻域信息提高空间转录组数据的分辨率，并改进对组织内转录组特征的识别 | NA | 提高空间转录组数据的分辨率和聚类分析的准确性 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本的转录组特征 | digital pathology | NA | 空间转录组技术 | 贝叶斯统计方法 | 转录组数据 | 脑、黑色素瘤、浸润性导管癌和卵巢腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18537 | 2024-08-07 |
Scalable, multimodal profiling of chromatin accessibility, gene expression and protein levels in single cells
2021-10, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-00927-2
PMID:34083792
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ASAP-seq的新工具，能够在单细胞水平上同时分析染色质可及性和蛋白质水平 | ASAP-seq结合了scATAC-seq数据和多种细胞表面及细胞内蛋白质标记物的检测，以及可选的线粒体DNA捕获，实现了单细胞中三种不同模态的同步分析 | NA | 展示系统性多组学分析在揭示基因调控中心法则中染色质、RNA和表面蛋白质协调及不同变化方面的应用 | 染色质可及性、基因表达和蛋白质水平在单细胞中的变化 | 基因组学 | NA | scATAC-seq, ASAP-seq | NA | 染色质可及性数据、蛋白质标记物数据、线粒体DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18538 | 2024-08-07 |
Loss of Adam10 Disrupts Ion Transport in Immortalized Kidney Collecting Duct Cells
2021, Function (Oxford, England)
DOI:10.1093/function/zqab024
PMID:34131651
|
研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9技术敲除mCCD细胞中的Adam10基因，观察其对钠转运能力和醛固酮反应的影响 | 首次揭示了Adam10基因敲除对肾皮质集合管细胞中钠转运和细胞标记物分布的影响 | 仅限于mCCD细胞系和特定基因敲除，可能不完全代表体内情况 | 探讨Adam10基因在肾皮质集合管细胞中的功能及其对离子转运的影响 | 自永生化的肾皮质集合管细胞系mCCD | NA | NA | CRISPR-Cas9技术，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫染色图像 | 多个独立的mCCD细胞克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 18539 | 2024-08-07 |
Single-Cell Sequencing of Hepatocellular Carcinoma Reveals Cell Interactions and Cell Heterogeneity in the Microenvironment
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S338090
PMID:34992435
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本，揭示了微环境中的细胞相互作用和细胞异质性 | 本研究通过单细胞测序数据识别了新的HCC预后标志物，包括ALDOB, APOC3, APOH等10个关键基因 | NA | 旨在基于单细胞测序数据识别肝细胞癌的新预后标志物 | 肝细胞癌（HCC）样本和正常肝组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 21个HCC样本和256个正常肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18540 | 2024-08-07 |
A Single-Cell Transcriptome Profiling of Anterior Kidney Leukocytes From Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783196
PMID:35027916
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，对尼罗罗非鱼前肾中的白细胞进行了转录模式分析 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究尼罗罗非鱼前肾白细胞的异质性，并识别出多种免疫细胞亚群 | 未能根据已知的特定标记物更详细地识别髓系细胞亚群 | 揭示尼罗罗非鱼前肾白细胞的亚群及其潜在标记物 | 尼罗罗非鱼前肾中的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 11,388个前肾白细胞 | NA | NA | NA | NA |