单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27897 篇文献，本页显示第 18481 - 18500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18481 | 2024-08-05 |
A senescence-based prognostic gene signature for colorectal cancer and identification of the role of SPP1-positive macrophages in tumor senescence
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1175490
PMID:37090726
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研究论文 | 本研究构建了一种与衰老相关的结直肠癌预后模型，并探讨了SPP1阳性巨噬细胞在肿瘤衰老中的作用 | 提出了一种基于衰老相关基因的新模型，可以识别预后较差的结直肠癌患者及具有免疫抑制性肿瘤微环境 | 顺势而为的临床数据和样本的多样性可能限制了结果的推广性 | 旨在构建一个与衰老相关的结直肠癌预后模型并研究肿瘤微环境中的衰老影响 | 结直肠癌患者的转录组和临床数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序 | LASSO模型 | 转录组数据、临床数据 | NA |
| 18482 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis for cancer and biology of the pancreas: A review on recent progress
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1029758
PMID:37091793
|
综述 | 本文回顾了单细胞转录组分析在胰腺生物学和癌症研究中的最新进展 | 文章探讨了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理中的最新发现，揭示了细胞异质性和癌症组织中的新免疫靶点及分子机制 | 未提及具体的限制 | 旨在阐明单细胞分析如何推动胰腺生物学的未来研究 | 研究对象包括胰腺的健康细胞类型及癌组织 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 18483 | 2024-08-05 |
An integrated bioinformatic analysis of bulk and single-cell sequencing clarifies immune microenvironment and metabolic profiles of lung adenocarcinoma to predict immunotherapy efficacy
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1163314
PMID:37091977
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和大样本测序分析肺腺癌的免疫微环境和代谢特征，以预测免疫疗法的疗效 | 提出了一种新的方法，通过单细胞与大样本测序结合，揭示了肺腺癌的免疫微环境和代谢特征 | 研究只集中在单一类型的肺腺癌，可能无法推广到其他癌症类型 | 探索免疫微环境如何影响肺腺癌免疫疗法的疗效 | 以肺腺癌的单细胞数据和TCGA大样本数据为研究对象 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序和大样本测序 | NA | 基因组数据 | 使用TCGA大样本数据和GSE131907单细胞数据 |
| 18484 | 2024-08-05 |
RNA-seq and Single-Cell Transcriptome Analyses of TRAIL Receptors Gene Expression in Human Osteosarcoma Cells and Tissues
2023, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351231161478
PMID:37101729
|
研究论文 | 本研究探讨了人类骨肉瘤细胞中TRAIL受体基因表达的特征. | 本研究提供了TRAIL受体在骨肉瘤中的表达谱，为治疗新策略提供了新视角. | 研究仍未明确TRAIL受体的具体作用机制. | 研究骨肉瘤中TRAIL受体的表达以探索新的治疗靶点. | 主要研究人类骨肉瘤细胞和组织中的TRAIL受体. | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq和单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了人类骨肉瘤细胞和组织的样本 |
| 18485 | 2024-08-05 |
MulCNN: An efficient and accurate deep learning method based on gene embedding for cell type identification in single-cell RNA-seq data
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1179859
PMID:37082202
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研究论文 | 本研究提出了一种新型的多级卷积神经网络MulCNN，旨在通过基因嵌入方法在单细胞RNA测序数据中识别细胞类型 | MulCNN利用细胞类型特异的基因表达特征提取方法，并通过多尺度卷积来提取关键特征，过滤噪声 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别问题 | 使用各种物种的数据集进行细胞类型识别 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 多级卷积神经网络 (MulCNN) | 单细胞RNA数据 | 多物种的数据集 |
| 18486 | 2024-08-05 |
Post-ischemic inflammatory response in the brain: Targeting immune cell in ischemic stroke therapy
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1076016
PMID:37078089
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研究论文 | 这篇文章探讨了缺血性中风后大脑的炎症反应和免疫细胞的作用 | 文章创新性地运用了单细胞测序技术来探讨缺血性中风中的细胞异质性和基因表达差异 | 该研究的局限性在于未提供具体的实验数据和样本规模 | 研究缺血性中风中大脑细胞的变化及其炎症反应 | 研究对象包括神经元、免疫细胞、胶质细胞和内皮细胞等 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 18487 | 2024-08-05 |
Integrating single-cell RNA-seq and spatial transcriptomics reveals MDK-NCL dependent immunosuppressive environment in endometrial carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1145300
PMID:37081869
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研究论文 | 本研究评估了子宫内膜癌的肿瘤微环境中的细胞群体。 | 本研究揭示了子宫内膜癌（EC）细胞通过MDK-NCL信号传递对内皮细胞的恶性表型影响，以及NCL与免疫抑制活动之间的相关性。 | 无具体限制信息提供 | 评估子宫内膜癌肿瘤微环境中的细胞群体及其相互作用。 | 本研究对象为子宫内膜癌的细胞群体，包括肿瘤细胞和内皮细胞。 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | RNA-seq数据 | 涉及5个单细胞RNA-seq数据集、1个空间转录组数据集和569个RNA-seq样本 |
| 18488 | 2024-08-05 |
Cell-free circulating tumor RNAs in plasma as the potential prognostic biomarkers in colorectal cancer
2023, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2023.1134445
PMID:37091184
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研究论文 | 本文探讨了循环肿瘤RNA作为结直肠癌的潜在预后生物标志物 | 提出了一个三基因标志物组合，用于早期诊断和最小残留病检测 | 研究结果需在更大规模的样本中进行验证 | 识别结直肠癌患者中cfRNA的组织特异性贡献 | 结直肠癌患者的血浆样本和肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 结直肠癌患者的配对血浆样本和5对肿瘤样本及3个额外肿瘤样本 |
| 18489 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity in an Acral Amelanotic Melanoma After Immunotherapy Treatment
2023, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S404381
PMID:37077860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了在接受免疫治疗后的肢端无色素性黑色素瘤中的细胞异质性 | 首次描述了无色素性黑色素瘤在接受PD-L1免疫治疗后的细胞异质性 | NA | 探究免疫治疗暴露后肢端无色素性黑色素瘤的细胞异质性 | 肢端无色素性黑色素瘤细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个细胞群，包括无色素细胞群1、无色素细胞群2和色素细胞群 |
| 18490 | 2024-08-08 |
Human lymphocytes mobilized with exercise have an anti-tumor transcriptomic profile and exert enhanced graft-versus-leukemia effects in xenogeneic mice
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1067369
PMID:37077913
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研究论文 | 本文首次详细分析了运动动员的淋巴细胞的单细胞转录组，并测试了它们作为供体淋巴细胞输注（DLI）在异种移植小鼠中的有效性 | 首次详细分析了运动动员的淋巴细胞的单细胞转录组，并发现这些淋巴细胞具有抗肿瘤转录组特征，能增强移植物抗白血病效应 | 研究仅在异种移植小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 分析运动动员的淋巴细胞的单细胞转录组，并测试其在异种移植小鼠中的抗白血病效应 | 运动动员的淋巴细胞及其在异种移植小鼠中的抗白血病效应 | 免疫学 | 白血病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自健康志愿者的外周血单个核细胞（PBMCs） |
| 18491 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of multi-omics data reveals T cell exhaustion in sepsis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1110070
PMID:37077915
|
研究论文 | 本研究通过综合分析多组学数据，揭示了脓毒症中T细胞耗竭的现象 | 本研究采用了基因集富集分析（GSEA）和Limma方法来识别与脓毒症相关的重要通路，并利用TIMER资源评估免疫细胞丰度，以及使用甲基化和单细胞转录组数据来识别关键通路基因 | NA | 探索脓毒症相关的高级生物标志物，以识别与疾病相关的重要通路并评估其临床意义 | 脓毒症患者的多组学数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 基因集富集分析（GSEA），Limma，TIMER，甲基化测序，单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据，甲基化数据，单细胞转录组数据 | 脓毒症患者与健康对照组 |
| 18492 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals distinct expression patterns among genes in the mouse incisor dental pulp
2023, The International journal of developmental biology
DOI:10.1387/ijdb.220173db
PMID:37078362
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠门牙牙髓中基因的表达模式 | 揭示了SOX转录因子在间充质干细胞分化过程中的调控作用 | NA | 探讨SOX转录因子在小鼠门牙牙髓细胞分化中的表达模式 | 小鼠门牙牙髓中的基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个间充质干细胞样本 |
| 18493 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of human chondrocytes reveals cell-cell communication alterations mediated by interactive signaling pathways in osteoarthritis
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1099287
PMID:37082621
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了骨关节炎患者关节软骨组织中的细胞间通讯变化，揭示了特定信号通路在骨关节炎发病机制中的作用 | 首次通过单细胞转录组测序技术揭示了骨关节炎中软骨细胞亚型间的细胞间通讯变化，并验证了特定信号通路在其中的作用 | 研究仅基于公共数据库中的数据，未进行体内外实验验证 | 探索骨关节炎发病机制中细胞间通讯的变化 | 骨关节炎患者的关节软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 来自骨关节炎患者的关节软骨组织样本 |
| 18494 | 2024-08-08 |
Expression of OLR1 gene on tumor-associated macrophages of head and neck squamous cell carcinoma, and its correlation with clinical outcome
2023, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2023.2203073
PMID:37089448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了头颈鳞状细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞上的OLR1基因表达，并探讨了其与临床预后的关系 | 首次揭示了OLR1基因在肿瘤相关巨噬细胞上的特异性表达与头颈鳞状细胞癌不良预后的显著关联 | 研究主要基于TCGA数据库的数据，可能需要进一步的实验验证 | 探讨OLR1基因在头颈鳞状细胞癌中的表达及其对临床预后的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和OLR1基因表达 | NA | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 498个头颈鳞状细胞癌患者肿瘤样本 |
| 18495 | 2024-08-08 |
A novel molecular signature for predicting prognosis and immunotherapy response in osteosarcoma based on tumor-infiltrating cell marker genes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1150588
PMID:37090691
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤浸润细胞标记基因开发了一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 首次基于肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）标记基因开发了一个预后模型，用于骨肉瘤的预后预测和免疫治疗反应 | NA | 开发一种新的分子特征，用于预测骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 骨肉瘤的预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq），WGCNA，LASSO回归分析，SVM算法 | 风险模型 | RNA转录组数据 | 11个细胞簇和2044个TILs标记基因 |
| 18496 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals immune responses in oral lichen planus
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1182732
PMID:37090715
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和免疫组库测序技术，揭示了口腔扁平苔藓（OLP）黏膜免疫微环境的特征 | 首次通过单细胞免疫图谱分析，揭示了OLP中组织驻留记忆CD8+ T细胞的活化状态及其他免疫细胞的克隆扩增和基因配对偏好 | NA | 探究口腔扁平苔藓（OLP）的免疫反应机制 | 口腔扁平苔藓（OLP）的黏膜免疫微环境 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组库测序 | NA | 转录组 | 四个OLP活检样本及其配对的外周血单个核细胞（PBMCs），两个健康组织和三个健康PBMCs样本 |
| 18497 | 2024-08-08 |
ProgClust: A progressive clustering method to identify cell populations
2023, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2023.1183099
PMID:37091787
|
研究论文 | 提出了一种名为ProgClust的方法，用于分解细胞群并检测稀有细胞，通过聚类树表示单细胞数据，并设计了一种渐进搜索方法来选择细胞群特异性基因和聚类细胞 | ProgClust能够自动确定聚类数量，并有效地识别常见和稀有细胞，同时在真实未标记数据中揭示潜在的细胞亚群 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群和稀有细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类树 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 18498 | 2024-08-08 |
Molecular characterization of colorectal mucinous adenocarcinoma and adenocarcinoma, not otherwise specified, identified by multiomic data analysis
2023, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2023.1150362
PMID:37091868
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研究论文 | 本文利用多组学数据分析了结直肠黏液腺癌和非特定类型腺癌的分子特征 | 发现了非特定类型腺癌具有免疫活跃但暴露于缺氧微环境，而黏液腺癌细胞能保护DNA免受损伤，微环境不利于白细胞穿透内皮迁移 | NA | 探究非特定类型腺癌和黏液腺癌的分子特征及其在肿瘤微环境中的差异 | 结直肠黏液腺癌、非特定类型腺癌及正常结肠组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多组学数据分析 | NA | 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学数据 | NA |
| 18499 | 2024-08-08 |
Deciphering cell-cell interactions and communication in the tumor microenvironment and unraveling intratumoral genetic heterogeneity via single-cell genomic sequencing
2022 Jul-Dec, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2023.2185434
PMID:37105769
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）的发展、检测原理、流程及其在肿瘤研究中的应用，并探讨了其潜在的临床应用 | scRNA-seq技术提供了比传统RNA测序方法更深入的分子机制理解，揭示了肿瘤演化过程中体细胞突变和功能的变化，以及免疫细胞的浸润和激活 | NA | 理解单细胞基因表达模式，追踪异质细胞中的基因表达或突变，评估癌细胞的克隆起源，并确定不同癌细胞亚群的选择性进化 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用和通信，以及肿瘤内遗传异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18500 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals new subtypes of lens superficial tissue in humans
2023-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13477
PMID:37057399
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了人眼透镜表层组织的新亚型 | 识别了特定表达C8orf4和ADAMTSL4的透镜上皮细胞亚型，以及与上皮细胞邻近的新类型纤维细胞 | 未明确人透镜干/祖细胞在上皮细胞中的分类及其分子特征 | 探讨人眼透镜上皮细胞的亚型及其分化的分子特征 | 人眼透镜表层组织中18,596个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 18,596个细胞 |