单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 18481 - 18500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18481 | 2024-08-05 |
Enzalutamide-induced signatures revealed by epigenetic plasticity using single-cell multi-omics sequencing in prostate cancer
2023-Mar-14, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2023.02.022
PMID:36910711
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序揭示了恩杂鲁胺诱导的前列腺癌表观遗传可塑性特征 | 整合单细胞测序技术，以揭示前列腺癌对恩杂鲁胺处理的表观遗传响应，提出新的组合药物策略 | 主要用于体外细胞系模型，可能无法完全反映真实临床情况 | 旨在解码恩杂鲁胺处理下前列腺癌的表观遗传可塑性 | 前列腺癌细胞系的单细胞转座酶可接近染色质和全转录组数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞多组学测序 | NA | 基因组数据 | 七个特征基因集合的细胞群体 |
| 18482 | 2024-08-08 |
B Lymphocyte Development in the Bursa of Fabricius of Young Broilers is Influenced by the Gut Microbiota
2023-Mar-14, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.04799-22
PMID:36917000
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物群对年轻肉鸡法氏囊B淋巴细胞发育的影响 | 发现了肠道微生物群与法氏囊B细胞发育的关联，并识别出Taf1作为B细胞谱系分化的一个新关键调节因子 | 肠道微生物群介导B细胞发育及其调控机制的研究尚不充分 | 研究肠道微生物群在早期生命中对B细胞发育和宿主体液免疫成熟的调控作用 | 年轻肉鸡的肠道微生物群和法氏囊B细胞发育 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及抗生素处理的鸡只样本 |
| 18483 | 2024-08-08 |
Atf4 regulates angiogenic differences between alveolar bone and long bone macrophages by regulating M1 polarization, based on single-cell RNA sequencing, RNA-seq and ATAC-seq analysis
2023-03-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04046-1
PMID:36918894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、RNA-seq和ATAC-seq分析，探讨了Atf4在调节齿槽骨和长骨巨噬细胞血管生成差异中的作用，特别是通过调节M1极化。 | 首次揭示了Atf4在齿槽骨和长骨巨噬细胞血管生成差异中的作用，并通过实验证实了Atf4通过激活M1极化来调节Vegfa的表达。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人体样本中验证这些发现。 | 探讨齿槽骨和长骨巨噬细胞在血管生成方面的差异，并揭示Atf4在这一过程中的作用。 | 齿槽骨和长骨的巨噬细胞，以及它们在血管生成中的差异。 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA-seq，ATAC-seq | NA | RNA | 小鼠的齿槽骨和长骨样本 |
| 18484 | 2024-08-08 |
Cell-specific clock-controlled gene expression program regulates rhythmic fiber cell growth in cotton
2023-03-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02886-0
PMID:36918913
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研究论文 | 本研究通过优化原生质体制备方法，结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq），系统地表征了野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花外珠被细胞，揭示了纤维细胞生长的分子机制。 | 首次揭示了纤维细胞特异性的昼夜节律钟控基因表达程序，为通过工程化纤维细胞的昼夜节律来改善纤维特性提供了新途径。 | NA | 探究棉花纤维细胞生长的分子机制。 | 野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花的外珠被细胞。 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据 | 野生型和无毛/无棉絮（fl）棉花的外珠被细胞 |
| 18485 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses reveal distinct expression patterns and roles of long non-coding RNAs during hESC differentiation into pancreatic progenitors
2023-03-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03259-x
PMID:36907881
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了长非编码RNA在人胚胎干细胞向胰腺前体细胞分化过程中的表达模式和作用 | 首次全面描述了长非编码RNA在人胚胎干细胞分化过程中的表达特征，并揭示了特定长非编码RNA在胰腺前体细胞生成中的关键作用 | NA | 深入理解人胚胎干细胞的分化过程，特别是长非编码RNA在此过程中的作用 | 人胚胎干细胞及其向胰腺前体细胞的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 77,382个细胞 |
| 18486 | 2024-08-08 |
Single-cell and spatial dissection of precancerous lesions underlying the initiation process of oral squamous cell carcinoma
2023-Mar-13, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00532-4
PMID:36914617
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研究论文 | 本文构建了单细胞转录组图谱和空间转录组图谱，以解析口腔鳞状细胞癌（OSCC）前病变阶段的细胞组成和空间结构 | 首次揭示了前病变阶段的细胞景观及其在OSCC启动中的作用，特别是发现了一种独特的免疫抑制性单核细胞亚型和VEGF信号的空间切换调控 | NA | 阐明口腔鳞状细胞癌前病变阶段的细胞景观及其在癌症启动中的作用 | 口腔黏膜的早期OSCC、伴随中至重度异型增生的邻近前病变以及匹配的正常区域 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序，空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | 9名人类口腔黏膜活检样本 |
| 18487 | 2024-08-05 |
Glycyrrhizic acid inhibits myeloid differentiation of hematopoietic stem cells by binding S100 calcium binding protein A8 to improve cognition in aged mice
2023-Mar-11, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-023-00337-9
PMID:36906583
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研究论文 | 该研究探讨了甘草酸通过与S100钙结合蛋白A8结合，抑制造血干细胞的髓系分化，从而改善老年小鼠的认知能力。 | 本研究首次揭示了甘草酸通过调节免疫细胞群体以改善老年小鼠的认知能力的具体机制。 | 该研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全推断人类的相应机制。 | 研究甘草酸对老年小鼠免疫系统的影响及其改善认知能力的机制。 | 研究对象为年轻小鼠、老年小鼠及甘草酸处理的老年小鼠的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 衰老疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞数据 | 涉及年轻小鼠、老年小鼠及甘草酸处理的老年小鼠的样本 |
| 18488 | 2024-08-05 |
Multi-omics and experimental analysis unveil theragnostic value and immunological roles of inner membrane mitochondrial protein (IMMT) in breast cancer
2023-03-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04035-4
PMID:36899366
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研究论文 | 这项研究揭示了内膜线粒体蛋白（IMMT）在乳腺癌中的治疗诊断价值及其免疫学角色 | 首次将多组学分析与实验验证结合，揭示IMMT在乳腺癌临床意义及其在免疫微环境中的作用 | IMMT的预后意义受到多种细胞成分和肿瘤突变负荷（TMB）水平的影响 | 评估内膜线粒体蛋白在乳腺癌中的诊断和预后价值 | 乳腺癌患者的内膜线粒体蛋白及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 数字病理 | 乳腺癌 | 多组学分析，siRNA敲低 | NA | 临床样本，细胞样本 | 临床样本及单细胞分析 |
| 18489 | 2024-08-08 |
CAF signature predicts the prognosis of colorectal cancer patients: A retrospective study based on bulk RNA sequencing and single-cell RNA sequencing data
2023-Mar-10, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000033149
PMID:36897717
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研究论文 | 本研究基于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于癌症相关成纤维细胞（CAFs）标志基因的结直肠癌（CRC）预后模型 | 首次基于CAFs标志基因构建了CRC患者的生存预测签名，并揭示了肿瘤抑制微环境和失调的免疫检查点基因在CRC组织中对患者不良预后的部分作用 | NA | 建立一个基于CAFs标志基因的CRC预后模型 | 结直肠癌患者的预后预测 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数据来自癌症基因组图谱数据库和基因表达综合数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 18490 | 2024-08-08 |
Quantitative Evaluation of Stem-like Markers of Human Glioblastoma Using Single-Cell RNA Sequencing Datasets
2023-Mar-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051557
PMID:36900348
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据集对37名胶质母细胞瘤患者的干细胞标志物进行定量评估 | 首次通过单细胞RNA测序数据集对胶质母细胞瘤干细胞标志物进行大规模定量评估和选择 | 研究主要集中在实验室和临床治疗中的应用，未涉及其他可能的临床场景 | 评估和选择胶质母细胞瘤干细胞标志物的效率和可行性 | 胶质母细胞瘤干细胞标志物 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 37名胶质母细胞瘤患者，共2173个干细胞标志物候选 |
| 18491 | 2024-08-05 |
Crosstalk between Mesenchymal Stem Cells and Cancer Stem Cells Reveals a Novel Stemness-Related Signature to Predict Prognosis and Immunotherapy Responses for Bladder Cancer Patients
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054760
PMID:36902193
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研究论文 | 该文章揭示了间充质干细胞与癌干细胞之间的相互作用，并发展出一种与干性相关的特征以预测膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次识别了三种间充质干细胞和癌干细胞亚群，并开发了新颖的干性相关特征用于预后和免疫治疗反应预测 | 尚未明确所有潜在的治疗靶点，且所使用的数据集有限 | 该研究的目的是解读间充质干细胞与癌干细胞的通信网络，并识别潜在的治疗靶点 | 研究对象包括膀胱癌中的间充质干细胞和癌干细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 两个数据集（GSE130001和GSE146137）以及两个PD-(L)1处理的队列（IMvigor210和Rose2021UC） |
| 18492 | 2024-08-05 |
A Unified Deep Learning Framework for Single-Cell ATAC-Seq Analysis Based on ProdDep Transformer Encoder
2023-Mar-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054784
PMID:36902216
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研究论文 | 提出了一种基于ProdDep Transformer编码器的统一深度学习框架用于分析单细胞ATAC-Seq数据 | 引入了PROTRAIT框架，结合了语法捕捉和细胞嵌入学习以实现对单细胞染色质可及性的预测 | 可能对特定类型的scATAC-seq数据集的适用性有局限，未详细讨论其他数据集的适用性 | 开发一个统一的深度学习框架以分析单细胞ATAC-Seq数据 | 单细胞转座酶可接近染色质分析的数据 | 数字病理学 | NA | NA | ProdDep Transformer | scATAC-seq数据 | 基于Buenrostro2018数据集的实验，涉及超过一百万个细胞 |
| 18493 | 2024-08-05 |
CRYAA and GJA8 promote visual development after whisker tactile deprivation
2023-Mar, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e13897
PMID:36915480
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研究论文 | 本研究探讨了触觉剥夺对视觉发展的影响 | 首次揭示了CRYAA和GJA8在触觉剥夺后对视力恢复的作用 | 未涉及触觉剥夺对其他感官的综合影响 | 研究触觉剥夺对视觉发展的影响及其机制 | 年轻小鼠及人类胚胎视网膜单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 生物样本 | 使用了年轻小鼠的视网膜样本和人类胚胎的单细胞数据 |
| 18494 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals that endothelial cells, EndMT cells and mural cells contribute to the pathogenesis of cavernous malformations
2023-03, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-023-00962-w
PMID:36914857
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研究论文 | 本文通过单细胞 RNA 测序分析了与中央神经系统渗透的 cavernous malformations (CMs) 相关的细胞类型 | 首次在 CMs 中以单细胞水平识别了内皮细胞向间充质细胞转变（EndMT）细胞，并预测了转录因子 SPI1 作为 EndMT 的新驱动因子 | 研究只针对12个人类 CM 样本和3个对照样本，样本量相对较小 | 进一步理解 CMs 的疾病机制和治疗策略 | 从人类 CM 样本中分析未选择的可存活细胞，并对不同细胞类型及其相互作用进行评估 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 12个 CM 样本和3个对照样本，共112,670个高质量细胞 |
| 18495 | 2024-08-08 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Feb-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.530299
PMID:36909601
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、免疫组织化学和功能实验，比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在细胞异质性和基因表达上的差异 | 首次全面比较了BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型在基因表达和先天免疫功能上的差异 | 未观察到BCi-NS1.1 HAE培养模型与原代细胞在流感病毒感染敏感性上的显著差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系衍生的HAE培养模型在呼吸道感染疾病研究中的应用价值 | BCi-NS1.1细胞系和原代细胞衍生的HAE培养模型 | NA | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 18496 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of CX3CR1 + cells reveal a pathogenic role for BIRC5 + myeloid proliferating cells driven by Staphylococcus aureus leukotoxins
2023-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.27.529760
PMID:36909517
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，揭示了在感染过程中，由金黄色葡萄球菌白细胞毒素驱动的BIRC5阳性骨髓增殖细胞在CX3CR1阳性细胞中的致病作用。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，揭示了BIRC5阳性骨髓增殖细胞在感染中的致病作用，并发现这些细胞的扩增与组织损伤毒素的存在有关。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现。 | 探讨在感染过程中，特定类型的骨髓细胞如何影响疾病进程。 | CX3CR1阳性细胞和BIRC5阳性骨髓增殖细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠模型中的CX3CR1阳性细胞 |
| 18497 | 2024-08-05 |
Mitochondria-Associated Endoplasmic Reticulum Membrane (MAM) Is a Promising Signature to Predict Prognosis and Therapies for Hepatocellular Carcinoma (HCC)
2023-Feb-24, Journal of clinical medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jcm12051830
PMID:36902617
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研究论文 | 这篇文章探讨了线粒体相关内质网膜(MAM)在肝细胞癌(HCC)预后和治疗中的潜在作用 | 研究首次详细探讨了MAM在HCC中的重要性并建立了MAM评分来预测患者预后 | 研究仅使用了特定数据集作为训练集，可能限制了发现的广泛适用性 | 旨在评估MAM评分在HCC患者预后和免疫治疗反应中的价值 | 研究对象为肝细胞癌患者及其肿瘤相关细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，基因共表达网络 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA-LIHC、ICGC及多个GEO数据集进行分析 |
| 18498 | 2024-08-08 |
The CXCL10/CXCR3 Pathway Contributes to the Synergy of Thermal Ablation and PD-1 Blockade Therapy against Tumors
2023-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15051427
PMID:36900218
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研究论文 | 研究探讨了热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 首次揭示了CXCL10/CXCR3轴在热消融与抗PD-1疗法联合治疗中的作用，并提出该信号通路的激活可能增强这种联合治疗的协同效应 | NA | 研究热消融与PD-1阻断疗法联合治疗肿瘤的协同作用及其机制 | 肿瘤组织中的浸润性免疫细胞及热消融治疗后的变化 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 肿瘤携带小鼠的肿瘤组织与对照肿瘤组织 |
| 18499 | 2024-08-05 |
Cell-Type-Specific Gene Regulatory Networks of Pro-Inflammatory and Pro-Resolving Lipid Mediator Biosynthesis in the Immune System
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054342
PMID:36901771
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研究论文 | 本研究探讨了免疫系统中促炎和促解决脂质介质合成的细胞类型特异性基因调控网络 | 首次系统地绘制了与PIM和SPM合成相关的细胞类型特异性基因调控网络 | 尽管识别了基因调控网络，但具体的调控机制仍需进一步研究 | 研究脂质介质在免疫反应中的基因调控及其细胞类型特异性 | 以免疫细胞为研究对象，关注PIM和SPM的合成路径 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 机器学习方法 | 基因表达数据 | 大规模单细胞数据集 |
| 18500 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Transcriptome Profiling of Liver Cells of Short-Term Alcoholic Liver Injury in Mice
2023-Feb-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24054344
PMID:36901774
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠短期酒精性肝损伤中肝脏细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平上揭示了酒精性肝损伤中不同肝脏细胞类型的分子和细胞机制 | NA | 探讨酒精性肝损伤的细胞和分子机制 | 小鼠肝脏细胞 | 数字病理学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 51,619个肝脏单细胞 |