单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 18461 - 18480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18461 | 2024-08-05 |
Genetic and Immunological Characterization of Brain Metastases from Solid Cancers
2024-May, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17001
PMID:38677762
|
研究论文 | 本研究对来自实体癌症的脑转移瘤进行了遗传和免疫特征的分析 | 通过分析脑转移瘤的肿瘤突变负担和相关免疫基因，确定了新的预后标志物和治疗靶点 | 样本数量较小，仅基于九名癌症患者的肿瘤样本 | 调查脑转移瘤特异性的生物标志物和相关预后因素 | 来自静冈癌症中心九名癌症患者的原发癌和转移癌病变 | 数字病理学 | 脑转移癌症 | 下一代测序，单细胞RNA测序，定量PCR | NA | 基因数据 | 九名癌症患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18462 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals the complex cellular niche of pterygium
2024-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2024.01.013
PMID:38290663
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了翼状胬肉的复杂细胞环境 | 首次确定了促进翼状胬肉的新的细胞亚群和细胞间相互作用 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行更广泛的临床验证 | 揭示翼状胬肉的病理机制及潜在治疗靶点 | 翼状胬肉患者和正常对照的结膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 45605个细胞来自翼状胬肉患者和正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 18463 | 2024-08-04 |
Hypercapnia alters stroma-derived Wnt production to limit β-catenin signaling and proliferation in AT2 cells
2023-02-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.159331
PMID:36626234
|
研究论文 | 这篇文章探讨了高二氧化碳血症如何通过限制β-连环蛋白信号传导和增殖能力，影响肺泡Ⅱ型细胞的功能 | 研究揭示了高二氧化碳血症对肺泡Ⅱ型细胞增殖能力的抑制及其机制，尤其是Wnt信号通路的改变 | 该研究主要基于小鼠模型，可能在人类中的适用性有限 | 了解高二氧化碳血症对肺损伤后肺修复过程的影响 | 小鼠模型中的肺泡Ⅱ型细胞及其周围的基质细胞 | 数字病理学 | 肺病 | 空间转录组学、细胞谱系追踪、3D培养 | NA | NA | 小鼠模型，样本数量未明确描述 | NA | NA | NA | NA |
| 18464 | 2024-08-05 |
Social reprogramming in ants induces longevity-associated glia remodeling
2020-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba9869
PMID:32875108
|
研究论文 | 本文探讨了社会性昆虫中工蚁转变为类女王状态对神经胶质细胞重塑及寿命的影响 | 发现社交行为的重编程与神经保护胶质细胞的扩展相关，揭示了工蚁转变为gamergate对寿命延长的影响 | 研究主要集中在特定的社交转变上，可能无法广泛适用于所有社交昆虫 | 探索社会性昆虫中工作形式与寿命之间的关系及其机制 | 研究对象是社会性昆虫中的工蚁与gamergate状态的比较 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18465 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq reveals ectopic and aberrant lung-resident cell populations in idiopathic pulmonary fibrosis
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba1983
PMID:32832599
|
研究论文 | 我们提供了一幅特发性肺纤维化（IPF）单细胞图谱，揭示了该致命间质肺病中的细胞多样性 | 识别出一种先前未被发现的异常基底细胞群体，并展示了IPF肺中细胞群体的复杂性 | 研究仅涉及有限的样本种类，可能无法完全代表所有IPF患者中的细胞异质性 | 研究特发性肺纤维化中的细胞组成及其潜在功能 | 312,928个来自32个IPF患者和其他对照的单细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 312,928个细胞来自32个IPF患者、28个吸烟和不吸烟的对照以及18个COPD患者的肺 | NA | NA | NA | NA |
| 18466 | 2024-08-04 |
Single-cell profiling transcriptomic reveals cellular heterogeneity and cellular crosstalk in choroidal neovascularization model
2024-May, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109877
PMID:38537669
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序探索了脉络膜新生血管化模型中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次详细描述了RPE/脉络膜复合体内的细胞多样性和特定细胞类型之间复杂的相互作用 | 研究可能需要更大样本量和长时间跟踪，以充分验证发现的细胞类型及其功能 | 探索与年龄相关性黄斑变性相关的脉络膜新生血管化中的细胞组成和相互作用 | 主要研究脉络膜/视网膜色素上皮复合体中的各种细胞类型，包括内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18467 | 2024-08-04 |
Roxithromycin exposure induces motoneuron malformation and behavioral deficits of zebrafish by interfering with the differentiation of motor neuron progenitor cells
2024-May, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2024.116327
PMID:38626605
|
研究论文 | 本研究探讨了罗克沙星（ROX）对斑马鱼运动神经元发育和行为缺陷的影响 | 首次揭示罗克沙星暴露导致斑马鱼运动神经元前体细胞分化受阻 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，可能无法完全适用于人类 | 研究罗克沙星早期暴露的发育毒性及其对运动功能的影响 | 使用斑马鱼作为脊椎动物模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 胚胎 | 总样本数为410（n=100，n=100，n=100，n=80，n=30，n=80） | NA | NA | NA | NA |
| 18468 | 2024-08-04 |
Pan-cancer analysis implicates novel insights of lactate metabolism into immunotherapy response prediction and survival prognostication
2024-Apr-25, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-024-03042-7
PMID:38664705
|
研究论文 | 该文章探讨了乳酸代谢与免疫治疗反应之间的关系及其在癌症预后中的应用 | 提出了一个与乳酸代谢相关的新标记（LM.SIG），用于预测免疫治疗反应和生存预后 | 研究依赖于公开的转录组数据，可能存在样本选择偏差 | 揭示乳酸代谢对免疫治疗反应的影响并预测癌症患者的生存状况 | 分析接受免疫治疗的癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 40个泛癌症单细胞RNA测序队列和8个免疫治疗转录组队列以及30个TCGA数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18469 | 2024-08-05 |
Loss of Y in regulatory T lymphocytes in the tumor micro-environment of primary colorectal cancers and liver metastases
2024-04-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-60049-y
PMID:38658633
|
研究论文 | 该文章研究了原发性结直肠癌和肝转移癌的肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞Y染色体缺失的频率和功能影响 | 首次探讨了肿瘤微环境中浸润性白血球中的Y染色体缺失与结直肠癌的关系 | 目前仅关注了调节性T淋巴细胞，未能探讨其他类型淋巴细胞的影响 | 研究肿瘤微环境中Y染色体缺失在结直肠癌发生中的作用 | 研究对象为血液、肿瘤微环境和非肿瘤组织中的细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 在肿瘤微环境中调节性T淋巴细胞的Y染色体缺失频率为22% | NA | NA | NA | NA |
| 18470 | 2024-08-05 |
scGAL: unmask tumor clonal substructure by jointly analyzing independent single-cell copy number and scRNA-seq data
2024-Apr-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10319-w
PMID:38649804
|
研究论文 | 该文章介绍了一种新型混合模型scGAL，用于推断肿瘤克隆拷贝数亚结构 | scGAL结合了自编码器和生成对抗网络，能够联合分析单细胞拷贝数和基因表达数据，克服拷贝数数据中的噪声影响 | 可能仍受到个别数据集特征和技术限制的影响 | 准确解码肿瘤克隆拷贝数亚结构以提供癌症的演化机制见解 | 真实癌症数据集中的单细胞拷贝数和基因表达数据 | 数字病理学 | 肿瘤 | scDNA-seq | 生成对抗网络 | 拷贝数数据和基因表达数据 | 三个真实癌症数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18471 | 2024-08-05 |
Discrete-state models identify pathway specific B cell states across diseases and infections at single-cell resolution
2024-04-21, Journal of theoretical biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.jtbi.2024.111769
PMID:38423206
|
研究论文 | 该文章研究了在健康和疾病状况下B细胞的特定状态。 | 开发了基于状态的离散模型，利用单细胞RNA测序数据来识别与氧调控通路相关的B细胞状态。 | 研究仅限于已发布的单细胞RNA测序数据，可能忽略其他重要因素。 | 理解B细胞在感染、疫苗接种和其他疾病中的状态及其调节方式。 | 研究不同疾病和感染中的B细胞状态及其转变。 | 数字病理学 | 乳腺癌, HIV | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 离散状态模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18472 | 2024-08-05 |
YTE-17 inhibits colonic carcinogenesis by resetting antitumor immune response via Wnt5a/JNK mediated metabolic signaling
2024-Apr, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.11.008
PMID:38665223
|
研究论文 | 本研究探讨了YTE-17通过Wnt5a/JNK介导的代谢信号通路抑制结肠癌发生的机制 | 本研究首次揭示YTE-17通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞平衡来预防结直肠癌 | 关于YTE-17在预防结直肠癌的机制了解仍有限 | 探索YTE-17在结直肠癌预防中的潜在作用 | 研究对象包括暴露于YTE-17的肠上皮细胞及其在结肠癌模型中的免疫微环境 | 数字病理学 | 结肠癌 | iTRAQ分析、单细胞RNA测序 | 参与性癌症模型 | 组织样本 | 不同阶段的结肠癌模型样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18473 | 2024-08-05 |
Sodium glucose co-transporter 2 inhibition increases epidermal growth factor expression and improves outcomes in patients with type 2 diabetes
2023-10, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.07.007
PMID:37543256
|
研究论文 | 本研究探讨了钠-葡萄糖共转运蛋白2抑制剂在2型糖尿病患者中对表皮生长因子表达的影响及其对肾脏结果的改善 | 本研究首次揭示了SGLT2抑制剂能agliflozin对EGF表达的影响及其在肾脏疾病进展中的潜在机制 | 本文的局限性在于使用的样本量及单细胞RNA测序的具体实验条件可能影响结果的普遍性 | 本研究的目的是探讨SGLT2抑制剂对2型糖尿病患者肾脏保护机制中的EGF表达的影响 | 研究对象包括3521名参与CANVAS研究的2型糖尿病患者及10名年轻的2型糖尿病患者的肾组织样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 生物样本 | 3521名参与者和20个肾组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18474 | 2024-08-05 |
Improved Protocol for Reproducible Human Cortical Organoids Reveals Early Alterations in Metabolism with MAPT Mutations
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.11.548571
PMID:37503195
|
研究论文 | 本研究报告了一种96孔方法，用于高效、可扩展和可重复的人类皮层类器官的生产 | 采用可控释放的FGF2和适当浓度的SB431542显著提高了类器官的皮层模式化和重复性 | 不同hPSC供体线和实验重复之间的高变异性仍然存在 | 研究人类皮层类器官的建立及分析与前额叶痴呆相关的突变对代谢的早期影响 | 来源于人类多能干细胞（hPSCs）的皮层类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18475 | 2024-08-05 |
Lactate from glycolysis regulates inflammatory macrophage polarization in breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03382-x
PMID:36729212
|
研究论文 | 乳腺癌中，来自糖酵解的乳酸调节炎症性巨噬细胞的极化 | 本文揭示了糖酵解产生的乳酸如何影响乳腺癌中巨噬细胞的极化模式 | 该研究主要基于细胞水平的数据，临床验证仍需进一步研究 | 探讨乳腺癌中乳酸的来源及其对炎症巨噬细胞极化的影响 | 主要研究乳腺癌细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学数据分析、单细胞转录组分析、临床数据分析、体外实验 | NA | RNA、细胞 | 22种免疫细胞与临床数据分析 | NA | NA | NA | NA |
| 18476 | 2024-08-04 |
YAP1 and WWTR1 expression inversely correlates with neuroendocrine markers in Merkel cell carcinoma
2023-03-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI157171
PMID:36719743
|
研究论文 | 本文探讨了Merkel细胞癌（MCC）中YAP1和WWTR1的表达与神经内分泌标志物之间的反向关系 | 研究揭示了MCC中NE基因表达的异质性，并发现YAP1/WWTR1沉默对MCPyV阳性MCC的发展至关重要 | 目前的临床诊断标志物无法区分MCPyV阳性和阴性亚型，且MCC肿瘤的表达谱尚未探索 | 研究MCC的转录环境及其与YAP1和WWTR1的关系 | 针对来自患者的肿瘤活检和细胞系进行的RNA-Seq分析 | 数字病理学 | 皮肤癌 | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 多个肿瘤活检样本和细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 18477 | 2024-08-05 |
The interleukin-1 receptor type-1 in disturbed flow-induced endothelial mesenchymal activation
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1190460
PMID:37539090
|
研究论文 | 本研究探讨了干扰流动（d-flow）诱导的内皮间充质转化（EndMT）中白细胞介素-1受体类型1（IL-1R1）的角色 | 发现IL-1R1作为内皮细胞中新型的机械敏感受体，连接d-flow与EndMT信号通路 | 不同血管细胞类型的IL-1R1信号数据不一致，尚需进一步验证 | 揭示IL-1R1在内皮细胞对干扰流动反应中的作用 | 研究动脉粥样硬化中内皮细胞和EndMT相关转录因子SNAI1的相互作用 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | scRNA-seq | Cre-lox系统小鼠 | 基因表达数据 | 人类动脉粥样硬化样本和特定小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 18478 | 2024-08-05 |
Comprehensive characterization of tumor immune landscape following oncolytic virotherapy by single-cell RNA sequencing
2022-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-021-03084-2
PMID:34716463
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序全面描述了肿瘤免疫微环境在肿瘤溶瘤病毒治疗后的变化 | 首次全面分析了溶瘤病毒治疗引起的癌症中免疫变化 | 缺乏对长期治疗效果和不同类型肿瘤的研究 | 探究溶瘤病毒治疗如何改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成 | 分析了使用HSV-2基础的溶瘤病毒处理的癌瘤中的免疫细胞组成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 处理过和未处理的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18479 | 2024-08-05 |
Site-1 protease ablation in the osterix-lineage in mice results in bone marrow neutrophilia and hematopoietic stem cell alterations
2020-06-23, Biology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1242/bio.052993
PMID:32576566
|
研究论文 | 这篇文章探讨了小鼠中osterix谱系中Site-1蛋白酶的缺失对骨髓中中性粒细胞及造血干细胞的影响 | 本研究初步揭示了Site-1蛋白酶在维持骨髓造血微环境平衡中的重要作用 | 研究主要在小鼠模型中进行，结果能否推广到人类需进一步验证 | 研究Site-1蛋白酶缺失对骨髓细胞组成及造血干细胞功能的影响 | 小鼠，尤其是osterix谱系中Site-1蛋白酶缺失的小鼠 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和蛋白质质谱 | NA | NA | 涉及多种骨髓来源的细胞，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 18480 | 2024-08-04 |
Gene Expression Patterns in the Ctenophore Pleurobrachia bachei: In Situ Hybridization
2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-3642-8_9
PMID:38668969
|
研究论文 | 本研究提出了一种用于观察海洋无脊椎动物Pleurobrachia bachei的基因表达模式的原位杂交方法 | 提供了适用于高度脆弱的动物的原位杂交协议，并展示了细胞表型标记的表达模式 | 对脆弱动物的应用具有挑战性，可能限制了方法的通用性 | 研究Ctenophora类动物的基因表达模式 | 成年Pleurobrachia bachei | 数字病理学 | NA | 原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 成年Pleurobrachia bachei的样本 | NA | NA | NA | NA |