单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 18461 - 18480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18461 | 2024-12-14 |
Fam3a-mediated prohormone convertase switch in α-cells regulates pancreatic GLP-1 production in an Nr4a2-Foxa2-dependent manner
2025-Jan, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2024.156042
PMID:39362520
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研究论文 | 研究探讨了Fam3a在α细胞中的作用及其通过Nr4a2-Foxa2依赖性机制调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的机制 | 揭示了Fam3a在α细胞中通过Nr4a2-Foxa2依赖性途径调节胰高血糖素样肽-1（GLP-1）生成的新机制，并提出了一种重新编程α细胞胰高血糖素加工输出为GLP-1的新策略 | NA | 探讨Fam3a在α细胞功能中的作用及其调节机制 | Fam3a敲除小鼠、人胰岛单细胞RNA测序数据、αTC1.9细胞、Fam3aα-/-小鼠及其胰岛 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组分析、核转位实验、双荧光素酶报告基因实验 | NA | RNA | Fam3a敲除小鼠、Fam3aα-/-小鼠、αTC1.9细胞、人胰岛单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18462 | 2024-12-14 |
LRRC45 accelerates bladder cancer development and ferroptosis inhibition via stabilizing NRF2 by competitively KEAP1 interaction
2025-Jan, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究揭示了LRRC45通过与KEAP1竞争性结合稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡的机制 | 首次揭示了LRRC45通过竞争性结合KEAP1来稳定NRF2，从而促进膀胱癌发展和抑制铁死亡 | 研究主要基于细胞实验，缺乏临床试验数据支持 | 探讨LRRC45在膀胱癌发展中的作用及其分子机制 | 膀胱癌细胞中的LRRC45及其与KEAP1和NRF2的相互作用 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18463 | 2024-12-14 |
3D printed PGCL@PLA/10CSPL composite scaffolds loaded with fibronectin 1 for intervertebral disc degeneration treatment
2024-Dec-13, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ad998f
PMID:39668784
|
研究论文 | 本文设计并制造了一种新型3D打印PGCL@PLA/10CSPL复合支架，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 本文创新性地设计了一种具有良好生物相容性和电活性的PGCL@1PAP/10CSPL支架，并加载了从单细胞转录组数据中识别出的纤维连接蛋白1（FN1），以加速异常髓核退变 | NA | 研究目的是开发一种新型植入系统，用于椎间盘退行性疾病的治疗 | 研究对象是椎间盘退行性疾病及其治疗 | 生物医学工程 | 椎间盘退行性疾病 | 3D打印技术 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18464 | 2024-12-14 |
Paired-Related Homeobox 1-Positive Cells Are Needed for Osseointegration
2024-Dec-11, The International journal of oral & maxillofacial implants
DOI:10.11607/jomi.10852
PMID:38498783
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研究论文 | 研究Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中对种植体诱导骨整合过程的贡献及其潜在机制 | 首次揭示了Prrx1阳性细胞在骨整合过程中的作用，并发现Sema3C在Prrx1阳性细胞驱动的成骨过程中起关键作用 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Prrx1阳性细胞在种植体诱导骨整合过程中的作用及其机制 | Prrx1阳性细胞在成年牙槽骨中的作用 | NA | NA | Cre重组酶诱导的谱系追踪、细胞消融、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用小鼠牙种植体模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 18465 | 2024-12-14 |
EEE1F1 could serve as a prognostic biomarker for patients with endometrial cancer: A comprehensive analysis by integrating bulk and single-cell sequencing
2024-Dec-11, Asian journal of surgery
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.asjsur.2024.11.065
PMID:39668036
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18466 | 2024-12-14 |
Conserved B cell signaling, activation, and differentiation in porcine jejunal and ileal Peyer's patches despite distinct immune landscapes
2024-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2024.08.005
PMID:39147277
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研究论文 | 研究了猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，尽管存在不同的免疫环境，但发现了保守的B细胞动态 | 首次通过单细胞和空间转录组学研究猪空肠和回肠Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并发现尽管存在不同的免疫环境，B细胞动态在肠道位置间是保守的 | 研究仅限于猪的空肠和回肠Peyer's patches，未涉及其他物种或其他肠道区域 | 探讨Peyer's patches中B细胞的信号传导、激活和分化，并研究其在不同肠道位置的保守性 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猪空肠和回肠Peyer's patches中的B细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18467 | 2024-12-14 |
GeneCompass: deciphering universal gene regulatory mechanisms with a knowledge-informed cross-species foundation model
2024-Dec, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-024-01034-y
PMID:39375485
|
研究论文 | 本文构建了一个跨物种的基础模型GeneCompass，用于解析普遍的基因调控机制 | GeneCompass通过整合四种先验生物学知识，在自监督学习中增强了基因调控机制的理解，并在多个下游任务中超越了现有模型 | NA | 解析跨物种的普遍基因调控机制，推动基础生命过程研究和临床应用 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 转录组数据 | 12000万个人类和小鼠的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18468 | 2024-12-14 |
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-Dec, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13607
PMID:39381961
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研究论文 | 本文研究了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长和再生过程中对卫星细胞稳态的维持作用 | 首次揭示了SRSF1在调节Fgfr1op2剪接中的关键作用，以及其对有丝分裂纺锤体组织和细胞衰老的影响 | 研究主要集中在新生小鼠的横膈膜和C2C12细胞系，可能无法完全代表所有骨骼肌的情况 | 探讨SRSF1缺失对卫星细胞功能和肌肉再生的影响机制 | 卫星细胞（SCs）及其在骨骼肌生长和再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、免疫染色、EdU掺入实验 | NA | RNA | 新生小鼠横膈膜的单核细胞悬液（KO和对照组）、C2C12肌母细胞和原代肌母细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18469 | 2024-12-14 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-Dec, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
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研究论文 | 研究了成年雌性和雄性小鼠中甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta的mRNA表达谱 | 首次详细分析了甘氨酸受体亚基在不同脑区和脊髓中的表达模式，并比较了雌雄小鼠在特定脑区的表达差异 | Glra4的表达水平过低，无法通过qRT-PCR检测到 | 探讨甘氨酸受体亚基在中枢神经系统中的表达模式及其在雌雄小鼠中的差异 | 甘氨酸受体亚基alpha 1、alpha 2、alpha 4和beta在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序、定量实时PCR (qRT-PCR)、RNAscope | NA | mRNA表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 18470 | 2024-12-14 |
Investigating intra-tumoural heterogeneity and microenvironment diversity in primary cardiac angiosarcoma through single-cell RNA sequencing
2024-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70113
PMID:39658531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境多样性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了原发性心脏血管肉瘤的复杂细胞景观和免疫微环境，并识别了潜在的分子治疗靶点 | 样本量较小，仅基于四个患者的肿瘤样本进行分析 | 揭示原发性心脏血管肉瘤的细胞异质性和肿瘤微环境，为开发新型疗法提供分子靶点 | 原发性心脏血管肉瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四个患者的肿瘤样本和五个正常心脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18471 | 2024-12-14 |
Oxygen, angiogenesis, cancer and immune interplay in breast tumour microenvironment: a computational investigation
2024-Dec, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.240718
PMID:39665095
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研究论文 | 本研究利用乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT）的数据，探讨了乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的相互作用 | 引入了一种基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据估算乳腺癌微环境中免疫细胞比例的方法，并通过混合遗传算法（HGA）进行参数估计 | NA | 研究乳腺癌微环境中氧气、血管生成、癌症与免疫细胞之间的复杂动态相互作用 | 乳腺癌微环境中的内皮细胞、氧气、血管内皮生长因子（VEGF）以及免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 混合遗传算法（HGA） | 单细胞RNA测序数据 | 乳腺特异性多瘤病毒中T抗原过表达小鼠模型（MMTV-PyMT） | NA | NA | NA | NA |
| 18472 | 2024-12-14 |
Single-cell transcriptomics: a new frontier in plant biotechnology research
2024-Nov-25, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-024-03383-9
PMID:39585480
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综述 | 本文综述了单细胞转录组技术在植物生物技术研究中的最新进展及其对植物发育理解的深远影响 | 单细胞转录组技术提供了前所未有的细胞分辨率，揭示了复杂的细胞过程和发育途径 | 单细胞转录组技术在植物研究中面临样本准备、细胞分离、数据复杂性和计算分析等挑战 | 探讨单细胞转录组技术在植物生物技术中的应用及其未来发展前景 | 植物细胞的基因表达、发育过程和环境响应 | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18473 | 2024-12-14 |
Expression of Anoikis-Related Genes and Potential Biomarkers in Colon Cancer Based on RNA-seq and scRNA-seq
2024-Nov, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-024-04957-9
PMID:38727936
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研究论文 | 本研究整合了结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据，评估了患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 首次通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估了结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建了结肠癌风险模型 | 研究仅基于现有数据集，未进行体外或体内实验验证 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，评估结肠癌患者分层、预后以及不同细胞类型中与失巢凋亡相关基因的表达，并构建结肠癌风险模型 | 结肠癌样本的转录组和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据 | 结肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18474 | 2024-12-14 |
Aging- and alcohol-associated spatial transcriptomic signature in mouse acute pancreatitis reveals heterogeneity of inflammation and potential pathogenic factors
2024-08, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany)
DOI:10.1007/s00109-024-02460-6
PMID:38940937
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研究论文 | 本研究通过建立衰老酒精性急性胰腺炎小鼠模型，应用Visium空间转录组学技术，揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎空间转录组特征 | 首次通过空间转录组学技术揭示了衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的炎症异质性，并识别出潜在的致病因素 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 阐明衰老和酒精相关的小鼠急性胰腺炎的空间转录组特征及其潜在机制 | 衰老和年轻小鼠的急性胰腺炎模型 | NA | 胰腺炎 | Visium空间转录组学 | NA | 转录组 | 衰老小鼠（18个月）和年轻小鼠（3个月）各一组 | NA | NA | NA | NA |
| 18475 | 2024-12-14 |
CTLA-4-expressing ILC3s restrain interleukin-23-mediated inflammation
2024-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07537-3
PMID:38867048
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了IL-23受体表达细胞在肠道中的急性反应，揭示了CTLA-4在ILC3s上的上调及其在调节IL-23介导的炎症中的作用 | 首次发现CTLA-4在ILC3s上的上调，并揭示了其在调节IL-23介导的炎症中的关键作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，对人类样本的研究较少，且未探讨CTLA-4在其他炎症性疾病中的作用 | 探讨IL-23介导的炎症反应中CTLA-4的作用机制 | 肠道中的IL-23受体表达细胞及ILC3s | 免疫学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类ILC3s样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18476 | 2024-12-14 |
A multiplexed, single-cell sequencing screen identifies compounds that increase neurogenic reprogramming of murine Muller glia
2024-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.26.559569
PMID:37808650
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研究论文 | 本文通过单细胞测序筛选出能够促进小鼠Müller胶质细胞神经再生的化合物 | 首次使用sci-Plex技术进行高通量单细胞分子分析，筛选出促进神经再生的化合物 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 提高哺乳动物中Müller胶质细胞的神经再生能力，以恢复视网膜疾病患者的视力 | 小鼠Müller胶质细胞的神经再生 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 92种化合物 | NA | NA | NA | NA |
| 18477 | 2024-12-14 |
q-Diffusion leverages the full dimensionality of gene coexpression in single-cell transcriptomics
2024-04-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06104-w
PMID:38565955
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研究论文 | 本文介绍了一种名为q-diffusion的框架，用于捕捉单细胞转录组数据中基因共表达的完整维度 | q-diffusion框架在捕捉基因共表达结构方面优于现有的分析工具，能够提供更丰富的细胞生物学理解 | NA | 探索单细胞RNA测序数据的完整维度，以更深入地理解细胞生物学 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达结构 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及CALGB/SWOG 80405临床试验、体外PBMC数据集和人类皮质组织的空间单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18478 | 2024-12-14 |
Segregation of morphogenetic regulatory function of Shox2 from its cell fate guardian role in sinoatrial node development
2024-03-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06039-2
PMID:38553636
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研究论文 | 研究探讨了Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与其细胞命运守护角色之间的分离 | 首次展示了Shox2在窦房结发育中细胞命运决定与形态发生调控功能的分离 | 研究仅限于Shox2和Nkx2-5的共同失活对窦房结发育的影响，未探讨其他可能的调控因子 | 探讨Shox2在窦房结发育中的双重角色及其相互关系 | Shox2在窦房结发育中的形态发生调控功能与细胞命运守护角色 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Shox2突变体、Nkx2-5突变体及两者的共同失活突变体（dKO）的窦房结细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18479 | 2024-12-14 |
Endothelial gene regulatory elements associated with cardiopharyngeal lineage differentiation
2024-03-21, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06017-8
PMID:38514806
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研究论文 | 研究识别了与心脏咽弓中胚层分化相关的内皮细胞基因调控元件 | 通过整合染色质重塑和基因表达数据与单细胞RNA测序数据，识别了101个内皮细胞基因的潜在调控元件，并使用机器学习策略预测增强子 | 研究主要基于小鼠胚胎数据，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性 | 识别和验证在心脏咽弓中胚层分化过程中激活的内皮细胞基因调控元件 | 内皮细胞基因调控元件及其在心脏咽弓中胚层分化中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 18480 | 2024-12-14 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-Jan-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
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研究论文 | 本文介绍了一种GPU加速的Kendall距离矩阵计算软件GADES，适用于大规模或稀疏数据的处理 | 提出了GPU加速的Kendall-$ au$距离矩阵计算方法，并解决了数据稀疏性带来的算法挑战 | 未提及具体的局限性 | 开发高效的计算策略，用于高性能的Kendall距离矩阵计算 | 大规模或稀疏的多维数据集，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | GPU加速计算 | NA | 数据矩阵 | 未提及具体的样本数量 | NA | NA | NA | NA |