单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 18421 - 18440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18421 | 2024-08-05 |
Slow-Cycling Cells in Glioblastoma: A Specific Population in the Cellular Mosaic of Cancer Stem Cells
2022-Feb-23, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14051126
PMID:35267434
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研究论文 | 本研究探讨了胶质母细胞瘤中慢周期细胞的特性和功能异质性 | 首次揭示了慢周期细胞与表型定义的癌症干细胞之间的显著异质性和独特性 | 研究中未深入探讨细胞间的交互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 研究胶质母细胞瘤中癌症干细胞群体的异质性 | 重点比较胶质母细胞瘤中的慢周期细胞与通常富集癌症干细胞的细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 流式细胞术、RNA测序、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 研究中解析了22个细胞组成的多个癌症干细胞组 | NA | NA | NA | NA |
| 18422 | 2024-08-05 |
Semiochemical responsive olfactory sensory neurons are sexually dimorphic and plastic
2020-11-24, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.54501
PMID:33231170
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研究论文 | 本研究探讨了基因和经验如何共同作用生成表型变异性，特别是在小鼠的主要嗅觉上皮中 | 识别出了一群性别特异性的嗅觉感知神经元，并发现其在不同性别小鼠中的表现出性别差异，同时揭示了活动依赖基因表达的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能不适用于其他物种 | 研究基因和经验在表现性状变异中的作用 | 主要嗅觉上皮中的嗅觉感知神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达 | 性别分离的小鼠和性别结合的小鼠的嗅觉神经元亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 18423 | 2024-08-05 |
Identification of Repurposable Drugs and Adverse Drug Reactions for Various Courses of COVID-19 Based on Single-Cell RNA Sequencing Data
2020-May-16, ArXiv
PMID:33299905
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据筛选出可重新利用的抗COVID-19药物和不良药物反应 | 首次使用系统生物学方法结合FDA批准的药物和小分子化合物的数据来发现防治COVID-19的新药物 | 未详细探讨所有候选药物的临床适应性和潜在不良反应 | 寻找可重新利用的药物以治疗COVID-19 | 美国FDA批准的药物和前临床小分子化合物 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含轻症和重症COVID-19患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18424 | 2024-08-05 |
Narrow band imaging-based radiogenomics for predicting radiosensitivity in nasopharyngeal carcinoma
2024-Jun, European journal of radiology open
IF:1.8Q3
DOI:10.1016/j.ejro.2024.100563
PMID:38681663
|
研究论文 | 本研究评估了窄带成像内镜在利用放射组学预测鼻咽癌放射敏感性的有效性，并探讨相关的分子机制 | 基于窄带成像的放射组学模型为预测鼻咽癌放射敏感性提供了一种新颖有效的方法 | 论文中未提及研究的局限性 | 研究的目的是评估窄带成像内镜在鼻咽癌放射敏感性预测中的有效性 | 参与研究的对象是57名经过病理诊断的鼻咽癌患者 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | RNA测序 | 随机森林算法 | 图像 | 57名鼻咽癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18425 | 2024-08-04 |
Identification of eight genes associated with recurrent patellar dislocation
2024-May-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.109697
PMID:38680665
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研究论文 | 本研究首次通过全外显子测序识别与反复髌骨脱臼相关的八个基因 | 识别出CPD基因与反复髌骨脱臼的相关性，提供了全新的视角来理解该疾病 | 研究可能缺乏大样本验证，样本的多样性有待提升 | 识别反复髌骨脱臼的易感基因并探讨其潜在发病机制 | 关注反复髌骨脱臼患者的基因组特征 | NA | NA | 全外显子测序 (WES) | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18426 | 2024-08-04 |
Stratification and prognostic evaluation of breast cancer subtypes defined by obesity-associated genes
2024-Apr-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-024-00988-0
PMID:38676834
|
研究论文 | 研究探讨与肥胖相关基因定义的乳腺癌亚型的分层与预后评估 | 识别了七个中心基因作为乳腺癌的分子诊断生物标志物，并提出了通过神经网络模型进行有效的诊断 | 七个中心基因作为预后分子标志物表现不佳，生存预测AUC值大多数低于0.5 | 研究肥胖作为乳腺癌风险因素对其机制的影响 | 1226名乳腺癌患者，其被分为BRCA亚型1和亚型2 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR，RNA转录组数据分析 | 神经网络模型 | 基因表达数据 | 1226名乳腺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18427 | 2024-08-05 |
Integrative analysis of metabolomics and transcriptomics to uncover biomarkers in sepsis
2024-04-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-59400-0
PMID:38678059
|
研究论文 | 利用代谢组学结合RNA测序识别脓毒症患者血液中的生物标志物并发现新的诊断和治疗靶点 | 首次联合应用代谢组学和转录组学，鉴定脓毒症特异性生物标志物和靶基因 | 样本量较小，仅包含16个脓毒症患者和11个系统性炎症反应综合症患者 | 识别脓毒症的生物标志物和潜在靶点 | 脓毒症患者和系统性炎症反应综合症患者的血液样本 | 数字病理学 | 脓毒症 | 液相色谱-质谱联用技术（LC-MS/MS）和RNA测序 | NA | 代谢物和基因数据 | 16个脓毒症患者和11个SIRS患者的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18428 | 2024-08-05 |
Synergistic induction of tertiary lymphoid structures by chemoimmunotherapy in bladder cancer
2024-Apr, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02598-7
PMID:38332180
|
研究论文 | 本文研究了在膀胱癌中，通过化疗和免疫疗法的联合使用促进三级淋巴结构的形成 | 首次系统评估了化疗和免疫疗法对膀胱癌患者免疫反应和淋巴结构成熟的联合效应 | 未提供对其他类型癌症的验证或比较研究 | 探讨其他治疗方式与免疫疗法联合使用以提高膀胱癌患者免疫反应的可能性 | 膀胱癌患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | RNA数据 | 包括接受免疫检查点抑制剂和化疗的膀胱癌患者相关样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18429 | 2024-08-04 |
CPPLS-MLP: a method for constructing cell-cell communication networks and identifying related highly variable genes based on single-cell sequencing and spatial transcriptomics data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae198
PMID:38678387
|
研究论文 | 提出了一种基于单细胞测序和空间转录组数据的新方法CPPLS-MLP，用于构建细胞间通信网络并识别相关的高度变异基因 | 该方法通过更准确地识别与细胞通信密切相关的高度变异基因，提供了一种新的视角来构建细胞间通信网络 | 目前尚未提及该方法在特定情境下的局限性或潜在问题 | 探索细胞间通信与高度变异基因之间的关系 | 重点研究细胞间通信网络及其相关的高度变异基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 (scRNA-seq), 空间转录组 | CPPLS-MLP | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18430 | 2024-08-04 |
scBOL: a universal cell type identification framework for single-cell and spatial transcriptomics data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae188
PMID:38678389
|
研究论文 | 提出了一种名为scBOL的通用细胞类型识别框架，用于单细胞和空间转录组数据 | 首次提出了普遍细胞类型识别这一新任务，并设计了从双边原型对齐角度出发的端到端算法 | 该研究的限制未在摘要中具体说明 | 开发一种能够有效标注单细胞转录组数据的通用方法，适应于空间和非空间维度 | 单细胞转录组和空间转录组数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 自动编码器神经网络和图卷积网络 | 原型学习 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18431 | 2024-08-05 |
scINRB: single-cell gene expression imputation with network regularization and bulk RNA-seq data
2024-Mar-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae148
PMID:38600665
|
研究论文 | 提出了一种基于网络正则化和批量RNA-seq数据的单细胞基因表达填充方法scINRB | scINRB通过网络正则化非负矩阵分解保持细胞间和基因间的相似性，并结合批量RNA-seq数据的信息 | 尽管scINRB表现出色，但研究的适用性和数据类型可能仍受限于特定的实验条件 | 开发一种准确且稳健的单细胞基因表达数据填充方法 | 主要研究单细胞RNA测序数据中的基因表达缺失（dropout事件） | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 非负矩阵分解 | 数据集 | 在模拟和实验数据集上进行测试 | NA | NA | NA | NA |
| 18432 | 2024-08-05 |
The Characteristics of Macrophage Heterogeneity in Atherosclerotic Aortas
2024-02, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-023-10434-1
PMID:37713049
|
研究论文 | 本文研究了动脉粥样硬化中巨噬细胞亚群的特征 | 通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群的不同表型和功能特性 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏大型临床样本的验证 | 探讨巨噬细胞在动脉粥样硬化中的作用及其异质性 | 动脉粥样硬化中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 6个亚群（基于单细胞分析） | NA | NA | NA | NA |
| 18433 | 2024-08-05 |
A Novel Four-Gene Signature Based on Nonsense-Mediated RNA Decay for Predicting Prognosis in Hepatocellular Carcinoma: Bioinformatics Analysis and Functional Validation
2024, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S450711
PMID:38680213
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研究论文 | 本文提出了一种基于无义介导的RNA降解(NMD)的四基因风险模型，用于预测肝细胞癌的预后 | 创新的NMD风险模型通过四个NMD相关基因有效区分肝细胞癌的高低风险组 | 尚未提及具体的临床试验数据来进一步支持模型的临床适用性 | 研究NMD在肝细胞癌预后方面的潜力 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | LASSO-Cox回归 | 无 | 基因表达数据 | 374个肝细胞癌样本和50个正常肝样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18434 | 2024-08-04 |
Single cell and spatial transcriptomics analysis of kidney double negative T lymphocytes in normal and ischemic mouse kidneys
2023-11-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-48213-2
PMID:38017015
|
研究论文 | 本文探讨了小鼠正常和缺血性肾脏中双阴性T淋巴细胞的单细胞与空间转录组学分析 | 研究首次揭示了相比传统CD4和CD8T细胞，DN T细胞在急性肾损伤中的分子特征和空间动态 | 对于DN T细胞的研究信息仍然非常有限，与CD4和CD8细胞的比较尚需进一步研究 | 阐明急性肾损伤期间DN T细胞的分子特征和空间动态 | 小鼠的DN、CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和空间转录组学 | NA | RNA数据 | 排序的小鼠DN、CD4和CD8细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18435 | 2024-08-05 |
Uncovering the Heterogeneity of Cardiac Lin-KIT+ Cells: A scRNA-seq Study on the Identification of Subpopulations
2023-10-08, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad057
PMID:37539750
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析心脏Lin-KIT+细胞的异质性及其亚群体。 | 该研究揭示并分类了心脏KIT细胞的三种主要亚群体及其独特的代谢适应性。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类心脏细胞的特性。 | 揭示心脏Lin-KIT+细胞的异质性并识别其亚群体及标记物。 | 成年小鼠心脏来源的细胞群体。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 成年小鼠心脏细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18436 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq defines dynamic T-cell subsets in longitudinal colon and peripheral blood samples in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007358
PMID:37586769
|
研究论文 | 这篇文章研究了在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎中动态变化的T细胞亚群 | 文章通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序识别了在结肠炎不同阶段的T细胞群体特征 | 这个研究是基于单一患者的样本，结果可能无法广泛应用于所有患者 | 旨在深入理解免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎过程中的免疫环境变化 | 研究对象为接受了pembrolizumab治疗并发生结肠炎的Merkel细胞癌患者 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体测序 | NA | 血液和结肠组织样本 | 一个患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18437 | 2024-08-04 |
SUMA: a lightweight machine learning model-powered shared nearest neighbour-based clustering application interface for scRNA-Seq data
2023, Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi
DOI:10.55730/1300-0152.2675
PMID:38681777
|
研究论文 | 本文介绍了SUMA，一个轻量级的机器学习模型驱动的共享最近邻聚类应用界面，用于scRNA-Seq数据 | SUMA使用随机森林模型预测邻居的最优数量，从而获得最佳聚类结果，并集成了多种常用方法 | 主要依赖用户定义的参数，可能会影响聚类结果的有效性 | 开发一种有效的工具用于单细胞转录组数据的聚类和细胞类型标注 | 公开的scRNA-Seq数据集及三种不同的基于图形的聚类算法 | 机器学习 | NA | 随机森林 | NA | 基因表达数据 | 多个公开可用的scRNA-Seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 18438 | 2024-08-05 |
StemnesScoRe: an R package to estimate the stemness of glioma cancer cells at single-cell resolution
2023, Turkish journal of biology = Turk biyoloji dergisi
DOI:10.55730/1300-0152.2672
PMID:38681778
|
研究论文 | 本研究开发了一个用于估计胶质瘤癌细胞干性指数的R软件包StemnesScoRe，达到单细胞分辨率。 | 首次使用scATAC-seq数据构建了特定于胶质瘤的干性评分模型。 | 尚未提及本研究的具体局限性 | 旨在更好地理解胶质瘤细胞的干性特征。 | 研究对象为胶质瘤癌症干细胞。 | 机器学习 | 胶质瘤 | scATAC-seq | 随机森林、梯度提升、极端梯度提升 | 转录组和表观基因组数据 | 涉及多个患者的胶质瘤单细胞RNA-seq数据和scATAC-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18439 | 2024-08-05 |
scATACpipe: A nextflow pipeline for comprehensive and reproducible analyses of single cell ATAC-seq data
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.981859
PMID:36238687
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研究论文 | 提出了一种名为scATACpipe的Nextflow管道，用于全面和可重复地分析单细胞ATAC-seq数据 | 开发了一个易于使用、可扩展、可重复的scATAC-seq数据分析管道，填补了当前的工具和管道之间的空白 | 没有明显提到的局限性 | 旨在提供一个全面的单细胞ATAC-seq数据分析管道 | 针对单细胞ATAC-seq数据的质量评估、预处理、降维、聚类等 | 数字病理学 | NA | ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 使用公共数据集进行验证，未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 18440 | 2024-08-05 |
Ocular macrophage origin and heterogeneity during steady state and experimental choroidal neovascularization
2020-Nov-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-020-02010-0
PMID:33187533
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠和人类眼部巨噬细胞在稳态和实验性脉络膜新生血管形成中的起源与异质性 | 首次揭示了小鼠和人类眼部巨噬细胞亚群的组成及其在疾病中的功能差异 | 尚未明确人类巨噬细胞亚群的所有功能特点和生物学意义 | 研究眼部巨噬细胞在稳态和病理状态下的异质性及其起源 | 小鼠模型及人类nAMD患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 与年龄相关的黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | Cx3cr1CreER/+ ; Rosa26zsGFP/+小鼠模型 | RNA数据 | 涉及的小鼠和人类样本数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |