单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28846 篇文献，本页显示第 18321 - 18340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18321 | 2024-08-07 |
Targeted Single-cell Isolation of Spontaneously Escaping Live Melanoma Cells for Comparative Transcriptomics
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0305
PMID:37575281
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞分离技术，用于详细分析黑色素瘤生长和侵袭的三维数据，并能够分离具有不同形态和侵袭参数的自发侵袭性癌细胞 | 该技术通过表达光转换荧光蛋白，标记并分离了处于不同迁移状态的癌细胞，进行了单细胞RNA测序，为研究癌细胞在不同状态下的转录组提供了新方法 | 主要由于缺乏直接比较不同迁移状态下自发侵袭性癌细胞转录组的方法，导致调控上皮、间质和阿米巴状态之间转换的基因转录仍不完全清楚 | 研究癌细胞从上皮样状态向侵袭性迁移状态转变过程中的基因转录变化 | 黑色素瘤细胞及其在不同迁移状态下的转录组 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 462个差异表达基因 |
| 18322 | 2024-08-07 |
scNCL: transferring labels from scRNA-seq to scATAC-seq data with neighborhood contrastive regularization
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad505
PMID:37584660
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研究论文 | 本文提出了一种新的迁移学习方法scNCL，利用先验知识和对比学习解决scRNA-seq到scATAC-seq数据的信息传递问题 | scNCL通过引入邻域对比学习来保留scATAC-seq细胞在原始特征空间中的邻域结构，并使用特征投影损失和对齐损失来协调scRNA-seq和scATAC-seq之间的嵌入 | NA | 开发一种新的迁移学习方法，以克服scATAC-seq数据的高维度、极端稀疏性和大规模带来的细胞类型识别挑战 | scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | 对比学习 | NA | 基因活性矩阵 | 百万级数据集 |
| 18323 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
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研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序和生物信息学方法分析了心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 首次系统比较了心脏成纤维细胞的转录组特征，并揭示了其在不同发育阶段的作用 | NA | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 心脏成纤维细胞及其在心脏发育中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 18个阶段来自两种小鼠品系的心脏成纤维细胞 |
| 18324 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome and Pigment Biochemistry Analysis Reveals the Potential for the High Nutritional and Medicinal Value of Purple Sea Cucumbers
2023-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512213
PMID:37569587
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研究论文 | 本文分析了紫色海参的单细胞转录组和色素生物化学，以揭示它们的营养和药用价值 | 首次通过单细胞RNA-seq揭示了海参色彩形态的基因活性和相应的细胞群体 | 缺乏对活性化学物质来源的深入了解 | 研究紫色海参的营养和药用价值，及其色素的生物化学机制 | 紫色海参及其色素合成相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 18325 | 2024-08-05 |
A Review of Single-Cell RNA-Seq Annotation, Integration, and Cell-Cell Communication
2023-07-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12151970
PMID:37566049
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综述 | 本综述评估了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析方法和工具的当前状况 | 强调了新工具的发展，用于注释单细胞数据、整合和解释多模态数据集 | 讨论了在scRNA-seq分析中遇到的挑战，包括稀疏性或低表达问题、细胞注释的可靠性等 | 旨在增强单细胞RNA测序分析的理解和应用 | 涉及单细胞RNA测序和细胞间通信的研究对象 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
| 18326 | 2024-08-05 |
Application of single-cell omics in inflammatory bowel disease
2023-Jul-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i28.4397
PMID:37576705
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞组学在炎症性肠病的应用 | 通过单细胞组学技术，识别了肠道免疫系统中的关键免疫细胞并探索了功能异质性 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在深入理解炎症性肠病中的复杂粘膜免疫系统 | 研究对象为炎症性肠病患者的粘膜组织和外周血样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织和血液样本 | NA |
| 18327 | 2024-08-07 |
The Transcriptome Landscape of the In Vitro Human Airway Epithelium Response to SARS-CoV-2
2023-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512017
PMID:37569398
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研究论文 | 研究使用体外人呼吸道上皮细胞模型（ALI和iALI）感染SARS-CoV-2后的基因表达谱变化 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后呼吸道上皮细胞的基因表达变化，特别是干扰素刺激基因和炎症基因的表达增加 | NA | 探究SARS-CoV-2感染对人呼吸道上皮细胞基因表达的影响 | 人呼吸道上皮细胞（ALI和iALI模型） | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了自有的和公开的批量及单细胞转录组数据集 |
| 18328 | 2024-08-05 |
Dissecting the brain with spatially resolved multi-omics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.003
PMID:37577383
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研究论文 | 本论文探讨了空间分辨的多组学技术在解析大脑空间异质性方面的应用 | 介绍了空间转录组学和质谱成像技术在神经科学中的应用 | 需要在活细胞中的实时空间多组学分析以及功能验证的整合应用方面做更多努力 | 研究空间分辨的多组学技术在神经科学中的应用 | 空间基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学技术 | 数字病理学 | 中枢神经系统疾病 | NGS、质谱成像 | NA | 空间组学数据 | NA |
| 18329 | 2024-08-05 |
The role of signaling crosstalk of microglia in hippocampus on progression of ageing and Alzheimer's disease
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.05.008
PMID:37577391
|
研究论文 | 本文研究了小胶质细胞在海马区在衰老和阿尔茨海默病进展中的信号交叉作用 | 研究首次揭示了小胶质细胞在衰老和阿尔茨海默病进程中的免疫调节作用及其信号交叉的复杂性 | 研究仅基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病的生物学机制 | 揭示小胶质细胞在衰老和阿尔茨海默病中的作用机制 | 使用5×FAD小鼠和野生型小鼠进行单细胞测序，分析小胶质细胞的功能和信号通路 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 5×FAD小鼠和野生型小鼠，年龄为2、12和24个月 |
| 18330 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses reveal cannabidiol rewires tumor microenvironment via inhibiting alternative activation of macrophage and synergizes with anti-PD-1 in colon cancer
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.013
PMID:37577382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，揭示了大麻二酚（CBD）通过抑制巨噬细胞的替代激活并增强M1样巨噬细胞，从而调节结直肠肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的效果 | 本研究首次通过单细胞测序技术揭示了CBD如何通过调节巨噬细胞的代谢模式和信号通路，影响肿瘤微环境，并增强抗PD-1免疫疗法的效果 | NA | 阐明大麻二酚（CBD）在结直肠癌中的具体抗癌机制 | 结直肠肿瘤微环境及巨噬细胞的激活状态 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 单细胞转录组和ATAC序列数据 | NA |
| 18331 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the regulatory effects of artesunate on splenic immune cells in polymicrobial sepsis
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.02.006
PMID:37577384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了青蒿琥酯对脓毒症模型小鼠脾脏免疫细胞微环境的保护作用及其机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了青蒿琥酯对脓毒症中脾脏免疫细胞的调节作用 | NA | 探究青蒿琥酯对脓毒症诱导的免疫细胞过度炎症或免疫抑制状态的保护作用及其机制 | 脓毒症模型小鼠的脾脏免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 18332 | 2024-08-07 |
New discoveries in the field of metabolism by applying single-cell and spatial omics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.06.002
PMID:37577385
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综述 | 本文综述了单细胞多组学（SCM-Omics）和空间多组学（SM-Omics）技术在代谢疾病研究中的应用进展 | 结合SCM-Omics和SM-Omics技术，探索细胞的分子和空间分析，为揭示代谢过程的异质性提供了有前景的工具 | NA | 探讨SCM-Omics和SM-Omics技术在代谢相关疾病中的应用，揭示代谢疾病的分子机制 | 代谢相关疾病，包括肥胖、糖尿病、非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和心血管疾病（CVD） | 代谢学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间多组学（SM-Omics） | NA | 细胞 | NA |
| 18333 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of cellular heterogeneity and interactions in the ischemia-reperfusion injured mouse intestine
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.02.002
PMID:37577387
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 发现了新的细胞亚群，如EC1、EC3和EC8，并揭示了它们在消化吸收和细胞连接中的作用 | NA | 研究小鼠肠道缺血再灌注损伤中的细胞异质性和细胞间相互作用 | 小鼠肠道中的九种主要细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 46,716个细胞 |
| 18334 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing and subcellular spatial transcriptomics facilitate the translation of liver microphysiological systems for regulatory application
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.06.013
PMID:37577388
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18335 | 2024-08-07 |
Cux1+ proliferative basal cells promote epidermal hyperplasia in chronic dry skin disease identified by single-cell RNA transcriptomics
2023-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.004
PMID:37577389
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和原位杂交技术，在慢性干燥皮肤疾病模型中识别出一种新型增殖性基底细胞（PBC），该细胞特异性表达转录因子Cux1，并探讨了其在皮肤表皮增生中的作用。 | 首次在干燥皮肤疾病模型中通过单细胞RNA测序技术识别出表达Cux1的增殖性基底细胞，并揭示了Cux1在角质形成细胞增殖中的关键作用。 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床应用的直接证据尚需进一步验证。 | 探讨慢性干燥皮肤疾病中表皮增生的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点。 | 慢性干燥皮肤疾病模型中的增殖性基底细胞及其在表皮增生中的作用。 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型及部分皮肤病患者样本 |
| 18336 | 2024-08-05 |
Therapeutic implications for localized prostate cancer by multiomics analyses of the ageing microenvironment landscape
2023, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.85209
PMID:37564213
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研究论文 | 本文探讨了衰老微环境在前列腺癌中的作用及其治疗意义 | 首次全面阐明了前列腺癌中衰老微环境的复杂特征，并建立了衰老微环境指数(AMI) | 缺乏大规模临床数据以进一步验证AMI的临床相关性 | 研究衰老微环境如何影响前列腺癌的进展及个性化治疗 | 813例前列腺癌患者及其衰老微环境特征 | 数字病理学 | 前列腺癌 | NMF算法、空间转录组学、GDSC、CMap和CellMiner数据库 | NA | 基因组数据、细胞实验数据 | 813例前列腺癌患者 |
| 18337 | 2024-08-05 |
Machine learning-based integration develops a neutrophil-derived signature for improving outcomes in hepatocellular carcinoma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1216585
PMID:37575244
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研究论文 | 本研究开发了一个基于中性粒细胞特征的风险模型，以改善肝细胞癌患者的预后 | 首次将中性粒细胞异质性用于肝细胞癌患者分层，并建立了新的风险模型 | 未详细讨论不同中性粒细胞特征对个体治疗决策的影响 | 探讨中性粒细胞在肝细胞癌免疫微环境中的作用，并开发相关的风险模型 | 肝细胞癌患者的中性粒细胞特征及其与预后的关系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 肿瘤组织大规模测序、单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 涉及了两组肝细胞癌患者 |
| 18338 | 2024-08-05 |
Study on the cytokines related to SARS-Cov-2 in testicular cells and the interaction network between cells based on scRNA-seq data
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0661
PMID:37589002
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研究论文 | 本研究探讨了与SARS-Cov-2相关的细胞因子在睾丸细胞中的表达及其细胞间相互作用网络。 | 研究整合了单细胞测序数据，分析了睾丸细胞中的细胞因子表达和细胞间的通信机制。 | 关于睾丸细胞细胞因子表达的研究相对较少，尚需进一步探索其在其他生理和病理状态下的作用。 | 本研究旨在分析COVID-19中细胞因子风暴对男性生育的潜在影响。 | 研究对象为睾丸细胞及其间的细胞相互作用。 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | NA | 20个细胞簇 |
| 18339 | 2024-08-05 |
Integrative multi-omics analyses unravel the immunological implication and prognostic significance of CXCL12 in breast cancer
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1188351
PMID:37564657
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研究论文 | 本研究综合分析CXCL12在乳腺癌中的免疫学意义和预后价值 | 通过整合多组学分析，识别出CXCL12相关的生物标志物并构建强有力的乳腺癌预后模型 | 尚未说明样本来源和选择标准的具体细节 | 探究CXCL12在乳腺癌中的作用及其相关生物标志物 | 乳腺癌患者的CXCL12表达水平及其与预后的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、WGCNA分析 | Cox回归模型、LASSO回归 | RNA测序数据、基因表达数据 | 总共分析了402个基因，并包括了不同风险组的验前结果 |
| 18340 | 2024-08-05 |
NR2F6, a new immune checkpoint that acts as a potential biomarker of immunosuppression and contributes to poor clinical outcome in human glioma
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1139268
PMID:37575237
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研究论文 | 该研究系统地探索了NR2F6在胶质瘤中的临床特征和生物功能 | 首次调查了NR2F6在胶质瘤中的作用，并提出其可能作为免疫抑制的生物标志物 | 本研究的样本主要来自公共数据库，可能存在样本选择偏倚 | 研究NR2F6在胶质瘤中的作用及其作为免疫检查点的潜力 | NR2F6在663个胶质瘤样本中的表达及其相关临床特征 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 663个胶质瘤样本用于训练，325个样本用于验证，60个样本用于确认 |