单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 18221 - 18240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18221 | 2024-08-08 |
Nanoplastics Shape Adaptive Anticancer Immunity in the Colon in Mice
2023-04-26, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.3c00644
PMID:37043775
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研究论文 | 本研究探讨了纳米塑料（NPs）对小鼠肠道微环境和结直肠癌发展的影响 | 首次揭示了口服聚乙烯纳米塑料通过破坏溶酶体引发IL-1β产生巨噬细胞的活化，进而影响结肠Treg和Th17细胞的分化，促进肿瘤生长 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证结果 | 探究纳米塑料摄入与结直肠癌发生之间的潜在联系 | 纳米塑料对肠道微环境和结直肠癌的影响 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 18222 | 2024-08-08 |
Nodal coordinates the anterior-posterior patterning of germ layers and induces head formation in zebrafish explants
2023-04-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112351
PMID:37018074
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研究论文 | 本文展示了通过应用区域性Nodal梯度于斑马鱼动物极外植体，可以生成模拟原肠运动关键细胞运动的结构，并评估了该结构的细胞命运动态和模式化过程。 | 首次展示了通过区域性Nodal梯度诱导斑马鱼外植体形成前-后模式化的胚层和头部结构，并鉴定了具有轴诱导能力的Nodal靶基因。 | NA | 研究如何完全模拟原肠运动细胞运动和协调胚层模式化以诱导头部形成的方法。 | 斑马鱼动物极外植体及其细胞命运和模式化过程。 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析和原位杂交技术 | NA | 基因表达数据 | 105个Nodal靶基因中的14个具有轴诱导能力，其中5个在斑马鱼胚胎腹侧过表达时能诱导完整或部分头部结构。 |
| 18223 | 2024-08-08 |
Elements of divergence in germline determination in closely related species
2023-Apr-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106402
PMID:37020963
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研究论文 | 本研究通过阶段匹配的单细胞RNA测序数据集，比较了两种近缘海胆物种的原始生殖细胞（PGCs）中的基因表达差异 | 揭示了两种海胆物种在生殖细胞基因表达上的多种差异，并发现了一种3'UTR元件在限制关键基因产物转录后调控中的作用 | NA | 探讨近缘物种间生殖细胞决定过程中的差异 | 两种海胆物种的原始生殖细胞（PGCs） | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 两种海胆物种的原始生殖细胞（PGCs） |
| 18224 | 2024-08-05 |
Structural and functional properties of mSWI/SNF chromatin remodeling complexes revealed through single-cell perturbation screens
2023-04-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2023.03.013
PMID:37028419
|
研究论文 | 本文揭示了mSWI/SNF染色质重塑复合体的结构和功能特性 | 通过单细胞干扰筛选，首次明确了mSWI/SNF亚单位在基因表达中的独特贡献 | 对于某些亚单位的特定功能和与疾病的关联尚未完全定义 | 研究mSWI/SNF复合体的组成亚单位对基因调控和病理的影响 | 针对mSWI/SNF亚单位的个体及组合进行CRISPR-Cas9敲除筛选 | 数字病理学 | 癌症 | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类肿瘤样本的表达谱 |
| 18225 | 2024-08-08 |
Identification of a broadly fibrogenic macrophage subset induced by type 3 inflammation
2023-04-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.add8945
PMID:37027478
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研究论文 | 本研究利用人类肝脏和肺部的单细胞RNA测序数据，识别出一种在III型炎症诱导下产生的新型广泛纤维化巨噬细胞亚群 | 首次识别出一种高度特异性的巨噬细胞群体，并赋予其在跨物种和组织中的促纤维化作用 | NA | 旨在识别人类纤维化组织中的关键巨噬细胞群体，以开发新的纤维化治疗方法 | 人类和鼠类的肝脏及肺部纤维化中的巨噬细胞 | NA | 纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人类和鼠类的肝脏及肺部样本 |
| 18226 | 2024-08-08 |
CD34+ cell-derived fibroblast-macrophage cross-talk drives limb ischemia recovery through the OSM-ANGPTL signaling axis
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add2632
PMID:37043578
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术，研究了CD34+细胞在缺血肢体恢复中的作用及其与巨噬细胞的相互作用。 | 首次提供了人类和小鼠正常及缺血肢体组织的精确单细胞图谱，并揭示了骨髓来源的巨噬细胞在缺血部位的迁移及其在组织再生中的作用。 | NA | 探讨CD34+细胞在缺血肌肉微环境中的分化潜力和功能角色。 | CD34+细胞及其在缺血肢体恢复中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的正常及缺血肢体组织 |
| 18227 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing highlights intratumor heterogeneity and intercellular network featured in adamantinomatous craniopharyngioma
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adc8933
PMID:37043580
|
研究论文 | 本研究通过整合分析44,038个单细胞转录组数据，揭示了 adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）中的肿瘤内异质性和肿瘤微环境（TME）特征 | 本研究首次定义了四种主要的肿瘤细胞状态，揭示了ACP的组织病理学特征和未知的细胞图谱，并识别出与免疫浸润和神经损伤相关的独特少突胶质细胞谱系 | NA | 揭示adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）的肿瘤内异质性和肿瘤微环境特征，以改善临床诊断和治疗策略 | adamantinomatous craniopharyngioma（ACP）的细胞图谱和生物学特征 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 44,038个单细胞 |
| 18228 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics in ovarian cancer identify a metastasis-associated cell cluster overexpressed RAB13
2023-04-12, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04094-7
PMID:37046345
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学研究卵巢癌中的转移相关细胞群体，并识别出其过表达的RAB13 | 本研究首次发现C4细胞亚群与卵巢癌转移及预后不良密切相关，并确认RAB13为其关键标记基因 | 研究的样本数量较少，可能对结果的泛化能力产生影响 | 研究卵巢癌的转移机制及找到新的治疗靶点 | 卵巢癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞数据 | 12个样本 |
| 18229 | 2024-08-05 |
Predictive and robust gene selection for spatial transcriptomics
2023-04-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-37392-1
PMID:37045821
|
研究论文 | 本文介绍了一种灵活的深度学习框架PERSIST，用于为空间转录组学研究挑选信息丰富的基因目标 | 本文的创新点在于提出了PERSIST框架，能够通过参考scRNA-seq数据优化选择小型基因面板 | 没有提到具体的限制因素 | 研究空间转录组学中如何优化基因选择 | 包含不同脑区、物种和scRNA-seq技术的数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | PERSIST | 基因表达数据 | 涉及不同脑区和物种的多组数据集 |
| 18230 | 2024-08-05 |
PUREE: accurate pan-cancer tumor purity estimation from gene expression data
2023-04-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04764-8
PMID:37041233
|
研究论文 | 本文开发了PUREE，一个从肿瘤基因表达数据中推断肿瘤纯度的工具 | PUREE采用弱监督学习方法，能够对未见肿瘤类型和群体的肿瘤样本进行泛化预测 | NA | 研究肿瘤纯度及其对肿瘤异质性的影响 | 7864个固体肿瘤样本的基因表达数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 弱监督学习 | 基因表达数据 | 7864个固体肿瘤样本 |
| 18231 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals novel clonally expanded monocytes associated with IL1β-IL1R2 pair in acute inflammatory demyelinating polyneuropathy
2023-04-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-32427-5
PMID:37041166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了急性炎症性脱髓鞘多发性神经病（AIDP）患者的外周血单个核细胞（PBMCs），揭示了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型及其与IL1β-IL1R2细胞间通讯的关系。 | 首次在AIDP患者中发现了一种新的克隆扩增的CD14+ CD163+单核细胞亚型，并观察到IL1β-IL1R2细胞间通讯的增加。 | 本研究为单中心前瞻性研究，样本量较小，需要进一步的多中心研究来验证结果。 | 通过分析AIDP患者PBMCs的单细胞图谱，加深对吉兰-巴雷综合征（GBS）患者外周免疫细胞组成的理解，并为未来研究提供理论基础。 | 急性炎症性脱髓鞘多发性神经病（AIDP）患者和健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs）。 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 5名AIDP患者和3名健康对照 |
| 18232 | 2024-08-05 |
A single-cell, time-resolved profiling of Xenopus mucociliary epithelium reveals nonhierarchical model of development
2023-04-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add5745
PMID:37027470
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研究论文 | 这篇文章揭示了蛙类粘液纤毛上皮的发育模式及其细胞类型的形成 | 揭示了粘液纤毛上皮的非等级性发育模式和多能早期上皮祖细胞的功能 | 未深入探讨粘液纤毛上皮发育的所有分子机制 | 研究粘液纤毛上皮的发育过程及其细胞命运获取机制 | 研究从多能状态到成熟阶段的粘液纤毛上皮细胞 | 数字病理 | 慢性呼吸系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA成像 | 多能早期上皮祖细胞到成熟细胞的多阶段样本 |
| 18233 | 2024-08-05 |
Ancient ubiquitous protein 1 (AUP1) is a prognostic biomarker connected with TP53 mutation and the inflamed microenvironments in glioma
2023-Apr-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02912-y
PMID:37029364
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研究论文 | 这篇文章研究了古老普遍蛋白1 (AUP1) 在胶质瘤中的预后作用及其与TP53突变和炎性微环境的关系 | 发现AUP1与TP53状态、肿瘤突变负担以及肿瘤增殖相关并首次评估其在胶质瘤中的角色 | 未能发现AUP1抑制与自噬活性改变之间的直接联系，可能需要进一步研究 | 探讨AUP1在胶质瘤中的作用及其作为预后生物标记的潜力 | 主要研究胶质瘤及其相关临床标志物 | 数字病理学 | 胶质瘤 | mRNA测序、蛋白质组学、全外显子组测序和免疫组化染色 | U87MG细胞系 | mRNA、蛋白质、临床案例 | 78个临床案例和多个数据集的单细胞测序数据 |
| 18234 | 2024-08-08 |
N,N-Dimethyl-3β-hydroxycholenamide attenuates neuronal death and retinal inflammation in retinal ischemia/reperfusion injury by inhibiting Ninjurin 1
2023-Apr-07, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02754-5
PMID:37029422
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研究论文 | 研究N,N-二甲基-3β-羟基胆甾胺（DMHCA）通过抑制Ninjurin 1减轻视网膜缺血/再灌注损伤中的神经元死亡和视网膜炎症 | 首次揭示了DMHCA通过抑制Ninjurin 1在视网膜缺血/再灌注损伤中的神经保护作用，并提供了单细胞RNA测序的新见解 | 文章未提及具体的局限性 | 探讨DMHCA在视网膜缺血/再灌注损伤中的效果及其分子机制 | DMHCA处理的小鼠视网膜缺血/再灌注损伤及DMHCA处理后的微胶质细胞 | NA | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 18235 | 2024-08-08 |
Comprehensive analysis of cuproptosis-related immune biomarker signature to enhance prognostic accuracy in gastric cancer
2023-04-07, Aging
DOI:10.18632/aging.204646
PMID:37036489
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研究论文 | 本研究探讨了铜依赖性程序性细胞死亡机制——铜死亡相关免疫基因（CRIGs）在胃癌（GC）中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 | 首次揭示了CRIGs在胃癌中的功能，并建立了一个有效的铜死亡相关免疫生物标志物签名，用于准确预测胃癌患者的长期生存 | NA | 挖掘铜死亡相关免疫基因在胃癌中的潜在功能及其作为生物标志物的价值 | 胃癌及其免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | scRNA-seq, 免疫组织化学 | Cox和LASSO分析 | 转录组数据, 临床信息 | 数据来自TCGA, GTEx, 和GEO数据库 |
| 18236 | 2024-08-05 |
Identification of cell barcodes from long-read single-cell RNA-seq with BLAZE
2023-04-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02907-y
PMID:37024980
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研究论文 | 文章介绍了BLAZE，这是一种用于仅依赖纳米孔长读长单细胞RNA测序数据识别细胞条形码的方法 | BLAZE准确高效地识别10x细胞条形码，而不依赖于匹配的短读数据 | NA | 旨在简化长读单细胞RNA测序并提高结果质量 | 长读单细胞RNA测序数据中的细胞条形码 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 长读RNA测序数据 | NA |
| 18237 | 2024-08-05 |
Prognostic values of tissue-resident CD8+T cells in human hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2023-Apr-06, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-023-03009-6
PMID:37024870
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研究论文 | 该研究分析了组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 | 首次系统描述了肝细胞癌和肝内胆管癌中CD8+T细胞的表达及其预后相关性 | 本研究的样本量和单细胞RNA测序分析可能存在选择偏倚 | 探讨组织驻留CD8+T细胞在肝细胞癌和肝内胆管癌中的预后价值 | 人类肝细胞癌和肝内胆管癌中的组织驻留CD8+T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重免疫组化（mIHC）和成像分析 | NA | 组织样本 | 使用了肝细胞癌和肝内胆管癌的组织微阵列 |
| 18238 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microevolution of the Stickleback Immune System
2023-04-06, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evad053
PMID:37039516
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研究论文 | 本研究揭示了三刺鱼免疫系统微进化的特征 | 首次创建了三刺鱼的综合免疫细胞图谱，并展示了免疫细胞类型之间显著的变异 | 研究的样本量相对较小，仅包含来自三个种群的九条鱼 | 探讨三刺鱼种群间免疫系统的微进化 | 三刺鱼（Gasterosteus aculeatus）和寄生虫感染相关免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 九条鱼，来自三个不同的种群 |
| 18239 | 2024-08-05 |
Cynomolgus monkey embryo model captures gastrulation and early pregnancy
2023-04-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.03.009
PMID:37028403
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研究论文 | 构建了与人类胚胎形态和转录组相似的猕猴胚胎模型，观察其发育潜力 | 首次展示了猕猴胚胎在体外发生胃肠形成与体内早期妊娠的能力 | 未对比不同胚胎发展阶段的各种模型 | 探讨猕猴胚胎的发育潜力并在伦理上对人类胚胎研究进行替代 | 猕猴胚胎模型 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞、胚胎组织 | 使用猕猴胚胎模型进行的多次实验，具体样本量未说明 |
| 18240 | 2024-08-08 |
FIPRESCI: droplet microfluidics based combinatorial indexing for massive-scale 5'-end single-cell RNA sequencing
2023-04-06, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-02893-1
PMID:37024957
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研究论文 | 本文介绍了一种基于液滴微流控技术的组合索引方法FIPRESCI，用于大规模5'端单细胞RNA测序 | FIPRESCI方法通过大规模样本复用，将液滴微流控系统的通量提高了十倍以上 | NA | 开发一种超高通量的5'端单细胞RNA测序方法 | 小鼠胚胎和12名癌症患者的外周血T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | 约100,000个单细胞转录组 |