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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1801 | 2025-10-06 |
EGCG-releasing nanofibrous scaffold enhances wound healing via γδ T cells modulation
2026-Feb, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种释放EGCG的纳米纤维支架,通过调节γδ T细胞活性促进伤口愈合 | 首次将具有对齐拓扑结构的EGCG释放纳米纤维支架与γδ T细胞调节机制相结合用于伤口愈合治疗 | 研究仅在C57BL/6J小鼠模型中进行,缺乏临床验证 | 探索γδ T细胞在EGCG释放纳米纤维支架促进伤口愈合中的作用机制 | 6-8周龄雄性C57BL/6J小鼠的伤口愈合模型 | 组织工程 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠伤口模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1802 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts regulating nanomedicine to overcome sorafenib resistance in hepatocellular carcinoma with portal vein tumor thrombus
2026-Feb, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向门静脉癌栓的纳米载体,通过共同递送siRNA和多激酶抑制剂来克服肝细胞癌对索拉非尼的耐药性 | 首次开发了靶向PVTT的纳米载体系统,通过下调CAFs中CXCL12表达来重塑肿瘤微环境并克服索拉非尼耐药 | 研究目前仅在原位小鼠模型中进行验证,尚未进入临床试验阶段 | 开发新型纳米药物以克服肝细胞癌门静脉癌栓对索拉非尼的耐药性 | 肝细胞癌门静脉癌栓模型和癌症相关成纤维细胞 | 纳米医学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原位小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
1803 | 2025-10-06 |
Evolution of comparative transcriptomics: biological scales, phylogenetic spans, and modeling frameworks
2025-Oct, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2025.102387
PMID:40774064
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综述 | 本文探讨比较转录组学在生物尺度、系统发育范围和建模框架三个方向上的演变趋势 | 系统总结了比较转录组学从组织器官水平向细胞类型中心的范式转变,以及从有限模式生物向更广泛系统发育覆盖的扩展 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据和分析方法的局限性 | 探讨比较转录组学领域的发展方向和未来趋势 | 比较转录组学研究的方法论和发展路径 | 自然语言处理 | NA | RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1804 | 2025-10-06 |
Inhibition of Macrophage ARID3A Alleviates Myocardial Ischemia-Reperfusion Injury After Heart Transplantation by Reducing THBS1/CD47 Signaling-Mediated Neutrophil Extracellular Traps Formation
2025-Sep-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509952
PMID:40913516
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞ARID3A通过调控THBS1/CD47信号通路影响中性粒细胞胞外诱捕网形成,从而加剧心脏移植后心肌缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现M1巨噬细胞通过THBS1/CD47轴促进NETs形成,并鉴定4-OI作为特异性抑制ARID3A的治疗候选物 | 中性粒细胞与其他非心肌细胞相互作用的精确机制仍需进一步探索 | 探究心脏移植后心肌缺血再灌注损伤的分子机制及治疗策略 | 小鼠模型中的巨噬细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 髓系特异性ARID3A基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1805 | 2025-09-07 |
Comment on "Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network pharmacology"
2025-Sep-06, Urolithiasis
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00240-025-01839-5
PMID:40913665
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1806 | 2025-10-06 |
Systemic comparison of molecular characteristics in different skin fibroblast senescent models
2025-Sep-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003312
PMID:39329281
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研究论文 | 系统比较不同皮肤成纤维细胞衰老模型的分子特征 | 首次系统比较四种不同诱导方式(UVB照射、D-半乳糖刺激、阿扎那韦处理、复制衰竭诱导)产生的皮肤成纤维细胞衰老模型与天然衰老细胞的转录组特征差异 | 研究仅关注转录组水平特征,未涉及蛋白质组或表观遗传学层面的验证 | 比较不同衰老模型与天然衰老皮肤成纤维细胞的分子特征差异 | 人类皮肤原代成纤维细胞(来自儿童和老年人)及四种衰老模型细胞 | 细胞生物学 | 皮肤衰老相关疾病 | 流式细胞术、免疫荧光染色、实时定量PCR、免疫细胞共培养、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 儿童和老年人皮肤成纤维细胞样本及四种衰老模型 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1807 | 2025-10-06 |
What makes the human brain special - from cellular function to clinical translation
2025-Sep-05, Journal of neurophysiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1152/jn.00120.2025
PMID:40912899
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综述 | 本文综述了人类大脑在神经元、胶质细胞和皮层回路方面的物种特异性差异及其临床转化研究 | 整合多模态研究方法系统阐述人类大脑从分子表达到系统水平的独特性,并关注动物研究向临床转化的挑战 | NA | 探索人类大脑相较于其他物种的特殊性及其临床转化潜力 | 人类脑组织样本中的神经元、胶质细胞和皮层回路 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞记录、网络记录、单细胞转录组学、形态学分析 | NA | 转录组数据、形态学数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1808 | 2025-10-06 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Sep-05, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了长期低剂量率辐射诱导肿瘤细胞恶性演化的动态过程 | 首次发现长期低剂量率辐射通过ANGPTL4-SDC4配体-受体对促进肿瘤恶性演化,并系统阐明了其分子机制 | 研究主要基于BEAS-2B细胞系,需要在更多细胞类型和体内模型中进一步验证 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤细胞恶性演化的影响及其分子机制 | BEAS-2B细胞系及辐射诱导的肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, FACS, 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | 细胞轨迹分析, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 蛋白互作数据 | BEAS-2B细胞系建立的辐射模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1809 | 2025-10-06 |
STAMP: Single-cell transcriptomics analysis and multimodal profiling through imaging
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.05.027
PMID:40532697
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研究论文 | 开发了一种名为STAMP的新型单细胞分析方法,通过成像平台实现转录组和蛋白质组的多模态分析 | 通过成像技术替代传统测序,实现低成本、高通量的单细胞多模态分析,同时保留细胞结构和形态 | NA | 克服传统单细胞RNA测序的可扩展性、成本高和细胞破坏等限制 | 外周血单核细胞、细胞系和干细胞 | 数字病理 | NA | 转录组成像、蛋白质组成像、H&E染色 | NA | 图像、转录组数据、蛋白质组数据 | 10,962,092个高质量细胞/核和6,030,429,954个转录本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | STAMP成像平台 |
1810 | 2025-10-06 |
Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023
PMID:40645177
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研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠模型,评估联合抗逆转录病毒疗法与MCL-1抑制剂对HTLV-1c感染的预防和治疗效果 | 首次发现HTLV-1c感染导致细胞内在凋亡失调,并证明MCL-1特异性抑制剂(而非其他BCL-2家族蛋白抑制剂)能有效清除HTLV-1c感染细胞 | 研究基于人源化小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对HTLV-1c感染的有效预防和治疗策略 | 人源化小鼠模型和HTLV-1c感染细胞 | 传染病学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 细胞内流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
1811 | 2025-10-06 |
Bone marrow immune remodeling in depression: TNF/NF-κB mediated leukocyte redistribution and construction of an interpretable predictive model
2025-Sep-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115487
PMID:40911995
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研究论文 | 本研究通过建立心理应激小鼠模型,系统研究了应激诱导的免疫失调机制,并构建了基于外周血参数的抑郁症预测模型 | 揭示了TNF/NF-κB通路介导的骨髓免疫重塑在应激诱导抑郁症中的调控作用,并构建了可解释的机器学习预测模型 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索抑郁症的神经免疫相互作用机制并开发临床诊断生物标志物 | 心理应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络,机器学习,SHAP分析 | 随机森林(RF) | 血液细胞参数,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 心理应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1812 | 2025-10-06 |
Essential role of CD56dimNKG2C+ NK cells trained by SARS-CoV-2 vaccines in protecting against COVID-19
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.05.031
PMID:40450518
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研究论文 | 本研究揭示了SARS-CoV-2灭活疫苗通过训练CD56dimNKG2C+ NK细胞与巨噬细胞协同作用在预防COVID-19中的关键机制 | 首次发现疫苗训练的特定NK细胞亚群(CD56dimNKG2C+)与M2样巨噬细胞在肺部保护中的协同作用,并揭示老年人群接种后这些适应性细胞缺失的现象 | 研究主要使用恒河猴模型,人类样本验证有限;老年人群样本特征需进一步扩大验证 | 评估SARS-CoV-2疫苗在先天免疫层面的保护机制 | 恒河猴模型和人类外周血单个核细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 恒河猴模型和人类参与者(包括年轻和老年群体) | NA | 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 | NA | NA |
1813 | 2025-10-06 |
CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.06.021
PMID:40534129
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系统综述 | 本系统综述总结了CRISPR基因编辑技术在囊性纤维化治疗中的应用进展 | 通过跨研究比较分析27篇文献,系统评估了不同CRISPR技术对CFTR基因突变的编辑效率和功能恢复效果 | 缺乏编辑效率和功能恢复的标准化报告,需要更多单细胞RNA测序和体内研究来获得临床相关结论 | 评估CRISPR基因编辑技术在囊性纤维化治疗中的技术进展和应用前景 | 囊性纤维化相关的CFTR基因突变 | 基因编辑 | 囊性纤维化 | CRISPR基因编辑技术,包括同源定向修复、碱基编辑和引物编辑 | NA | 文献数据 | 27篇研究文章 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1814 | 2025-10-06 |
Recognition of molecular clusters and a novel prognostic signature based on natural killer cell-related genes in skin cutaneous melanoma
2025-Sep-03, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03975-z
PMID:40903770
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研究论文 | 基于自然杀伤细胞相关基因识别皮肤黑色素瘤的分子亚型并构建新型预后特征 | 首次基于NK细胞相关基因对皮肤黑色素瘤进行分子分型,并构建了12基因预后特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗靶点 | 皮肤黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 体细胞突变分析 | 多机器学习算法组合, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO、GTEx等公共数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1815 | 2025-10-06 |
NUTM2A-AS1 as a potential key regulator in cancer: unraveling its ceRNA networks and impact on tumor biology
2025-Sep-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03019-y
PMID:40903777
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综述 | 本文全面综述了长链非编码RNA NUTM2A-AS1在多种癌症中的ceRNA调控网络及其对肿瘤生物学的影响 | 系统揭示了NUTM2A-AS1作为ceRNA通过不同miRNA-mRNA轴在多种癌症中的调控机制,并首次整合其在八种不同癌症类型中的功能 | 主要基于现有文献综述,缺乏原创性实验验证和临床数据支持 | 阐明NUTM2A-AS1在癌症发生发展中的调控机制及其临床转化潜力 | NUTM2A-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症中的ceRNA网络 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析,CRISPR,单细胞RNA测序 | NA | 文献数据,表达谱数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1816 | 2025-10-06 |
Establishment of Drosophila intestinal cell lines as tools for multiomic screening and deciphering intestinal biology
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17336-z
PMID:40897748
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研究论文 | 本研究首次建立了果蝇肠道细胞系,为肠道生物学研究提供了新工具 | 首次成功建立果蝇肠道来源的细胞系,填补了该领域长期缺乏细胞系资源的空白 | NA | 建立果蝇肠道细胞系作为多组学筛选工具并解析肠道生物学 | 果蝇肠道细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1817 | 2025-10-06 |
Single cell RNA seq reveals the pro-regenerative phenotype of thrombospondin-2 deficient dermal fibroblasts
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15839-3
PMID:40897801
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示血小板反应蛋白-2缺陷型真皮成纤维细胞具有促再生表型 | 首次在单细胞水平揭示TSP2缺陷导致真皮成纤维细胞异质性改变,发现Sox10+多能祖细胞富集和纤维化亚群减少 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究TSP2缺陷对真皮成纤维细胞异质性和组织修复能力的影响 | 野生型和TSP2敲除小鼠皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 组织修复与再生 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 计算机模拟分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | WT和TSP2 KO小鼠皮肤成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1818 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of retinoblastoma: a visual window on intra-patient heterogeneity
2025-Sep-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14814-5
PMID:40898088
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析视网膜母细胞瘤的组织学异质性,首次实现相邻分子亚型的空间定位 | 首次在视网膜母细胞瘤中实现分子亚型1和2的相邻空间定位,揭示组织学特征与分子谱的强相关性 | 仅分析单个病例样本,样本量有限,需要更多病例验证 | 探索视网膜母细胞瘤的组织学异质性与分子亚型的关系 | 视网膜母细胞瘤患者眼球切除标本中的不同分化区域 | 空间转录组学 | 视网膜母细胞瘤 | 空间转录组学,免疫组织化学 | 聚类分析 | 空间转录组数据,组织图像 | 1例原发性视网膜母细胞瘤病例,16个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1819 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of pig skin reveals cellular heterogeneity from embryonic development to postnatal aging
2025-Sep-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02390-w
PMID:40898171
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研究论文 | 构建了涵盖10个发育阶段的猪皮肤单细胞转录组图谱,揭示了从胚胎发育到出生后衰老的细胞异质性变化 | 首次在猪皮肤中构建从胚胎期到老年期的完整单细胞图谱,发现新型AUTS2⁺成纤维细胞亚型及其神经调节功能 | 研究主要基于猪模型,人类直接适用性需要进一步验证 | 解析皮肤从胚胎发育到衰老过程中的细胞动态变化和分子机制 | 荣昌猪皮肤组织 | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析,跨物种比较分析 | 单细胞转录组数据 | 443,529个细胞,涵盖胚胎第56天至出生后7年共10个发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1820 | 2025-10-06 |
Mapping T cell dynamics to molecular profiles through behavior-guided transcriptomics
2025-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01126-4
PMID:39930061
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研究论文 | 开发了一种将T细胞活体成像数据与单细胞转录组学整合的方法,用于分析动态T细胞行为相关的基因程序 | 将BEHAV3D活体成像平台与单细胞RNA测序相结合,创建了行为引导转录组学(BGT)方法,能够关联T细胞动态行为与分子特征 | 需要使用者具备基本的细胞培养、成像和编程技能,实验周期较长(一个月) | 开发整合T细胞动态行为与转录组分析的方法,识别功能性T细胞的生物标志物 | 患者来源的肿瘤类器官(PDO)与工程化T细胞的共培养体系 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 活体成像, 荧光激活细胞分选 | BEHAV3D平台, 计算机模拟 | 图像数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 活体成像 | NA | BEHAV3D三维活体成像平台 |