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当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 1801 - 1820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2026-02-27 |
Toward informed batch correction for single-cell transcriptome integration
2026-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00943-1
PMID:41699077
|
综述 | 本文回顾了单细胞转录组数据整合中常用的批次效应校正方法，并展望了未来框架的发展方向 | 提出未来批次校正框架应学习可解释的基因和细胞表示，并实现对技术和生物变异的知情建模 | NA | 探讨单细胞转录组数据整合中的批次效应校正问题 | 单细胞转录组数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1802 | 2026-02-27 |
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71279
PMID:41733593
|
研究论文 | 本研究整合多组转录组数据和机器学习方法，识别并验证了神经损伤的新型生物标志物，并阐明了其在神经免疫互作中的功能 | 首次整合WGCNA、差异表达分析和三种机器学习算法，结合单细胞RNA测序数据，系统性地识别并验证了神经损伤的关键调控基因及其细胞特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证；功能机制研究主要在细胞模型中进行，体内功能验证不足 | 识别和验证神经损伤的新型生物标志物，并阐明其在神经免疫互作中的功能机制 | 神经损伤和假手术样本的RNA-seq数据及单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), 三种机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的神经损伤和假手术样本的RNA-seq及scRNA-seq数据 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1803 | 2026-02-27 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing unravels neutrophil heterogeneity and validates SPP1 as a prognostic biomarker in cervical cancer
2026-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15636-9
PMID:41612311
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，揭示了宫颈癌中中性粒细胞的异质性，并验证了SPP1作为预后生物标志物的作用 | 首次在宫颈癌中系统表征了四种功能不同的中性粒细胞亚型，并确定了SPP1-CD44轴作为中性粒细胞-肿瘤细胞相互作用的关键介质 | 研究样本量相对较小（单细胞数据来自5个样本），且主要基于转录组数据，需要进一步的功能验证和更大规模的临床队列验证 | 解析宫颈癌肿瘤微环境中中性粒细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用，并开发预后生物标志物 | 宫颈癌组织样本、TCGA-CESC和GTEx数据库中的批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组织化学、免疫荧光分析、体外功能实验 | LASSO-Cox回归模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | 单细胞数据：5个宫颈癌组织样本；批量数据：TCGA-CESC和GTEx数据库中的多个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1804 | 2026-02-27 |
Phylogenomic tree of Cercozoa based on single-cell transcriptomes from 100 uncultured cells
2026-Jan-30, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02536-4
PMID:41618358
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，对100个未培养的Cercozoa细胞进行采样，构建了基于系统基因组学的Cercozoa系统发育树 | 通过单细胞转录组学广泛采样未培养的Cercozoa多样性，将分类单元采样增加了300%以上，并报告了五个新的未知谱系和两个仅从环境序列中已知的谱系 | 某些先前建立的类群（如Imbricatea类）在系统发育树中未被恢复，表明采样或方法可能存在局限性 | 研究Cercozoa的系统发育关系和多样性，以增进对其基本生物学的理解 | 单细胞真核生物Cercozoa（原生生物），包括土壤和海洋沉积物中的捕食性原生生物、海洋浮游生物等 | 系统发育学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、形态图像数据 | 100个未培养的Cercozoa细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1805 | 2026-02-27 |
Peroxiredoxin 1 mediates bleomycin-induced acute lung injury in mice via macrophage NOD1/NF-κB axis
2026-Jan-30, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03533-5
PMID:41618391
|
研究论文 | 本研究揭示了过氧化物还原酶1（Prdx1）通过激活巨噬细胞中的NOD1/NF-κB信号通路，在博来霉素诱导的急性肺损伤中起关键作用 | 首次发现Prdx1作为损伤相关分子模式在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制，并证实其通过巨噬细胞NOD1/NF-κB轴介导炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；Prdx1中和抗体的临床应用潜力需进一步评估 | 探究Prdx1在博来霉素诱导的急性肺损伤中的作用机制，寻找潜在治疗靶点 | 小鼠（包括Prdx1基因敲除小鼠） | 病理生理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1806 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1807 | 2026-02-27 |
From origins to nomenclature: illuminating the landscape of CNS fibroblasts and fibroblast-like cells
2026-Jan-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02236-8
PMID:41618474
|
综述 | 本文综述了中枢神经系统成纤维细胞及其类似细胞的起源、亚型、功能和命名问题 | 系统梳理了CNS成纤维细胞与血管软脑膜细胞、A型周细胞等类似细胞之间的重叠特征与命名混乱，强调了单细胞测序技术带来的新见解 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要依赖现有文献分析 | 阐明中枢神经系统成纤维细胞及其类似细胞的亚型、功能、发育起源和命名规范，以减少该领域的混淆 | 中枢神经系统成纤维细胞、血管软脑膜细胞、A型周细胞等基质细胞 | 神经生物学 | NA | 单细胞测序、组织学分析、功能分析、转录组学分析 | NA | 转录组数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1808 | 2026-02-27 |
Granzyme A-producing type 1 innate lymphoid cells promote salivary secretion in the aged submandibular gland
2026-Jan-29, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-026-00407-7
PMID:41606670
|
研究论文 | 本文探讨了衰老过程中颌下腺唾液分泌的维持机制，发现GZMA+ ILC1细胞通过GZMA-Pard3轴促进上皮细胞功能 | 首次揭示了GZMA+ ILC1细胞在衰老颌下腺中通过GZMA-Pard3轴维持唾液分泌的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证；机制细节如GZMA-Pard3轴的具体作用途径仍需深入探究 | 探究衰老过程中唾液腺分泌功能维持的细胞机制 | 小鼠颌下腺组织、淋巴细胞簇、上皮细胞 | 单细胞生物学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、显微切割、共培养系统、体内耗竭实验 | NA | 单细胞转录组数据、组织学图像 | 按衰老阶段分层的小鼠群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1809 | 2026-02-27 |
Translating spatial transcriptomic signatures in adenosquamous carcinoma into bulk prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma: a bottom-up approach
2026-Jan-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01297-1
PMID:41571939
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析肺腺鳞癌，识别出TTF-1/p40阴性肿瘤细胞群，并将其基因特征转化为肺腺癌的预后生物标志物 | 开发了一种自下而上的生物标志物发现策略，利用空间转录组学从腺鳞癌中识别罕见肿瘤状态，并成功将其转化为适用于肺腺癌的批量预后分层工具 | 研究主要基于肺腺鳞癌模型，其发现向肺腺癌的转化需进一步验证，且样本量可能有限 | 将空间转录组学定义的罕见肿瘤状态转化为临床相关的预后生物标志物 | 肺腺鳞癌和肺腺癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、免疫组化 | RGB-UMAP | 空间转录组数据、批量转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1810 | 2026-02-27 |
Chemically guided single-cell transcriptomics reveals sulfotransferase-mediated scaffold remodeling in securinine biosynthesis
2026-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68816-3
PMID:41577683
|
研究论文 | 本研究结合化学逻辑、稳定同位素标记喂养实验和单细胞转录组学，揭示了Flueggea suffruticosa中一叶萩碱生物合成的核心途径，并发现磺基转移酶在支架重塑中的新作用 | 揭示了磺基转移酶（FsNSST1和FsNSST2）在生物合成中的非传统作用——作为支架重塑的关键介导者，而非常规的修饰酶；开发了化学引导的单细胞转录组学方法用于解析复杂生物合成途径 | 研究主要聚焦于核心生物合成途径，可能尚未完全解析所有分支途径或调控机制；单细胞转录组学的空间分辨率可能受限于特定维管相关细胞类型的鉴定 | 阐明一叶萩碱（securinine）在Flueggea suffruticosa中的生物合成途径 | Flueggea suffruticosa植物及其生物合成基因（FsMS、FsNSST1、FsNSST2） | 植物代谢组学与合成生物学 | NA | 稳定同位素标记喂养实验、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、化学分析数据 | 未明确说明样本数量，但涉及特定维管相关细胞类型的单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1811 | 2026-02-27 |
Mitochondrial pyruvate metabolism in club cells drives airway inflammation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102742
PMID:41418787
|
研究论文 | 本文研究了气道club细胞中线粒体丙酮酸代谢如何控制上皮分化和过敏性气道炎症 | 揭示了线粒体丙酮酸代谢在哮喘发病机制中的关键作用，并识别了Mpc2基因通过调节Cxcl17-Cxcr4信号通路与肺泡巨噬细胞互作，从而抑制2型炎症的新机制 | 研究主要基于OVA诱导的哮喘模型，可能不完全反映人类哮喘的复杂性；未详细探讨其他代谢途径的潜在贡献 | 探究哮喘中气道club细胞代谢失调如何驱动上皮修复缺陷和炎症反应 | 哮喘患者的气道club细胞和杯状细胞，以及OVA诱导的哮喘小鼠模型 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 哮喘患者和OVA诱导哮喘模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1812 | 2026-02-27 |
An innovative in vitro system unveils IGF1R signaling regulating Merkel cell generation
2026-Jan-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102756
PMID:41455470
|
研究论文 | 本研究开发了包括短期离体触须外植体、小鼠皮肤类器官和人干细胞衍生皮肤类器官在内的新型体外培养系统，用于研究Merkel细胞的发育，并揭示了IGF1R信号通路在其中的调控作用 | 首次建立了能够有效研究Merkel细胞发育的多种体外培养系统，并发现PRC抑制剂能促进Merkel细胞生成，同时鉴定出IGF1R作为新的调控因子 | 研究主要基于体外培养系统，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 研究Merkel细胞的发育机制及其调控信号通路 | Merkel细胞、小鼠触须、小鼠皮肤类器官、人干细胞衍生皮肤类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、药物筛选 | 类器官模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1813 | 2026-02-27 |
NR4A1 limits CD8⁺ T Cell effector responses and protection in tuberculosis
2026-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.12.699051
PMID:41648508
|
研究论文 | 本研究通过小鼠、猕猴和人类数据验证，发现核受体NR4A1是结核病中CD8⁺ T细胞免疫的关键抑制因子，并提出了NR4A1-NKG7轴作为新的宿主导向治疗靶点 | 首次将NR4A1鉴定为结核病中CD8⁺ T细胞免疫的负调控因子，并揭示了NR4A1通过抑制NKG7表达来限制CD8⁺ T细胞效应功能的分子机制 | 研究主要基于动物模型，在人类结核病中的直接验证仍需进一步临床研究 | 探究结核病感染中CD8⁺ T细胞功能失调的调控机制 | CD8⁺ T细胞、NR4A1核受体、结核分枝杆菌感染模型 | 免疫学 | 结核病 | 基因敲除小鼠、过继转移模型、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、空间分析、ChIP-qPCR、药理学抑制 | NA | 基因表达数据、空间定位数据、蛋白质结合数据 | 小鼠模型、猕猴数据集、人类数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1814 | 2026-02-27 |
Biomarkers Informed by Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Biomarkers for Grade 3 Follicular Lymphoma
2026-Jan-09, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2026.100958
PMID:41521011
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，识别并验证了AID、CXCR4、CD71和Ki67作为滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物，以改进风险分层 | 首次利用单细胞和空间转录组学数据识别滤泡性淋巴瘤3级的客观生物标志物，并验证其预后价值，提高了分级的可重复性 | 研究样本量有限（59例），且需在统一治疗的队列中进行进一步的临床验证 | 识别客观的生物标志物以改进滤泡性淋巴瘤的预后分层 | 正常生发中心和滤泡性淋巴瘤样本 | 数字病理学 | 滤泡性淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，免疫组织化学 | NA | 转录组数据，图像数据 | 59例滤泡性淋巴瘤标本（42例1-2级，17例3级）及扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1815 | 2026-02-27 |
Vascular Smooth Muscle Cell-Specific BCAT2 Deficiency Attenuates Diabetic Atherosclerotic Calcification via Histone Propionylation
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1052
PMID:41503231
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研究论文 | 本研究揭示了血管平滑肌细胞特异性BCAT2缺失通过组蛋白丙酰化减轻糖尿病动脉粥样硬化钙化的新机制 | 首次发现支链氨基酸分解代谢在糖尿病动脉粥样硬化钙化中的作用，并阐明BCAT2-BCKA轴通过组蛋白丙酰化表观遗传调控RUNX2表达，从而促进血管平滑肌细胞成骨分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体临床试验中得到验证 | 阐明BCAT2在糖尿病动脉粥样硬化钙化中的作用及其分子机制 | 糖尿病足截肢患者的动脉组织、ApoE敲除小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 代谢组学与单细胞转录组学 | 糖尿病心血管并发症 | 气流辅助解吸电喷雾电离质谱成像、单细胞RNA测序、空间代谢组学 | ApoE敲除小鼠糖尿病动脉粥样硬化钙化模型 | 质谱成像数据、单细胞转录组数据、组织切片图像 | 糖尿病足截肢患者的动脉组织、基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 1816 | 2026-02-27 |
Lymph Node Metastasis-Associated Spatiotemporal Mapping of the TFF3-Linked Niche in Breast Cancer: Integrating Radiogenomic Signatures with Immune-Ecosystem Remodeling
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1016
PMID:41551914
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和放射基因组学，揭示了TFF3在乳腺癌淋巴结转移中的核心调控作用及其与免疫微环境重塑和MAPK-EMT轴的关系 | 首次通过多模态整合（单细胞测序、空间图谱、放射组学）系统解析了TFF3在淋巴结转移性乳腺癌中的双重功能（调控MAPK-EMT轴和免疫检查点），并发现6-巯基嘌呤可作为新型TFF3拮抗剂 | 研究主要基于回顾性队列（TCGA/佛山队列），需要前瞻性临床验证；动物模型未能完全模拟人类肿瘤微环境的复杂性 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的分子机制并开发潜在治疗策略 | 原发性乳腺癌伴腋窝淋巴结转移患者样本、体外细胞模型、体内异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学, 孟德尔共定位分析, 放射组学 | 机器学习 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | TCGA和佛山队列患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1817 | 2026-02-27 |
A Deep Learning-Generated Mixed Tumor-Stroma Ratio for Prognostic Stratification and Multi-omics Profiling in Bladder Cancer
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1053
PMID:41602481
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于卷积神经网络的混合肿瘤-基质比率（MTSR）计算方法，用于膀胱癌的预后分层和多组学分析 | 首次提出并验证了深度学习生成的MTSR作为膀胱癌的独立预后指标，并通过多组学分析揭示了其与ITGB8富集的基质-致癌通路的机制联系 | 研究依赖于回顾性多中心队列，需要前瞻性验证；mpMRI放射组学模型的预测准确性有待进一步提高 | 通过量化肿瘤-基质架构来改进膀胱癌的风险分层，并探索其分子基础 | 膀胱癌患者的组织切片和多参数MRI图像 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 全切片图像分析，多组学分析（包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序），放射组学 | 卷积神经网络（ResNet50），随机森林 | 图像（组织切片和MRI图像），转录组数据 | 多中心队列，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | bulk RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1818 | 2026-02-27 |
Single-Cell Multiome Impact of Prenatal Heavy Metal Exposure on Early Airway Development
2026-Jan-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0563OC
PMID:40737448
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序和高分辨率代谢组学，揭示了产前镉和砷暴露对小鼠早期胚胎肺发育的多层面分子和细胞破坏 | 首次整合单细胞多组学测序（ATAC-seq + RNA-seq）和高分辨率代谢组学，系统描绘了产前重金属暴露对早期肺发育的多层次破坏，并识别出Gata6和Gli2功能减弱是其中的核心调控缺陷 | 研究仅在小鼠模型中进行，且暴露剂量和时间为特定设定，人类暴露的复杂环境和长期效应仍需进一步验证 | 探究产前镉和砷共同暴露对早期肺气道发育的细胞类型特异性机制和分子影响 | 产前暴露于镉和砷的小鼠胚胎肺组织（胚胎第12天） | 单细胞多组学 | 肺发育障碍 | 单细胞多组学测序（scATAC-seq + scRNA-seq），高分辨率代谢组学 | NA | 单细胞多组学数据，代谢组学数据 | 小鼠胚胎肺组织（对照组和暴露组，具体数量未明确说明） | NA | 单细胞多组学测序，单细胞ATAC-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1819 | 2026-02-27 |
WNT10A-SMOC2-LRP4 network affects permanent tooth development via potential tooth-bone interaction
2025-Dec-17, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-025-06451-y
PMID:41408627
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研究论文 | 本文通过一例非综合征性牙齿缺失病例，探讨了WNT10A、SMOC2和LRP4基因变异如何通过牙-骨相互作用影响恒牙发育 | 首次报道了LRP4基因的新变异与牙齿缺失的关联，并通过单细胞RNA-seq和免疫荧光揭示了LRP4阳性牙槽骨细胞通过FGF信号调控WNT10A和SMOC2阳性牙髓细胞的潜在机制 | 研究基于单一病例，样本量有限，需要更大规模的研究验证 | 探究下颌环境对非综合征性牙齿缺失的影响，特别是基因变异在牙-骨相互作用中的作用 | 一名19岁非综合征性牙齿缺失患者及其基因变异 | 数字病理学 | 牙齿缺失 | 全外显子组测序、Sanger测序、单细胞RNA-seq、免疫荧光染色 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA-seq数据、影像数据 | 1名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1820 | 2026-02-27 |
A defined bacterial consortium and spatial transcriptomics highlight the complex interaction between Campylobacter jejuni and the murine intestine
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2600053
PMID:41411657
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研究论文 | 本研究通过建立定义的细菌群落并结合空间转录组学技术，揭示了空肠弯曲菌与小鼠肠道之间的复杂相互作用 | 首次使用定义的13种细菌群落结合空间转录组学，在单细胞水平上解析宿主、微生物群和病原体在肠道感染中的相互作用 | 研究仅使用小鼠模型，结果可能无法完全适用于人类；定义的细菌群落可能无法完全模拟自然微生物群的复杂性 | 阐明特定肠道细菌与空肠弯曲菌介导的宿主反应之间的相互作用机制 | 无菌小鼠、定义的13种细菌群落、空肠弯曲菌81-176菌株 | 空间转录组学 | 肠道感染 | 16S rRNA基因测序、荧光原位杂交、RNAscope、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 三组无菌小鼠：C13组、C13+空肠弯曲菌组、无菌对照组 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |