本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1801 | 2026-02-21 |
A tri-omics and machine learning framework identifies prognostic biomarkers and metabolic signatures in sepsis
2026-Jan-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37342-z
PMID:41611834
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、蛋白质组学、代谢组学和单细胞转录组学数据,结合机器学习方法,识别了脓毒症相关的预后生物标志物和代谢特征 | 建立了一个结合多组学数据、机器学习算法和单细胞分析的综合分析框架,首次将TPR和ERN1基因与脓毒症的免疫代谢重塑联系起来,并构建了基因-代谢物联合分类模型 | 研究缺乏独立、多组学匹配队列的外部验证,且计算筛选的中药活性单体需后续实验验证 | 阐明脓毒症的分子机制并识别候选生物标志物,为下游机制和转化研究提供可测试的假设 | 脓毒症患者的多组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)及单细胞转录组数据 | 机器学习 | 脓毒症 | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞转录组学、非靶向代谢组学筛选 | LASSO回归、SVM-RFE算法、逻辑回归、支持向量机、随机森林 | 组学数据(转录组、蛋白质组、代谢组)、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1802 | 2026-02-21 |
scAURA: Alignment- and Uniformity-based Graph Debiased Contrastive Representation Architecture for Self-Supervised Clustering of Single-Cell Transcriptomics
2026-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.25.701579
PMID:41659516
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scAURA的统一框架,结合图去偏对比学习和自监督聚类,用于单细胞转录组数据的细胞类型识别 | scAURA通过整合图去偏对比学习与自监督聚类,解决了单细胞RNA测序数据中的高维性、稀疏性和噪声问题,在多个数据集上超越了现有最先进方法 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性和鲁棒性 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 图去偏对比学习架构 | 单细胞转录组数据 | 18个真实单细胞数据集,涵盖多种组织和细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1803 | 2026-02-21 |
HMGB1 affects the progression of neurofibromatosis type 1-associated malignant peripheral nerve sheath tumors through E2F2
2026-Jan-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04165-3
PMID:41580779
|
研究论文 | 本研究揭示了HMGB1通过直接转录激活E2F2,驱动神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤的细胞周期进程和肿瘤恶性进展 | 首次在单细胞水平上整合分析NF1-MPNST和PNF组织,阐明了HMGB1通过直接结合并激活E2F2转录来驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于患者来源的组织和细胞系,体内模型为异种移植小鼠模型,未来需要在更接近人类肿瘤微环境的基因工程小鼠模型中进一步验证 | 探究HMGB1在神经纤维瘤病1型相关恶性外周神经鞘瘤进展中的功能作用和分子机制 | 患者来源的NF1-MPNST和丛状神经纤维瘤组织、NF1细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、CUT&Tag、ChIP-qPCR、qPCR、Western blot | NA | RNA测序数据、蛋白质印迹数据、染色质免疫沉淀数据 | 患者来源的NF1-MPNST和PNF组织(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1804 | 2026-02-21 |
Spatially resolved transcriptome-metabolome integration reveals region-specific glial lipid dysregulation associated with Alzheimer's pathology
2026-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.23.701345
PMID:41648223
|
研究论文 | 本研究开发了一个名为iMIST的集成平台,结合代谢物成像、组织学和空间转录组学,揭示了阿尔茨海默病小鼠模型中胶质细胞脂质代谢失调的区域特异性模式及其与病理的联系 | 首次开发了iMIST集成平台,能够在同一组织切片上整合MALDI代谢物成像、组织学和空间转录组学数据,直接展示了胶质细胞稳态失调如何在不同脑区和微环境中表现,并将局部病理与整体代谢失衡联系起来 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需要进一步验证;技术整合的复杂性可能限制其广泛推广 | 探究阿尔茨海默病中胶质细胞脂质代谢失调的空间分布特征及其与病理的关联 | 晚发性阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MALDI代谢物成像,空间转录组学,组织学分析 | NA | 空间多组学数据(代谢组、转录组、图像) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1805 | 2026-02-21 |
Super-resolved, three-dimensional spatial transcriptomics reveals cell-type and brain-region-specific modulation of key epitranscriptomic switches following adolescent alcohol exposure
2026-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.22.698893
PMID:41648353
|
研究论文 | 本研究开发了一种超分辨三维空间转录组学方法,用于量化大鼠脑内关键表观转录组开关在青少年酒精暴露后的细胞类型和脑区特异性变化 | 开发了首个超分辨三维空间转录组学方法,实现了在完整脑组织中以细胞类型和脑区特异性方式量化关键表观转录组调节因子 | 研究仅针对特定表观转录组调节因子(m6A甲基转移酶),且仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人类样本或更广泛的表观转录组标记中验证 | 阐明表观转录组机制在神经精神疾病中的作用,特别是青少年酒精暴露对大脑表观转录组调控的影响 | 大鼠脑组织(包括杏仁核中央核、海马CA1区、齿状回、杏仁基底外侧核、海马CA3区)中的神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞 | 空间转录组学 | 神经精神疾病 | 空间转录组学,表观转录组分析 | NA | 空间转录组数据,RNA表达数据 | 青少年间歇性乙醇暴露(AIE)大鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | 超分辨三维空间转录组学方法(作者自主研发) |
| 1806 | 2026-02-21 |
Integrative multi-omics reveal a CD4⁺ T cell-derived six-gene signature linking the immune-stromal ecosystem to prognosis and immunotherapy selection in pancreatic cancer
2026-Jan-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15613-2
PMID:41572218
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,揭示了一个源自CD4⁺ T细胞的六基因特征,该特征将胰腺癌的免疫-基质生态系统与预后及免疫治疗选择联系起来 | 首次从CD4⁺ T细胞角度构建了一个六基因特征,用于连接胰腺癌的免疫-基质生态系统、预后分层和免疫治疗选择,并通过单细胞RNA测序和细胞通讯分析揭示了其细胞定位和相互作用网络 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列进一步验证;体外细胞系实验未能完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 开发用于胰腺癌风险分层和指导免疫治疗选择的稳健生物标志物 | 胰腺癌患者(来自TCGA、GTEx、GEO数据库)、胰腺癌细胞系(H6C7、CAPAN-1、PANC-1) | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、Western印迹、生物信息学分析 | 六基因特征模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据集(训练集)、GEO数据集GSE57495(验证集)、单细胞RNA测序数据集GSE212966 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1807 | 2026-02-21 |
The Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha genome unveils structural variation-driven metabolic innovation
2026-Jan-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68463-8
PMID:41535305
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序结合PacBio HiFi和ONT超长测序技术,构建了福鼎大白茶的高质量单倍型基因组,揭示了结构变异如何驱动茶叶代谢多样性 | 首次利用单细胞测序技术对茶叶精子细胞进行测序,结合长读长测序实现高精度单倍型基因组组装,并建立了基于半同胞的QTL定位平台 | 研究主要聚焦于福鼎大白茶品种,其他茶叶品种的基因组变异和代谢多样性可能未被全面覆盖 | 探究茶叶基因组结构变异与代谢多样性之间的关联 | 福鼎大白茶(Camellia sinensis var. sinensis cv. Fuding Dabaicha)的基因组和代谢产物 | 基因组学 | NA | 单细胞测序, PacBio HiFi测序, ONT超长测序 | NA | 基因组序列数据, 代谢组数据 | 107个精子细胞 | PacBio, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞测序, 长读长测序 | PacBio HiFi, ONT | PacBio HiFi测序和ONT超长测序技术 |
| 1808 | 2026-02-21 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2026-Jan, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁中疤痕相关巨噬细胞与胆道上皮细胞相互作用加剧肝纤维化的机制 | 首次结合单细胞和空间转录组技术,系统解析了胆道闭锁肝脏微环境异质性,并识别出促进纤维化的关键细胞互作及诊断标志物 | 样本量较小(仅8例组织),且缺乏长期随访数据验证治疗靶点的临床转化潜力 | 探究胆道闭锁肝纤维化的微环境机制并开发诊断模型 | 人类肝脏组织(包括正常组织、胆总管囊肿组织和胆道闭锁组织) | 数字病理学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | 诊断模型(基于基因特征) | 单细胞转录组数据,空间定位数据 | 8例组织(2例正常邻近组织,2例胆总管囊肿组织,4例胆道闭锁组织) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1809 | 2026-02-21 |
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04580-3
PMID:40921808
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了与牙周炎相关的关键基因特征 | 采用多组学方法结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别了牙周炎相关的关键基因,并发现了四个枢纽基因 | 研究依赖于GEO数据库的公开数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 | 识别牙周炎的潜在治疗靶点 | 牙周炎相关的基因表达数据 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 转录组学分析, 孟德尔随机化 | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据 | 三个独立数据集(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1810 | 2026-02-21 |
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04593-y
PMID:41020944
|
研究论文 | 本研究利用多组学孟德尔随机化方法,揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果作用机制 | 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据,并识别CTSB为关键风险因子 | 研究主要基于遗传学关联分析,需要进一步的实验验证来阐明具体的分子机制 | 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌之间的遗传因果关系及免疫微环境的中介作用 | 前列腺癌 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,基因集富集分析,免疫浸润分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组,转录组,蛋白组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1811 | 2026-02-21 |
Acute Phase Response-driven Hepatic Niche Remodeling Promotes Fibrosis Resolution After Alcohol Cessation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101689
PMID:41320154
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,探讨了酒精戒断后急性期反应驱动的肝微环境重塑如何促进酒精相关性肝病纤维化消退的机制 | 首次通过空间转录组学识别了酒精戒断后肝内独特的促纤维化和纤维溶解微环境,并揭示了血清淀粉样蛋白A(SAA)通过HDL介导的巨噬细胞信号通路在纤维化消退中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未全面评估长期酒精戒断后的动态变化 | 探究酒精相关性肝病在戒断后纤维化消退的分子机制 | 酒精相关性肝病小鼠模型及人类肝组织样本 | 空间转录组学 | 酒精相关性肝病 | 空间转录组学、体外细胞分析、基因敲除模型 | NA | 空间转录组数据、基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未明确)及人类肝样本 | Nanostrings | 空间转录组学 | CosMx | 1000-plex CosMx空间转录组学检测 |
| 1812 | 2026-02-21 |
Androgen Signaling in ILC2s Drives Sex Differences in Helicobacter-induced Gastric Inflammation and Atrophy
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101690
PMID:41320155
|
研究论文 | 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞(ILC2)的活化,在幽门螺杆菌诱导的胃部炎症中发挥保护作用,并阐明了ILC2在驱动胃部癌前病变性别差异中的关键角色 | 首次发现雄激素信号通过调控ILC2的活性来影响幽门螺杆菌感染的胃部炎症反应,并明确了ILC2是驱动胃部癌前病变性别差异的主要调节因子 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;且未详细探讨其他性激素(如雌激素)的潜在影响 | 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应,并阐明其在胃部癌前病变性别差异中的作用机制 | 感染幽门螺杆菌的雄性和雌性小鼠,以及经手术去势或二氢睾酮处理的模型小鼠 | 单细胞组学与免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多种性别和处理条件的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1813 | 2026-02-21 |
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101683
PMID:41320153
|
研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎(NEC)中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用及其机制 | 揭示了谷氨酰胺代谢开关(从谷氨酰胺酶GLS转向谷氨酸脱氢酶GLUD1)如何决定巨噬细胞的促炎或抗炎表型,并阐明了其在疾病不同阶段(预防期与进展期)产生相反效果的机制 | 研究主要基于新生大鼠NEC模型和体外骨髓来源巨噬细胞实验,人类数据为对已发表scRNA-seq数据的再分析,缺乏直接的人类体内验证 | 探究谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿肠道炎症中的作用机制,为新生儿肠道疾病的个性化营养干预提供依据 | 新生大鼠坏死性小肠结肠炎(NEC)模型、骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)、已发表的人类新生儿NEC单细胞RNA测序数据 | NA | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、转录组学分析 | NA | 基因表达数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1814 | 2026-02-21 |
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101682
PMID:41260570
|
研究论文 | 本研究探讨了分选连接蛋白SNX27在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的新作用 | 首次揭示了SNX27在肠道中的关键作用,发现其缺失会破坏上皮屏障功能并促进炎症,为理解炎症性肠病(IBD)的发病机制提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本数据来自公共数据库,缺乏直接的人类功能验证 | 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 | 人类炎症性肠病(IBD)患者数据和小鼠肠道上皮细胞特异性SNX27敲除模型 | 分子生物学与病理学 | 炎症性肠病(包括溃疡性结肠炎和克罗恩病) | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的结肠炎模型 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了公共数据库(NCBI GEO)中的IBD患者数据集和SNX27ΔIEC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1815 | 2026-02-21 |
GPR68, A Proton-sensing GPCR, Mediates Acid-induced Visceral Nociception
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101671
PMID:41197770
|
研究论文 | 本研究探讨了质子感应G蛋白偶联受体GPR68在酸诱导的结肠痛觉中的作用 | 首次发现GPR68在结肠感觉神经元中表达,并证实其在酸诱导的结肠痛觉中起关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究GPR68在结肠炎症酸诱导痛觉中的机制 | 结肠感觉神经元、小鼠模型、人类炎症性肠病组织 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、Ca2+成像、药理学研究 | NA | RNA-seq数据、电生理记录、Ca2+成像数据 | 野生型和GPR68-/-小鼠、人类炎症性肠病组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1816 | 2026-02-21 |
Mapping the evolution of kainate receptor research over five decades: trends, hotspots, and emerging frontiers
2026-Jan, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04540-x
PMID:40848135
|
综述 | 本文对过去五十年(1975-2024)关于红藻氨酸受体(KAR)的研究进行了全面的文献计量学分析,旨在绘制该领域的发展脉络、识别关键趋势和研究热点,并指出新兴前沿 | 这是首个关于KAR研究的文献计量学路线图,系统性地揭示了该领域的动态演变、全球合作模式以及未被满足的转化需求 | 研究挑战包括KAR调节剂的临床转化有限,以及其在精神疾病中的作用尚未完全阐明 | 提供一个关于KAR研究领域的系统性概述,包括其发展历程、全球贡献和转化潜力,以指导未来的研究和临床应用 | 红藻氨酸受体(KARs),一种离子型谷氨酸受体亚型 | 神经科学 | 癫痫等神经和精神疾病 | 文献计量学分析(使用CiteSpace, VOSviewer, Bibliometrix),以及cryo-electron microscopy, single-cell RNA sequencing等先进技术 | NA | 文献数据(出版物) | 从PubMed, Web of Science, Scopus数据库中检索并去重后的11,671篇出版物 | NA | NA | NA | NA |
| 1817 | 2026-02-21 |
Canopy2: Tumor Phylogeny Inference by Bulk DNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026, Statistics in biosciences
IF:0.8Q4
DOI:10.1007/s12561-024-09466-1
PMID:41694548
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Canopy2的贝叶斯框架,用于通过bulk DNA和单细胞RNA测序数据推断肿瘤系统发育树并进行突变分析 | Canopy2通过联合概率分布模型,首次能够解析单细胞数据中零值的不同来源(非癌性、随机性和技术性),并在低测序深度、低细胞捕获率及高度异质性肿瘤中保持高精度 | 方法主要基于单核苷酸变异(SNVs),未明确讨论其对拷贝数变异(CNVs)或其他结构变异的适用性 | 开发一种能够准确推断肿瘤系统发育树和亚群突变谱的计算方法 | 肿瘤细胞群体(特别是乳腺癌和胶质母细胞瘤) | 计算生物学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, bulk DNA测序 | 贝叶斯框架, 马尔可夫链蒙特卡洛方法 | 单核苷酸变异数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk DNA-seq | NA | NA |
| 1818 | 2026-02-21 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,揭示了ISG15作为原发性干燥综合征中巨噬细胞介导炎症的关键调节因子 | 结合批量转录组学、单细胞转录组学和机器学习算法,系统识别了pSS中的免疫代谢生物标志物,并首次在体外验证了ISG15在巨噬细胞炎症反应中的关键作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;体外实验仅使用THP-1细胞系,可能无法完全反映体内复杂微环境 | 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 | 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据 | 42,157个唾液腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1819 | 2026-02-21 |
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
|
研究论文 | 本研究结合单细胞测序和RNA测序,揭示了自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗反应中的作用 | 整合单细胞测序和RNA测序数据,识别高活性NK细胞及其相关基因,并构建基于六种关键基因的预后风险模型 | NA | 阐明高活性NK细胞相关基因在CSCC预后和免疫治疗中的潜在价值 | 宫颈鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 宫颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序, RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1820 | 2026-02-21 |
DeepCE: a deep learning framework for correlation-enhanced gene regulatory network inference in single-cell RNA sequencing data
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag033
PMID:41716221
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DeepCE的深度学习框架,用于增强单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 | DeepCE通过整合双向门控循环单元和卷积神经网络,强化了动态调控的提取,能捕获时间依赖性和局部空间模式,从而提高基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的深度学习算法,以增强单细胞RNA测序数据中基因调控网络推断的有效性和可靠性 | 小鼠和人类数据集中的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 双向门控循环单元, 卷积神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |