单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
18141	2024-08-08	Understanding and targeting erythroid progenitor cells for effective cancer therapy 2023-07-01, Current opinion in hematology IF:3.1Q2 DOI:10.1097/MOH.0000000000000762 PMID:37052294	综述	本文综述了红细胞祖细胞（EPCs）在癌症中的作用及其作为治疗靶点的潜力	近年来研究发现EPCs在癌症中具有促进肿瘤生长的作用，并能转化为免疫抑制性髓系细胞，限制T细胞功能和免疫治疗	NA	总结EPCs的生物学特性，探讨其促进肿瘤活动的机制，并展望未来针对这些细胞的治疗策略	红细胞祖细胞（EPCs）及其在癌症治疗中的应用	NA	癌症	单细胞转录组和谱系追踪分析	NA	转录组	NA
18142	2024-08-05	Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics 2023-06-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI169653 PMID:37053016	研究论文	本文研究了由单细胞转录组学揭示的甲状腺癌中去分化转化的过程	通过单细胞转录组学揭示了去分化甲状腺癌细胞的不同亚型和转化模型，识别出重要的转化关键阶段	目前对肿瘤内部复杂的转化过程仍缺乏全面理解	阐明甲状腺癌中去分化转化的细胞谱系和命运转变	不同亚型甲状腺癌患者的单细胞转录组和基因变化数据	数字病理学	甲状腺癌	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	不同亚型甲状腺癌患者的细胞数据
18143	2024-08-05	Fibroblast and Immune Cell Cross-Talk in Cardiac Fibrosis 2023-06, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-023-01877-8 PMID:37074566	综述	本文全面概述了在心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用	识别了在心肌梗死中可能的促炎成纤维细胞，并探讨了成纤维细胞如何影响炎症细胞行为	没有提到具体的实验数据支持或临床试验结果	探究心脏损伤背景下炎症与修复反应之间复杂的相互作用	关注心脏疾病中的成纤维细胞和炎症细胞	心血管疾病	心脏纤维化	单细胞转录组学	NA	NA	NA
18144	2024-08-05	Unraveling the heterogeneity of cholangiocarcinoma and identifying biomarkers and therapeutic strategies with single-cell sequencing technology 2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie DOI:10.1016/j.biopha.2023.114697 PMID:37060660	综述	本文旨在利用单细胞测序技术评估胆管癌的异质性，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点	通过单细胞测序技术深入分析胆管癌的肿瘤细胞基因组和表观基因组，提供了癌症进展机制的新见解	目前尚未解决的准确诊断方法限制了研究的广泛应用	寻找胆管癌的早期诊断生物标志物和改进治疗策略	胆管癌细胞及其异质性	数字病理学	胆管癌	单细胞测序	NA	肿瘤组织	NA
18145	2024-08-08	Wnt3a-Loaded Extracellular Vesicles Promote Alveolar Epithelial Regeneration after Lung Injury 2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202206606 PMID:37072558	研究论文	本研究开发了一种通过将Wnt3a固定在细胞外囊泡(EVs)表面来远程传递Wnt3a的策略，以促进肺损伤后的肺泡上皮再生	本研究创新性地利用细胞外囊泡作为载体，有效解决了Wnt蛋白亲水性差的问题，并成功验证了其在肺泡上皮细胞再生中的生物活性	NA	探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)治疗的新方法	Wnt3a细胞外囊泡在肺损伤后肺泡上皮再生中的作用	NA	慢性阻塞性肺疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
18146	2024-08-08	Clustering ensemble in scRNA-seq data analysis: Methods, applications and challenges 2023-06, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106939 PMID:37075602	综述	本文综述了单细胞RNA测序数据分析中聚类集成方法的应用、挑战及未来方向	聚类集成方法能提高单细胞转录组数据分析的准确性和可靠性	不同聚类方法产生的结果存在差异，不稳定的分区会影响分析的准确性	总结聚类集成方法在单细胞转录组数据分析中的应用和挑战	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	聚类集成	转录组数据	NA
18147	2024-08-08	Single-cell RNA sequencing reveals XBP1-SLC38A2 axis as a metabolic regulator in cytotoxic T lymphocytes in multiple myeloma 2023-05-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2023.216171 PMID:37054944	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，比较了多发性骨髓瘤患者与健康捐赠者骨髓和外周血中T细胞的基因表达谱，揭示了XBP1-SLC38A2轴在细胞毒性T淋巴细胞中的代谢调控作用。	首次揭示了XBP1通过直接结合SLC38A2的启动子来抑制其表达，从而影响T细胞的谷氨酰胺摄取和免疫功能。	研究样本仅包括10名新诊断的多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者，样本量较小。	阐明多发性骨髓瘤中T淋巴细胞功能障碍和代谢重编程的机制。	多发性骨髓瘤患者的骨髓和外周血中的T细胞。	数字病理学	多发性骨髓瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	10名多发性骨髓瘤患者和3名健康捐赠者
18148	2024-08-05	Single-Cell Spatial Analysis Identifies Regulators of Brain Tumor-Initiating Cells 2023-05-15, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3004 PMID:37067922	研究论文	本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示了调节脑肿瘤发起细胞的机制	首次揭示了脑肿瘤微环境中不同解剖区域对肿瘤异质性调控的影响	研究主要基于小鼠模型，应用于人类具体情况需要进一步验证	探索脑肿瘤微环境如何影响脑胶质母细胞瘤的异质性	小鼠和人类的脑胶质母细胞瘤微环境	数字病理学	脑癌	空间转录组学和单细胞RNA测序	无	转录组数据	在小鼠模型中使用了特定的脑胶质母细胞瘤细胞系
18149	2024-08-08	Mesenchymal loss of p53 alters stem cell capacity and models human soft tissue sarcoma traits 2023-05-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2023.03.009 PMID:37059101	研究论文	本研究探讨了p53在间充质干细胞中缺失对成人未分化软组织肉瘤（USTS）的影响	发现p53缺失导致间充质干细胞的干细胞特性改变，并模拟了人类软组织肉瘤的特征	NA	理解间充质干细胞介导的肿瘤发生，并为肉瘤研究提供有效的鼠模型	间充质干细胞中的p53缺失及其对软组织肉瘤的影响	数字病理学	软组织肉瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
18150	2024-08-08	Identifying a dynamic transcriptomic landscape of the cynomolgus macaque placenta during pregnancy at single-cell resolution 2023-05-08, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2023.03.012 PMID:37054708	研究论文	本研究通过单细胞转录组学方法，全面分析了食蟹猴胎盘在妊娠期间的动态转录组景观	首次展示了食蟹猴胎盘在整个妊娠期间的单细胞转录组全景，揭示了胎盘细胞在不同妊娠阶段的特异性差异及其分子机制	NA	深入理解灵长类胎盘在妊娠期间的细胞层次结构和分子机制，为支持健康妊娠结果提供基础	食蟹猴胎盘在妊娠期间的细胞和分子机制	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
18151	2024-08-08	Characterization of T-cell receptors and immunoglobulin heavy chains loci and identification of T/B cell clusters in teleost 2023-May, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2023.108746 PMID:37054766	研究论文	本研究通过Iso-seq技术测序了大量完整的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）转录本，并利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了血液白细胞中的T/B细胞簇，揭示了鲆鱼中TCR和IgH基因座的组织结构和表达模式	首次全面描述了鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的基因组织结构，并通过单细胞RNA测序技术验证了这些基因在T/B细胞簇中的高表达	NA	旨在深入理解鲆鱼中T细胞受体和免疫球蛋白重链基因座的结构和功能，以及它们在T和B淋巴细胞进化和功能中的作用	鲆鱼中的T细胞受体（TCR）和免疫球蛋白重链（IgH）基因座及其在T/B细胞簇中的表达	数字病理学	NA	Iso-seq, 单细胞RNA测序	NA	转录本, 基因表达	大量完整的TCR和IgH转录本, 血液白细胞的单细胞RNA测序数据
18152	2024-08-08	Single-cell transcriptome analysis revealed the immune profile of PD-1 blockade in gallbladder carcinoma liver metastasis 2023-05-01, Hepatology communications IF:5.6Q1 DOI:10.1097/HC9.0000000000000131 PMID:37058121	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析揭示了PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移中的免疫特征	发现PD-1治疗后CD8+T细胞的细胞毒性活性提高和骨髓细胞的促炎表型增强，以及SPP1+TAMs与不良预后相关	NA	探讨PD-1阻断剂在胆囊癌肝转移治疗中的免疫机制	胆囊癌肝转移患者的免疫细胞动态	数字病理学	胆囊癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	19,648个高质量单细胞转录组数据
18153	2024-08-08	Analysis of Madelung disease based on sc-RNA sequencing: A case report and literature review 2023-05, Molecular immunology IF:3.2Q3 DOI:10.1016/j.molimm.2023.04.005 PMID:37060787	病例报告和文献综述	本研究首次利用单细胞RNA测序分析了Madelung病中肿瘤细胞与免疫细胞的关系，并结合文献综述提供了新的病理机制视角和临床治疗依据	首次使用单细胞RNA测序技术分析Madelung病中肿瘤细胞与免疫细胞的关系	缓解手术效果有限，多数患者治疗后仍会复发或转移	探讨Madelung病的病理机制并为靶向治疗提供临床依据	Madelung病中的肿瘤细胞和免疫细胞	NA	Madelung病	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
18154	2024-08-08	Effect of high alkalinity on shrimp gills: Histopathological alternations and cell specific responses 2023-May, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.114902 PMID:37062262	研究论文	本研究首次评估了高碱度胁迫对Exopalaemon carinicauda鳃微结构的影响，并通过单细胞RNA测序探索了鳃细胞在碱度适应中的异质性响应	本研究首次使用单细胞RNA测序技术探讨了高碱度胁迫下虾鳃细胞的特定响应和分子机制	NA	研究高碱度胁迫对虾鳃的组织病理变化和细胞特异性响应	Exopalaemon carinicauda虾的鳃细胞	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
18155	2024-08-05	Transient suppression of SUMOylation in embryonic stem cells generates embryo-like structures 2023-04-25, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2023.112380 PMID:37061916	研究论文	研究表明，化学抑制SUMO化的鼠胚胎干细胞生成类胚胎结构	该研究通过暂时抑制SUMO化来探索胚胎发育的新策略，首次生成了具有胚胎特征的自组织结构	本研究未提及对长时间影响或体内实验的验证	探讨合成胚胎学在哺乳动物植入前发育中的应用	鼠胚胎干细胞及其生成的类胚胎结构	数字病理学	NA	化学抑制	NA	单细胞转录组数据	NA
18156	2024-08-05	Lack of ethnic diversity in single-cell transcriptomics hinders cell type detection and precision medicine inclusivity 2023-04-14, Med (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.medj.2023.03.002 PMID:37060896	评论	这篇文章讨论了单细胞转录组学中缺乏民族多样性带来的挑战。	强调单细胞数据中民族表现不足对细胞类型检测和个性化医学包容性的影响	未能充分代表不同民族的单细胞数据限制了对稀有细胞类型的研究	探讨缺乏民族多样性对疾病研究和精准医学的影响	单细胞转录组学中的细胞类型及其标记	数字病理学	NA	单细胞转录组学	NA	NA	NA
18157	2024-08-08	PCSK9, a novel immune and ferroptosis related gene in abdominal aortic aneurysm neck 2023-04-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-023-33287-9 PMID:37055467	研究论文	研究探讨了PCSK9基因在腹主动脉瘤颈部的作用及其与免疫检查点和铁死亡相关基因的关联	首次发现PCSK9在腹主动脉瘤颈部的高表达，并揭示了其与免疫检查点和铁死亡相关基因的相互作用	研究仅基于GSE47472和GSE164678两个数据集，样本量相对较小	探究PCSK9在腹主动脉瘤颈部的作用及其潜在机制	PCSK9基因在腹主动脉瘤颈部的表达及其与免疫检查点和铁死亡相关基因的关系	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	14名腹主动脉瘤患者和8名捐赠者的数据集，以及CaCl诱导的腹主动脉瘤样本的单细胞RNA测序数据
18158	2024-08-08	Hpgd affects the progression of hypoxic pulmonary hypertension by regulating vascular remodeling 2023-Apr-13, BMC pulmonary medicine IF:2.6Q2 DOI:10.1186/s12890-023-02401-y PMID:37055764	研究论文	本研究通过生物信息学分析，探讨Hpgd基因在低氧性肺动脉高压（HPH）中的调控作用及其对血管重塑的影响。	首次揭示Hpgd基因在HPH中的调控作用，并通过实验验证其对肺动脉内皮细胞增殖、凋亡、粘附和血管生成能力的影响。	研究主要集中在体外实验，未来需要进一步的动物模型实验来验证Hpgd在HPH中的作用。	探讨Hpgd基因在低氧性肺动脉高压中的作用及其对血管重塑的调控机制。	Hpgd基因在低氧性肺动脉高压中的作用及其对肺动脉内皮细胞的影响。	数字病理学	肺动脉高压	单细胞测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（RNA-seq）	NA	RNA	523个关键基因通过单细胞测序数据识别，41个关键基因通过批量RNA测序数据识别
18159	2024-08-08	Isolating peripheral blood mononuclear cells from HIV-infected patients for single-cell RNA sequencing and integration analysis 2023-Apr-13, STAR protocols IF:1.3Q4 DOI:10.1016/j.xpro.2023.102222 PMID:37060557	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了HIV感染者外周血单个核细胞的转录变化	利用单细胞RNA测序技术深入解析了HIV感染对免疫细胞转录变化的影响	NA	研究HIV感染对免疫细胞转录变化的影响	HIV感染者的外周血单个核细胞	数字病理学	HIV感染	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	来自HIV感染者的外周血单个核细胞
18160	2024-08-08	Coronary Artery Disease Risk Gene PRDM16 is Preferentially Expressed in Vascular Smooth Muscle Cells and a Potential Novel Regulator of Smooth Muscle Homeostasis 2023-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.04.03.535461 PMID:37066230	研究论文	本研究通过分析增强子组蛋白标记H3K27ac ChIP-seq数据，发现冠状动脉疾病风险基因PRDM16在血管平滑肌细胞中优先表达，并可能作为平滑肌细胞稳态的新调控因子。	首次揭示了PRDM16在血管疾病进展中的未知功能，并证实其在血管平滑肌细胞中的优先表达及其对平滑肌细胞稳态的调控作用。	研究主要集中在体外实验和小鼠模型上，未来需要进一步研究PRDM16在病理条件如动脉粥样硬化中的作用。	通过筛选超级增强子调控的转录因子，识别血管平滑肌细胞稳态的新调控因子。	血管平滑肌细胞及其在冠状动脉疾病中的表型转换。	数字病理学	心血管疾病	ChIP-seq, RNA-seq, qRT-PCR, 蛋白质印迹	NA	序列数据	包括多个动脉组织样本、Prdm16 SMC特异性敲除小鼠及主动脉组织样本。