单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 18081 - 18100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18081 | 2024-08-08 |
Tenofovir alters the immune microenvironment of pregnant women with hepatitis B virus infection: Evidence from single-cell RNA sequencing
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110245
PMID:37163920
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫微环境的影响 | 首次揭示了替诺福韦治疗后妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女外周血单个核细胞的细胞亚型和分子特征的变化 | 研究样本量较小，仅包括三名妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女 | 探讨替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫功能的影响 | 妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 | 细胞 | 6个样本，共68,200个外周血单个核细胞 |
| 18082 | 2024-08-08 |
EGFR marks a subpopulation of dermal mesenchymal cells highly expressing IGF1 which enhances hair follicle regeneration
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17766
PMID:37165726
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研究论文 | 本研究旨在识别通过旁分泌机制增强毛囊再生的新型真皮间充质细胞亚群 | 发现表皮生长因子受体（EGFR）标记的真皮间充质细胞亚群，这些细胞高表达胰岛素样生长因子1（IGF1），有助于毛囊新生 | NA | 识别新型真皮间充质细胞亚群，探讨其在毛囊再生中的作用 | 真皮间充质细胞及其在毛囊再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光染色、流式细胞术（FACS） | NA | RNA | 新生和成年小鼠的真皮细胞 |
| 18083 | 2024-08-05 |
Competition between skin antimicrobial peptides and commensal bacteria in type 2 inflammation enables survival of S. aureus
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112494
PMID:37167061
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研究论文 | 该文章探讨了在类型2炎症下皮肤抗菌肽与共生细菌之间的竞争，如何影响金黄色葡萄球菌的生存。 | 揭示了IL-4Rα激活导致抗菌肽生成减少，从而选择性抑制抗生素生产的共生细菌株生存的机制。 | 没有提供不同类型的炎症对抗菌肽和细菌相互作用行为的全面比较。 | 研究皮肤抗菌肽和共生细菌在类型2炎症条件下与金黄色葡萄球菌生存之间的相互作用。 | 主要对象为Il4ra小鼠及其皮肤微生物组。 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞测序 | NA | 微生物组数据 | Il4ra小鼠的单细胞样本及相关微生物组分析 |
| 18084 | 2024-08-08 |
Glial progenitor heterogeneity and key regulators revealed by single-cell RNA sequencing provide insight to regeneration in spinal cord injury
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112486
PMID:37149868
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了脊髓损伤后星形胶质细胞系的异质性及其在再生中的作用 | 首次揭示了脊髓损伤后成年脊髓中星形胶质细胞系细胞的多样性及其调控机制 | NA | 探究脊髓损伤后星形胶质细胞系细胞的异质性及其对再生的贡献 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞系细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成年脊髓损伤模型中的GFAP表达细胞 |
| 18085 | 2024-08-08 |
A single-cell view on host immune transcriptional response to in vivo BCG-induced trained immunity
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112487
PMID:37155329
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了BCG疫苗诱导的训练免疫（TI）在人体内的免疫转录反应异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了BCG诱导的训练免疫中巨噬细胞和CD8 T细胞的异源转录反应，并发现了STAT1作为关键转录因子在所有巨噬细胞亚群中的作用 | NA | 研究BCG疫苗诱导的训练免疫在人体内的免疫转录反应异质性 | 巨噬细胞和CD8 T细胞的转录反应 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 156个样本 |
| 18086 | 2024-08-08 |
Dynamic cellular changes in acute kidney injury caused by different ischemia time
2023-May-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106646
PMID:37168554
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了不同缺血时间下急性肾损伤的动态细胞变化过程 | 发现了Slc5a2近端小管细胞对急性肾损伤的敏感性，并揭示了中性氨基酸转运蛋白基因表达随时间的变化，以及血浆异亮氨酸水平在急性肾损伤中的下降 | NA | 解析缺血再灌注损伤导致的急性肾损伤的动态过程 | 急性肾损伤的细胞变化及代谢物变化 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床相关的缺血再灌注损伤小鼠模型 |
| 18087 | 2024-08-05 |
Digital microfluidics-based digital counting of single-cell copy number variation (dd-scCNV Seq)
2023-05-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221934120
PMID:37155890
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研究论文 | 本研究报告了一种基于数字微流控技术的单细胞拷贝数变异数字计数的新方法。 | 提出的dd-scCNV Seq方法通过直接切割单细胞DNA并利用这些片段进行扩增，解决了现有单细胞全基因组扩增方法的偏差问题，提升了拷贝数变异计数的准确性。 | 研究中未对dd-scCNV Seq的广泛适用性和长期保存性进行评估。 | 旨在开发一种准确的单细胞拷贝数变异分析技术，以推动生物发现。 | 主要研究对象为单细胞DNA的拷贝数变异。 | 数字病理学 | NA | 数字微流控 | NA | DNA片段 | NA |
| 18088 | 2024-08-05 |
The combination therapy of isomucronulatol 7-O-beta-glucoside (IMG) and CEP-9722 targeting ferroptosis-related biomarkers in non-small cell lung cancer (NSCLC)
2023-May-11, BMC pulmonary medicine
IF:2.6Q2
DOI:10.1186/s12890-023-02445-0
PMID:37165402
|
研究论文 | 本文研究了非小细胞肺癌(NSCLC)中与铁死亡相关的生物标志物的组合治疗 | 建立了一个以铁死亡为基础的预后模型，并通过单细胞测序揭示了基因表达与肿瘤的关系 | 研究的样本和数据主要来源于公共数据库，可能存在数据偏差 | 旨在为NSCLC患者建立潜在的预测模型并提供可用的靶向药物 | 非小细胞肺癌患者的基因表达档案及其细胞群体和状态 | 数字病理学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及GSE31210训练集和TCGA测试集的多名患者 |
| 18089 | 2024-08-05 |
Protocol for using single-cell sequencing to study the heterogeneity of NF1 nerve sheath tumors from clinical biospecimens
2023-May-10, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102297
PMID:37167059
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞测序技术研究神经纤维瘤1型相关神经鞘瘤异质性的协议 | 提供了一种针对临床生物样本获取单细胞悬浮液并进行转录组分析的新方法 | 该协议主要针对NF1神经鞘瘤，适用性可能有限 | 研究NF1神经鞘瘤的异质性 | 来自神经纤维瘤1型的神经鞘瘤临床样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 临床生物样本 |
| 18090 | 2024-08-05 |
Spatially resolved multi-omics highlights cell-specific metabolic remodeling and interactions in gastric cancer
2023-05-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38360-5
PMID:37164975
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研究论文 | 本文通过整合多种组学手段，揭示了胃癌中细胞特异性的代谢重塑及其相互作用 | 创新性地结合了质谱成像技术和空间转录组学，提供了肿瘤微环境中代谢异质性的分层可视化 | NA | 旨在改善对肿瘤生物学的理解，为高级治疗策略的设计提供基础 | 研究宫癌样本中的肿瘤及非肿瘤细胞的代谢重塑和相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 质谱成像、空间代谢组学和空间转录组学 | NA | 代谢物、脂质、基因表达数据 | 同一胃癌样本中的多个细胞类型 |
| 18091 | 2024-08-08 |
scRAA: the development of a robust and automatic annotation procedure for single-cell RNA sequencing data
2023-May-10, Journal of biopharmaceutical statistics
IF:1.2Q2
DOI:10.1080/10543406.2023.2208671
PMID:37162278
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研究论文 | 本文提出了一种名为scRAA的鲁棒自动注释程序，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 引入了一种鲁棒的集成方法进行细胞分类，并采用了批次校正方法来处理参考数据和查询数据之间的批次效应 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型预测的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成方法 | 基因表达数据 | 涉及肺和胰腺数据 |
| 18092 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and microenvironment in one adenoid cystic carcinoma sample
2023-May-10, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01082-4
PMID:37162576
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一个腺样囊性癌样本及其正常唾液腺组织的异质性和微环境 | 首次从单细胞层面全面描述了腺样囊性癌的异质性和肿瘤微环境，包括细胞特征、免疫细胞浸润和细胞间通讯 | 仅使用了一个患者的样本进行分析，可能限制了结果的普遍性 | 确定肿瘤异质性和微环境中的因素，为腺样囊性癌提供新的治疗靶点 | 腺样囊性癌样本及其正常唾液腺组织 | 数字病理学 | 唾液腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 一个腺样囊性癌样本和正常唾液腺组织 |
| 18093 | 2024-08-08 |
Integrated bulk and single-cell RNA-sequencing reveals SPOCK2 as a novel biomarker gene in the development of congenital pulmonary airway malformation
2023-May-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02436-z
PMID:37165378
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了SPOCK2作为先天性肺气道畸形的新型生物标志物基因 | 本研究首次通过整合批量和单细胞RNA测序数据，揭示了SPOCK2作为先天性肺气道畸形的新型生物标志物基因，并发现了其他潜在的诊断和治疗靶点 | 需要进一步的大样本功能研究来确认这些基因在先天性肺气道畸形中的作用 | 识别先天性肺气道畸形（CPAM）的特征基因表达模式和标志物基因 | 先天性肺气道畸形（CPAM）患者的肺组织 | 数字病理学 | 先天性肺气道畸形 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 迭代加权基因相关网络分析（iWGCNA） | 基因表达数据 | 2074个显著差异表达基因，其中1675个上调，399个下调 |
| 18094 | 2024-08-05 |
Single-cell omics traces the heterogeneity of prostate cancer cells and the tumor microenvironment
2023-May-09, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00450-z
PMID:37161356
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综述 | 本文综述了单细胞组学在前列腺癌细胞及肿瘤微环境异质性方面的应用 | 文章构建了前列腺癌单细胞组学研究的综合目录，并讨论了单细胞组学技术对未来研究的影响 | 文章可能没有详细探讨每种单细胞组学技术的具体应用限制 | 旨在提供对前列腺癌诊断和治疗的更全面理解 | focus on single-cell RNA sequencing and its implications in prostate cancer | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | 深度学习模型 | NA | NA |
| 18095 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of xenotransplanted human retinal organoids defines two migratory cell populations of nonretinal origin
2023-05-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.04.004
PMID:37163980
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研究论文 | 本研究通过将人视网膜类器官移植到缺乏光感受器的鼠眼中，并进行组织学和单细胞RNA测序，探讨了受体视网膜对移植类器官细胞存活、成熟和增殖的调控作用 | 研究发现移植的人类细胞能够迁移到所有受体视网膜层并长距离移动，这些细胞被鉴定为星形胶质细胞和脑/脊髓样神经前体细胞，这些细胞在阶段匹配的培养类器官中缺失或罕见 | NA | 探讨人视网膜类器官移植作为退行性视网膜疾病治疗的可能性 | 人视网膜类器官移植后的细胞行为及其在受体视网膜中的作用 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 移植的人视网膜类器官细胞到缺乏光感受器的鼠眼中 |
| 18096 | 2024-08-05 |
The value of EYA1/3/4 in clear cell renal cell carcinoma: a study from multiple databases
2023-05-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-34324-3
PMID:37156847
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研究论文 | 本文系统分析了EYAs家族在透明细胞肾细胞癌中的价值 | 本研究首次阐明了EYA1/3/4在ccRCC中的预后意义，并建立了预测模型 | 由于数据来源于多个数据库，可能存在偏倚和数据异质性 | 研究EYA家族基因在透明细胞肾细胞癌中的预后和生物学作用 | 以透明细胞肾细胞癌患者为研究对象 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞测序、Cox回归分析 | NA | 基因表达数据 | 涉及多个数据库的数据，具体样本量未详述 |
| 18097 | 2024-08-05 |
Deciphering and advancing CAR T-cell therapy with single-cell sequencing technologies
2023-05-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01783-1
PMID:37149643
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评论 | 本文总结了单细胞测序技术在CAR T细胞疗法中的应用 | 提出了一种多组学研究模式来指导CAR T细胞疗法的未来研究 | 未提及具体的实验数据或临床试验结果 | 探讨单细胞测序技术如何推动CAR T细胞疗法的发展 | CAR T细胞疗法及其在癌症免疫治疗中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 18098 | 2024-08-05 |
High-throughput and high-accuracy single-cell RNA isoform analysis using PacBio circular consensus sequencing
2023-05-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38324-9
PMID:37149708
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研究论文 | 本文介绍了一种名为HIT-scISOseq的方法，可以实现高通量和高准确度的单细胞RNA异构体测序 | HIT-scISOseq通过去除大部分伪影cDNA并连接多个cDNA，提高了PacBio CCS的测序通量和准确性 | 没有提到具体的局限性 | 研究旨在提高单细胞RNA异构体测序的通量和准确性 | 研究对象为3375个角膜缘细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | PacBio circular consensus sequencing | NA | cDNA读数 | 3375个角膜缘细胞 |
| 18099 | 2024-08-08 |
Down-regulation of WWP2 aggravates Type 2 diabetes mellitus-induced vascular endothelial injury through modulating ubiquitination and degradation of DDX3X
2023-05-06, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-023-01818-3
PMID:37149668
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研究论文 | 本文探讨了WWP2通过调节DDX3X的泛素化和降解在2型糖尿病（T2DM）引起的血管内皮损伤中的作用。 | 发现WWP2作为T2DM引起血管内皮损伤的新调节因子，并通过催化DDX3X的K63连接的多泛素化来抑制高糖和棕榈酸（HG/PA）诱导的内皮损伤。 | NA | 揭示WWP2在T2DM引起血管内皮损伤中的关键作用及其调控机制。 | 血管内皮细胞中的WWP2表达及其对T2DM引起的内皮损伤的影响。 | NA | 糖尿病 | 单细胞转录组分析、质谱、共免疫沉淀和免疫荧光检测 | NA | 转录组数据 | T2DM患者和健康对照的血管内皮细胞，以及内皮特异性Wwp2敲除小鼠 |
| 18100 | 2024-08-08 |
Protocol for tumor dissociation and fluorescence-activated cell sorting of human head and neck cancers
2023-May-06, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102294
PMID:37149858
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研究论文 | 本文描述了一种用于人类头颈部肿瘤解离和荧光激活细胞分选的逐步方法 | 该协议促进了单细胞RNA测序和三维患者源性类器官生成的有效下游应用 | NA | 开发一种有效的肿瘤解离和细胞分选方法，以便进行进一步的单细胞分析和类器官生成 | 人类头颈部肿瘤及其包含的多种细胞类型 | 数字病理学 | 头颈部癌 | 荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新鲜的人类头颈部肿瘤样本 |