本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18061 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of gene signatures associated with aging in human aortic dissection
2024-Jun-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e31298
PMID:38828294
|
研究论文 | 本文通过生物信息学分析探讨了与人类主动脉夹层相关的衰老基因签名。 | 研究识别了与衰老相关的枢纽基因,并提出了ESR1下调可能加重主动脉夹层的假说。 | 研究需要进一步验证有关ESR1在主动脉夹层形成中的作用,尤其是在临床环境中。 | 分析衰老相关基因与主动脉夹层的关联,以提供新见解和治疗策略。 | 衰老相关基因及其在主动脉夹层中表达的调控网络。 | 数字病理学 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | 涉及从13名主动脉夹层患者的197,605个主动脉细胞中获得的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18062 | 2024-08-05 |
Molecular characterization of nodose ganglia development reveals a novel population of Phox2b+ glial progenitors in mice
2024-Jun-03, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1441-23.2024
PMID:38830761
|
研究论文 | 本文研究了迷走神经结的发展,并发现了一种新的Phox2b+胶质前体细胞群体 | 揭示了迷走神经结的胶质前体细胞具有独特的转录程序,并且这些细胞能够产生自主神经元 | 对迷走神经胶质细胞的发育基因程序尚未完全理解 | 探究迷走神经结中的胶质细胞前体的发育和转录特征 | 以小鼠为研究对象,分析迷走神经结中胶质前体细胞的性质 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | 小鼠,性别不限 | NA | NA | NA | NA |
| 18063 | 2024-08-04 |
Mitochondrial RNA modification-based signature to predict prognosis of lower grade glioma: a multi-omics exploration and verification study
2024-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-63592-w
PMID:38824202
|
研究论文 | 该研究探讨了线粒体RNA修饰在低级别胶质瘤预后中的作用 | 提出了一种基于线粒体RNA修饰的评分系统以预测低级别胶质瘤的预后,并通过多组学数据进行验证 | 线粒体RNA修饰相关基因的作用机制可能尚未完全解释 | 研究线粒体RNA修饰对低级别胶质瘤的影响及其预后预测能力 | 低级别胶质瘤及其相关的线粒体RNA修饰基因 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | RNA-seq | LASSO回归, 随机生存森林 | 基因表达数据 | 1120个正常脑组织样本和529个低级别胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18064 | 2024-08-05 |
Enhancement of the function of mesenchymal stem cells by using a GMP-grade three-dimensional hypoxic large-scale production system
2024-May-30, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e30968
PMID:38826705
|
研究论文 | 建立了一种GMP级三维缺氧大规模生产系统以增强间充质干细胞(MSCs)的功能 | 提出了一种新型的TDHLSP系统,能够有效提高临床级MSCs的生产并改善其功能特性 | 在CD142表达下调后,3D_Hypo MSCs的增强功能显著下降 | 旨在建立一种大规模生产间充质干细胞的系统,并分析不同培养条件下的生物差异 | 研究目标是探讨在不同培养环境下生成的间充质干细胞的功能表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 2×10^8个间充质干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18065 | 2024-08-05 |
Serum ITIH5 as a novel diagnostic biomarker in cholangiocarcinoma
2024-May, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16143
PMID:38475675
|
研究论文 | 本研究旨在识别用于胆管癌诊断的独特分泌蛋白ITIH5。 | ITIH5在胆管癌中的特异性上调,且未在大多数其他癌症或良性肝胆疾病中观察到。 | 本研究的样本量及适用范围尚未明确说明。 | 研究的目的是确定胆管癌的特异性诊断生物标志物。 | 研究对象包括胆管癌及与其对比的其他恶性肿瘤、良性肝胆疾病和慢性肝病。 | 数字病理学 | 胆管癌 | RNA测序 | NA | 组织和血清样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18066 | 2024-08-04 |
Deciphering the role of CX3CL1-CX3CR1 in aortic aneurysm pathogenesis: insights from Mendelian randomization and transcriptomic analyses
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1383607
PMID:38715600
|
研究论文 | 本研究探讨了CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤发病机制中的作用 | 通过孟德尔随机化和转录组分析揭示了CX3CL1-CX3CR1信号通路在主动脉瘤中的潜在致病性 | 未提供具体实验验证结果的详细信息 | 研究CX3CL1-CX3CR1在主动脉瘤中的致病机制 | 研究了91种循环炎症蛋白与主动脉瘤之间的因果关系 | 数字病理学 | 主动脉瘤 | 孟德尔随机化分析, RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了731种免疫特征和91种循环炎症蛋白 | NA | NA | NA | NA |
| 18067 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and transcriptional drivers of triple-negative breast cancer
2023-12-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113564
PMID:38100350
|
研究论文 | 本研究通过结合功能和分子 profiling 以及计算分析,定义了三阴性乳腺癌(TNBC)的转录、表观遗传和代谢亚型及其亚型驱动的超级增强子和转录因子 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌的转录亚型在单细胞水平上的相对均一性,并发现 PRRX1 转录因子是驱动间质型 TNBC 的关键因素 | NA | 旨在表征三阴性乳腺癌的异质性及其转录驱动因素 | 三阴性乳腺癌的转录、表观遗传和代谢亚型及其驱动因素 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | 大规模多平台多组学研究 | NA | NA | NA | NA |
| 18068 | 2024-08-05 |
A longitudinal single-cell atlas of treatment response in pediatric AML
2023-12-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.10.008
PMID:37977148
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序剖析儿童急性髓系白血病(pAML)的治疗反应。 | 揭示了在治疗过程中,亚型特异性的细胞塑性出现,并识别了可能的靶向过程。 | 该研究样本规模较小,仅涉及28名患者。 | 研究儿童急性髓系白血病不同亚型的细胞组成及其对治疗反应的影响。 | 28名代表不同pAML亚型的儿童患者,涵盖诊断、缓解和复发阶段。 | 数字病理学 | 儿童急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 28名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 18069 | 2024-08-05 |
Cell-in-Cell-Mediated Entosis Reveals a Progressive Mechanism in Pancreatic Cancer
2023-12, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.08.035
PMID:37657757
|
研究论文 | 该文章探讨了细胞间介导的细胞吞噬在胰腺癌中的作用机制 | 研究首次揭示了NET1作为胰腺癌进展的一个新型相关基因,且细胞吞噬与胰腺癌预后不良相关 | 未能全面探索细胞吞噬在所有胰腺癌表现中发挥的作用 | 阐明细胞吞噬在胰腺导管腺癌进展中的作用 | 研究对象包括胰腺导管腺癌细胞和其在不同培养条件下的表现 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及胰腺癌样本及其肝转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18070 | 2024-08-05 |
Stricturing Crohn's Disease Single-Cell RNA Sequencing Reveals Fibroblast Heterogeneity and Intercellular Interactions
2023-11, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.07.014
PMID:37507073
|
研究论文 | 这篇文章通过单细胞RNA测序揭示了克罗恩病狭窄中的成纤维细胞异质性和细胞间相互作用 | 首次生成了狭窄肠道的单细胞RNA测序图谱,揭示了成纤维细胞异质性和相互作用 | 该研究可能未涵盖所有克罗恩病狭窄的生物学特征,且主要集中于成纤维细胞 | 探索克罗恩病中狭窄形成的机制并识别新的治疗靶点 | 克罗恩病的全厚度组织样本,特别是成纤维细胞的异质性和功能 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和细胞数据 | 99个组织样本和409,001个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18071 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558911
PMID:37790561
|
research paper | 本研究探讨了AML患者样本与T细胞相互作用对患者预后的影响及ICAM1的关键作用 | 揭示了与AML敏感性或抗性相关的转录程序,并发现ICAM1在T细胞介导的杀伤中扮演重要角色 | 研究可能未涵盖所有AML患者的异质性 | 探讨T细胞与急性髓性白血病之间的相互作用及其对患者预后的影响 | 急性髓性白血病患者样本及其与工程化CD4 T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多例AML患者样本及CD4 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 18072 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
|
研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态,促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18073 | 2024-08-04 |
The Use of Single-Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics in Understanding the Pathogenesis and Treatment of Skin Diseases
2023-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2023.100198
PMID:37205302
|
review | 本论文回顾了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤疾病研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学来剖析皮肤疾病的关键细胞成分及其空间排列 | NA | 提升皮肤疾病治疗的精准医学水平 | 皮肤疾病,包括异常伤口愈合、炎症性皮肤疾病和癌症 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18074 | 2024-08-05 |
Identification of an adipose tissue-resident pro-preadipocyte population
2023-05-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112440
PMID:37119138
|
研究论文 | 本研究揭示了脂肪组织中一种特定的前脂肪细胞群体及其分化路径 | 通过单细胞RNA测序发现了一种新的人类CD31 CD45细胞群,并将其放置于已知前脂肪细胞群之前的表观遗传路径上 | 研究可能受到样本选择和细胞异质性的限制 | 揭示脂肪细胞的分化过程及其生理机制 | 研究了脂肪组织中的间质血管部分(SVF)中细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18075 | 2024-08-05 |
Osteoblast-intrinsic defect in glucose metabolism impairs bone formation in type II diabetic male mice
2023-05-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85714
PMID:37144869
|
研究论文 | 本研究揭示了糖尿病小鼠骨生成受损的机制,强调了骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷 | 首次识别糖尿病小鼠中骨母细胞内在的葡萄糖代谢缺陷是糖尿病性骨质疏松的潜在原因 | 仅在小鼠模型中进行研究,限制了结果对人类的直接适用性 | 探讨2型糖尿病对骨生成的影响及其机制 | 以青少年2型糖尿病小鼠为研究对象 | 数字病理学 | 糖尿病性骨质疏松 | 稳定同位素追踪,Seahorse测定,单细胞RNA测序 | NA | 生物样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18076 | 2024-08-05 |
High-content CRISPR screening
2022, Nature reviews. Methods primers
DOI:10.1038/s43586-022-00098-7
PMID:37214176
|
研究论文 | 该文章介绍了高内容CRISPR筛选技术及其应用于生物发现的潜力 | 文章强调了高内容方法如何提供前所未有的细节,以直接获得生物学见解 | NA | 探索CRISPR筛选的基本和高级概念及其在生物医学研究和药物开发中的应用 | 各种基因功能的非偏见探讨,包括癌症研究、免疫学和微生物学等领域 | 数字生物学 | 癌症 | CRISPR | NA | RNA测序, 空间成像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18077 | 2024-08-05 |
Dense and accurate whole-chromosome haplotyping of individual genomes
2017-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01389-4
PMID:29101320
|
研究论文 | 本文介绍了一种整合相位策略,用于对个体基因组进行密集且准确的全染色体单倍型分析 | 提出了一种新颖的整合相位策略,通过结合不同的测序技术实现高效的单倍型分析 | 缺乏对更广泛生物样本的验证,目前结果主要基于特定个体NA12878 | 研究旨在提高基因组分析中对单倍型信息的获取和利用 | 研究对象为人类基因组中的单倍型信息 | 数字病理学 | NA | 链特异性单细胞测序、PacBio数据、10X Genomics链接读测序 | NA | 基因组数据 | 使用了10个Strand-seq文库和10倍覆盖的PacBio数据或10X Genomics链接读数据 | NA | NA | NA | NA |
| 18078 | 2024-08-05 |
Single-cell and bulk RNA sequencing reveal heterogeneity and diagnostic markers in papillary thyroid carcinoma lymph-node metastasis
2024-Jun, Journal of endocrinological investigation
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s40618-023-02262-6
PMID:38146045
|
研究论文 | 本研究分析了乳头状甲状腺癌的淋巴结转移,寻找诊断标记物和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和大规模RNA测序,探索了乳头状甲状腺癌淋巴结转移的异质性 | 研究中样本量有限,仅包括66名患者的样本 | 旨在发现乳头状甲状腺癌淋巴结转移的诊断标记物及治疗靶点 | 研究对象为乳头状甲状腺癌患者的淋巴结转移细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和常规模RNA测序(RNA-seq) | NA | RNA | 66名乳头状甲状腺癌患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 18079 | 2024-08-04 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Myocardial Fibrosis Mechanism of Doxorubicin-Induced Cardiotoxicity
2024-May-31, International heart journal
IF:1.2Q3
DOI:10.1536/ihj.23-302
PMID:38749755
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了多柔比星诱导心肌纤维化的机制 | 首次明确了多柔比星诱导心肌纤维化的细胞和分子介导因素,并发现了可以作为治疗靶点的Ctsb | 主要研究集中在小鼠模型上,可能在临床应用中存在差异 | 探索多柔比星诱导的心脏毒性和心肌纤维化机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 正常和多柔比星诱导慢性心脏毒性的鼠模型心脏组织中的非心肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 18080 | 2024-08-05 |
Proteomic analysis of pleomorphic dermal sarcoma reveals a fibroblastic cell of origin and distinct immune evasion mechanisms
2024-05-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-62927-x
PMID:38822058
|
研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析发现多形性皮肤肉瘤的细胞来源和独特的免疫逃逸机制 | 首次识别出多形性皮肤肉瘤的潜在细胞来源及其免疫逃逸机制 | 样本数量相对较小,可能影响结果的普适性 | 探讨多形性皮肤肉瘤的细胞起源及其免疫逃逸途径 | 分析健康皮肤、恶性黑色素瘤、鳞状细胞癌和多形性皮肤肉瘤的样本 | 数字病理学 | 皮肤肿瘤 | 质谱 | NA | 蛋白质数据、单细胞测序数据 | 分析了20个正常皮肤样本、27个恶性黑色素瘤样本、20个鳞状细胞癌样本和24个多形性皮肤肉瘤样本 | NA | NA | NA | NA |