单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27924 篇文献，本页显示第 18041 - 18060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 18041 | 2024-08-07 |
Heritable transcriptional defects from aberrations of nuclear architecture
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06157-7
PMID:37286600
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研究论文 | 本文探讨了核内微核和染色体桥等异常结构对遗传转录抑制的影响 | 首次识别微核和染色体桥作为遗传转录抑制的来源，并使用长时程活细胞成像和单细胞RNA测序技术进行验证 | 文中提到的转录抑制改变的穿透性异质性可能导致研究结果的解释存在一定的不确定性 | 揭示导致表观遗传变异的机制，特别是在癌症中的作用 | 癌细胞中的微核和染色体桥 | NA | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 18042 | 2024-08-05 |
A single-cell level comparison of human inner ear organoids with the human cochlea and vestibular organs
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112623
PMID:37289589
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研究论文 | 本文展示了人类多能干细胞衍生的内耳类器官与人类耳蜗和前庭器官的比较 | 提出了利用单细胞转录组学评估内耳类器官的细胞类型异质性 | 当前组织培养模型缺乏足够的细胞类型多样性来研究内耳疾病 | 研究内耳类器官及其在内耳发育和疾病中的潜在应用 | 采用单细胞转录组学分析人类胎儿和成人内耳组织的细胞类型 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞转录组学 | 内耳类器官 | 组织 | NA |
| 18043 | 2024-08-07 |
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112599
PMID:37279110
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研究论文 | 本文研究了一种异源初免-加强疫苗策略，使用自组装肽纳米颗粒TLR-7/8激动剂（SNP）疫苗初免和黑猩猩腺病毒（ChAdOx1）疫苗加强，以激活先天和适应性免疫，促进肿瘤消退。 | 首次证明了静脉注射异源初免-加强疫苗策略能有效增强CD8 T细胞反应和肿瘤消退，且这种效应依赖于I型IFN信号传导。 | NA | 研究一种新的异源初免-加强疫苗策略，以提高肿瘤治疗效果。 | 异源初免-加强疫苗策略对肿瘤免疫的影响。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型MC38肿瘤 |
| 18044 | 2024-08-05 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human injured brain
2023-06-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101057
PMID:37263268
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research paper | 本研究揭示了人类受损大脑中的代谢异质性 | 文章创新性在于结合空间转录组学和代谢研究，生成了一种全面的分子标记，展示了人类受伤大脑中多样的代谢变化 | NA | 旨在整合空间组织和功能方向的生物学理解 | 六名脑外伤患者的外科样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据及代谢物数据 | 六名脑外伤患者的外科样本 |
| 18045 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ependymal subtypes related to cytoskeleton dynamics as the core driver of syringomyelia pathological development
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106850
PMID:37275526
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研究论文 | 本研究揭示了与细胞骨架动态相关的脑室细胞亚型，这些亚型是脊髓囊肿病理发展的核心驱动因素 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了脊髓囊肿中脑室细胞亚型的动态变化及其与细胞骨架的关系 | 在研究中仅使用了一种可逆模型，可能无法完全模拟所有临床特征 | 研究脊髓囊肿发生和发展过程中的时空病理改变 | 主要研究脑室细胞（EPCs）、少突胶质细胞谱系和小胶质细胞的动态变化 | 数字病理学 | 脊髓囊肿 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 18046 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptional Mapping Reveals Site-Specific Pathways Underlying Human Atherosclerotic Plaque Rupture
2023-06-13, Journal of the American College of Cardiology
IF:21.7Q1
DOI:10.1016/j.jacc.2023.04.008
PMID:37286250
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化斑块破裂的确切位置和潜在机制。 | 首次通过空间转录组学在动脉粥样硬化中确定了斑块破裂易感区域的转录特征。 | 研究主要集中在颈动脉斑块，可能无法广泛应用于其他类型的动脉粥样硬化。 | 研究动脉粥样硬化斑块破裂的机制并识别针对心血管事件的治疗靶点。 | 研究对象为人类颈动脉的动脉粥样硬化斑块。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类颈动脉斑块样本 |
| 18047 | 2024-08-07 |
[Applications and advances of spatial transcriptomics in oncology research]
2023-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18048 | 2024-08-05 |
Tox4 regulates transcriptional elongation and reinitiation during murine T cell development
2023-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04992-y
PMID:37286708
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研究论文 | 本研究揭示了HMG蛋白Tox4在小鼠T细胞发育中的作用 | 首次揭示Tox4在小鼠T细胞发育中调控转录延长与重新启动的机制 | 研究主要集中在小鼠模型，可能存在物种间差异 | 探究Tox4在小鼠T细胞发育中的功能 | 小鼠模型中的T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 18049 | 2024-08-07 |
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-Jun-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.80075
PMID:37284748
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研究论文 | 本文开发了一种TBX5/MYL2谱系追踪报告系统，并结合单细胞RNA测序技术，研究了人类诱导多能干细胞在心脏分化过程中第一心脏场的主导地位。 | 首次在人类诱导多能干细胞中使用谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了第一心脏场在心脏分化中的主导地位。 | 研究仅限于二维分化协议和两个独立的人类诱导多能干细胞系。 | 探索人类诱导多能干细胞在心脏分化过程中第一和第二心脏场的起源和分化。 | 人类诱导多能干细胞的心脏分化过程。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个时间点的数据，涉及两个独立的人类诱导多能干细胞系 |
| 18050 | 2024-08-07 |
Single-cell profiling reveals a potent role of quercetin in promoting hair regeneration
2023-06-07, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwac062
PMID:37285263
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研究论文 | 本文报道了外用槲皮素（Que）刺激休眠毛囊生长，促进小鼠毛囊角质细胞增殖和毛囊周围微血管再生的研究 | 首次构建了动态单细胞转录组图谱，揭示了槲皮素治疗促进毛囊分化轨迹和真皮内皮细胞血管生成特征的分子机制 | NA | 探讨槲皮素在促进毛发生长中的作用及其分子机制 | 小鼠毛囊和真皮内皮细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组 | NA |
| 18051 | 2024-08-07 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
|
研究论文 | 本文介绍了一种从饮食诱导的肥胖小鼠阴道中分析γδ T细胞的协议，使用单细胞RNA测序和流式细胞术 | 本文提供了一种新的方法来研究肥胖对性传播疾病易感性的影响，特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | NA | 研究肥胖如何影响性传播疾病的易感性，特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | 饮食诱导的肥胖小鼠阴道中的γδ T细胞 | 数字病理学 | 性传播疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 18052 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal changes in cell heterogeneity during progression of human tendinopathy
2023-06-06, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01613-2
PMID:37280595
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间RNA测序揭示了人类肌腱病进展中的细胞异质性变化 | 创新点在于构建了健康和疾病人类肌腱的细胞图谱，并探讨了细胞亚型的空间分布变化 | 本研究未提及具体的限制因素 | 本研究旨在理解肌腱病进展中的细胞异质性和分子机制 | 研究对象为健康和患病的人类肌腱细胞 | 数字病理学 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序及空间RNA测序 | NA | 细胞数据 | 大约35,000个细胞 |
| 18053 | 2024-08-05 |
Identification of the E2F1-RAD51AP1 axis as a key factor in MGMT-methylated GBM TMZ resistance
2023-06-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究揭示了E2F1-RAD51AP1轴在MGMT甲基化的胶质母细胞瘤TMZ耐药性中的关键作用 | 本研究首次识别了E2F1作为EGFRvIII阳性胶质瘤细胞中的关键转录因子，并确定了RAD51AP1在TMZ耐药机制中的作用 | 在MGMT高表达的GBM细胞中，RAD51AP1对TMZ敏感性没有显著影响，可能限制了其在不同类型GBM中的应用 | 阐明导致EGFRvIII和TMZ耐药性的关键机制 | 研究对象为EGFRvIII阳性胶质瘤细胞及其对TMZ的反应 | 肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR-Cas13a单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了EGFRvIII阳性胶质瘤细胞的多个样本进行实验 |
| 18054 | 2024-08-05 |
Cell-attribute aware community detection improves differential abundance testing from single-cell RNA-Seq data
2023-06-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39017-z
PMID:37277399
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研究论文 | 本文提出了一种新的差异丰度测试范式ELVAR，旨在改善单细胞RNA测序数据的分析。 | ELVAR以细胞属性为基础进行聚类，能够在单细胞流形中推断出差异富集的细胞群体，克服了单细胞数据中的噪声问题。 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞类型在生物老化和疾病风险中的差异丰度模式。 | 模拟和真实的单细胞及单核RNA测序数据集。 | 数字病理学 | 老年疾病，癌症前状态，Covid-19 | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA-seq数据 | 多个模拟和真实数据集 |
| 18055 | 2024-08-07 |
A single-cell transcriptome atlas of pig skin characterizes anatomical positional heterogeneity
2023-06-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86504
PMID:37276016
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了来自陈华猪和大白猪六个不同解剖区域的猪皮肤组织，揭示了皮肤细胞类型及其亚型的异质性 | 首次详细描述了猪皮肤不同解剖区域细胞类型的异质性，并识别了特定位置基因的表达模式 | NA | 探究猪皮肤不同解剖区域的细胞异质性及其基因表达模式 | 猪皮肤组织中的七种细胞类型及其亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 233,715个细胞 |
| 18056 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals sexual diversity in the human bladder and its prospective impacts on bladder cancer and urinary tract infection
2023-06-05, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01535-6
PMID:37277784
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人类膀胱中的性别多样性及其对膀胱癌和尿路感染的潜在影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了正常人类膀胱细胞中基于性别的基因表达差异，并探讨了这些差异对膀胱癌和尿路感染的影响 | 研究主要基于已发表的数据，未来需要更多的实验验证和临床数据支持 | 旨在理解正常膀胱细胞中基于性别的基因表达差异及其对膀胱相关疾病的影响 | 人类膀胱细胞中的性别多样性及其对膀胱癌和尿路感染的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 27,437个细胞 |
| 18057 | 2024-08-07 |
Group-specific cellular metabolism in Medulloblastoma
2023-06-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04211-6
PMID:37277823
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研究论文 | 本研究探讨了髓母细胞瘤（MB）中不同分子亚群的细胞代谢特征及其对患者预后的影响 | 首次对MB中的代谢异质性进行了详细分析，并揭示了代谢基因表达与患者生存之间的关联 | 研究主要基于现有数据集，未来需要更多实验验证 | 深入理解MB中的代谢表型及其对患者预后的影响 | 髓母细胞瘤患者的细胞代谢特征 | NA | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 共分析了1288名患者的样本，其中902名患者的bulk RNA数据，491名患者的DNA数据，以及34名患者的单细胞RNA测序数据 |
| 18058 | 2024-08-05 |
Intrinsic TGF-β signaling attenuates proximal tubule mitochondrial injury and inflammation in chronic kidney disease
2023-06-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39050-y
PMID:37270534
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研究论文 | 本研究描述了TGF-β信号传导在慢性肾病中对近端小管线粒体稳态和炎症的作用 | 揭示了TGF-β信号对近端小管线粒体损伤和免疫反应的影响，提供了新的治疗靶点以减缓慢性肾病的进展 | 未提及具体的人类临床研究数据，数据主要来源于小鼠模型 | 研究TGF-β信号在慢性肾病中如何影响近端小管的线粒体功能 | 近端小管细胞及其在慢性肾病中的功能 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 空间转录组学和批量RNA测序 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 小鼠模型中的样本数量未具体说明 |
| 18059 | 2024-08-05 |
Construction and validation of an oxidative-stress-related risk model for predicting the prognosis of osteosarcoma
2023-06-02, Aging
DOI:10.18632/aging.204764
PMID:37285835
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研究论文 | 本研究构建并验证了一个与氧化应激相关的骨肉瘤预后风险模型 | 首次识别了八个与氧化应激相关的基因，并建立了相应的预后模型 | 可能只限于特定的数据库，外部验证样本量相对较小 | 开发一个用于骨肉瘤预后的风险模型 | 86名骨肉瘤患者的基因表达和临床数据 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 86名骨肉瘤患者 |
| 18060 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq revealed the heterogeneity and convergence of the immune microenvironment in renal cell carcinoma
2023-Jun-02, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01113-0
PMID:37264263
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序和大缩 RNA 测序数据揭示了肾细胞癌免疫微环境的异质性和收敛性 | 该研究识别了肾细胞癌中11种不同细胞类型，并确定了RNASET2和GATM作为潜在预后生物标志物 | 研究样本数量较少，可能限制了结果的普遍性 | 探讨肾细胞癌的肿瘤微环境及其对患者预后的影响 | 六个肾细胞癌肿瘤样本的单细胞和大缩RNA序列数据 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 (sc-RNAseq) | NA | RNA序列数据 | 六个肾细胞癌肿瘤样本 |