单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
18001 2024-08-08
Intratumoral erythroblastic islands restrain anti-tumor immunity in hepatoblastoma
2023-05-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了13名未经治疗的肝母细胞瘤患者的肿瘤微环境,发现异常积累的红细胞岛(EBIs)与肝母细胞瘤的生存率呈负相关,并揭示了EBIs通过LGALS9/TIM3轴抑制树突状细胞功能,从而影响抗肿瘤T细胞免疫反应的机制。 首次发现红细胞岛在肿瘤中的功能,并揭示了其通过特定分子轴抑制树突状细胞功能,影响抗肿瘤免疫反应的机制。 研究样本仅限于13名未经治疗的肝母细胞瘤患者,可能需要更大样本量来验证结果的普遍性。 探讨肝母细胞瘤肿瘤微环境中红细胞岛的功能及其对免疫反应的影响。 肝母细胞瘤患者的肿瘤微环境及红细胞岛的功能。 数字病理学 肝母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA RNA序列 13名未经治疗的肝母细胞瘤患者
18002 2024-08-05
Methanol fixation is the method of choice for droplet-based single-cell transcriptomics of neural cells
2023-05-15, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究系统比较了不同固定方法对神经细胞单细胞转录组学的影响 确定了甲醇固定作为滴度单细胞转录组学实验的首选方法 未详细探讨其他类型细胞在不同固定方法下的适用性 比较不同样本保存方法对神经细胞转录组学的影响 来源于诱导多能干细胞的神经细胞和胶质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA分子 NA
18003 2024-08-05
Single-cell RNA sequencing reveals the vascular smooth muscle cell phenotypic landscape in aortic aneurysm
2023-05-15, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究揭示了主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型景观和分化轨迹 首次使用单细胞RNA测序分析了主动脉瘤中不同表型的血管平滑肌细胞及其潜在功能 未讨论血管平滑肌细胞表型变化在主动脉瘤发展中的具体机制 分析主动脉瘤中血管平滑肌细胞的表型景观和分化特征 主要研究主动脉瘤中的血管平滑肌细胞及其不同表型 数字病理学 主动脉瘤 单细胞RNA测序 NA 细胞数据 共分析了12个主动脉瘤样本和5个正常主动脉样本
18004 2024-08-05
Multiplexed single-cell transcriptome analysis reveals molecular characteristics of monkey pluripotent stem cell lines
2023-May-15, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 这篇文章介绍了一种多重单细胞测序技术,用于分析猴子多能干细胞的分子特征 首次在非人灵长类细胞中应用多重单细胞测序技术,展示了人类干细胞培养条件向猴子细胞的转化 未提供关于样本数量和具体的操作细节的详细信息 旨在探索猴子多能干细胞的分子特征及其培养条件 猴子多能干细胞系 数字病理学 NA 单细胞测序 NA NA NA
18005 2024-08-05
Multi-label transcriptional classification of colorectal cancer reflects tumor cell population heterogeneity
2023-05-15, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文研究了多标签转录分类如何反映结直肠癌肿瘤细胞群体的异质性 首次应用多标签CRIS分类器,展示了结直肠癌样本可以被分配多个亚型,提供了额外的临床和生物学相关信息 缺乏不同癌症类型的验证,需要扩展到其他癌症类型和分类系统 探讨CRIS分类器的多标签分配是否能提供更多临床和生物学的相关信息 606个结直肠癌患者来源的异种移植(PDX)样本及相关RNA-seq数据集 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq 机器学习模型 基因表达数据 606个结直肠癌患者来源的异种移植样本
18006 2024-08-08
Novel CH25H+ and OASL+ microglia subclusters play distinct roles in cerebral ischemic stroke
2023-May-15, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了脑缺血性卒中后微胶质细胞的转录变化及其在卒中治疗中的潜在作用 首次鉴定出CH25H+和OASL+微胶质细胞亚群,并揭示了它们在脑缺血性卒中中的不同作用 NA 探讨脑缺血性卒中后微胶质细胞的转录变化及其在卒中治疗中的潜在作用 微胶质细胞亚群在脑缺血性卒中的作用 数字病理学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA RNA 使用脑缺血组织和假手术小鼠的脑组织进行单细胞RNA测序,以及Ch25h-/-小鼠进行功能研究
18007 2024-08-08
Author Correction: Identification of a differentiation-related prognostic nomogram based on single-cell RNA sequencing in clear cell renal cell carcinoma
2023-May-15, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18008 2024-08-08
An exploratory study for tuft cells in the breast and their relevance in triple-negative breast cancer: the possible relationship of SOX9
2023-May-13, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了乳腺中的簇状细胞及其在三阴性乳腺癌中的相关性,特别是SOX9的可能关系 首次发现簇状细胞样表达特征在三阴性乳腺癌中的存在,并通过免疫组化证实了簇状细胞在正常人乳腺中的存在 研究样本量有限,需要进一步的大规模研究来验证结果 探索簇状细胞在乳腺中的存在及其在三阴性乳腺癌中的作用 簇状细胞、三阴性乳腺癌、SOX9 数字病理学 乳腺癌 免疫组化(IHC)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 组织样本 4例先前报道的POU2F3阳性浸润性乳腺癌、1853例新的浸润性乳腺癌、15例非肿瘤性乳腺组织
18009 2024-08-08
Publisher Correction: Modeling group heteroscedasticity in single-cell RNA-seq pseudo-bulk data
2023-May-12, Genome biology IF:10.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18010 2024-08-05
Single-cell sequencing reveals homogeneity and heterogeneity of the cytopathological mechanisms in different etiology-induced AKI
2023-05-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了不同病因诱导的急性肾损伤(AKI)中细胞病理机制的均一性和异质性 本研究构建了一个包含20种细胞类型的多模型AKI单细胞测序图谱,并发现了新型AKI内皮损伤生物标志物S100a6 研究主要在小鼠模型上进行,可能存在物种间差异 探讨不同病因诱导的急性肾损伤的细胞病理机制 小鼠模型,包含五种常见的AKI病因 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞数据 包含80,689个高质量细胞
18011 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals the local cell landscape in mouse epididymal initial segment during aging
2023-May-11, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠附睾头段(IS)的细胞景观,揭示了与年龄相关的细胞和分子变化 首次揭示了小鼠附睾头段在衰老过程中存在炎症老化状态,这与男性近端生殖道的普遍低免疫反应模式相反 NA 探究衰老过程中小鼠附睾头段的局部细胞和分子变化 年轻和老年小鼠的附睾头段组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 共获取了来自年轻和老年小鼠附睾头段组织的10,027个细胞
18012 2024-08-08
Single-Cell Analysis in Immuno-Oncology
2023-May-08, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用,特别是多组学分析如何通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、T细胞受体测序等技术,以及相关的生物信息学工具,来高吞吐量地评估大量分析物在单细胞分辨率下的情况。 本文介绍了单细胞组学技术在解析肿瘤微环境中免疫和非免疫成分的多样性方面的创新应用,以及这些技术如何帮助理解适应性免疫反应的抗原特异性和动态变化,并为潜在的治疗靶点提供建议。 NA 探讨单细胞组学技术在免疫肿瘤学中的应用,以及如何通过这些技术来优化患者的治疗方案。 肿瘤微环境中的免疫和非免疫细胞,以及它们在不同患者中的分布和响应模式。 免疫学 肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、T细胞受体测序(scTCR-seq) NA 单细胞数据 NA
18013 2024-08-05
Single-nucleus and Spatially Resolved Intratumor Subtype Heterogeneity in Bladder Cancer
2023-May, European urology open science IF:3.2Q1
研究论文 本研究探讨了膀胱癌中肿瘤内部亚型异质性的程度及其潜在的临床影响 提出了通过单核RNA测序和批量RNA测序评估膀胱癌内部亚型异质性的新方法,并展示了其与临床结果的相关性 使用DroNc-seq测序协议生成的数据稀疏性是一个限制因素 研究膀胱癌肿瘤内部亚型异质性及其对临床结果的影响 48个膀胱肿瘤进行单核RNA测序和空间转录组学分析 数字病理学 膀胱癌 RNA测序 NA RNA数据 48个膀胱肿瘤
18014 2024-08-05
The peripheral nervous system
2023-05-01, Development (Cambridge, England)
综述 本文讨论了外周神经系统在身体中的多样角色及其不同领域的起源和异质性 提出了最新的发现和概念,并改进了以前的细胞类型分类 未提及具体的实验数据或实例来支持某些观点 探讨外周神经系统的多样性以及对未来研究的展望 外周神经系统的各种神经元亚型及其功能 NA NA 单细胞转录组学 NA NA NA
18015 2024-08-08
Spatial transcriptomics herald a new era of transcriptome research
2023-05, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
18016 2024-08-05
Construction of a prognostic model for lung adenocarcinoma based on membrane-tension-related genes
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究构建了一个与膜张力相关基因的肺腺癌预后模型 首次关注膜张力在肺腺癌中的作用,并构建了基于膜张力相关基因的预后模型 样本可能存在选择偏差,模型在不同人群中的验证需要进一步研究 旨在识别影响肺腺癌预后的关键生物标志物 关注于肺腺癌患者的膜张力相关基因及其预后价值 数字病理学 肺癌 RNA测序 COX回归模型和LASSO回归模型 基因组数据 从TCGA数据库中获取了肺腺癌样本的RNA测序数据
18017 2024-08-05
IRF7 and IFIT2 in mediating different hemorrhage outcomes for non-small cell lung cancer after bevacizumab treatment
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
研究论文 本文研究了IRF7和IFIT2在非小细胞肺癌患者接受贝伐单抗治疗后不同出血结果中的作用 揭示了IRF7和IFIT2可能影响非小细胞肺癌患者贝伐单抗治疗后的出血结果的新机制 在贝伐单抗治疗对不同类型肺癌出血结果的影响机制方面仍需进一步研究 探讨贝伐单抗治疗后非小细胞肺癌不同病理类型患者出血结果的潜在机制 非小细胞肺癌患者中的腺癌和鳞癌肿瘤样本 数字病理学 肺癌 单细胞测序,实时聚合酶链反应,免疫荧光分析等 NA 肿瘤组织样本 LUAD和LUSC患者的肿瘤组织样本
18018 2024-08-05
Immune characteristics and genetic markers of esophageal cancer by single-cell analysis: implications for immunotherapy
2023-Apr-28, Journal of thoracic disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞分析探讨了食管癌的肿瘤环境特征和潜在遗传标记. 应用单细胞分析技术识别了食管癌中的特定细胞亚群,并发现了CXCL8蛋白作为潜在的预后标志物. 本研究主要基于公共基因组数据,可能缺乏临床样本的多样性与个体差异考量. 研究食管癌患者的肿瘤微环境特征,为个性化治疗提供基础. 研究对象为食管癌样本及其旁癌样本中的免疫细胞亚群. 数字病理学 食管癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 从TCGA数据库下载的食管癌样本数据
18019 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Atlas of Yak Testis Cells
2023-Apr-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了牦牛睾丸细胞的图谱 首次通过单细胞RNA测序技术全面且无偏地研究了性成熟4岁牦牛的精子发生过程,并鉴定了多种细胞类型及其标记基因 NA 探索牦牛精子发生过程中的细胞异质性 牦牛的睾丸细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 性成熟4岁牦牛的睾丸细胞
18020 2024-08-05
UVRAG Promotes Tumor Progression through Regulating SP1 in Colorectal Cancer
2023-Apr-27, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究探讨了UVRAG在结直肠癌中的作用及其对预后的影响 揭示了UVRAG通过上调SP1表达增强肿瘤迁移和药物耐受性,提供了结直肠癌潜在机制的见解 本研究的具体限制未提及 旨在分析UVRAG在结直肠癌中的表达及其对患者预后的影响 研究对象为结直肠癌患者的肿瘤组织样本 数字病理学 结直肠癌 RNA测序和单细胞RNA测序 NA 组织样本 高UVRAG表达组和低UVRAG表达组的样本
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