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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1781 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887
PMID:40582491
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研究论文 | 通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用,并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因 | 首次系统性地整合批量转录组学、单细胞RNA测序和功能实验,全面表征胰腺癌中多胺代谢的作用机制 | 多胺代谢在胰腺癌中的全面临床意义仍需进一步探索 | 研究多胺代谢在胰腺导管腺癌进展和免疫逃逸中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 多组学分析 | 胰腺癌 | 批量转录组学,单细胞RNA测序,功能实验 | 随机森林算法,主成分分析 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
1782 | 2025-10-05 |
CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898
PMID:40623543
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研究论文 | 本研究揭示CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质,增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性 | 首次阐明CEMIP2通过透明质酸降解调节肿瘤微环境并增强化疗疗效的分子机制 | CEMIP2在肿瘤微环境中具体作用机制仍需进一步验证 | 探究CEMIP2在胰腺导管腺癌化疗敏感性中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和PDAC小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 临床PDAC标本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
1783 | 2025-10-05 |
The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015
PMID:40389038
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研究论文 | 本研究通过大鼠败血症腹膜炎模型,揭示内脏大神经通过调节中性粒细胞亚群平衡来影响细菌清除的新机制 | 首次证明内脏大神经在感染急性期通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡(激活态与静止态)来影响细菌清除,而非通过巨噬细胞 | 研究仅关注急性感染期(24小时内),未评估长期效应;机制研究主要基于相关性分析 | 阐明内脏大神经在败血症感染过程中的免疫调节作用 | 大肠杆菌诱导的败血症腹膜炎大鼠模型 | 免疫学 | 败血症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 大鼠败血症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1784 | 2025-10-05 |
Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021
PMID:40721173
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研究论文 | 本研究通过多模态方法探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与脑形态、免疫炎症标志物和空间转录组学的关联 | 首次结合神经内分泌标志物、脑结构差异和空间转录组学综合分析ASD攻击行为的神经生物学机制,识别了前额叶-边缘系统-纹状体网络失衡与促炎状态的复杂相互作用 | 样本量较小(42名男性参与者),缺乏纵向数据,未考虑遗传和环境因素的影响,研究结果可能不适用于更广泛的自闭症人群 | 识别自闭症谱系障碍中攻击行为的潜在机制并为治疗策略提供依据 | 42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者(21名攻击性患者和21名非攻击性对照) | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 多重检测分析、磁共振成像、变形基形态测量法、空间转录组学 | NA | 行为问卷数据、血浆生物标志物、脑影像数据、基因表达数据 | 42名男性ASD患者(21名攻击性,21名非攻击性),其中13名攻击性患者接受了MRI扫描 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1785 | 2025-10-05 |
Testis-specific protein HSF5 is essential for proper chromatin organization and transcriptional reprogramming to drive pachynema progression
2025-Sep-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了睾丸特异性蛋白HSF5在调控粗线期染色质组织和转录重编程中的关键作用 | 首次发现HSF5通过形成HSF5-USP7复合物抑制减数分裂性染色体上的H2AK119ub修饰,并揭示其在XY小体形成和精子蛋白酶体活性调控中的新功能 | HSF5调控转录调控网络的具体分子机制尚未完全阐明 | 阐明HSF5在哺乳动物减数分裂前期I粗线期进展中的分子调控机制 | 小鼠精母细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
1786 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
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研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型,人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
1787 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
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研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化,为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1788 | 2025-10-05 |
Identifying potential therapeutic targets in periodontitis: a multi-omics approach integrating bulk and single-cell RNA sequencing with Mendelian randomization
2025-Sep-09, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04580-3
PMID:40921808
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和转录组学分析,识别与牙周炎相关的关键基因特征 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合,识别出牙周炎的四个枢纽基因(CXCR4, ARHGDIB, PLAT, C19orf10) | 仅分析了GEO数据库中的三个独立数据集,样本来源有限 | 识别牙周炎的潜在治疗靶点和分子机制 | 牙周炎相关基因表达数据和细胞类型 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 转录组学分析, GO/KEGG富集分析 | LASSO, 随机森林 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 三个独立数据集(来自GEO数据库) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
1789 | 2025-10-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics uncover the prognostic, epigenetic, and immunological roles of FANCC in low-grade glioma
2025-Sep-09, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2556255
PMID:40923898
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,揭示了FANCC在低级别胶质瘤中的预后、表观遗传和免疫调控作用 | 首次报道FANCC作为低级别胶质瘤的致癌驱动因子,通过免疫微环境重编程和DNA修复失调协同促进肿瘤进展 | NA | 全面研究FANCC在低级别胶质瘤中的临床意义、预后价值和分子机制,以确定新的治疗靶点 | 低级别胶质瘤患者样本 | 数字病理学 | 低级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, GSEA分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
1790 | 2025-10-05 |
NOTCH3 drives fatty acid oxidation and ferroptosis resistance in aggressive meningiomas
2025-Sep-09, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05208-5
PMID:40924320
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中通过驱动脂肪酸氧化代谢重编程赋予铁死亡抵抗性的新机制 | 首次发现NOTCH3通过促进脂肪酸氧化代谢重编程导致脂质耗竭,从而赋予脑膜瘤细胞铁死亡抵抗性 | 研究主要基于细胞系模型,需要进一步在体内验证 | 探究NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中的代谢调控机制及其与治疗抵抗的关系 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 癌症代谢 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序, 非靶向代谢组学, 脂质组学, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 脂质数据 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
1791 | 2025-10-05 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现Apelin-APJ信号通路在重症监护后综合征(PICS)中的保护作用 | 首次揭示Apelin-APJ信号通路受损通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 | 需要进一步研究明确组织特异性作用 | 探讨PICS的分子机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型和ARDS/严重COVID-19幸存者 | NA | 重症监护后综合征 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 基因表达数据,血液样本 | 小鼠模型和ARDS/COVID-19患者(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
1792 | 2025-10-05 |
Extracellular Matrix and Fibroblast Activation in Lymphangioleiomyomatosis
2025-Sep-08, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0237OC
PMID:40920984
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术将LAM细胞按癌症干细胞基因表达分为三个亚群,并发现mTORC1驱动的4E-BP1/eIF4E翻译控制机制 | 研究针对罕见疾病样本量有限,机制研究主要基于体外实验 | 探究淋巴管平滑肌瘤病中细胞外基质和成纤维细胞激活的分子机制 | 淋巴管平滑肌瘤病细胞和LAM相关成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1793 | 2025-10-05 |
Standardizing single-cell approaches to osteoarthritis: Toward a comprehensive cellular atlas
2025-Sep-04, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.016
PMID:40914548
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评论 | 本文探讨了单细胞RNA测序在骨关节炎研究中的应用现状与未来发展方向 | 提出标准化细胞类型注释和整合新旧数据集的需求,以构建完整的骨关节炎单细胞图谱 | NA | 推动骨关节炎单细胞研究的标准化进程 | 骨关节炎关节组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1794 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell RNA model aids prediction of EGFR-TKI resistance
2025-Sep-04, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgaf038
PMID:40739818
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研究论文 | 本研究利用纵向单细胞RNA测序数据探索肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 首次在单细胞水平建立EGFR耐药评分系统并揭示代谢重编程在耐药中的作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 研究肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1795 | 2025-10-05 |
Contribution of S1pr1-featured astrocyte subpopulation to cisplatin-induced neuropathic pain in male mice
2025-Sep-03, Pain
IF:5.9Q1
DOI:10.1097/j.pain.0000000000003780
PMID:40899794
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了顺铂诱导神经病理性疼痛中S1pr1高表达星形胶质细胞亚群的作用机制 | 首次发现顺铂诱导的S1pr1高表达星形胶质细胞亚群及其通过Wnt信号通路参与神经病理性疼痛的新机制 | 研究仅使用雄性小鼠,未考察性别差异;机制研究仍需进一步验证 | 探究顺铂诱导神经病理性疼痛的细胞和分子机制 | 雄性小鼠脊髓组织 | 单细胞转录组学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性小鼠脊髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
1796 | 2025-10-05 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672376
PMID:40909701
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研究论文 | 系统评估不同采样方法在空间转录组数据上的表现 | 首次系统评估空间转录组数据的采样方法,提出空间平滑杠杆评分方法能平衡转录组异质性和组织结构保持 | 研究仅基于有限的数据集进行验证,需要更多样化的数据集进一步确认 | 评估和优化空间转录组数据的采样方法以减少计算负担 | 空间转录组数据集(小鼠卵巢、MERFISH大脑、人类乳腺癌、肺组织)和模拟数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | PCA, 随机SVD, 空间权重矩阵 | 空间转录组数据, 基因表达数据, 空间坐标 | 多个真实ST数据集和模拟数据 | NA | 空间转录组学, MERFISH | NA | NA |
1797 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
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研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据,未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析,孟德尔随机化,功能富集分析,SMR分析,共定位分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
1798 | 2025-10-05 |
Isotope-encoded spatial biology identifies plaque-age-dependent maturation and synaptic loss in an Alzheimer's disease mouse model
2025-Sep-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63328-y
PMID:40890115
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研究论文 | 本研究通过同位素编码的空间生物学技术追踪阿尔茨海默病小鼠模型中Aβ斑块的年龄依赖性成熟过程及其与突触丧失的关联 | 结合质谱成像与稳定同位素标记技术对Aβ斑块进行时间标记,实现从初始沉积开始的斑块老化空间追踪 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究Aβ斑块演化过程如何影响周围组织及其与神经毒性的关系 | App基因敲入Aβ小鼠模型 | 空间生物学 | 阿尔茨海默病 | 质谱成像, 稳定同位素标记, 空间转录组学 | NA | 质谱成像数据, 基因表达数据, 结构染色数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1799 | 2025-10-05 |
Patterns of Mitochondrial ATP Predict Tissue Folding
2025-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.31.673364
PMID:40909554
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体ATP的空间分布模式可预测胚胎发育过程中的组织折叠 | 首次发现线粒体在顶端收缩过程中局部富集于上皮细胞顶端,且这种亚细胞模式可计算预测组织折叠 | 未详细探讨线粒体空间分布调控的具体分子机制 | 探究胚胎形态发生过程中化学能量的空间分布模式及其与组织折叠的关系 | 果蝇、鸡和小鼠胚胎的上皮组织 | 发育生物学 | NA | 时间序列成像、空间转录组学、耗氧率测量 | 计算预测模型 | 图像、基因表达、代谢数据 | 多物种胚胎样本(果蝇、鸡、小鼠) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1800 | 2025-10-06 |
A simple liquid 3D cell culture paradigm models oxidative mitochondrial metabolism of epithelial breast cancer cells with relevance for lung metastases
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.24.671623
PMID:40909564
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研究论文 | 本研究比较了两种3D细胞培养模型在模拟乳腺癌细胞代谢特性和肺转移能力方面的差异 | 开发了一种新型的液体3D细胞培养模型(EmC),能够更好地模拟乳腺癌细胞的氧化磷酸化代谢和肺转移特性 | 研究仅针对三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3、MDA-MB-468),需要更多细胞系验证 | 比较不同3D细胞培养模型对乳腺癌细胞代谢特性和转移能力的影响 | 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3、MDA-MB-468) | 细胞生物学 | 乳腺癌 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢流分析、电子显微镜 | 3D细胞培养模型 | 图像、蛋白质组数据、转录组数据、代谢数据 | 三种乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |