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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2025-11-27 |
Maternal dietary fibre intake results in sex-specific single-cell molecular changes in the heart of the offspring
2025-Nov-25, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20257187
PMID:41082647
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研究论文 | 本研究探讨母体膳食纤维摄入通过肠道微生物代谢产物短链脂肪酸对后代心脏细胞分子特征的性别特异性影响 | 首次在单细胞水平揭示母体膳食纤维摄入对后代心脏细胞转录组和免疫组成的性别特异性调控机制 | 研究仅使用小鼠模型,样本量有限(scRNA-seq n=16),未验证具体分子机制 | 确定孕期短链脂肪酸递送是否导致后代心脏产生性别和细胞特异性分子变化 | 孕期和哺乳期母鼠及其六周龄后代 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, FACS, 16S rRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫细胞分选数据, 微生物组数据 | scRNA-seq 16个样本, FACS 27个样本, 16S rRNA 28个样本 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 1782 | 2025-11-27 |
Unraveling the carcinogenic mechanisms of benzo[a]pyrene in prostate cancer: a multi-omics approach
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04842-0
PMID:41288678
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了苯并[a]芘在前列腺癌中的致癌机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、分子对接、孟德尔随机化和文献计量学等多种方法系统研究BaP在前列腺癌中的作用机制 | NA | 阐明苯并[a]芘在前列腺癌发生发展中的致病机制 | 前列腺癌相关基因和苯并[a]芘作用靶点 | 多组学分析 | 前列腺癌 | 网络毒理学,单细胞转录组学,差异基因表达分析,分子对接,孟德尔随机化,文献计量学 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1783 | 2025-11-27 |
Unraveling the ferroptosis landscape in intervertebral disc degeneration through integrated bioinformatics and single-cell sequencing
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04826-0
PMID:41288682
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研究论文 | 通过整合生物信息学和单细胞测序技术系统解析椎间盘退变中铁死亡的作用机制并探索白藜芦醇的治疗潜力 | 首次在单细胞水平系统揭示椎间盘退变中铁死亡相关基因网络的细胞异质性表达模式及细胞间相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 阐明铁死亡在椎间盘退变发病机制中的作用并探索潜在药物治疗靶点 | 椎间盘退变患者样本及体外培养的髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 分子对接, CCK-8检测, RT-qPCR | CytoTRACE轨迹推断 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1784 | 2025-11-27 |
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07860-x
PMID:41288782
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研究论文 | 本研究探讨了间皮素表达的三阴性乳腺癌的临床病理特征及其与免疫抑制微环境的关系 | 首次系统研究MSLN表达TNBC的临床病理特征,发现其与免疫抑制微环境和化疗免疫治疗反应差相关 | 样本量有限,需要更大规模研究验证 | 研究间皮素在三阴性乳腺癌中的作用及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,单细胞分析,泛癌分析 | NA | 转录组数据,临床数据 | 本地队列和公共数据库样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1785 | 2025-11-27 |
Using single cell sequencing to investigate tumor microenvironment differences in left and right colon cancer and prognosis-related core genes
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03375-5
PMID:41288794
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究左右结肠癌肿瘤微环境差异并构建预后相关风险模型 | 首次在单细胞水平系统比较左右结肠癌的肿瘤微环境差异,并识别出7个预后相关核心基因 | 数据来源于公共数据库,缺乏独立验证队列 | 探究左右结肠癌肿瘤微环境差异并建立预后预测模型 | 结肠癌患者单细胞RNA测序数据和TCGA数据库临床数据 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫组化 | Cox回归模型, 列线图模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据, 免疫组化图像 | GEO数据库单细胞数据和TCGA结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1786 | 2025-11-27 |
Dominant intragraft plasma cells targeting bilirubin implicate local heme catabolism in human cardiac allograft vasculopathy
2025-Nov-25, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194138
PMID:41289018
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现心脏移植物血管病变中浸润的浆细胞主要靶向胆红素,揭示了局部血红素代谢在疾病发展中的作用 | 首次发现心脏移植物血管病变中优势浆细胞克隆特异性靶向胆红素,揭示了局部血红素代谢产物作为自身抗原的新机制 | 样本量有限,需要更大规模研究验证;机制研究尚未完全阐明胆红素特异性抗体在疾病发生中的具体作用 | 探究心脏移植物血管病变中移植物浸润浆细胞的抗原特异性及其在疾病发病机制中的作用 | 心脏移植患者的移植物组织和外周血浆细胞 | 单细胞测序 | 心脏移植物血管病变 | 单细胞RNA测序,免疫球蛋白基因分析,重组单克隆抗体生成,组织化学分析 | NA | 单细胞转录组数据,免疫球蛋白序列数据,组织影像数据 | 从移植物浆细胞克隆生成37个重组单克隆抗体,从外周血浆细胞生成24个对照抗体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1787 | 2025-11-27 |
Function and Development of Deep-sea Mussel Bacteriocytes Revealed by SnRNA-seq and Spatial Transcriptomics
2025-Nov-25, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf109
PMID:41289084
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示深海贻贝细菌细胞的功能与发育机制 | 首次结合原位去定植实验、单核转录组和空间转录组技术系统解析深海共生体系中细菌细胞的功能与发育轨迹 | NA | 探究深海贻贝与化学合成微生物共生体系中细菌细胞的功能特性和发育过程 | 深海贻贝的细菌细胞(宿主细胞内共生菌) | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位去定植实验, 多组学分析, 3D重建 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1788 | 2025-11-27 |
scDBImpute: Dual-branch Imputation for Single-cell RNA-seq Data Dropouts
2025-Nov-25, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3636928
PMID:41289139
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中丢失值填补的双分支插补方法 | 结合线性和非线性关联进行丢失值填补,不同于先前假设预定义结构的方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的丢失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双分支模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1789 | 2025-11-27 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2025-Nov-25, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术,重建肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)谱系,识别关键调控因子并开发预后风险分层模型 | 首次在肺腺癌中系统构建EMT连续谱,发现混合E/M状态具有最高转移潜能,并识别关键转录因子调控网络 | 样本量相对有限(10例患者),需要更大队列验证发现 | 阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭性的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,细胞轨迹推断 | 风险分层模型,调控网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 10例肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1790 | 2025-11-27 |
Modelling the effects of human SUR1 R1420H variation on insulin secretory function using isogenic iPSC-derived pancreatic islets
2025-Nov-25, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06605-1
PMID:41291239
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研究论文 | 利用等基因iPSC衍生的胰腺胰岛模型研究人类SUR1 R1420H变异对胰岛素分泌功能的影响 | 首次建立等基因iPSC衍生的胰腺胰岛平台,系统研究SUR1 R1420H变异在不同发育阶段对胰岛素分泌的时序性影响 | 研究仅基于两个亲本印第安美洲iPSC系,样本量有限 | 探究SUR1 R1420H变异是否导致KATP通道功能丧失及其对胰岛素分泌的发育阶段特异性影响 | 等基因iPSC衍生的胰腺胰岛(SC-islets) | 干细胞生物学 | 2型糖尿病 | CRISPR-Cas9基因编辑,单细胞RNA测序 | iPSC衍生胰腺胰岛模型 | 基因表达数据,胰岛素分泌数据 | 两个亲本iPSC系(IS1和IS2)衍生的三种基因型(1420RR,1420RH,1420HH)SC-islets | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1791 | 2025-11-27 |
Mapping cellular interactions and communication landscapes in cervical cancer via single-cell transcriptomics
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04040-7
PMID:41291352
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研究论文 | 通过单细胞转录组学方法系统解析宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性及细胞间通讯网络 | 首次在宫颈癌中系统绘制细胞间通讯图谱并识别MIF通路在癌症相关成纤维细胞中的关键作用 | 样本量相对有限(20例患者),且主要基于公共数据库的再分析 | 阐明宫颈癌肿瘤微环境中的细胞多样性、细胞间信号网络及分子机制 | 宫颈癌组织及癌旁正常组织 | 单细胞转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, ELISA | UMAP, t-SNE, 时序轨迹建模 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 20例患者的配对肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1792 | 2025-11-27 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据识别骨关节炎相关基因并筛选潜在治疗药物 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,通过多算法整合分析鉴定OA关键基因,并利用斑马鱼模型验证药物作用机制 | 研究样本来源未明确说明,药物预测需进一步临床验证 | 发现骨关节炎治疗新靶点和潜在药物 | 骨关节炎相关基因和药物靶点 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | 随机森林, 高维加权基因共表达网络分析, 蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1793 | 2025-11-27 |
Non-invasive assessment of activated renal macrophages by imaging of colony-stimulating factor 1 receptor in mouse model with ischemic acute kidney injury
2025-Nov-25, Journal of inflammation (London, England)
DOI:10.1186/s12950-025-00482-6
PMID:41291764
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研究论文 | 本研究通过CSF1R-PET成像技术无创评估小鼠缺血性急性肾损伤模型中活化的肾脏巨噬细胞 | 首次证明11C-CPPC-PET可作为临床可用工具无创检测活化的肾脏巨噬细胞,主要针对M2表型 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 开发无创评估肾脏炎症的方法 | 小鼠缺血性急性肾损伤模型和肾脏/肾周脓肿模型 | 医学影像 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,PET成像,体外放射自显影,免疫组织化学分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,组织学数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,PET成像 | NA | NA |
| 1794 | 2025-11-27 |
Cigarette smoke-mediated YTHDC2 suppression drives macrophage senescence and a tumor-promoting microenvironment in lung cancer
2025-Nov-25, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.70068
PMID:41292214
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研究论文 | 本研究揭示了香烟烟雾通过抑制YTHDC2表达诱导巨噬细胞衰老,从而促进肺癌肿瘤微环境形成的机制 | 首次发现YTHDC2在香烟烟雾诱导的巨噬细胞衰老和肿瘤促进微环境形成中的关键调控作用 | NA | 探究香烟烟雾对m6A阅读器YTHDC2的影响及其在肺癌免疫微环境重塑中的作用 | 肺癌组织、巨噬细胞、香烟烟雾暴露的肺癌模型 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 吸烟者与非吸烟者的肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1795 | 2025-11-27 |
CD8+ T cell depletion promotes human Tph/Tfh cell proliferation and Sjögren syndrome-like symptoms in PBMC-based humanized mice
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191700
PMID:41277554
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研究论文 | 本研究开发了一种通过CD8+ T细胞耗竭促进人Tph/Tfh和B细胞增殖的方法,并建立了干燥综合征样症状的人源化小鼠模型 | 首次发现CD8+ T细胞耗竭可促进人Tph/Tfh细胞在体增殖,并建立了可模拟干燥综合征症状的PBMC人源化小鼠模型 | 研究基于人源化小鼠模型,与真实人体环境存在差异 | 研究人Tph/Tfh细胞分化机制及干燥综合征发病机理 | 人外周血单个核细胞、人源化小鼠模型、Tph/Tfh细胞、B细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 多色流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人PBMC移植的免疫缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 1796 | 2025-11-27 |
Dicer is essential for proper maturation, composition, and function in the postnatal retina
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113794
PMID:41244583
|
研究论文 | 本研究探讨了Dicer/miRNAs在出生后视网膜发育中的关键作用 | 首次揭示了Dicer在出生后视网膜祖细胞/前体细胞中对视网膜成熟和功能的必要性 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 评估Dicer缺失对出生后视网膜发育和功能的影响 | 小鼠视网膜祖细胞/前体细胞和成年视网膜 | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,光学相干断层扫描,视网膜电图,组织学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据,图像数据,电生理数据 | 一周龄和成年小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1797 | 2025-11-27 |
Fibrinogen triggers perivascular fibroblast activation in a mouse model of cortical ischemic stroke
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113834
PMID:41280671
|
研究论文 | 本研究揭示了纤维蛋白原是皮质缺血性中风小鼠模型中血管周围成纤维细胞活化的关键触发因子 | 首次证明血液来源的纤维蛋白原通过β1整合素信号通路诱导血管周围成纤维细胞活化,并揭示其通过髓系细胞间接促进纤维化瘢痕形成的机制 | 研究仅限于小鼠光血栓形成模型,人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究缺血性中风后纤维化瘢痕形成的分子机制 | 小鼠皮质缺血性中风模型中的血管周围成纤维细胞 | 神经科学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序,遗传学方法,药理学干预 | NA | 基因表达数据,细胞行为观察数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1798 | 2025-11-27 |
Multi-cellular phenotypic dynamics during the progression of an immunocompetent breast cancer model
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113808
PMID:41280683
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫活性乳腺癌模型中肿瘤微环境的多细胞表型动态变化 | 首次在小鼠乳腺癌同种移植模型中系统描绘肿瘤微环境的多细胞表型时间动态模式 | 使用小鼠模型而非人类样本,可能无法完全反映人类乳腺癌的复杂性 | 揭示乳腺癌肿瘤微环境中细胞组成和表型的时间动态变化规律 | 小鼠乳腺癌同种移植模型中的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 不同时间点的小鼠乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1799 | 2025-11-27 |
Innovative insights and future research directions in gastric cancer through single-cell RNA sequencing
2025-Nov-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i11.103808
PMID:41281499
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综述 | 本文通过单细胞RNA测序分析胃癌,解读研究发现并提出未来研究方向 | 提出整合多组学方法、空间转录组学、人工智能临床应用和新型免疫治疗策略等创新研究方向 | NA | 改善胃癌治疗结果,推动个性化医疗和早期检测 | 胃癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1800 | 2025-11-27 |
S3R: Modeling spatially varying associations with Spatially Smooth Sparse Regression
2025-Nov-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.06.674629
PMID:40964272
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研究论文 | 提出一种名为S3R的空间平滑稀疏回归框架,用于建模空间转录组数据中分子和细胞特征之间的空间变化关联 | 结合结构化稀疏性和最小生成树引导的平滑惩罚,能够在邻域内保持系数连贯性同时允许锐利边界 | NA | 开发能够处理空间转录组数据中噪声、共线性、细胞混合和高维预测因子的统计模型 | 空间转录组数据中的分子和细胞特征关联 | 空间转录组学 | 乳腺癌,胰腺导管腺癌,皮肤感染,神经退行性疾病 | 空间转录组学 | 稀疏回归 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Xenium | Visium空间转录组平台, Xenium原位分析平台 |