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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2026-05-01 |
The 2026 Nucleic Acids Research database issue and the online molecular biology database collection
2026-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1427
PMID:41431842
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评论 | 介绍2026年《核酸研究》数据库专刊内容及在线分子生物学数据库合集更新 | 专刊包含首个突破性论文JoGo,覆盖层级命名和背景化的人类单倍型,以及So3D提供真正三维空间转录组学数据 | 未提及具体研究局限性 | 总结和推广分子生物学数据库领域的新资源和更新 | 核酸、蛋白质结构、结构域和家族、酶、蛋白质组、人类单倍型、空间转录组学数据 | 机器学习 | NA | 三维空间转录组学 | NA | 数据库 | NA | NA | 三维空间转录组学 | NA | NA |
| 1782 | 2026-05-01 |
Single cell RNA-sequencing reveals an association between testosterone treatment and reduced hormone signaling in the human mammary gland
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697241
PMID:41509433
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示睾酮治疗与人类乳腺激素信号减少之间的关联 | 首次利用单细胞RNA测序比较接受睾酮替代疗法的跨性别男性与顺性别女性的乳腺组织,发现睾酮治疗显著降低雌激素信号通路基因表达,提出睾酮可能通过抑制雌激素信号发挥保护作用 | 研究样本量有限,未深入探讨睾酮治疗对乳腺长期安全性及癌症风险的具体机制 | 探究睾酮替代疗法对人类乳腺生物学的影响及其对激素信号通路的调控 | 接受睾酮替代疗法的跨性别男性和顺性别女性的乳腺组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人口统计学匹配队列的顺性别女性和接受TRT的跨性别男性乳腺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 1783 | 2026-05-01 |
Reduced Intestinal GLP-1+ Cell Numbers Are Associated With an Inflammation-related Epithelial Metabolic Signature
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101656
PMID:41047099
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研究论文 | 该研究探讨了肠道炎症中GLP-1+细胞数量减少与上皮代谢特征改变的关系 | 首次揭示GLP-1+细胞减少是肠道炎症的普遍特征,并发现其与上皮细胞代谢重编程相关,而非仅因功能受损 | 尚未明确GLP-1+细胞减少的具体分子机制及因果关系;人类数据仅来自Crohn病患者,未涵盖其他IBD亚型 | 探究肠内分泌细胞特别是GLP-1+细胞在肠道炎症中的作用机制 | 肠内分泌细胞(EECs)中的L细胞及GLP-1+细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织切片 | 4种小鼠炎症模型、IL-10缺乏小鼠、ClpPΔIEC小鼠、人类Crohn病患者黏膜活检、人类及小鼠肠道类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台(具体产品未在摘要中明确) |
| 1784 | 2026-05-01 |
Integrative single-cell and bulk RNA sequencing unravels the role of ACTN1 in promoting lung cancer with brain metastasis and epidermal growth factor receptor-tyrosine kinase inhibitor resistance
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1738641
PMID:42058147
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研究论文 | 整合单细胞和批量RNA测序揭示ACTN1在促进肺癌脑转移及EGFR-TKI耐药中的作用 | 首次通过整合scRNA-seq和批量RNA测序构建肺癌脑转移微环境图谱,并识别出ACTN1+上皮细胞亚群与EGFR-TKI耐药和脑转移的关联 | 基于公开数据集,可能未完全涵盖所有患者异质性;体外实验需进一步在体内模型中验证 | 探讨ACTN1在肺癌脑转移和EGFR-TKI耐药中的功能及机制 | 肺癌脑转移病灶中的肿瘤微环境细胞及EGFR-TKI耐药的肺癌细胞系 | 数字病理学,机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,高维加权基因共表达网络分析,机器学习 | NA | 基因表达数据 | 整合公开的scRNA-seq数据集及细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1785 | 2026-05-01 |
LGMN+ macrophage promotes the formation of a tumor-supportive microenvironment in gastric cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1810794
PMID:42058204
|
研究论文 | 发现LGMN+巨噬细胞通过促进血管生成和建立免疫抑制微环境驱动胃癌进展 | 通过单细胞RNA测序揭示LGMN+巨噬细胞在胃癌中的富集及其与不良预后的关联,并利用巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠证实其促癌机制 | NA | 评估LGMN+巨噬细胞对胃癌进展的影响并阐明其潜在机制 | 胃癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 公共数据库中的胃癌样本及巨噬细胞特异性LGMN条件性敲除小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 1786 | 2026-05-01 |
The AhR-TLR4 axis in non-IgE-mediated Cow's milk allergy: a systematic review with integrated multi-omics corroboration
2026, Frontiers in allergy
IF:3.3Q2
DOI:10.3389/falgy.2026.1789143
PMID:42058623
|
系统综述 | 系统综述结合多组学验证,探究非IgE介导的牛奶蛋白过敏中AhR-TLR4轴的作用及相关生物标志物和治疗策略 | 首次通过系统综述与单细胞RNA测序数据的整合分析,阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中由肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并验证B/E比值作为早期风险分层标志物的潜力 | 纳入研究的异质性可能影响结论的普适性,单细胞RNA测序数据来源为公开数据集且样本量有限 | 阐明非IgE介导的牛奶蛋白过敏中肠道菌群失调驱动的AhR-TLR4致病轴,并评估相关预测性生物标志物和潜在治疗方法 | 0-3岁经医生确诊的非IgE介导的牛奶蛋白过敏婴儿 | 机器学习和生物信息学 | 牛奶蛋白过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | 39项研究汇总,单细胞RNA测序整合分析基于公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1787 | 2026-05-01 |
Molecular mechanisms underlying psoriasis and depression: an integrated analysis using mendelian randomization, transcriptomics, and single-cell sequencing
2026, Frontiers in molecular medicine
DOI:10.3389/fmmed.2026.1770665
PMID:42058679
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学和单细胞测序的整合分析,探究银屑病与抑郁症共病的分子机制 | 首次整合孟德尔随机化、转录组学和单细胞组学三种方法,系统揭示银屑病与抑郁症共病的共享基因和通路 | 主要基于公开数据库分析,缺乏独立临床样本验证;孟德尔随机化结果需进一步实验验证 | 探究银屑病与抑郁症共病的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | 银屑病和抑郁症患者 | 数字病理学 | 银屑病, 抑郁症 | 孟德尔随机化, 转录组学, 单细胞测序 | LASSO回归模型 | eQTL数据, 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1788 | 2026-05-01 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01139-5
PMID:41460424
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组测序分析揭示高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 | 首次通过单细胞和空间转录组测序联合分析,鉴定出高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个具有免疫抑制表型、与不良预后相关的独特肿瘤细胞亚群 | NA | 识别高级别IDH突变型星形细胞瘤中独特的肿瘤细胞亚群及其特征 | 高级别(WHO 3-4级)和低级别(WHO 2级)IDH突变型星形细胞瘤样本 | 数字病理学 | 星形细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 1789 | 2026-05-01 |
Dermatomyositis is characterized by JAK1-mediated monocyte-driven vasculopathy and inflammation
2025-Dec-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea9007
PMID:41442501
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析皮肌炎中JAK1介导的单核细胞驱动血管病变和炎症机制 | 首次通过跨疾病比较(皮肌炎与红斑狼疮)揭示皮肌炎特异性单核细胞与内皮细胞互作导致的血管病变,并发现JAK1抑制可逆转相关表型 | 样本量有限且主要聚焦皮肤组织,对肌肉病变机制未深入探讨 | 阐明皮肌炎免疫发病机制,尤其是血管病变和炎症的分子基础 | 皮肌炎患者的非病灶皮肤、病灶皮肤及外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯网络分析 | 基因表达数据 | 皮肌炎、红斑狼疮患者及健康对照的皮肤和外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1790 | 2026-05-01 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了Igf2调控早期出生后DPP4+前脂肪细胞池扩展的机制 | 首次发现Igf2在早期生命阶段通过促进DPP4+前脂肪细胞增殖而非分化来驱动脂肪组织扩展 | 未提供具体局限性信息 | 阐明早期生命阶段促进脂肪组织快速扩展的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的DPP4+前脂肪细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢健康肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下脂肪组织样本(断奶前和成年小鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 1791 | 2026-05-01 |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by promoting senescence in alveolar type 2 cells
2025-12, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00361-3
PMID:41023452
|
研究论文 | 本文探讨αCGRP(Calca)缺乏如何通过促进肺泡2型细胞衰老加剧肺纤维化 | 首次揭示αCGRP缺乏通过促进AT2细胞炎症性衰老加剧肺纤维化的机制,并采用单细胞RNA测序和标记自由蛋白质组学等多组学方法分析 | 未明确说明研究的局限性 | 探究αCGRP缺乏是否通过促进AT2细胞衰老加剧肺纤维化 | 肺纤维化患者样本及Calca基因敲除大鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 标记自由蛋白质组学, 免疫组化 | NA | 组织切片, RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 15名肺纤维化患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1792 | 2026-05-01 |
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01116-y
PMID:41171370
|
研究论文 | 发现幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞通过miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原通路促进胃癌增殖 | 首次揭示幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞中TLR/miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原信号通路在幽门螺杆菌阳性胃癌中的关键作用,并验证miR-148a-5p agomir作为化疗增敏剂的潜力 | 缺乏关于幽门螺杆菌对癌症相关成纤维细胞影响或治疗干预靶点的研究 | 研究幽门螺杆菌阳性胃癌中癌症相关成纤维细胞促进肿瘤增殖的机制及潜在治疗靶点 | 幽门螺杆菌阳性胃癌患者及小鼠模型 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序,转录组测序,微RNA测序 | NA | 测序数据,细胞系,小鼠模型 | 公开微RNA和转录组测序数据,单细胞测序数据,以及体外和体内模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1793 | 2026-05-01 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学揭示Merkel细胞癌中表皮与真皮肿瘤细胞的基因表达差异,强调微环境对肿瘤细胞表型可塑性的影响 | 首次通过高分辨率空间转录组学比较Merkel细胞癌中表皮亲嗜性肿瘤细胞与真皮肿瘤细胞的转录组特征,发现微环境可诱导肿瘤细胞向角质细胞分化 | 未提及具体局限性 | 研究微环境对Merkel细胞癌细胞表型可塑性的调节作用 | Merkel细胞癌的表皮亲嗜性肿瘤细胞、肿瘤核心及血管旁肿瘤细胞 | 数字病理学 | Merkel细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 高分辨率空间转录组学平台及单细胞转录组学平台 |
| 1794 | 2026-05-01 |
Transcriptomic Analysis of Skeletal Muscle Systems Comparing Bovines, Humans, and Mice Using scRNA-Seq
2025-12, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70035
PMID:41335100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对牛、人类和小鼠的骨骼肌系统进行转录组分析,构建了从产前到产后发育的完整单细胞图谱并比较了跨物种的转录组特征 | 首次构建了牛骨骼肌发育的完整单细胞景观,并系统比较了牛、人类和小鼠三物种在细胞类型、基因表达和调控元件上的进化保守性与物种特异性差异 | 部分细胞谱系的功能和发育程序仍不明确,研究仅基于单细胞转录组数据,缺乏对非编码调控元件或表观遗传修饰的深入分析 | 揭示哺乳动物骨骼肌发育过程中保守和分化的分子机制 | 牛、人类和小鼠的骨骼肌组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 包含牛产前到产后发育阶段的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1795 | 2025-12-12 |
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01108-y
PMID:41129052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1796 | 2026-05-01 |
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00591-6
PMID:41062857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对培养的原代白色和棕色前脂肪细胞进行分析,发现两者共享一种共同的纤维脂肪祖细胞亚群 | 首次在棕色脂肪组织中发现纤维脂肪祖细胞样细胞,并揭示白色和棕色脂肪组织祖细胞亚群存在保守性特征 | 研究主要基于体外培养系统,体内验证需进一步扩展;未深入探讨FAPL在病理条件下的功能差异 | 探究体外培养条件对白色和棕色脂肪组织祖细胞异质性的影响及其生理相关性 | 原代白色和棕色前脂肪细胞 | 机器学习和单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1797 | 2026-05-01 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis identifies B-cell subpopulations and associated cancer subtypes with distinct clinical and molecular characteristics
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01082-5
PMID:40526246
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析,识别B细胞亚群及相关癌症亚型,揭示其不同的临床和分子特征 | 首次在泛癌层面系统识别八个B细胞亚群,并基于特异性基因签名构建预测癌症预后和免疫治疗反应的模型 | NA | 识别B细胞亚群特异性标志物在泛癌中的临床相关性,并构建预测癌症预后和免疫治疗反应的模型 | B细胞亚群、癌症患者样本(15种癌症类型) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | 无监督聚类模型 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据 | 424名患者,102,504个细胞,涵盖15种癌症类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1798 | 2026-05-01 |
Fibroblast-derived PI16 enhances tumor immune-suppressive microenvironment via inducing Tregs differentiation
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01090-5
PMID:40694273
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研究论文 | 研究了成纤维细胞来源的PI16通过诱导Treg分化增强食管鳞癌肿瘤免疫抑制微环境的作用机制 | 首次揭示PI16+成纤维细胞通过DOCK2依赖性机制促进Treg分化,并提出PI16+成纤维细胞作为克服肿瘤免疫抑制的新型治疗靶点 | 未明确提及研究局限性 | 探讨成纤维细胞来源的PI16在食管鳞癌肿瘤微环境中对免疫抑制的调控作用 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境中的成纤维细胞和调节性T细胞 | 机器学习和单细胞测序分析 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫共沉淀、质谱分析、多重荧光免疫组化 | NA | scRNA-seq数据(GSE203115) | 公共scRNA-seq数据集及体外/体内实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1799 | 2026-05-01 |
A multi-omics approach reveals dysregulated TNF-related signaling pathways in circulating NK and T cell subsets of young children with autism
2025-10, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00349-z
PMID:40739030
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研究论文 | 采用多组学方法揭示幼儿自闭症谱系障碍循环NK和T细胞亚群中TNF相关信号通路失调 | 首次结合转录组、蛋白质组和单细胞RNA-seq多模态方法,在2-4岁阿拉伯自闭症儿童队列中系统分析免疫失调机制,发现JAK3、CUL2和CARD11基因与症状严重度负相关,并揭示TRAIL、RANKL和TWEAK信号通路在特定免疫细胞亚群中的失调 | 样本量有限且仅针对阿拉伯儿童,未包含其他族群;单细胞RNA-seq分析未深入探讨细胞亚群功能状态;缺乏纵向数据评估免疫变化的动态过程 | 探究幼儿自闭症谱系障碍中外周免疫失调的分子机制 | 2-4岁阿拉伯自闭症儿童及其匹配对照人群 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | NGS, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, 靶向转录组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞转录组数据 | 卡塔尔2-4岁阿拉伯自闭症儿童队列及匹配对照(具体数量未在摘要中说明) | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 蛋白质组学 | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | NA |
| 1800 | 2026-05-01 |
Molecular stratification of prostate cancer through sensory perception-related multi-omics analysis reveals chemoresistant mechanisms
2025-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01099-w
PMID:40828231
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研究论文 | 通过感官知觉相关多组学分析揭示前列腺癌分子分型及化疗耐药机制 | 首次将感官知觉相关mRNA和lncRNA整合进行多组学分析,识别出三个与化疗耐药和免疫微环境重塑相关的前列腺癌分子亚型,并发现TNF-CCL20轴是免疫抑制信号和耐药性的核心介质 | 未提及具体局限性 | 探究感官知觉通路在前列腺癌进展中的作用,揭示化疗耐药机制 | 前列腺癌患者组织样本和血清样本 | 机器学习 | 前列腺癌 | 多组学分析、scRNA-seq、TIDE、ESTIMATE、NicheNet | 共识聚类、单细胞轨迹分析 | 基因表达数据(mRNA和lncRNA)、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |