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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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1781 | 2025-10-05 |
S100A12 correlates with inflammatory and pain symptoms in patients with Chronic Prostatitis/Chronic Pelvic Pain Syndrome
2025-Sep-04, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2025.105536
PMID:40914239
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研究论文 | 本研究探讨了S100A12作为慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征炎症和疼痛相关生物标志物的潜力 | 首次发现S100A12在CP/CPPS患者精浆和血清中显著升高,并与炎症标志物和疼痛评分相关,揭示了其作为诊断生物标志物的优越性能 | 回顾性病例对照研究设计,样本量相对有限(90例患者),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 研究S100A12在慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征中作为炎症和疼痛生物标志物的作用 | 90名慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征患者和90名年龄匹配的健康对照 | 生物医学研究 | 慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征 | 单细胞RNA测序,受试者工作特征分析,生物标志物检测 | NA | 临床样本数据(精浆、血清、尿液),基因表达数据 | 90名患者和90名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1782 | 2025-10-05 |
Residual disease in NPM1-mutated acute myeloid leukemia
2025-Sep-03, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2025.120586
PMID:40912477
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综述 | 本文综述了NPM1突变急性髓系白血病中微小残留病的监测技术及其临床应用 | 系统评估了qPCR、NGS、ddPCR等传统技术与CRISPR-Cas9、单细胞测序、人工智能等新兴技术在MRD监测中的整合应用 | 人工智能工具在临床实践中的整合有限,受限于数据质量、算法偏见、基础设施和监管框架等问题 | 评估NPM1突变急性髓系白血病中微小残留病监测技术的发展现状与临床挑战 | NPM1突变急性髓系白血病患者 | 自然语言处理 | 急性髓系白血病 | 定量PCR、下一代测序、微滴数字PCR、CRISPR-Cas9、单细胞测序 | 人工智能、机器学习 | 分子生物学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1783 | 2025-10-05 |
Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma
2025-Sep-02, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114193
PMID:40907793
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研究论文 | 本研究开发了一种基于聚合物的化学免疫疗法,通过联合诱导免疫原性细胞死亡和PD-L1阻断来增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫 | 首次将可诱导免疫原性细胞死亡的HPMA共聚物-表柔比星偶联物与多价HPMA共聚物-PD-L1肽拮抗剂相结合,创建了更安全的免疫治疗策略 | 研究主要基于B16F10黑色素瘤模型,尚未在更多肿瘤类型中验证 | 开发更安全有效的黑色素瘤免疫治疗方法 | 黑色素瘤小鼠模型和免疫细胞 | 免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,免疫细胞耗竭实验 | NA | 基因表达数据,免疫表型数据 | 黑色素瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1784 | 2025-10-05 |
Interferon Epsilon Loss Is Elusive 9p21 Link to Immune-Cold Tumors, Resistant to Immune Checkpoint Therapy, and Endogenous CXCL9/10 Induction
2025-Sep, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2024.12.020
PMID:39725169
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素ε(IFNϵ)缺失是9p21染色体区域与免疫冷肿瘤、免疫检查点治疗抵抗及内源性CXCL9/10诱导缺陷的关键分子联系 | 首次确定IFNϵ是9p21区域介导免疫逃避的主要干扰素信号,阐明了9p缺失通过IFNϵ-CXCL9/10轴导致免疫冷肿瘤的机制 | 研究结果在34种肿瘤类型中表现出显著的组织特异性(Z≤1.95 in 4/34),部分肿瘤类型中IFNE丢失与肿瘤免疫微环境模式关联较弱 | 探究9p染色体缺失导致免疫检查点治疗抵抗的分子机制 | 人类肿瘤样本、细胞系及小鼠模型,涵盖头颈鳞癌、非鳞状非小细胞肺癌、黑色素瘤、尿路上皮癌和间皮瘤 | 肿瘤免疫学 | 多种癌症 | 空间单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数分析、中介分析 | 小鼠基因工程模型(ΔS vs ΔL) | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | 13份报告中的36个免疫检查点治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1785 | 2025-10-05 |
Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma
2025-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006
PMID:39993622
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研究论文 | 通过多区域肺腺癌活检样本的空间转录组学和单细胞RNA测序分析,揭示肿瘤内异质性的空间和细胞结构 | 首次系统描绘肺腺癌不同区域(核心、边缘、正常区域)中癌细胞亚群的空间分布特征及其与免疫细胞的共定位关系 | 研究样本数量有限,仅基于活检样本分析,未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌肿瘤内异质性的空间结构和细胞组成 | 肺腺癌患者的多区域活检样本(肿瘤核心、肿瘤边缘、正常区域) | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多区域肺腺癌活检样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1786 | 2025-10-05 |
Dissecting key contributions of TH2 and TH17 cytokines to atopic dermatitis pathophysiology
2025-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.007
PMID:40409379
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研究论文 | 本研究通过细胞模型揭示TH2和IL-22细胞因子在特应性皮炎病理机制中的关键作用 | 首次系统比较TH2、TH17和TH22细胞因子对表皮表型的特异性影响,并发现TH2+IL-22组合最能模拟AD病理特征 | 研究基于体外细胞模型,可能与体内真实环境存在差异 | 解析特应性皮炎相关细胞因子如何驱动特异性表皮疾病标志 | 原代和永生化角质形成细胞来源的人表皮等效物 | 皮肤生物学 | 特应性皮炎 | 单细胞空间转录组学,转录组分析 | 细胞刺激模型 | 转录组数据,形态学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
1787 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Profiling of Penile Squamous Cell Carcinoma Reveals Dynamics of Tumor Differentiation and Immune Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500216
PMID:40470730
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示阴茎鳞状细胞癌的肿瘤分化动态和免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和高分辨率空间转录组学解析PSCC的发育轨迹和肿瘤微环境,发现独立于HPV感染状态的肿瘤分化模式及具有干细胞特征的Tum_1亚型 | 研究样本量有限,主要聚焦于PSCC,部分结论需要其他鳞状细胞癌类型的进一步验证 | 探究阴茎鳞状细胞癌的发育轨迹和肿瘤微环境特征 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1788 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TRPC6抑制介导的肾脏抗纤维化机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义了TRPC6抑制剂SH045处理的肾脏保护性细胞组成和细胞类型特异性转录程序,并发现新型内皮细胞亚群ECRIN | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 小鼠单侧输尿管梗阻模型、慢性缺血再灌注损伤模型及慢性肾脏病患者肾脏样本 | 单细胞组学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠疾病模型和慢性肾脏病患者肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1789 | 2025-10-05 |
NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501238
PMID:40539245
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研究论文 | 本研究揭示了NDRG1通过稳定LDHA促进乳酸积累,诱导免疫抑制微环境从而推动肺腺癌进展的机制 | 首次发现NDRG1通过抑制LDHA泛素化稳定其表达,促进乳酸积累和组蛋白H3K18乳酸化,驱动免疫抑制微环境形成 | 样本量相对有限,需要更多临床验证 | 探究NDRG1在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌患者样本和临床数据 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 临床数据分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 测序数据 | 30个LUAD样本(单细胞RNA测序),29,863例患者和55,586例对照(GWAS),220例LUAD患者(临床数据) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1790 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群,发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关,并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1791 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70835
PMID:40903834
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综述 | 本文总结了利用转录组学技术解析正常和病变主动脉瓣生物学机制的最新进展 | 整合最新转录组学发现,识别关键分子靶点并优先排序用于湿实验验证 | NA | 深入理解主动脉瓣疾病机制,为开发有效疗法提供依据 | 主动脉瓣在正常和病变状态下的生物学特征 | 转录组学 | 钙化性主动脉瓣疾病 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
1792 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境,并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限,机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
1793 | 2025-10-05 |
DISCO: A DIFFUSION MODEL FOR SPATIAL TRANSCRIPTOMICS DATA COMPLETION
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084277
PMID:40909878
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的空间转录组数据补全框架DISCO | 首次将扩散模型应用于空间转录组数据补全,结合图神经网络编码器和双重扩散模块 | 未明确说明模型在极端数据缺失情况下的性能限制 | 解决空间转录组数据中大规模缺失区域的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 扩散模型, 图神经网络 | 扩散模型, GNN | 空间基因表达数据 | 多个测序平台、物种和数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1794 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics and Single Cell-RNASeq Reveals Cellular Heterogeneity of SARS-CoV-2 in Lung Tissues and Global Mutational Patterns in COVID-19 Patients
2025-Sep, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70586
PMID:40910395
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性及全球突变模式 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,在空间维度上定位SARS-CoV-2病毒基因表达热点区域,并关联免疫细胞浸润模式 | 研究样本来源地域有限,突变分析主要基于GISAID数据库的公开数据 | 解析COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性特征和病毒突变模式 | COVID-19患者的肺组织样本和GISAID数据库中的SARS-CoV-2序列数据 | 空间转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, Pseudotime分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组序列数据 | 未明确样本数量,包含轻度和重度COVID-19患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
1795 | 2025-10-05 |
Identification of Core gene expression alterations regulated by gut microbiota in tumor progression and immunotherapy resistance through integrative pan-cancer analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146911
PMID:40819753
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研究论文 | 通过整合性泛癌分析识别肠道微生物在肿瘤进展和免疫治疗耐药中调控的核心基因表达变化 | 开发了微生物相关特征评分方法,首次在33种癌症类型和29种正常组织中系统性量化肠道微生物驱动的转录改变 | 研究主要基于计算分析方法,实验验证相对有限 | 阐明肠道微生物在肝细胞癌进展中的具体作用机制及其下游靶点 | 33种癌症类型和29种正常组织,重点研究肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞分析,空间转录组学,机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 33种癌症类型和29种正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
1796 | 2025-10-05 |
Integrative spatial multi-omics identifies the TEK receptor tyrosine kinase as a central biomacromolecule of endothelial-immune interactions in glioblastoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146964
PMID:40834945
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析发现TEK受体酪氨酸激酶是胶质母细胞瘤中内皮-免疫相互作用的核心生物大分子 | 首次通过整合空间多组学方法系统揭示TEK在胶质母细胞瘤微环境中的核心作用,并发现其作为可药物化靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和计算模拟,需要进一步的体内实验验证 | 探索胶质母细胞瘤微环境中血管-免疫轴的关键调控分子 | 胶质母细胞瘤微环境中的内皮细胞、恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组关联研究,结构基药物筛选,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
1797 | 2025-10-05 |
stImage: a versatile framework for optimizing spatial transcriptomic analysis through customizable deep histology and location informed integration
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf429
PMID:40905789
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研究论文 | 开发了一个名为stImage的开源R包,用于优化空间转录组分析 | 首次在统一框架中完全整合基因表达、组织学特征和精确空间坐标,并提供54种整合策略 | NA | 优化空间转录组分析,提高生物学见解 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据、组织学图像、空间坐标 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
1798 | 2025-10-05 |
Steatohepatitis alters lymphocytes cytotoxicity and localization, accelerating colorectal liver metastases
2025-Aug-28, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101222
PMID:40882404
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研究论文 | 本研究探讨脂肪性肝炎如何通过改变淋巴细胞毒性和定位来加速结直肠癌肝转移 | 首次揭示MASH通过改变CD8+T细胞和NK细胞的定位与功能,而非单纯数量变化,来促进肝转移的新机制 | 研究基于小鼠模型,需要人类样本验证;未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 阐明MAFLD中代谢应激引起的肝脏免疫细胞变化及其对结直肠癌肝转移早期阶段的影响 | 小鼠模型中的肝脏免疫细胞和MC38癌细胞 | 免疫肿瘤学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序,RT-PCR,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
1799 | 2025-10-05 |
Nitrogen-Driven Orchestration of Lateral Root Development: Molecular Mechanisms and Systemic Integration
2025-Aug-21, Biology
DOI:10.3390/biology14081099
PMID:40906392
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综述 | 本文系统综述了氮素如何通过分子机制调控植物侧根发育过程及其系统整合 | 整合了单细胞转录组学和先进成像技术揭示的侧根对氮素响应的细胞异质性,强调了氮素作为主调节器通过分子枢纽同步营养感应与根形态发生的动态重编程机制 | 作为综述文章,主要整合现有研究而非提出新的实验证据 | 阐明氮素感知、信号传导及其与侧根发育途径整合的分子机制,旨在提高作物氮素利用效率 | 植物侧根发育过程,包括起始、原基形成、出现和伸长 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组学,先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
1800 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify lactylation-related gene signatures in lung ischemia-reperfusion injury after lung transplantation
2025-Aug-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115361
PMID:40914702
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别肺移植后缺血再灌注损伤中与乳酸化相关的基因特征 | 首次将乳酸化相关基因特征与肺移植缺血再灌注损伤关联,并通过多组学整合和机器学习方法识别诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据集,实验验证仅限于小鼠模型 | 识别肺移植后缺血再灌注损伤中乳酸化相关的关键调控基因 | 肺移植患者的转录组数据和小鼠肺缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 乳酸测定, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, RT-qPCR | LASSO, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞数据 | GSE145989和GSE18995数据集,小鼠肺IRI模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |