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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群，发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关，并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1782 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70835
PMID:40903834
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综述 | 本文总结了利用转录组学技术解析正常和病变主动脉瓣生物学机制的最新进展 | 整合最新转录组学发现，识别关键分子靶点并优先排序用于湿实验验证 | NA | 深入理解主动脉瓣疾病机制，为开发有效疗法提供依据 | 主动脉瓣在正常和病变状态下的生物学特征 | 转录组学 | 钙化性主动脉瓣疾病 | RNA测序，单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1783 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境，并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限，机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1784 | 2025-10-05 |
DISCO: A DIFFUSION MODEL FOR SPATIAL TRANSCRIPTOMICS DATA COMPLETION
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084277
PMID:40909878
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的空间转录组数据补全框架DISCO | 首次将扩散模型应用于空间转录组数据补全，结合图神经网络编码器和双重扩散模块 | 未明确说明模型在极端数据缺失情况下的性能限制 | 解决空间转录组数据中大规模缺失区域的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 扩散模型, 图神经网络 | 扩散模型, GNN | 空间基因表达数据 | 多个测序平台、物种和数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1785 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics and Single Cell-RNASeq Reveals Cellular Heterogeneity of SARS-CoV-2 in Lung Tissues and Global Mutational Patterns in COVID-19 Patients
2025-Sep, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70586
PMID:40910395
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性及全球突变模式 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在空间维度上定位SARS-CoV-2病毒基因表达热点区域，并关联免疫细胞浸润模式 | 研究样本来源地域有限，突变分析主要基于GISAID数据库的公开数据 | 解析COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性特征和病毒突变模式 | COVID-19患者的肺组织样本和GISAID数据库中的SARS-CoV-2序列数据 | 空间转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, Pseudotime分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组序列数据 | 未明确样本数量，包含轻度和重度COVID-19患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1786 | 2025-10-05 |
Identification of Core gene expression alterations regulated by gut microbiota in tumor progression and immunotherapy resistance through integrative pan-cancer analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146911
PMID:40819753
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研究论文 | 通过整合性泛癌分析识别肠道微生物在肿瘤进展和免疫治疗耐药中调控的核心基因表达变化 | 开发了微生物相关特征评分方法，首次在33种癌症类型和29种正常组织中系统性量化肠道微生物驱动的转录改变 | 研究主要基于计算分析方法，实验验证相对有限 | 阐明肠道微生物在肝细胞癌进展中的具体作用机制及其下游靶点 | 33种癌症类型和29种正常组织，重点研究肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞分析，空间转录组学，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 33种癌症类型和29种正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 1787 | 2025-10-05 |
Integrative spatial multi-omics identifies the TEK receptor tyrosine kinase as a central biomacromolecule of endothelial-immune interactions in glioblastoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146964
PMID:40834945
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析发现TEK受体酪氨酸激酶是胶质母细胞瘤中内皮-免疫相互作用的核心生物大分子 | 首次通过整合空间多组学方法系统揭示TEK在胶质母细胞瘤微环境中的核心作用，并发现其作为可药物化靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和计算模拟，需要进一步的体内实验验证 | 探索胶质母细胞瘤微环境中血管-免疫轴的关键调控分子 | 胶质母细胞瘤微环境中的内皮细胞、恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组关联研究,结构基药物筛选,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 1788 | 2025-10-05 |
stImage: a versatile framework for optimizing spatial transcriptomic analysis through customizable deep histology and location informed integration
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf429
PMID:40905789
|
研究论文 | 开发了一个名为stImage的开源R包，用于优化空间转录组分析 | 首次在统一框架中完全整合基因表达、组织学特征和精确空间坐标，并提供54种整合策略 | NA | 优化空间转录组分析，提高生物学见解 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据、组织学图像、空间坐标 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1789 | 2025-10-05 |
Steatohepatitis alters lymphocytes cytotoxicity and localization, accelerating colorectal liver metastases
2025-Aug-28, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101222
PMID:40882404
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研究论文 | 本研究探讨脂肪性肝炎如何通过改变淋巴细胞毒性和定位来加速结直肠癌肝转移 | 首次揭示MASH通过改变CD8+T细胞和NK细胞的定位与功能，而非单纯数量变化，来促进肝转移的新机制 | 研究基于小鼠模型，需要人类样本验证；未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 阐明MAFLD中代谢应激引起的肝脏免疫细胞变化及其对结直肠癌肝转移早期阶段的影响 | 小鼠模型中的肝脏免疫细胞和MC38癌细胞 | 免疫肿瘤学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1790 | 2025-10-05 |
Nitrogen-Driven Orchestration of Lateral Root Development: Molecular Mechanisms and Systemic Integration
2025-Aug-21, Biology
DOI:10.3390/biology14081099
PMID:40906392
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综述 | 本文系统综述了氮素如何通过分子机制调控植物侧根发育过程及其系统整合 | 整合了单细胞转录组学和先进成像技术揭示的侧根对氮素响应的细胞异质性，强调了氮素作为主调节器通过分子枢纽同步营养感应与根形态发生的动态重编程机制 | 作为综述文章，主要整合现有研究而非提出新的实验证据 | 阐明氮素感知、信号传导及其与侧根发育途径整合的分子机制，旨在提高作物氮素利用效率 | 植物侧根发育过程，包括起始、原基形成、出现和伸长 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组学，先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1791 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq to identify lactylation-related gene signatures in lung ischemia-reperfusion injury after lung transplantation
2025-Aug-19, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115361
PMID:40914702
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别肺移植后缺血再灌注损伤中与乳酸化相关的基因特征 | 首次将乳酸化相关基因特征与肺移植缺血再灌注损伤关联，并通过多组学整合和机器学习方法识别诊断生物标志物 | 研究主要基于公共数据集，实验验证仅限于小鼠模型 | 识别肺移植后缺血再灌注损伤中乳酸化相关的关键调控基因 | 肺移植患者的转录组数据和小鼠肺缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 乳酸测定, 蛋白质印迹, 免疫组织化学, 免疫荧光, RT-qPCR | LASSO, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞数据 | GSE145989和GSE18995数据集，小鼠肺IRI模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1792 | 2025-10-05 |
Novel Insights into T-Cell Exhaustion and Cancer Biomarkers in PDAC Using ScRNA-Seq
2025-Aug-07, Biology
DOI:10.3390/biology14081015
PMID:40906153
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌中T细胞耗竭和癌症生物标志物 | 鉴定出16个癌症和T细胞的新型标志物，揭示了PDAC中T细胞耗竭的新机制 | 需要进一步的临床研究来验证这些新型标志物作为PDAC患者潜在治疗靶点的有效性 | 研究胰腺导管腺癌中T细胞耗竭机制并识别相关生物标志物 | 人类PDAC数据集中的癌细胞和T细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, PPI分析, 生存分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自原发性肿瘤和邻近正常组织的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1793 | 2025-10-05 |
Mechanistic Study of NT5E in Reg3β-Induced Macrophage Polarization and Cooperation with Plasma Proteins in Myocarditis Injury and Repair
2025-Aug-07, Biology
DOI:10.3390/biology14081017
PMID:40906170
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研究论文 | 本研究探讨NT5E通过Reg3β调控巨噬细胞极化并与血浆蛋白协同影响心肌炎的机制 | 首次揭示NT5E在Reg3β诱导的巨噬细胞M2极化中的双重作用，并通过孟德尔随机化识别了81个与心肌炎因果相关的血浆蛋白 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，需要进一步的体内实验验证 | 探索NT5E调控巨噬细胞极化及与血浆蛋白协同作用在心肌炎发生发展中的分子机制 | 巨噬细胞极化、血浆蛋白、心肌炎发病机制 | 分子生物学与免疫学 | 心肌炎 | RNA测序, Western blotting, qPCR, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1794 | 2025-10-05 |
Tracking clonal dynamics of CD8 T cells and immune dysregulation in progression of systemic lupus erythematosus with nephritis
2025-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01504-2
PMID:40744996
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA和T细胞受体测序分析系统性红斑狼疮患者的免疫细胞动态变化 | 揭示了干扰素驱动机制与细胞毒性T细胞功能障碍在SLE发作中的关键联系，并发现效应CD8 T细胞克隆扩增是疾病恶化的主要驱动因素 | 样本量相对有限（6名SLE患者），需要更大规模研究验证 | 探究系统性红斑狼疮疾病进展中CD8 T细胞克隆动态和免疫失调机制 | 系统性红斑狼疮患者和健康捐赠者的外周血单个核细胞 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, TCR测序数据, 批量RNA测序数据 | 6名SLE患者（19个样本）和32名健康捐赠者，另验证数据集包括79名对照和62名SLE患者的批量数据，以及99名健康对照和162名SLE患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1795 | 2025-10-05 |
Transmembrane Serine Protease TMPRSS11B promotes an acidified tumor microenvironment and immune suppression in lung squamous cell carcinoma
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646727
PMID:40235980
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研究论文 | 本研究揭示了跨膜丝氨酸蛋白酶TMPRSS11B通过促进肿瘤微环境酸化和免疫抑制在肺鳞癌发展中的作用机制 | 首次发现TMPRSS11B在肺鳞癌中通过促进乳酸外排导致肿瘤微环境酸化，并诱导M2样巨噬细胞富集和免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究TMPRSS11B对肿瘤微环境和免疫系统的影响，寻找肺鳞癌治疗新靶点 | 肺鳞癌细胞、小鼠肿瘤模型、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | RNA FISH分析、空间转录组学、超pH敏感纳米颗粒成像、代谢物分析 | 同系小鼠肿瘤模型、SNL自发肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、代谢物数据、成像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1796 | 2025-10-05 |
Identification of sepsis biomarkers through glutamine metabolism-mediated immune regulation: a comprehensive analysis employing mendelian randomization, multi-omics integration, and machine learning
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1640425
PMID:40909263
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化、多组学分析和机器学习方法，识别与谷氨酰胺代谢介导的免疫调控相关的脓毒症生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和多种机器学习算法，系统揭示谷氨酰胺代谢通过HLA-DR+ NK细胞影响脓毒症风险的机制 | 研究样本量有限，主要依赖公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 识别脓毒症的早期诊断生物标志物并阐明其发病机制 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血单核细胞及相关的基因组和转录组数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习, RT-qPCR | CatBoost, XGBoost, NGBoost | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | 使用多个公共数据集(GSE167363, GSE236713, GSE28750)，包含1400种血浆代谢物、731种免疫细胞表型和脓毒症GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 1797 | 2025-10-05 |
Identification of cuproptosis-related genes in chronic apical periodontitis based on bulk and single-cell RNA sequencing analyses and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1559220
PMID:40909264
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析，识别了慢性根尖周炎中与铜死亡相关的关键基因，并进行了实验验证 | 首次将新发现的细胞死亡途径——铜死亡与慢性根尖周炎联系起来，结合bulk和单细胞测序技术进行综合分析 | 样本量相对较小（CAP和HC各3例用于单细胞分析），需要在更大样本中验证结果 | 探索铜死亡相关基因在慢性根尖周炎发病机制中的作用 | 慢性根尖周炎患者和健康对照者的牙周组织 | 生物信息学 | 慢性根尖周炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学染色 | ROC曲线分析, 细胞通讯分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 临床样本CAP组3例，健康对照组3例（单细胞测序）；GEO数据库数据集GSE237398和GSE223924 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1798 | 2025-10-05 |
Programmed cell death-driven remodeling of the melanoma microenvironment enables prognostic stratification and therapeutic prediction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612217
PMID:40909289
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序数据全面表征了黑色素瘤中程序性细胞死亡的特征及其与肿瘤异质性、预后和免疫治疗结局的关联 | 首次在黑色素瘤中系统评估程序性细胞死亡的异质性，开发了基于15个基因的预后特征模型，能够有效预测患者生存和免疫治疗反应 | 研究结果需要在前瞻性队列中进一步验证，机制研究尚不充分 | 全面表征程序性细胞死亡相关特征及其与黑色素瘤异质性、预后和免疫治疗结局的关联 | 黑色素瘤患者（皮肤和肢端亚型）的单细胞和批量RNA测序数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，机器学习 | LASSO, Ridge, XGBoost | 基因表达数据 | 多个黑色素瘤队列数据 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 1799 | 2025-10-05 |
Developing a prognostic model of glutamine metabolism-related genes associated with clinical features and immune status in melanoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1485006
PMID:40909968
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析构建了与黑色素瘤临床特征和免疫状态相关的谷氨酰胺代谢相关基因预后模型 | 首次系统识别谷氨酰胺代谢相关基因并构建黑色素瘤预后风险模型，揭示其与免疫细胞浸润和免疫检查点表达的关系 | 仅通过RT-PCR验证了部分基因表达，缺乏更深入的机制研究 | 开发基于谷氨酰胺代谢相关基因的黑色素瘤预后预测模型 | 黑色素瘤患者和A375细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | scRNA-seq, RT-PCR, 生物信息学分析 | Cox回归风险模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA-SKCM数据库的黑色素瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 使用R包Seurat进行scRNA-seq数据处理 |
| 1800 | 2025-10-05 |
Csf1+ AD-MSCs promote stroke repair by activating the resident microglia
2025, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.3389/ebm.2025.10611
PMID:40910104
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研究论文 | 本研究探讨了Csf1+脂肪来源间充质基质细胞通过激活驻留小胶质细胞促进脑出血修复的机制 | 首次发现Csf1+ AD-MSCs亚群通过抑制单核细胞浸润和激活驻留小胶质细胞促进脑组织修复 | 研究仅使用大鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究AD-MSCs促进脑出血修复的作用机制 | 脑出血大鼠模型和脂肪来源间充质基质细胞 | 单细胞转录组学 | 脑出血 | 单细胞转录组测序，组织病理学技术 | NA | 单细胞RNA测序数据，组织病理图像 | 脑出血大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |