单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37547 篇文献，本页显示第 1781 - 1800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1781 | 2026-02-27 |
scDBic: A novel deep learning-based biclustering algorithm for analyzing scRNA-seq data
2026-Feb-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag095
PMID:41746287
|
研究论文 | 提出了一种名为scDBic的新型深度学习双聚类算法，专门用于分析单细胞RNA测序数据，以改善细胞聚类性能并识别关键基因 | 结合深度自编码器与反向策略，首次将深度学习应用于scRNA-seq数据的双聚类，解决了传统方法在局部一致性、细胞丢失和高维数据适应性方面的不足 | 未在摘要中明确说明算法的具体局限性 | 开发一种能更有效分析单细胞RNA测序数据、发现细胞群并识别其关键基因的算法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1782 | 2026-02-27 |
Unraveling the Phylogenetic Signal of Gene Expression from Single-cell RNA-seq Data
2026-Feb-26, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag017
PMID:41746302
|
研究论文 | 本研究评估了从单细胞RNA测序数据中调用单核苷酸变异的六种策略，并分析了推断基因型和细胞系统发育的质量 | 首次系统比较了多种从scRNA-seq数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法，揭示了scAllele、Monopogen和Monovar在提供系统发育信息方面的优势 | 研究仅基于5名癌症患者的381个单细胞转录组，样本量有限，且基因表达的系统发育信号仅在部分患者中显著 | 评估从单细胞RNA测序数据推断单核苷酸变异和细胞系统发育的方法性能 | 5名癌症患者的381个单细胞转录组 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 381个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1783 | 2026-02-27 |
Multi-Scale Mapping of Gene Expression from Whole-slide Images for Identifying Phenotype-Associated Subpopulations
2026-Feb-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521151
PMID:41736695
|
研究论文 | 本研究提出了一个名为BiSCALE的深度学习框架，能够从全切片图像中预测组织和近细胞水平的基因表达，并将其与临床表型关联 | 开发了首个能够同时预测组织（批量）和近细胞（点）水平基因表达的多尺度深度学习框架，并引入了Vision-Mamba融合模块和两阶段训练策略来桥接不同尺度数据间的差异 | 研究仅在三种癌症类型上进行了训练和验证，模型的普适性在其他癌症类型中尚未得到充分验证 | 从常规病理全切片图像中进行多尺度基因分析和表型相关特征发现，以识别与表型相关的细胞亚群 | 肿瘤样本和空间转录组学数据点 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学，深度学习 | Vision-Mamba融合模块，WSI基础编码器 | 图像（全切片图像），基因表达数据 | 2109个批量肿瘤样本和141,000个空间转录组学数据点 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1784 | 2026-02-27 |
Intra-tumoral tertiary lymphoid structures characterized by a B cell-related signature elicit antitumor effect through HAPLN3 in hepatocellular carcinoma
2026-Feb-25, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0758
PMID:41739581
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的B细胞相关特征及其通过HAPLN3介导的抗肿瘤效应 | 首次在肝细胞癌中系统阐明了三级淋巴结构的细胞特征、驱动机制及其与免疫治疗反应的关系，并鉴定出HAPLN3作为关键的B细胞激活因子 | 研究队列主要基于回顾性样本，需要前瞻性临床研究验证HAPLN3的治疗潜力 | 探究肝细胞癌中肿瘤内三级淋巴结构的细胞特征、形成机制及其对预后的影响 | 339名肝细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 全外显子组测序, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 339名肝细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1785 | 2026-02-27 |
A systems immunology approach reveals divergent immune profiles of RSV and SARS-CoV-2 infections in infants
2026-Feb-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea7097
PMID:41739901
|
研究论文 | 本研究采用系统免疫学方法，通过细胞因子分析、单细胞转录组学和表观基因组学，揭示了婴儿感染RSV和SARS-CoV-2后免疫反应的显著差异 | 首次在婴儿群体中系统比较了RSV和SARS-CoV-2感染的免疫特征，揭示了疾病特异性的细胞类型特征和表观遗传变化 | 样本量相对较小（RSV感染19例，SARS-CoV-2感染30例，健康对照17例），且仅分析了血液样本，未涉及呼吸道局部免疫反应 | 揭示RSV和SARS-CoV-2感染在婴儿中临床差异的免疫机制 | 婴儿（中位年龄2.3个月）的血液样本，包括RSV感染、SARS-CoV-2感染和健康对照组 | 系统免疫学 | 呼吸道感染 | 细胞因子分析，单细胞转录组学，表观基因组学 | NA | 血液样本的分子和细胞数据 | RSV感染婴儿19例，SARS-CoV-2感染婴儿30例，健康对照婴儿17例 | NA | 单细胞转录组学，表观基因组学 | NA | NA |
| 1786 | 2026-02-27 |
Comparing the impact of sample multiplexing approaches for single-cell RNA-sequencing on downstream analysis using cerebellar organoids
2026-Feb-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114780
PMID:41743667
|
研究论文 | 本研究比较了Parse Biosciences组合条形码和10x Genomics CellPlex两种单细胞RNA测序多重化技术在分析小脑类器官时的表现 | 首次系统比较了两种商业单细胞RNA测序多重化技术在小脑类器官这一复杂组织模型中的应用效果 | 研究仅针对小脑类器官模型，未涵盖其他组织类型；样本规模可能有限 | 评估不同单细胞RNA测序多重化技术对下游分析的影响 | 小脑类器官 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定，但涉及小脑类器官样本 | Parse Biosciences, 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | Parse Biosciences组合条形码, 10x Genomics CellPlex | Parse Biosciences组合条形码技术，10x Genomics CellPlex微流控捕获技术 |
| 1787 | 2026-02-27 |
Single cell transcriptomic atlas reveals macrophage polarization dynamics and intercellular communication networks in gingival tissue of periodontitis patients undergoing orthodontic treatment
2026-Feb-19, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100402
PMID:41722860
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的极化动态和细胞间通讯网络 | 首次在牙周炎合并正畸治疗的临床背景下，系统描绘了巨噬细胞的异质性、极化轨迹及其作为细胞通讯枢纽的功能 | 研究样本量有限，且为横断面设计，未能动态追踪治疗过程中的变化 | 探究牙周炎患者正畸治疗期间牙龈组织中巨噬细胞的亚型、极化动态及细胞间相互作用 | 接受正畸治疗的牙周炎患者的牙龈组织样本 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 降维分析、伪时间轨迹分析、RNA速率分析、细胞通讯推断 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，仅提及来自患者的牙龈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1788 | 2026-02-27 |
Ion channel gene signature for diagnosis and antifibrotic therapy in liver fibrosis
2026-Feb-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07856-1
PMID:41699670
|
研究论文 | 本研究通过整合多组转录组数据集，识别了肝纤维化中差异表达的人类离子通道基因，并确定了AQP1、GJA1和KCNN2作为关键基因，具有诊断和治疗潜力 | 首次系统性地分析了人类离子通道基因在肝纤维化中的表达谱，结合单细胞RNA测序和分子对接模拟，识别了与纤维化进展和免疫重塑相关的关键基因及潜在治疗药物 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的体内功能验证，且候选药物的疗效需进一步实验确认 | 旨在分析人类离子通道基因在肝纤维化中的表达特征，并识别具有诊断和治疗相关性的关键基因 | 肝纤维化患者样本、胆管结扎小鼠模型以及相关的转录组数据集 | 生物信息学 | 肝纤维化 | 转录组分析、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、免疫组化、分子对接模拟 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多个转录组数据集、人类肝硬化组织样本、胆管结扎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1789 | 2026-02-27 |
Time-Dependent Effects of Rapid-Acting Antidepressants in iPSC-Derived Neurons from Treatment-Resistant Depression and Healthy Volunteers
2026-Feb-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8733841/v1
PMID:41743330
|
研究论文 | 本研究利用iPSC来源的神经元模型，评估了多种快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者中的时间依赖性分子效应 | 首次使用iPSC来源的神经元模型并行评估多种快速起效抗抑郁药物，揭示了药物间共享的下游效应和细胞类型特异性变化 | 模型可能无法完全模拟体内复杂环境，样本量未明确说明，且仅关注了短期药物效应 | 探究快速起效抗抑郁药物在治疗抵抗性抑郁症中的分子机制 | iPSC来源的成熟皮质样神经元，来自治疗抵抗性抑郁症患者和健康志愿者 | 神经科学 | 抑郁症 | iPSC分化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫细胞化学、CSF蛋白质组学 | iPSC来源的神经元模型 | 转录组数据、蛋白质数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1790 | 2026-02-27 |
Mosaic variants in KRAS and STAT5B associated with a mixed phenotype of 2 acquired errors of immunity
2026-Feb-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.01.018
PMID:41628732
|
研究论文 | 本文报道了一例罕见的获得性KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异病例，导致混合免疫缺陷表型 | 首次报道两种不同获得性免疫缺陷变异（KRAS和STAT5B功能获得性嵌合变异）共同导致混合临床表型 | 单病例研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 研究获得性嵌合变异在免疫疾病发病机制中的作用 | 一名18岁女性患者，患有炎症性肠病、脾肿大、血小板减少、支气管扩张、单核细胞增多和嗜酸性粒细胞增多 | NA | 免疫缺陷疾病 | 诊断面板测序、全基因组测序、靶向扩增子测序、短读长和长读长单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因组数据、RNA数据、蛋白质数据 | 纵向血液和组织样本（单病例） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1791 | 2026-02-27 |
Single-cell disentangled representations for perturbation modeling and treatment effect estimation
2026-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.689783
PMID:41394575
|
研究论文 | 本文开发了scDRP生成框架，利用解耦表示学习来分离扰动依赖和扰动独立的潜在变量，以估计单细胞扰动数据中的个体化治疗效果 | 提出scDRP框架，结合解耦表示学习和渐近正确性保证，通过稀疏正则化的β-VAE分离潜在变量，并基于分位数保持效应假设进行条件最优传输来推断反事实状态 | 未明确说明模型在特定扰动类型或细胞类型中的泛化能力限制，以及数据噪声对估计精度的影响 | 估计单细胞扰动数据中的个体化治疗效果，揭示细胞状态特异性基因调控变化 | 单细胞扰动数据，包括模拟和真实数据，涉及鼻病毒、香烟烟雾提取物暴露、干扰素刺激和CRISPR敲除等扰动 | 机器学习 | 慢性髓系白血病 | 单细胞测序 | β-VAE, 条件最优传输 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1792 | 2026-02-27 |
GM-CSF regulates ILC states and myeloid cell signaling during ulceration in Crohn's disease
2026-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.03.703526
PMID:41676475
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示了GM-CSF在克罗恩病溃疡区域调控髓系-淋巴系细胞互及肠道免疫稳态的关键作用 | 首次使用Xenium单细胞空间转录组技术解析克罗恩病中CSF因子的空间表达模式，并建立了csf2rb/斑马鱼肠道损伤模型验证GM-CSF的功能 | 研究主要聚焦于回肠组织，其他肠道部位的情况尚不明确；斑马鱼模型与人类疾病存在物种差异 | 阐明CSF因子在克罗恩病炎症过程中调控免疫细胞空间分布和功能的机制 | 克罗恩病患者回肠组织、csf2rb/基因缺陷斑马鱼 | 空间转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞空间转录组测序、斑马鱼模型、重组蛋白治疗 | csf2rb/斑马鱼肠道损伤模型 | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明患者样本数量，包含人类组织样本和斑马鱼模型 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | Xenium | Xenium单细胞空间转录组平台 |
| 1793 | 2026-02-27 |
transFusion: a novel comprehensive platform for integration analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag059
PMID:41645434
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为transFusion的新型综合平台，专门用于单细胞RNA测序和10× Visium空间转录组学数据的整合分析 | transFusion平台提供了12项关键功能，包括细胞间依赖性分析、配体-受体共表达识别与可视化以及空间多模态梯度变异模式分析，旨在克服现有平台在整合多模态数据和最大化空间信息利用方面的不足 | 平台主要针对10× Visium数据，可能不适用于其他空间转录组技术，且依赖于用户的计算资源 | 开发一个综合平台，以促进单细胞和空间转录组学数据的整合分析，帮助研究人员探索组织架构、细胞间通信和空间依赖性 | 单细胞RNA测序数据和10× Visium空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Visium | 10× Visium空间转录组技术 |
| 1794 | 2026-02-27 |
Leveraging the genetics of human face shape boosts the discovery of orofacial cleft risk loci
2026-Feb-03, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.01.30.26345139
PMID:41674607
|
研究论文 | 本研究利用人类面部形状的遗传学数据，通过一种多效性信息化的GWAS方法（cFDR-GWAS），增强了非综合征性唇裂伴或不伴腭裂（nsCL/P）风险基因座的发现能力 | 应用cFDR-GWAS方法结合正常面部形状和非综合征性唇裂的GWAS汇总统计，首次系统性地利用共享遗传基础来提升风险基因座的发现效率，识别出多个新基因座 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了结果在其他种族中的普适性；部分新基因座在独立队列中的复制效果有限 | 通过整合正常面部形状和非综合征性唇裂的遗传数据，提升对唇裂风险基因座的发现和优先排序能力 | 欧洲人群的正常面部形状数据和非综合征性唇裂患者数据 | 遗传学 | 唇裂 | GWAS, cFDR-GWAS, 空间转录组学 | 经验贝叶斯策略 | 遗传汇总统计数据 | 正常面部形状数据n=4,680和n=3,566，非综合征性唇裂数据n=3,969 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1795 | 2026-02-27 |
Efferocytosis deficiency exacerbates local inflammation and predicts recurrence in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Feb-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1016
PMID:41638263
|
研究论文 | 本研究全面表征了慢性鼻窦炎（CRS）中的胞葬作用，并探讨了其在鼻息肉型CRS（CRSwNP）中与炎症内型及临床预后的关联 | 首次在单细胞分辨率下解析CRS中的胞葬作用，并识别出一个5分子标志物组合（S1PR5, MerTK, MFGE8, CD300a, PPARδ）作为CRSwNP复发的预测工具 | 研究主要基于公共单细胞RNA测序数据重新分析，可能受限于原始数据集的样本量和覆盖范围 | 阐明胞葬作用在慢性鼻窦炎特别是鼻息肉型中的作用机制及其与炎症和临床结局的关系 | 慢性鼻窦炎患者（包括有和无鼻息肉亚型）的鼻息肉组织与健康对照的鼻黏膜组织 | 数字病理学 | 慢性鼻窦炎 | 定量实时PCR、免疫组化、单细胞RNA测序 | 回归模型、受试者工作特征分析 | 基因表达数据、组织图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及患者组织与健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1796 | 2026-02-27 |
Modifying Glucose Metabolism Reverses Memory Defects of Alzheimer's Disease Model at Late Stages
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202506695
PMID:41355756
|
研究论文 | 本研究报道了一种新型化合物SL能够逆转晚期阿尔茨海默病模型小鼠的记忆缺陷并减少Aβ斑块 | 首次发现SL通过调节葡萄糖代谢和ATP生成，在AD晚期阶段逆转记忆缺陷，并识别出Aging-AD-Rescue基因表达模式 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证；机制细节需进一步探索 | 探索通过调节葡萄糖代谢逆转阿尔茨海默病晚期记忆缺陷的治疗策略 | APP/PS1阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、免疫印迹、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1797 | 2026-02-27 |
Colorectal Cancer Cell's Weapon: RNF32 Engages SPP1+ Macrophages to Foster Liver Metastasis, Targeted by Indole-3-Acetic Acid
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519735
PMID:41387204
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现RNF32是结直肠癌肝转移的关键驱动基因，其通过稳定β-catenin激活Wnt通路并上调CCL2，进而招募SPP1+巨噬细胞重塑转移前微环境，并筛选出抑制剂IAA可靶向RNF32抑制转移 | 首次揭示RNF32通过催化GSK3β的K48连接泛素化稳定β-catenin的双重功能机制，并发现其通过CCL2-CCR2/FABP1/PPARG轴招募SPP1+巨噬细胞形成促转移微环境，同时通过虚拟筛选鉴定出新型RNF32抑制剂IAA | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证相对有限；IAA的体内药效和毒性需进一步评估；SPP1+巨噬细胞与肿瘤细胞CD44互作的具体分子机制有待深入解析 | 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞、肝转移微环境中的巨噬细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、虚拟筛选、Cox回归、WGCNA | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质互作数据 | TCGA数据库样本及实验模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1798 | 2026-02-27 |
MR-DELTAnet: A Longitudinal MRI-Transformer Model Predicting Pathological Complete Response and Revealing Immune Microenvironment via scRNA-seq in Locally Advanced Rectal Cancer
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517721
PMID:41417633
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于纵向MRI的Transformer模型MR-DELTAnet，用于预测局部晚期直肠癌患者对新辅助放化疗的病理完全缓解，并通过单细胞RNA测序揭示免疫微环境特征 | 首次结合纵向MRI数据和Transformer架构，集成Delta-Efficient Latent-Temporal Attention机制，预测病理完全缓解并关联单细胞RNA测序揭示免疫微环境差异 | 研究为回顾性多中心设计，可能存在选择偏倚；外部验证样本量相对较小（n=181），需前瞻性研究进一步验证 | 开发非侵入性工具，准确评估局部晚期直肠癌对新辅助放化疗的肿瘤反应，以指导个性化治疗策略 | 局部晚期直肠癌患者 | 计算机视觉 | 直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Transformer | MRI图像 | 1026名局部晚期直肠癌患者（训练集633例，内部验证集212例，外部验证集181例），另加26例单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1799 | 2026-02-27 |
METTL5 Enables Immune Evasion of Liver Cancer via Chemokine mRNA Translation Regulation
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512528
PMID:41431992
|
研究论文 | 本研究揭示了METTL5通过调控趋化因子CXCL16的mRNA翻译，介导18S rRNA的mA修饰，从而促进肝内胆管癌的免疫逃逸 | 首次发现METTL5作为18S rRNA mA甲基转移酶，通过下调CXCL16的翻译来排斥CD8 T细胞，从而驱动肝内胆管癌的免疫逃逸，并证明靶向METTL5联合PD-1阻断可有效消除肿瘤 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序分析，在人类患者中的直接验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究METTL5在调控肝脏免疫微环境以促进癌症进展中的作用，并评估其作为治疗靶点的潜力 | 肝内胆管癌（ICC）小鼠模型、人类ICC样本、免疫细胞（特别是CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞） | 癌症免疫学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）、脂质纳米颗粒包裹的siRNA递送、免疫细胞过继转移 | 基因敲除小鼠模型（cKO） | 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据、体内成像数据 | 小鼠模型及人类ICC样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 1800 | 2026-02-27 |
Decoding cell state transitions driven by dynamic cell-cell communication in spatial transcriptomics
2026-Feb, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00934-2
PMID:41491113
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CCCvelo的方法，用于解码空间转录组学中由动态细胞间通讯驱动的细胞状态转换 | 提出了CCCvelo方法，通过联合优化动态细胞间通讯信号网络和潜在细胞状态转换时钟，首次在空间转录组学中重建细胞间通讯驱动的细胞状态转换动态 | NA | 研究多细胞系统中细胞命运决定的调控机制，特别是细胞间通讯如何驱动细胞状态转换 | 小鼠皮层、胚胎躯干发育和人类前列腺癌数据集 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | 物理信息神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |