单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1781	2025-05-15	Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC 2025-May-10, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-025-03259-w PMID:40349025	研究论文	该研究探讨了硫氧还蛋白（TXN）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫治疗耐药性生物标志物的作用及其在冷肿瘤形成中的关键影响	发现TXN在NSCLC患者中高表达并与冷肿瘤特征相关，揭示了TXN通过调节CD40促进肿瘤免疫逃逸的新机制	研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内动物模型的验证	探究TXN在NSCLC免疫治疗耐药性中的作用及其分子机制	非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织样本及A549和SK-MES-1细胞系	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	NSCLC患者组织样本及两种肺癌细胞系（A549和SK-MES-1）
1782	2025-05-15	Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models 2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-010820 PMID:40341024	研究论文	研究探讨了在鼠胰腺导管腺癌模型中，通过阻断LIF和PD-L1增强立体定向体部放疗（SBRT）的抗肿瘤效果	首次展示了LIF和PD-L1同时抑制与SBRT联合治疗的显著协同效应，并深入分析了其免疫调节机制	研究仅在鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探索胰腺导管腺癌的新型联合治疗方案	鼠胰腺导管腺癌模型	肿瘤免疫治疗	胰腺癌	流式细胞术、Luminex检测、bulk RNA测序、单细胞RNA测序	鼠原位胰腺肿瘤模型	基因表达数据、免疫细胞表型数据	多个鼠胰腺肿瘤模型
1783	2025-05-15	NEUROD1 efficiently converts peripheral blood cells into neurons with partial reprogramming by pluripotency factors 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2401387122 PMID:40299704	研究论文	本研究介绍了一种优化的方法，通过外周血细胞将体细胞转化为神经元，避免了诱导多能干细胞（iPSC）中间步骤	使用NEUROD1和四种Yamanaka重编程因子的独特组合，在3周内生成谷氨酸能神经元，提供了一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法	虽然外周血细胞提供了潜在的替代方案，但其在神经元重编程中的广泛应用仍需进一步验证	开发一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法，将外周血细胞转化为神经元，用于神经系统疾病建模和药物发现	外周血细胞	细胞重编程	神经系统疾病	单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、Cre-LoxP系统谱系追踪	NA	基因表达数据、甲基化数据	NA
1784	2025-05-15	Induced B cell receptor diversity predicts PD-1 blockade immunotherapy response 2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2501269122 PMID:40314973	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学等方法，分析了接受抗PD-1治疗的基底细胞癌患者，发现B细胞受体（BCR）克隆多样性的诱导与PD-1抑制治疗的成功反应相关	揭示了B细胞受体克隆多样性在PD-1阻断免疫治疗反应中的动态作用，并开发了基于基线肿瘤RNA测序的机器学习模型来预测PD-1诱导的BCR克隆多样性	研究样本量有限，且需要进一步验证机器学习模型在其他癌症类型中的普适性	探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物	局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者	digital pathology	basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma	单细胞RNA测序, 高清空间转录组学, 空间免疫受体分析	machine learning model	RNA测序数据, 空间转录组数据	一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大规模的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列
1785	2025-05-15	Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9 2025-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003104 PMID:38945689	research paper	该研究揭示了迷走神经通过调控CXCL9表达在急性-慢性肝衰竭（ACLF）发展中的作用机制	首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯机制在ACLF发展中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，临床转化需要进一步验证	阐明迷走神经调控ACLF发展的分子机制	急性-慢性肝衰竭（ACLF）小鼠模型和患者样本	神经免疫学	肝病	蛋白质组学分析、scRNA-seq、流式细胞术、免疫组化/免疫荧光染色、CRISPR/Cas9技术	小鼠ACLF模型	蛋白质组数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据	ACLF小鼠模型和患者样本（具体数量未明确说明）
1786	2025-05-15	Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection 2025-May, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2025.110496 PMID:40090183	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FMDV感染对小鼠T和B细胞亚群记忆免疫反应的影响	首次全面分析了FMDV感染对记忆免疫细胞亚群的影响，并揭示了Fos相关基因的关键作用	研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证	探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制	小鼠脾脏中的T和B细胞亚群	免疫学	口蹄疫	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确说明的小鼠脾脏细胞样本
1787	2025-05-15	Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus 2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200384 PMID:40117520	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的重要作用	首次构建了EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录组图谱，并揭示了MIF-CD74轴在B细胞存活信号传导中的关键作用	样本量较小(仅11例未接受免疫治疗的患者)，且仅针对早期发病的AChR抗体阳性MG患者	探究重症肌无力胸腺中B细胞增殖和存活的分子机制	11例未接受免疫治疗的早期发病AChR抗体阳性重症肌无力患者的胸腺组织	单细胞转录组学	重症肌无力	单细胞转录组测序、多重组织学染色、ELISA	NA	单细胞转录组数据、组织学图像、蛋白质浓度数据	11例EOMG患者的胸腺样本
1788	2025-05-15	BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies 2025-May, Spinal cord IF:2.1Q1 DOI:10.1038/s41393-025-01077-x PMID:40229538	研究论文	本研究通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤（SCI）后的变化，揭示BDNF调控的GABA信号在神经元再生中的关键作用，并评估hUC-MSCs和iPS来源的MSCs在促进神经修复中的潜力	揭示了BDNF调控的GABA信号在星形胶质细胞中对神经元再生的关键作用，并评估了hUC-MSCs和iPS-MSCs通过激活该通路促进神经修复的潜力	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探索SCI后星形胶质细胞的变化及其在神经修复中的作用，评估MSCs治疗的潜力	星形胶质细胞、hUC-MSCs、iPS来源的MSCs	生物信息学	脊髓损伤	scRNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq、GSEA	NA	转录组数据	来自GEO数据库的scRNA-seq、空间转录组学和bulk RNA-seq数据
1789	2025-05-15	USP14-IMP2-CXCL2 axis in tumor-associated macrophages facilitates resistance to anti-PD-1 therapy in gastric cancer by recruiting myeloid-derived suppressor cells 2025-04-23, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03425-w PMID:40269263	研究论文	该研究揭示了USP14-IMP2-CXCL2轴在肿瘤相关巨噬细胞中通过招募髓源性抑制细胞促进胃癌抗PD-1治疗耐药性的机制	首次揭示了USP14-IMP2-CXCL2信号轴在TAMs中驱动抗PD-1治疗耐药性的分子机制，并提出通过抑制该轴增强治疗敏感性的新策略	研究主要基于临床样本和动物模型，尚未在更大规模临床试验中验证	探究胃癌抗PD-1治疗耐药性的分子机制并寻找潜在治疗靶点	胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	来自无法手术胃癌患者的内镜活检样本
1790	2025-05-15	A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466 PMID:40090085	研究论文	研究发现了一类在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群，这些细胞表达高水平的TLR7，并促进自身免疫反应	首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72 BCs这一关键过渡细胞群，揭示了其在自身抗体分泌细胞生成中的作用	研究主要基于青少年SLE患者，结果在成人SLE中的适用性需要进一步验证	探究CD72+ B细胞在系统性红斑狼疮自身免疫反应中的作用机制	青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，批量RNA测序(RNA-seq)，多组学整合分析	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，研究对象为青少年SLE患者的B细胞
1791	2025-05-15	Integration of Transcriptomic and Single-Cell Data to Uncover Senescence- and Ferroptosis-Associated Biomarkers in Sepsis 2025-Apr-11, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040942 PMID:40299574	research paper	该研究通过整合转录组学和单细胞数据，揭示了脓毒症中与衰老和铁死亡相关的生物标志物	首次结合WGCNA和scRNA-seq技术，识别脓毒症中铁死亡和衰老相关的关键基因，并评估其诊断潜力及药物相互作用	需要进一步的临床验证和精准医学应用研究	探索脓毒症的病理生理机制，并寻找诊断和靶向治疗的生物标志物	脓毒症患者	生物信息学	脓毒症	WGCNA, scRNA-seq, 分子对接	NA	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	公共数据集(GSE57065, GSE65682, GSE26378)
1792	2025-05-15	Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance 2025-Apr-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031 PMID:40215978	研究论文	本研究揭示了放疗通过诱导铜依赖性细胞死亡（铜死亡）来克服肿瘤放射抗性的机制	首次发现放疗可诱导铜死亡，并揭示了铜死亡与放射抗性之间的分子机制	研究主要基于食管癌模型，其他癌症类型的适用性尚需验证	探索放疗诱导铜死亡的机制及其在克服肿瘤放射抗性中的应用	癌细胞、患者肿瘤组织、细胞系和患者来源的异种移植模型	肿瘤学	食管癌	RNA-seq、单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据	包括放射抗性食管癌细胞、患者肿瘤组织及异种移植模型
1793	2025-05-15	Revealing tumor microenvironment communication through m6A single-cell analysis and elucidating immunotherapeutic potentials for cutaneous melanoma (CM) 2025-Apr-09, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06176-z PMID:40205154	研究论文	通过m6A单细胞分析揭示皮肤黑色素瘤肿瘤微环境中的通讯机制，并探讨其免疫治疗潜力	首次在皮肤黑色素瘤中研究m6A修饰的作用，并发现COL3A1基因作为黑色素瘤-成纤维细胞相互作用的关键调节因子	研究仅基于三个皮肤黑色素瘤样本的公开数据，样本量较小	探索m6A RNA甲基化在皮肤黑色素瘤肿瘤微环境中的作用及其免疫治疗潜力	皮肤黑色素瘤的肿瘤微环境细胞	肿瘤微环境分析	皮肤黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 非负矩阵分解(NMF)分析	NMF聚类模型	单细胞RNA测序数据	3个皮肤黑色素瘤样本(来自公共数据库GSE215121)
1794	2025-05-15	Comprehensive Integrated Analysis Reveals the Spatiotemporal Microevolution of Cancer Cells in Patients with Bone-Metastatic Prostate Cancer 2025-Apr-09, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040909 PMID:40299503	研究论文	本研究通过单细胞转录组学系统分析了前列腺癌骨转移的异质性和微环境适应性	整合了迄今为止最大的单细胞转录组数据集，揭示了上皮癌细胞在转移过程中的关键进化轨迹，并鉴定了一个新的上皮亚群NEndoCs	传统聚类方法在面对癌症上皮细胞显著异质性时存在挑战	系统表征前列腺癌骨转移的异质性和微环境适应性	前列腺癌骨转移患者	数字病理学	前列腺癌	单细胞转录组学	无监督聚类	单细胞转录组数据	124个样本（包括原发前列腺肿瘤、不同骨转移部位和非恶性组织），602,497个高质量单细胞转录组
1795	2025-05-15	Immune Regulation and Disulfidptosis in Atherosclerosis Influence Disease Progression and Therapy 2025-Apr-09, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040926 PMID:40299531	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和生物信息学方法，探讨了免疫调节和二硫键凋亡在动脉粥样硬化中的作用及其对疾病进展和治疗的影响	首次将二硫键凋亡与动脉粥样硬化联系起来，并确定了CTSC、TGFBI和GMFG作为关键生物标志物，开发了高精度的诊断风险评分模型	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和测序深度的限制	探究动脉粥样硬化的分子机制，寻找新的治疗靶点和诊断方法	动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和平滑肌细胞	生物信息学	心血管疾病	scRNA-seq, WGCNA, 机器学习	诊断风险评分模型	单细胞RNA测序数据	NA
1796	2025-05-15	Exploring Immune-Related Ferroptosis Genes in Thyroid Cancer: A Comprehensive Analysis 2025-Apr-08, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040903 PMID:40299520	研究论文	本研究探索甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因（IRFGs），以发现新的治疗靶点	整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了一个稳健的预后模型，并鉴定了与免疫细胞浸润和免疫反应密切相关的IRFGs	研究样本可能不足以代表所有甲状腺癌亚型，且需要进一步的实验验证	发现甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因（IRFGs）作为新的治疗靶点，并改进预后评估	甲状腺癌患者及其肿瘤微环境（TME）中的免疫相关铁死亡基因	生物信息学	甲状腺癌	CIBERSORTx, WGCNA, LASSO Cox回归, Pearson相关性分析, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR	预后风险评分模型	RNA测序数据	TCGA-THCA数据集中的甲状腺癌样本，具体数量未明确说明
1797	2025-05-15	Exploring Human Brain Metabolism via Genome-Scale Metabolic Modeling with Highlights on Multiple Sclerosis 2025-Apr-02, ACS chemical neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.1021/acschemneuro.5c00006 PMID:40091499	研究论文	本研究通过基因组尺度代谢模型（GEMs）探索人脑代谢，特别关注多发性硬化症（MS）	整合单细胞RNA-seq数据和全局Human1，通过tINIT算法重建脑细胞特异性GEMs，并生成组合脑模型iHumanBrain2690	NA	理解脑生理和疾病状态下的复杂代谢	神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞及其前体细胞	系统生物学	多发性硬化症	单细胞RNA-seq, tINIT算法	GEMs	RNA-seq数据	NA
1798	2025-05-15	A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations 2025-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108362 PMID:39919386	综述	本文系统回顾了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用和创新，特别是在胰岛细胞研究中的进展	强调了scRNA-seq在解析细胞类型、基因活性和细胞间相互作用方面的创新应用，为理解复杂生物过程和疾病提供了新视角	讨论了scRNA-seq在样本制备、测序和计算分析方面的挑战和限制	回顾scRNA-seq技术在胰岛细胞研究中的应用及其对理解复杂生物过程和疾病的贡献	胰岛细胞及其在葡萄糖稳态中的作用	基因组学	糖尿病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	NA
1799	2025-05-15	Characterization of shell field populations in gastropods and their autonomous specification mechanism independent of inter-quartet interactions 2025-Apr-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204538 PMID:40105679	research paper	本研究重新调查了帽贝壳场规范的诱导假说，并识别了发育壳场中的三个细胞群体	发现壳场早期规范在2q来源细胞中基本独立于其他四分体的相互作用	研究仅针对帽贝，可能不适用于其他软体动物	探究软体动物壳场规范的自主性	帽贝的胚胎壳场细胞群体	developmental biology	NA	two-color in situ hybridization, single-cell transcriptome analysis	NA	gene expression data	16-cell embryos of limpets
1800	2025-05-15	Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis 2025-Apr-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204307 PMID:40110772	research paper	研究通过CRISPR/Cas9系统创建稳定的hamp敲除斑马鱼模型，揭示了hamp在铁调节和造血中的关键作用	首次在斑马鱼模型中揭示了hamp缺失导致母体铁过载，并影响血红蛋白基因表达和血液祖细胞发育	研究仅局限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物或人类中进行验证	探索hamp在斑马鱼造血过程中的作用及其对铁稳态的影响	斑马鱼胚胎及其血液祖细胞	developmental biology	blood disorders	CRISPR/Cas9系统, 单细胞RNA测序	CRISPR knockout model	genetic and RNA sequencing data	斑马鱼胚胎及其血液祖细胞样本